MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009477	TAA	2	6	19675	19680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244159
502	NC_009477	TTAG	2	8	19685	19692	25 %	50 %	25 %	0 %	148244159
503	NC_009477	ATC	2	6	19726	19731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244159
504	NC_009477	TCAT	2	8	19805	19812	25 %	50 %	0 %	25 %	148244159
505	NC_009477	ATT	2	6	19816	19821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244159
506	NC_009477	CTTC	2	8	19950	19957	0 %	50 %	0 %	50 %	148244159
507	NC_009477	TCT	2	6	19982	19987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244159
508	NC_009477	TTTA	2	8	20050	20057	25 %	75 %	0 %	0 %	148244159
509	NC_009477	CGT	2	6	20063	20068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244159
510	NC_009477	T	7	7	20101	20107	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
511	NC_009477	CTTTT	2	10	20119	20128	0 %	80 %	0 %	20 %	148244159
512	NC_009477	T	6	6	20125	20130	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
513	NC_009477	TCA	2	6	20189	20194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244159
514	NC_009477	TTAG	2	8	20261	20268	25 %	50 %	25 %	0 %	148244159
515	NC_009477	TCTT	2	8	20317	20324	0 %	75 %	0 %	25 %	148244159
516	NC_009477	A	6	6	20365	20370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009477	TAA	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009477	TTTA	2	8	20413	20420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009477	ATTT	2	8	20428	20435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009477	ATT	2	6	20462	20467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009477	TA	3	6	20471	20476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009477	TA	3	6	20494	20499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009477	TTA	2	6	20521	20526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009477	AGT	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009477	TAT	2	6	20575	20580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009477	TAAA	2	8	20588	20595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009477	GATG	2	8	20685	20692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009477	TTTATT	2	12	20693	20704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009477	TAT	2	6	20717	20722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009477	TGA	2	6	20780	20785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009477	GAA	2	6	20811	20816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
532	NC_009477	TAA	2	6	20843	20848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244160
533	NC_009477	AGA	2	6	20903	20908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
534	NC_009477	A	6	6	20920	20925	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
535	NC_009477	TAC	2	6	20972	20977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244160
536	NC_009477	ACAA	2	8	20983	20990	75 %	0 %	0 %	25 %	148244160
537	NC_009477	A	8	8	20989	20996	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
538	NC_009477	ATA	2	6	21004	21009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244160
539	NC_009477	TAG	2	6	21040	21045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244160
540	NC_009477	AAT	2	6	21075	21080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244160
541	NC_009477	GTC	2	6	21100	21105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244160
542	NC_009477	ACA	2	6	21111	21116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244160
543	NC_009477	AAGA	2	8	21142	21149	75 %	0 %	25 %	0 %	148244160
544	NC_009477	AG	3	6	21185	21190	50 %	0 %	50 %	0 %	148244160
545	NC_009477	TAA	2	6	21191	21196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244160
546	NC_009477	AGAAAA	2	12	21224	21235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148244160
547	NC_009477	CTA	2	6	21262	21267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244160
548	NC_009477	A	6	6	21295	21300	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
549	NC_009477	TAC	2	6	21305	21310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244160
550	NC_009477	GAA	2	6	21339	21344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
551	NC_009477	AT	3	6	21373	21378	50 %	50 %	0 %	0 %	148244160
552	NC_009477	CGA	2	6	21392	21397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244160
553	NC_009477	GAA	2	6	21411	21416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
554	NC_009477	A	7	7	21419	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
555	NC_009477	AGA	2	6	21467	21472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
556	NC_009477	GAA	2	6	21480	21485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244160
557	NC_009477	GTTT	2	8	21514	21521	0 %	75 %	25 %	0 %	148244160
558	NC_009477	AAT	2	6	21531	21536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009477	TA	3	6	21575	21580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009477	ATC	2	6	21597	21602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_009477	CAAA	2	8	21615	21622	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_009477	TTTCT	2	10	21760	21769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
563	NC_009477	TAA	2	6	21796	21801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009477	CTT	2	6	21822	21827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_009477	TCT	2	6	21887	21892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009477	CTA	2	6	21951	21956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244161
567	NC_009477	AT	3	6	21983	21988	50 %	50 %	0 %	0 %	148244161
568	NC_009477	GTG	2	6	22007	22012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244161
569	NC_009477	TCA	2	6	22020	22025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244161
570	NC_009477	GAA	2	6	22080	22085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244161
571	NC_009477	A	6	6	22093	22098	100 %	0 %	0 %	0 %	148244161
572	NC_009477	TTA	2	6	22101	22106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244161
573	NC_009477	TGA	2	6	22119	22124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244161
574	NC_009477	ACAT	2	8	22185	22192	50 %	25 %	0 %	25 %	148244161
575	NC_009477	TTAAAC	2	12	22340	22351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244161
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577	NC_009477	A	6	6	22452	22457	100 %	0 %	0 %	0 %	148244161
578	NC_009477	TA	3	6	22490	22495	50 %	50 %	0 %	0 %	148244161
579	NC_009477	AAC	2	6	22573	22578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009477	AAG	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009477	AGA	2	6	22694	22699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009477	ATT	2	6	22706	22711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009477	ATG	2	6	22773	22778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009477	TTC	2	6	22789	22794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_009477	GAA	2	6	22882	22887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244162
586	NC_009477	TGA	2	6	22896	22901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244162
587	NC_009477	TTGATA	2	12	22913	22924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244162
588	NC_009477	ATA	2	6	22979	22984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244162
589	NC_009477	TTTA	2	8	23042	23049	25 %	75 %	0 %	0 %	148244162
590	NC_009477	ATT	2	6	23100	23105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244162
591	NC_009477	TTA	2	6	23111	23116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244162
592	NC_009477	GTT	2	6	23138	23143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244162
593	NC_009477	TAA	2	6	23156	23161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244162
594	NC_009477	GGT	2	6	23206	23211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244162
595	NC_009477	GTATAT	2	12	23236	23247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244162
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597	NC_009477	GAT	3	9	23314	23322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
598	NC_009477	TGA	2	6	23349	23354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
599	NC_009477	TGG	2	6	23373	23378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244163
600	NC_009477	A	6	6	23386	23391	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
601	NC_009477	A	7	7	23409	23415	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
602	NC_009477	ATT	2	6	23455	23460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244163
603	NC_009477	AT	3	6	23494	23499	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
604	NC_009477	ATG	2	6	23507	23512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
605	NC_009477	TA	3	6	23516	23521	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
606	NC_009477	ATTATC	2	12	23525	23536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244163
607	NC_009477	TGA	2	6	23544	23549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
608	NC_009477	TATGG	2	10	23557	23566	20 %	40 %	40 %	0 %	148244163
609	NC_009477	ATT	2	6	23588	23593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244163
610	NC_009477	AT	3	6	23616	23621	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
611	NC_009477	A	6	6	23644	23649	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
612	NC_009477	GAAA	2	8	23650	23657	75 %	0 %	25 %	0 %	148244163
613	NC_009477	AAT	2	6	23689	23694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244163
614	NC_009477	ATT	2	6	23734	23739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244163
615	NC_009477	A	6	6	23773	23778	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
616	NC_009477	ATG	2	6	23807	23812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
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618	NC_009477	TAA	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244163
619	NC_009477	TAA	2	6	23964	23969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244163
620	NC_009477	A	6	6	23971	23976	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
621	NC_009477	AT	3	6	23998	24003	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
622	NC_009477	T	6	6	24006	24011	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
623	NC_009477	TGA	2	6	24069	24074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244163
624	NC_009477	T	6	6	24111	24116	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
625	NC_009477	CTA	2	6	24134	24139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244163
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627	NC_009477	T	6	6	24183	24188	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
628	NC_009477	ATA	2	6	24239	24244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244163
629	NC_009477	AGA	2	6	24258	24263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244163
630	NC_009477	TA	3	6	24265	24270	50 %	50 %	0 %	0 %	148244163
631	NC_009477	TTG	2	6	24271	24276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244163
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633	NC_009477	CAA	2	6	24350	24355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244163
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