MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 6150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009443	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	146322039
2	NC_009443	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	146322039
3	NC_009443	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	146322039
4	NC_009443	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	146322039
5	NC_009443	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	146322039
6	NC_009443	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	146319851
7	NC_009443	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	146319851
8	NC_009443	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	146319851
9	NC_009443	ACTT	2	8	2520	2527	25 %	50 %	0 %	25 %	146319852
10	NC_009443	GTCC	2	8	2586	2593	0 %	25 %	25 %	50 %	146319852
11	NC_009443	AAAG	2	8	2824	2831	75 %	0 %	25 %	0 %	146319853
12	NC_009443	GAAG	2	8	3408	3415	50 %	0 %	50 %	0 %	146319853
13	NC_009443	GTAT	2	8	3623	3630	25 %	50 %	25 %	0 %	146319853
14	NC_009443	AATG	2	8	4189	4196	50 %	25 %	25 %	0 %	146319855
15	NC_009443	AAAT	2	8	4658	4665	75 %	25 %	0 %	0 %	146319856
16	NC_009443	CTTG	2	8	5245	5252	0 %	50 %	25 %	25 %	146319856
17	NC_009443	TTGG	2	8	5624	5631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009443	GATT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	25 %	0 %	146319858
19	NC_009443	ATGA	2	8	5868	5875	50 %	25 %	25 %	0 %	146319858
20	NC_009443	ATCA	2	8	6275	6282	50 %	25 %	0 %	25 %	146319859
21	NC_009443	AATC	2	8	6299	6306	50 %	25 %	0 %	25 %	146319859
22	NC_009443	GTTT	2	8	6505	6512	0 %	75 %	25 %	0 %	146319859
23	NC_009443	TCAA	2	8	6532	6539	50 %	25 %	0 %	25 %	146319859
24	NC_009443	CTTA	2	8	7005	7012	25 %	50 %	0 %	25 %	146319859
25	NC_009443	GATG	2	8	7587	7594	25 %	25 %	50 %	0 %	146319860
26	NC_009443	GCAA	2	8	8219	8226	50 %	0 %	25 %	25 %	146319860
27	NC_009443	TCAG	2	8	9159	9166	25 %	25 %	25 %	25 %	146319860
28	NC_009443	ATTG	2	8	9396	9403	25 %	50 %	25 %	0 %	146319860
29	NC_009443	CTTG	2	8	9438	9445	0 %	50 %	25 %	25 %	146319860
30	NC_009443	AAGG	2	8	9717	9724	50 %	0 %	50 %	0 %	146319860
31	NC_009443	GAAG	2	8	9838	9845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009443	TCTT	2	8	10169	10176	0 %	75 %	0 %	25 %	146319862
33	NC_009443	TGCC	2	8	10184	10191	0 %	25 %	25 %	50 %	146319862
34	NC_009443	CTAT	2	8	10648	10655	25 %	50 %	0 %	25 %	146319864
35	NC_009443	AGTG	2	8	11511	11518	25 %	25 %	50 %	0 %	146319864
36	NC_009443	AGAT	2	8	11819	11826	50 %	25 %	25 %	0 %	146319865
37	NC_009443	GAAG	2	8	12134	12141	50 %	0 %	50 %	0 %	146319865
38	NC_009443	GATT	2	8	12202	12209	25 %	50 %	25 %	0 %	146319865
39	NC_009443	GGCG	2	8	12213	12220	0 %	0 %	75 %	25 %	146319865
40	NC_009443	AGGC	2	8	12864	12871	25 %	0 %	50 %	25 %	146319865
41	NC_009443	TAAA	2	8	12898	12905	75 %	25 %	0 %	0 %	146319865
42	NC_009443	CTTG	2	8	14361	14368	0 %	50 %	25 %	25 %	146319867
43	NC_009443	TGTT	2	8	14435	14442	0 %	75 %	25 %	0 %	146319867
44	NC_009443	GTTC	2	8	14461	14468	0 %	50 %	25 %	25 %	146319867
45	NC_009443	GTCG	2	8	14530	14537	0 %	25 %	50 %	25 %	146319867
46	NC_009443	CAAC	2	8	14589	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	146319867
47	NC_009443	ATGG	2	8	14608	14615	25 %	25 %	50 %	0 %	146319867
48	NC_009443	CAAC	2	8	14651	14658	50 %	0 %	0 %	50 %	146319867
49	NC_009443	TTGG	2	8	14716	14723	0 %	50 %	50 %	0 %	146319867
50	NC_009443	AAGA	2	8	14956	14963	75 %	0 %	25 %	0 %	146319867
51	NC_009443	ACAA	2	8	15339	15346	75 %	0 %	0 %	25 %	146319867
52	NC_009443	TTAT	2	8	15774	15781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009443	ATTA	2	8	16357	16364	50 %	50 %	0 %	0 %	146319868
54	NC_009443	GTGA	2	8	17377	17384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009443	AGCG	2	8	17548	17555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009443	AGCC	2	8	18430	18437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009443	GTAA	2	8	19009	19016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009443	TCAC	2	8	19066	19073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009443	GCGA	2	8	19165	19172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009443	ATTC	2	8	20030	20037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009443	CTAA	2	8	20387	20394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009443	TAGG	2	8	21041	21048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009443	AATC	2	8	22187	22194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009443	GCGT	2	8	23098	23105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009443	TTTG	2	8	23627	23634	0 %	75 %	25 %	0 %	146319871
66	NC_009443	CAAA	2	8	24384	24391	75 %	0 %	0 %	25 %	146319871
67	NC_009443	GGTC	2	8	24482	24489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009443	AACA	2	8	24891	24898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009443	TCTA	2	8	25035	25042	25 %	50 %	0 %	25 %	146319872
70	NC_009443	ATCA	2	8	25374	25381	50 %	25 %	0 %	25 %	146319872
71	NC_009443	TTTG	2	8	26286	26293	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009443	ATTG	2	8	26802	26809	25 %	50 %	25 %	0 %	146319873
73	NC_009443	TTGA	2	8	27013	27020	25 %	50 %	25 %	0 %	146319873
74	NC_009443	TGAT	2	8	27026	27033	25 %	50 %	25 %	0 %	146319873
75	NC_009443	TTTG	2	8	27291	27298	0 %	75 %	25 %	0 %	146319873
76	NC_009443	ATTT	2	8	27353	27360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009443	TGCC	2	8	27763	27770	0 %	25 %	25 %	50 %	146319874
78	NC_009443	GCGG	2	8	28280	28287	0 %	0 %	75 %	25 %	146319874
79	NC_009443	GAAA	2	8	28435	28442	75 %	0 %	25 %	0 %	146319874
80	NC_009443	TGGG	2	8	29374	29381	0 %	25 %	75 %	0 %	146319876
81	NC_009443	TCAA	2	8	29413	29420	50 %	25 %	0 %	25 %	146319876
82	NC_009443	CGTG	2	8	29840	29847	0 %	25 %	50 %	25 %	146319876
83	NC_009443	TCAA	2	8	30093	30100	50 %	25 %	0 %	25 %	146319876
84	NC_009443	AACC	2	8	30142	30149	50 %	0 %	0 %	50 %	146319876
85	NC_009443	CTTG	2	8	30200	30207	0 %	50 %	25 %	25 %	146319876
86	NC_009443	AATT	2	8	30383	30390	50 %	50 %	0 %	0 %	146319877
87	NC_009443	TTTA	2	8	30565	30572	25 %	75 %	0 %	0 %	146319877
88	NC_009443	AAGA	2	8	30826	30833	75 %	0 %	25 %	0 %	146319878
89	NC_009443	TGAA	2	8	30893	30900	50 %	25 %	25 %	0 %	146319878
90	NC_009443	TTCA	2	8	32020	32027	25 %	50 %	0 %	25 %	146319879
91	NC_009443	TACT	2	8	32085	32092	25 %	50 %	0 %	25 %	146319879
92	NC_009443	GTCC	2	8	33094	33101	0 %	25 %	25 %	50 %	146319879
93	NC_009443	TTCC	2	8	33231	33238	0 %	50 %	0 %	50 %	146319879
94	NC_009443	GCAG	2	8	33681	33688	25 %	0 %	50 %	25 %	146319879
95	NC_009443	TACC	2	8	33898	33905	25 %	25 %	0 %	50 %	146319879
96	NC_009443	CCAA	2	8	34763	34770	50 %	0 %	0 %	50 %	146319879
97	NC_009443	GACG	2	8	34890	34897	25 %	0 %	50 %	25 %	146319879
98	NC_009443	AAGA	2	8	35101	35108	75 %	0 %	25 %	0 %	146319879
99	NC_009443	AAAT	2	8	35149	35156	75 %	25 %	0 %	0 %	146319879
100	NC_009443	TGGT	2	8	36022	36029	0 %	50 %	50 %	0 %	146319880
101	NC_009443	CAAC	2	8	36135	36142	50 %	0 %	0 %	50 %	146319880
102	NC_009443	ACCT	2	8	36432	36439	25 %	25 %	0 %	50 %	146319880
103	NC_009443	AGCC	2	8	37007	37014	25 %	0 %	25 %	50 %	146319881
104	NC_009443	GATT	2	8	37070	37077	25 %	50 %	25 %	0 %	146319881
105	NC_009443	CTGG	2	8	37129	37136	0 %	25 %	50 %	25 %	146319881
106	NC_009443	GGCT	2	8	38134	38141	0 %	25 %	50 %	25 %	146319882
107	NC_009443	GTCC	2	8	38626	38633	0 %	25 %	25 %	50 %	146319883
108	NC_009443	CAAG	2	8	38819	38826	50 %	0 %	25 %	25 %	146319883
109	NC_009443	GCAG	2	8	39092	39099	25 %	0 %	50 %	25 %	146319883
110	NC_009443	AACC	2	8	39554	39561	50 %	0 %	0 %	50 %	146319883
111	NC_009443	CGTC	2	8	39568	39575	0 %	25 %	25 %	50 %	146319883
112	NC_009443	CAAA	2	8	40240	40247	75 %	0 %	0 %	25 %	146319884
113	NC_009443	GACC	2	8	40744	40751	25 %	0 %	25 %	50 %	146319884
114	NC_009443	AAAG	2	8	41306	41313	75 %	0 %	25 %	0 %	146319885
115	NC_009443	GCGG	2	8	41400	41407	0 %	0 %	75 %	25 %	146319885
116	NC_009443	TGCC	2	8	42329	42336	0 %	25 %	25 %	50 %	146319886
117	NC_009443	TGAA	2	8	42455	42462	50 %	25 %	25 %	0 %	146319886
118	NC_009443	ATAC	2	8	43219	43226	50 %	25 %	0 %	25 %	146319887
119	NC_009443	AAAG	2	8	43238	43245	75 %	0 %	25 %	0 %	146319887
120	NC_009443	TGAC	2	8	43544	43551	25 %	25 %	25 %	25 %	146319887
121	NC_009443	AATA	2	8	43613	43620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009443	TAAA	2	8	43646	43653	75 %	25 %	0 %	0 %	146319888
123	NC_009443	TTAT	2	8	44336	44343	25 %	75 %	0 %	0 %	146319888
124	NC_009443	GAAG	2	8	44592	44599	50 %	0 %	50 %	0 %	146319888
125	NC_009443	GAAG	2	8	44760	44767	50 %	0 %	50 %	0 %	146319888
126	NC_009443	TTGG	2	8	44935	44942	0 %	50 %	50 %	0 %	146319889
127	NC_009443	CGAC	2	8	45150	45157	25 %	0 %	25 %	50 %	146319889
128	NC_009443	TTGA	2	8	45950	45957	25 %	50 %	25 %	0 %	146319889
129	NC_009443	TCAG	2	8	46077	46084	25 %	25 %	25 %	25 %	146319889
130	NC_009443	AATA	2	8	46213	46220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009443	CTCC	2	8	46239	46246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_009443	TTCG	2	8	46340	46347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009443	AAGC	2	8	46462	46469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009443	AAAC	2	8	46664	46671	75 %	0 %	0 %	25 %	146319890
135	NC_009443	ATCA	2	8	46734	46741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009443	CTAT	2	8	47537	47544	25 %	50 %	0 %	25 %	146319891
137	NC_009443	TCAA	2	8	47558	47565	50 %	25 %	0 %	25 %	146319891
138	NC_009443	GCTT	2	8	47872	47879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009443	CCTA	2	8	47958	47965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009443	GCTA	2	8	48225	48232	25 %	25 %	25 %	25 %	146319892
141	NC_009443	AAGA	2	8	48828	48835	75 %	0 %	25 %	0 %	146319893
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143	NC_009443	TGAT	2	8	49088	49095	25 %	50 %	25 %	0 %	146319894
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