MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009443	ACA	2	6	47654	47659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319891
1002	NC_009443	CAC	2	6	47664	47669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319891
1003	NC_009443	TGT	2	6	47689	47694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319891
1004	NC_009443	GTA	2	6	47750	47755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319891
1005	NC_009443	GCTT	2	8	47872	47879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_009443	CCTA	2	8	47958	47965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009443	TAT	2	6	47971	47976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009443	GAAGT	2	10	48053	48062	40 %	20 %	40 %	0 %	146319892
1009	NC_009443	TGA	2	6	48129	48134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319892
1010	NC_009443	TAT	2	6	48150	48155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319892
1011	NC_009443	GAA	2	6	48166	48171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319892
1012	NC_009443	TTATC	2	10	48183	48192	20 %	60 %	0 %	20 %	146319892
1013	NC_009443	GCTA	2	8	48225	48232	25 %	25 %	25 %	25 %	146319892
1014	NC_009443	TC	3	6	48244	48249	0 %	50 %	0 %	50 %	146319892
1015	NC_009443	TTG	2	6	48262	48267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319892
1016	NC_009443	ATT	2	6	48275	48280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319892
1017	NC_009443	TAATC	2	10	48291	48300	40 %	40 %	0 %	20 %	146319892
1018	NC_009443	GGA	2	6	48367	48372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319892
1019	NC_009443	ATG	2	6	48426	48431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319893
1020	NC_009443	TAT	2	6	48442	48447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319893
1021	NC_009443	TC	3	6	48500	48505	0 %	50 %	0 %	50 %	146319893
1022	NC_009443	TTG	3	9	48519	48527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319893
1023	NC_009443	TCAAT	2	10	48550	48559	40 %	40 %	0 %	20 %	146319893
1024	NC_009443	CAG	2	6	48601	48606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319893
1025	NC_009443	CAA	2	6	48616	48621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319893
1026	NC_009443	GAT	2	6	48708	48713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319893
1027	NC_009443	TTG	2	6	48766	48771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319893
1028	NC_009443	TAT	2	6	48780	48785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319893
1029	NC_009443	TTATT	2	10	48803	48812	20 %	80 %	0 %	0 %	146319893
1030	NC_009443	CAG	2	6	48813	48818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319893
1031	NC_009443	AAGA	2	8	48828	48835	75 %	0 %	25 %	0 %	146319893
1032	NC_009443	ATCA	2	8	48859	48866	50 %	25 %	0 %	25 %	146319894
1033	NC_009443	TTG	2	6	48941	48946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319894
1034	NC_009443	A	6	6	48957	48962	100 %	0 %	0 %	0 %	146319894
1035	NC_009443	TGAT	2	8	49088	49095	25 %	50 %	25 %	0 %	146319894
1036	NC_009443	A	6	6	49159	49164	100 %	0 %	0 %	0 %	146319894
1037	NC_009443	AAC	2	6	49256	49261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319894
1038	NC_009443	ATTG	2	8	49353	49360	25 %	50 %	25 %	0 %	146319894
1039	NC_009443	GT	3	6	49643	49648	0 %	50 %	50 %	0 %	146319894
1040	NC_009443	ATTG	2	8	49662	49669	25 %	50 %	25 %	0 %	146319894
1041	NC_009443	GAAA	2	8	49698	49705	75 %	0 %	25 %	0 %	146319894
1042	NC_009443	TTTA	2	8	49812	49819	25 %	75 %	0 %	0 %	146319895
1043	NC_009443	TTG	2	6	49891	49896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146319895
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1048	NC_009443	CAA	2	6	50068	50073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319895
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1050	NC_009443	AG	3	6	50180	50185	50 %	0 %	50 %	0 %	146319895
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1052	NC_009443	GAT	3	9	50315	50323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319895
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1056	NC_009443	ATT	2	6	50433	50438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319895
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1062	NC_009443	GTA	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319896
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1068	NC_009443	TGA	2	6	50906	50911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319896
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1083	NC_009443	GTTG	2	8	51465	51472	0 %	50 %	50 %	0 %	146319896
1084	NC_009443	CTA	2	6	51476	51481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319896
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1088	NC_009443	GATT	2	8	51704	51711	25 %	50 %	25 %	0 %	146319896
1089	NC_009443	CT	3	6	51734	51739	0 %	50 %	0 %	50 %	146319896
1090	NC_009443	TAG	2	6	51839	51844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319896
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1092	NC_009443	ATTT	2	8	51955	51962	25 %	75 %	0 %	0 %	146319896
1093	NC_009443	TCA	2	6	52137	52142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319896
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1095	NC_009443	GA	3	6	52156	52161	50 %	0 %	50 %	0 %	146319896
1096	NC_009443	ATC	2	6	52163	52168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319896
1097	NC_009443	GACC	2	8	52226	52233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_009443	AGTCTA	2	12	52234	52245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1099	NC_009443	TAA	3	9	52254	52262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_009443	TGA	2	6	52273	52278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_009443	ATAG	2	8	52294	52301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_009443	GAGAA	2	10	52302	52311	60 %	0 %	40 %	0 %	146319897
1103	NC_009443	AAAC	2	8	52314	52321	75 %	0 %	0 %	25 %	146319897
1104	NC_009443	GGA	2	6	52341	52346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319897
1105	NC_009443	AG	3	6	52353	52358	50 %	0 %	50 %	0 %	146319897
1106	NC_009443	GAA	2	6	52380	52385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319897
1107	NC_009443	AT	3	6	52397	52402	50 %	50 %	0 %	0 %	146319897
1108	NC_009443	GAA	2	6	52436	52441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319897
1109	NC_009443	GAG	2	6	52476	52481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319897
1110	NC_009443	GAAT	2	8	52534	52541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009443	TA	3	6	52712	52717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009443	TGA	2	6	52925	52930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319898
1113	NC_009443	ACC	2	6	52977	52982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146319898
1114	NC_009443	TGG	2	6	53062	53067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319898
1115	NC_009443	GAG	2	6	53139	53144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319898
1116	NC_009443	CAT	2	6	53180	53185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319898
1117	NC_009443	GCC	2	6	53228	53233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146319898
1118	NC_009443	CGG	2	6	53359	53364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146319898
1119	NC_009443	GCT	2	6	53394	53399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319898
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1122	NC_009443	GAG	2	6	53646	53651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319898
1123	NC_009443	GGA	2	6	53663	53668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146319898
1124	NC_009443	CAG	2	6	53691	53696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146319898
1125	NC_009443	GCGGAC	2	12	53708	53719	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146319898
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