MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009443	GTTTA	2	10	146140	146149	20 %	60 %	20 %	0 %	146320010
3002	NC_009443	TGG	2	6	146209	146214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320010
3003	NC_009443	AAT	2	6	146330	146335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320010
3004	NC_009443	ATT	2	6	146345	146350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320010
3005	NC_009443	ATTA	2	8	146368	146375	50 %	50 %	0 %	0 %	146320010
3006	NC_009443	CTG	2	6	146391	146396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320010
3007	NC_009443	GT	3	6	146424	146429	0 %	50 %	50 %	0 %	146320010
3008	NC_009443	ATG	2	6	146472	146477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320010
3009	NC_009443	A	7	7	146488	146494	100 %	0 %	0 %	0 %	146320010
3010	NC_009443	ATG	2	6	146509	146514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320010
3011	NC_009443	A	9	9	146545	146553	100 %	0 %	0 %	0 %	146320011
3012	NC_009443	GA	3	6	146590	146595	50 %	0 %	50 %	0 %	146320011
3013	NC_009443	TCG	2	6	146605	146610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3014	NC_009443	TGA	2	6	146640	146645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320011
3015	NC_009443	TCG	2	6	146725	146730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3016	NC_009443	ACTT	2	8	146754	146761	25 %	50 %	0 %	25 %	146320011
3017	NC_009443	T	6	6	146776	146781	0 %	100 %	0 %	0 %	146320011
3018	NC_009443	TGC	2	6	146800	146805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3019	NC_009443	AAG	2	6	146810	146815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320011
3020	NC_009443	CAG	2	6	146855	146860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3021	NC_009443	TGA	2	6	146872	146877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320011
3022	NC_009443	CGT	2	6	146885	146890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3023	NC_009443	ATG	2	6	146898	146903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320011
3024	NC_009443	GTC	2	6	146910	146915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
3025	NC_009443	TCG	2	6	146951	146956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320011
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3027	NC_009443	CAT	2	6	147065	147070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320012
3028	NC_009443	TGA	2	6	147076	147081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320012
3029	NC_009443	TGA	2	6	147104	147109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320012
3030	NC_009443	TGA	2	6	147239	147244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320012
3031	NC_009443	ACA	2	6	147282	147287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320012
3032	NC_009443	GAA	2	6	147326	147331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320012
3033	NC_009443	TTCA	2	8	147365	147372	25 %	50 %	0 %	25 %	146320012
3034	NC_009443	CCAGAA	2	12	147381	147392	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	146320012
3035	NC_009443	TTC	2	6	147393	147398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320012
3036	NC_009443	GGT	2	6	147450	147455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320012
3037	NC_009443	ATA	2	6	147487	147492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320012
3038	NC_009443	TCA	2	6	147548	147553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320012
3039	NC_009443	AGTT	2	8	147634	147641	25 %	50 %	25 %	0 %	146320012
3040	NC_009443	GCATG	2	10	147662	147671	20 %	20 %	40 %	20 %	146320012
3041	NC_009443	CTT	2	6	147764	147769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320012
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3043	NC_009443	TGG	2	6	147824	147829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320012
3044	NC_009443	AAAAT	2	10	148075	148084	80 %	20 %	0 %	0 %	146320012
3045	NC_009443	AGCACC	2	12	148088	148099	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	146320012
3046	NC_009443	TGA	2	6	148127	148132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320012
3047	NC_009443	CGT	2	6	148137	148142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320012
3048	NC_009443	CTTC	2	8	148161	148168	0 %	50 %	0 %	50 %	146320012
3049	NC_009443	TAA	2	6	148440	148445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_009443	T	6	6	148486	148491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_009443	ATAAA	2	10	148514	148523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_009443	GT	3	6	148552	148557	0 %	50 %	50 %	0 %	146320013
3053	NC_009443	T	6	6	148607	148612	0 %	100 %	0 %	0 %	146320013
3054	NC_009443	TTG	2	6	148675	148680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320013
3055	NC_009443	TC	3	6	148744	148749	0 %	50 %	0 %	50 %	146320013
3056	NC_009443	ATC	2	6	148792	148797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320013
3057	NC_009443	ACA	2	6	148831	148836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320013
3058	NC_009443	TCT	2	6	148840	148845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320013
3059	NC_009443	CGG	2	6	148855	148860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320013
3060	NC_009443	ATG	2	6	148984	148989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
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3062	NC_009443	TTG	2	6	149115	149120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320013
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3065	NC_009443	TCAA	2	8	149182	149189	50 %	25 %	0 %	25 %	146320013
3066	NC_009443	TGA	2	6	149195	149200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
3067	NC_009443	TTG	2	6	149203	149208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320013
3068	NC_009443	CTGG	2	8	149261	149268	0 %	25 %	50 %	25 %	146320013
3069	NC_009443	GA	3	6	149303	149308	50 %	0 %	50 %	0 %	146320013
3070	NC_009443	GCC	2	6	149506	149511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146320013
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3072	NC_009443	GACC	2	8	149594	149601	25 %	0 %	25 %	50 %	146320013
3073	NC_009443	AGG	2	6	149653	149658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320013
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3081	NC_009443	GATT	2	8	149861	149868	25 %	50 %	25 %	0 %	146320013
3082	NC_009443	TTC	2	6	149901	149906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320013
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3089	NC_009443	TGA	2	6	150228	150233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320013
3090	NC_009443	GAT	2	6	150287	150292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320014
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3092	NC_009443	CCA	2	6	150344	150349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320014
3093	NC_009443	CG	3	6	150355	150360	0 %	0 %	50 %	50 %	146320014
3094	NC_009443	ATA	2	6	150361	150366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320014
3095	NC_009443	GCA	2	6	150385	150390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320014
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3097	NC_009443	CTTT	2	8	150485	150492	0 %	75 %	0 %	25 %	146320014
3098	NC_009443	A	6	6	150509	150514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_009443	GTCT	2	8	150530	150537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_009443	GT	3	6	150717	150722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_009443	ACTAAG	2	12	150730	150741	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3102	NC_009443	CTA	2	6	150824	150829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_009443	ATT	2	6	150853	150858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_009443	A	6	6	150861	150866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_009443	AG	3	6	150887	150892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_009443	TAA	2	6	151037	151042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_009443	AAAG	2	8	151061	151068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_009443	TGG	2	6	151126	151131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
3109	NC_009443	T	6	6	151208	151213	0 %	100 %	0 %	0 %	146320016
3110	NC_009443	GTGGCG	2	12	151296	151307	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	146320016
3111	NC_009443	TGG	2	6	151345	151350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
3112	NC_009443	TCC	2	6	151376	151381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320016
3113	NC_009443	TGG	2	6	151396	151401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320016
3114	NC_009443	CCG	2	6	151418	151423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146320016
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3118	NC_009443	CAGT	2	8	151876	151883	25 %	25 %	25 %	25 %	146320017
3119	NC_009443	ATT	3	9	151890	151898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320017
3120	NC_009443	GCT	2	6	152024	152029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320017
3121	NC_009443	GA	3	6	152065	152070	50 %	0 %	50 %	0 %	146320017
3122	NC_009443	ACT	2	6	152136	152141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320017
3123	NC_009443	AG	3	6	152175	152180	50 %	0 %	50 %	0 %	146320017
3124	NC_009443	TGA	2	6	152185	152190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320017
3125	NC_009443	AGAT	2	8	152192	152199	50 %	25 %	25 %	0 %	146320017
3126	NC_009443	CCT	2	6	152218	152223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320018
3127	NC_009443	GCCA	2	8	152283	152290	25 %	0 %	25 %	50 %	146320018
3128	NC_009443	GCCA	2	8	152295	152302	25 %	0 %	25 %	50 %	146320018
3129	NC_009443	TGG	2	6	152312	152317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320018
3130	NC_009443	GGT	2	6	152318	152323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320018
3131	NC_009443	GAG	2	6	152373	152378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320018
3132	NC_009443	TTG	2	6	152382	152387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320018
3133	NC_009443	GGCTGT	2	12	152417	152428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	146320018
3134	NC_009443	GCT	2	6	152475	152480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320018
3135	NC_009443	GGC	2	6	152546	152551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320018
3136	NC_009443	GCGG	2	8	152552	152559	0 %	0 %	75 %	25 %	146320018
3137	NC_009443	GGAGTT	2	12	152564	152575	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320018
3138	NC_009443	GAT	2	6	152667	152672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320018
3139	NC_009443	GGGTC	2	10	152699	152708	0 %	20 %	60 %	20 %	146320018
3140	NC_009443	TTTC	2	8	152815	152822	0 %	75 %	0 %	25 %	146320018
3141	NC_009443	CAG	2	6	152865	152870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320018
3142	NC_009443	AAG	2	6	152949	152954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320018
3143	NC_009443	TGG	2	6	152983	152988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320018
3144	NC_009443	GCGG	2	8	152991	152998	0 %	0 %	75 %	25 %	146320018
3145	NC_009443	GCT	2	6	153033	153038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320018
3146	NC_009443	AGC	2	6	153110	153115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320018
3147	NC_009443	GCTG	2	8	153144	153151	0 %	25 %	50 %	25 %	146320018
3148	NC_009443	TTGG	2	8	153303	153310	0 %	50 %	50 %	0 %	146320019
3149	NC_009443	TTC	2	6	153321	153326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320019
3150	NC_009443	TAG	2	6	153347	153352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
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3152	NC_009443	GAT	2	6	153393	153398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
3153	NC_009443	TTG	2	6	153402	153407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320019
3154	NC_009443	AGT	2	6	153446	153451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
3155	NC_009443	ATC	2	6	153480	153485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320019
3156	NC_009443	TA	3	6	153537	153542	50 %	50 %	0 %	0 %	146320019
3157	NC_009443	T	6	6	153641	153646	0 %	100 %	0 %	0 %	146320019
3158	NC_009443	GAT	2	6	153647	153652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
3159	NC_009443	TTTCA	2	10	153669	153678	20 %	60 %	0 %	20 %	146320019
3160	NC_009443	GTT	2	6	153725	153730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320019
3161	NC_009443	CCTG	2	8	153742	153749	0 %	25 %	25 %	50 %	146320019
3162	NC_009443	GGT	2	6	153875	153880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320019
3163	NC_009443	GAT	2	6	153924	153929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320019
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3165	NC_009443	TTA	2	6	154033	154038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320019
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3167	NC_009443	A	6	6	154152	154157	100 %	0 %	0 %	0 %	146320020
3168	NC_009443	GTTATA	2	12	154217	154228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	146320020
3169	NC_009443	TCG	2	6	154245	154250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
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3171	NC_009443	TAT	2	6	154275	154280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320020
3172	NC_009443	GAA	2	6	154284	154289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320020
3173	NC_009443	CTTG	2	8	154308	154315	0 %	50 %	25 %	25 %	146320020
3174	NC_009443	CTG	2	6	154327	154332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
3175	NC_009443	AGT	2	6	154378	154383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
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3180	NC_009443	GAT	2	6	154795	154800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
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3183	NC_009443	CTA	2	6	154899	154904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320020
3184	NC_009443	TATC	2	8	154911	154918	25 %	50 %	0 %	25 %	146320020
3185	NC_009443	TGG	2	6	154923	154928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320020
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3187	NC_009443	TGA	2	6	154941	154946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
3188	NC_009443	TAC	2	6	154993	154998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320020
3189	NC_009443	A	6	6	155015	155020	100 %	0 %	0 %	0 %	146320020
3190	NC_009443	TGC	2	6	155220	155225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
3191	NC_009443	TGC	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320020
3192	NC_009443	CAAA	2	8	155357	155364	75 %	0 %	0 %	25 %	146320020
3193	NC_009443	TGG	2	6	155393	155398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320020
3194	NC_009443	AAC	2	6	155427	155432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320020
3195	NC_009443	GAA	2	6	155497	155502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320020
3196	NC_009443	ATG	2	6	155524	155529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320020
3197	NC_009443	TAGG	2	8	155554	155561	25 %	25 %	50 %	0 %	146320020
3198	NC_009443	TTC	2	6	155579	155584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3199	NC_009443	CTT	2	6	155592	155597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3200	NC_009443	GAA	2	6	155606	155611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320021
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3202	NC_009443	TGGGGA	2	12	155661	155672	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	146320021
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3204	NC_009443	ATT	2	6	155712	155717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320021
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3207	NC_009443	T	7	7	155953	155959	0 %	100 %	0 %	0 %	146320021
3208	NC_009443	TGG	2	6	155968	155973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320021
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3214	NC_009443	CCA	2	6	156430	156435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320021
3215	NC_009443	TGT	3	9	156442	156450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320021
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3217	NC_009443	A	6	6	156495	156500	100 %	0 %	0 %	0 %	146320021
3218	NC_009443	AGG	2	6	156518	156523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320021
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3220	NC_009443	ATGC	2	8	156562	156569	25 %	25 %	25 %	25 %	146320022
3221	NC_009443	CTT	2	6	156570	156575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320022
3222	NC_009443	TTTG	2	8	156607	156614	0 %	75 %	25 %	0 %	146320022
3223	NC_009443	TAA	2	6	156723	156728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320022
3224	NC_009443	TGA	2	6	156758	156763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320022
3225	NC_009443	TGGTC	2	10	156855	156864	0 %	40 %	40 %	20 %	146320022
3226	NC_009443	ATG	2	6	156874	156879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320022
3227	NC_009443	TGA	2	6	156914	156919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320022
3228	NC_009443	GGA	2	6	157032	157037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320022
3229	NC_009443	CTT	2	6	157074	157079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320022
3230	NC_009443	TTTG	2	8	157137	157144	0 %	75 %	25 %	0 %	146320022
3231	NC_009443	TGG	2	6	157344	157349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320022
3232	NC_009443	AGG	2	6	157358	157363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320022
3233	NC_009443	TTA	2	6	157421	157426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320023
3234	NC_009443	TAT	2	6	157471	157476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320023
3235	NC_009443	CTT	2	6	157499	157504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320023
3236	NC_009443	AGA	2	6	157551	157556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320023
3237	NC_009443	GAG	2	6	157747	157752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320023
3238	NC_009443	ATTT	2	8	157774	157781	25 %	75 %	0 %	0 %	146320023
3239	NC_009443	GTCTT	2	10	157810	157819	0 %	60 %	20 %	20 %	146320023
3240	NC_009443	AAC	2	6	157868	157873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320023
3241	NC_009443	TCTG	2	8	157885	157892	0 %	50 %	25 %	25 %	146320023
3242	NC_009443	TCA	2	6	158001	158006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320023
3243	NC_009443	TAG	2	6	158040	158045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320023
3244	NC_009443	A	6	6	158171	158176	100 %	0 %	0 %	0 %	146320023
3245	NC_009443	ATCC	2	8	158194	158201	25 %	25 %	0 %	50 %	146320023
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3482	NC_009443	GTAG	2	8	170360	170367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3493	NC_009443	GCA	2	6	171098	171103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320035
3494	NC_009443	ATCC	2	8	171141	171148	25 %	25 %	0 %	50 %	146320035
3495	NC_009443	AGG	2	6	171219	171224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320035
3496	NC_009443	ATT	2	6	171270	171275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320035
3497	NC_009443	AGA	2	6	171304	171309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320035
3498	NC_009443	TGGA	2	8	171310	171317	25 %	25 %	50 %	0 %	146320035
3499	NC_009443	AATC	2	8	171376	171383	50 %	25 %	0 %	25 %	146320035
3500	NC_009443	GAA	2	6	171407	171412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320035

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