MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	TAAA	2	8	130	137	75 %	25 %	0 %	0 %	148244140
2	NC_009477	AACA	2	8	408	415	75 %	0 %	0 %	25 %	148244140
3	NC_009477	AATT	2	8	759	766	50 %	50 %	0 %	0 %	148244141
4	NC_009477	TCAA	2	8	909	916	50 %	25 %	0 %	25 %	148244141
5	NC_009477	AGCA	2	8	924	931	50 %	0 %	25 %	25 %	148244141
6	NC_009477	TTAT	2	8	977	984	25 %	75 %	0 %	0 %	148244141
7	NC_009477	GTTT	2	8	1173	1180	0 %	75 %	25 %	0 %	148244141
8	NC_009477	ATAA	2	8	1288	1295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009477	TCAA	2	8	1519	1526	50 %	25 %	0 %	25 %	148244142
10	NC_009477	TGAT	2	8	2209	2216	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
11	NC_009477	ATGT	2	8	2247	2254	25 %	50 %	25 %	0 %	148244143
12	NC_009477	TCAT	2	8	2926	2933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009477	TCTA	2	8	2953	2960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009477	ACAT	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	148244144
15	NC_009477	AAGA	2	8	3599	3606	75 %	0 %	25 %	0 %	148244144
16	NC_009477	CATT	2	8	4236	4243	25 %	50 %	0 %	25 %	148244145
17	NC_009477	CTTT	2	8	4944	4951	0 %	75 %	0 %	25 %	148244146
18	NC_009477	AATA	2	8	5419	5426	75 %	25 %	0 %	0 %	148244146
19	NC_009477	AAAG	2	8	5578	5585	75 %	0 %	25 %	0 %	148244146
20	NC_009477	ATTT	2	8	6103	6110	25 %	75 %	0 %	0 %	148244147
21	NC_009477	TATT	2	8	6371	6378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009477	AATA	2	8	6822	6829	75 %	25 %	0 %	0 %	148244148
23	NC_009477	GTTT	2	8	7042	7049	0 %	75 %	25 %	0 %	148244148
24	NC_009477	CTAG	2	8	7108	7115	25 %	25 %	25 %	25 %	148244148
25	NC_009477	TTAA	2	8	7379	7386	50 %	50 %	0 %	0 %	148244149
26	NC_009477	AATG	2	8	7626	7633	50 %	25 %	25 %	0 %	148244149
27	NC_009477	TGAA	2	8	7639	7646	50 %	25 %	25 %	0 %	148244149
28	NC_009477	ATTT	2	8	7963	7970	25 %	75 %	0 %	0 %	148244149
29	NC_009477	TTAG	2	8	8714	8721	25 %	50 %	25 %	0 %	148244149
30	NC_009477	TCGT	2	8	9059	9066	0 %	50 %	25 %	25 %	148244150
31	NC_009477	TTCA	2	8	9071	9078	25 %	50 %	0 %	25 %	148244150
32	NC_009477	TCTA	2	8	9113	9120	25 %	50 %	0 %	25 %	148244150
33	NC_009477	ATAC	2	8	9412	9419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009477	AAAT	2	8	9749	9756	75 %	25 %	0 %	0 %	148244151
35	NC_009477	TCCA	2	8	10269	10276	25 %	25 %	0 %	50 %	148244152
36	NC_009477	TAAA	2	8	10514	10521	75 %	25 %	0 %	0 %	148244152
37	NC_009477	CTTT	2	8	10557	10564	0 %	75 %	0 %	25 %	148244152
38	NC_009477	TCTT	2	8	10587	10594	0 %	75 %	0 %	25 %	148244152
39	NC_009477	AATT	2	8	10769	10776	50 %	50 %	0 %	0 %	148244152
40	NC_009477	ATTA	2	8	10808	10815	50 %	50 %	0 %	0 %	148244152
41	NC_009477	AATG	2	8	10848	10855	50 %	25 %	25 %	0 %	148244152
42	NC_009477	TCTT	2	8	10990	10997	0 %	75 %	0 %	25 %	148244152
43	NC_009477	ACTT	2	8	11479	11486	25 %	50 %	0 %	25 %	148244152
44	NC_009477	AGCA	2	8	11564	11571	50 %	0 %	25 %	25 %	148244152
45	NC_009477	TAAA	2	8	12049	12056	75 %	25 %	0 %	0 %	148244153
46	NC_009477	TAAA	2	8	12346	12353	75 %	25 %	0 %	0 %	148244153
47	NC_009477	TTAA	2	8	12435	12442	50 %	50 %	0 %	0 %	148244153
48	NC_009477	ATTT	2	8	12768	12775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009477	ATAA	2	8	12823	12830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009477	TTTA	2	8	13188	13195	25 %	75 %	0 %	0 %	148244154
51	NC_009477	CTTT	2	8	13274	13281	0 %	75 %	0 %	25 %	148244154
52	NC_009477	GTTA	2	8	13758	13765	25 %	50 %	25 %	0 %	148244155
53	NC_009477	GAAT	2	8	14146	14153	50 %	25 %	25 %	0 %	148244155
54	NC_009477	AATG	2	8	14571	14578	50 %	25 %	25 %	0 %	148244155
55	NC_009477	ATTA	2	8	14856	14863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009477	AGTA	2	8	15665	15672	50 %	25 %	25 %	0 %	148244157
57	NC_009477	TTCA	2	8	15788	15795	25 %	50 %	0 %	25 %	148244157
58	NC_009477	ACTA	2	8	15932	15939	50 %	25 %	0 %	25 %	148244157
59	NC_009477	ATAA	2	8	16440	16447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009477	AATT	2	8	16663	16670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009477	GAAA	2	8	16759	16766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009477	AATA	2	8	16767	16774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009477	GAAA	2	8	16783	16790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009477	AAAT	2	8	16934	16941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009477	CTTT	2	8	17212	17219	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009477	TCAT	2	8	17396	17403	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009477	AAAT	2	8	17444	17451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009477	CTTA	2	8	17469	17476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009477	AAGA	2	8	17672	17679	75 %	0 %	25 %	0 %	148244158
70	NC_009477	TTAT	2	8	18373	18380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009477	AAAT	2	8	18675	18682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009477	CAAA	2	8	18697	18704	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009477	TACA	2	8	18994	19001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009477	TTAG	2	8	19685	19692	25 %	50 %	25 %	0 %	148244159
75	NC_009477	TCAT	2	8	19805	19812	25 %	50 %	0 %	25 %	148244159
76	NC_009477	CTTC	2	8	19950	19957	0 %	50 %	0 %	50 %	148244159
77	NC_009477	TTTA	2	8	20050	20057	25 %	75 %	0 %	0 %	148244159
78	NC_009477	TTAG	2	8	20261	20268	25 %	50 %	25 %	0 %	148244159
79	NC_009477	TCTT	2	8	20317	20324	0 %	75 %	0 %	25 %	148244159
80	NC_009477	TTTA	2	8	20413	20420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009477	ATTT	2	8	20428	20435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009477	TAAA	2	8	20588	20595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009477	GATG	2	8	20685	20692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009477	ACAA	2	8	20983	20990	75 %	0 %	0 %	25 %	148244160
85	NC_009477	AAGA	2	8	21142	21149	75 %	0 %	25 %	0 %	148244160
86	NC_009477	GTTT	2	8	21514	21521	0 %	75 %	25 %	0 %	148244160
87	NC_009477	CAAA	2	8	21615	21622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009477	ACAT	2	8	22185	22192	50 %	25 %	0 %	25 %	148244161
89	NC_009477	AAGA	2	8	22419	22426	75 %	0 %	25 %	0 %	148244161
90	NC_009477	TTTA	2	8	23042	23049	25 %	75 %	0 %	0 %	148244162
91	NC_009477	ATAA	2	8	23264	23271	75 %	25 %	0 %	0 %	148244162
92	NC_009477	GAAA	2	8	23650	23657	75 %	0 %	25 %	0 %	148244163
93	NC_009477	GATT	2	8	24706	24713	25 %	50 %	25 %	0 %	148244163
94	NC_009477	AATC	2	8	25120	25127	50 %	25 %	0 %	25 %	148244164
95	NC_009477	ACAT	2	8	25543	25550	50 %	25 %	0 %	25 %	148244165
96	NC_009477	AAGA	2	8	25777	25784	75 %	0 %	25 %	0 %	148244165
97	NC_009477	CTTT	2	8	26086	26093	0 %	75 %	0 %	25 %	148244166
98	NC_009477	ATTT	2	8	26324	26331	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
99	NC_009477	TATT	2	8	26369	26376	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
100	NC_009477	AGTA	2	8	26763	26770	50 %	25 %	25 %	0 %	148244166
101	NC_009477	TTTA	2	8	27015	27022	25 %	75 %	0 %	0 %	148244166
102	NC_009477	TCGC	2	8	27937	27944	0 %	25 %	25 %	50 %	148244167
103	NC_009477	ATGT	2	8	28453	28460	25 %	50 %	25 %	0 %	148244167
104	NC_009477	TTGA	2	8	29092	29099	25 %	50 %	25 %	0 %	148244168
105	NC_009477	AATG	2	8	29408	29415	50 %	25 %	25 %	0 %	148244168

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.