MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009443	TAA	2	6	267368	267373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320122
5502	NC_009443	GAAA	2	8	267374	267381	75 %	0 %	25 %	0 %	146320122
5503	NC_009443	CTT	2	6	267387	267392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320122
5504	NC_009443	GAA	2	6	267393	267398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320122
5505	NC_009443	AGC	2	6	267635	267640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5506	NC_009443	GGT	2	6	267771	267776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320122
5507	NC_009443	CAT	2	6	267805	267810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5508	NC_009443	ATA	2	6	267907	267912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320122
5509	NC_009443	ATC	2	6	268047	268052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5510	NC_009443	TCG	2	6	268067	268072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5511	NC_009443	TAA	2	6	268073	268078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320122
5512	NC_009443	GTT	2	6	268080	268085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320122
5513	NC_009443	TCT	2	6	268093	268098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320122
5514	NC_009443	ATC	2	6	268176	268181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5515	NC_009443	GGT	3	9	268188	268196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320122
5516	NC_009443	TGC	2	6	268208	268213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5517	NC_009443	AAC	2	6	268237	268242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320122
5518	NC_009443	AAC	2	6	268404	268409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320122
5519	NC_009443	ACT	2	6	268429	268434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5520	NC_009443	CAG	2	6	268498	268503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5521	NC_009443	GAA	2	6	268628	268633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320122
5522	NC_009443	TGG	2	6	268739	268744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320122
5523	NC_009443	ACT	2	6	268849	268854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5524	NC_009443	TCT	2	6	268889	268894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320122
5525	NC_009443	AGA	2	6	268916	268921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320122
5526	NC_009443	GCA	2	6	268929	268934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5527	NC_009443	CGA	2	6	269003	269008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5528	NC_009443	CTT	2	6	269043	269048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320122
5529	NC_009443	ATC	2	6	269112	269117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5530	NC_009443	CTA	2	6	269126	269131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320122
5531	NC_009443	TAGG	2	8	269317	269324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_009443	AGT	2	6	269325	269330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_009443	TTGT	2	8	269422	269429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_009443	TGG	2	6	269440	269445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_009443	TCTA	2	8	269507	269514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5536	NC_009443	TAGAA	2	10	269543	269552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_009443	A	6	6	269551	269556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_009443	T	6	6	269561	269566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_009443	ATCA	2	8	269592	269599	50 %	25 %	0 %	25 %	146320123
5540	NC_009443	CGAC	2	8	269655	269662	25 %	0 %	25 %	50 %	146320123
5541	NC_009443	GGT	2	6	269663	269668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320123
5542	NC_009443	CTT	2	6	269727	269732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320123
5543	NC_009443	GAT	2	6	269771	269776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320123
5544	NC_009443	ACT	2	6	269796	269801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320123
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5546	NC_009443	GGCGAC	2	12	269947	269958	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	146320123
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5548	NC_009443	CA	3	6	270055	270060	50 %	0 %	0 %	50 %	146320123
5549	NC_009443	TCT	2	6	270069	270074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320123
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5553	NC_009443	GCG	2	6	270341	270346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320123
5554	NC_009443	CAAA	2	8	270411	270418	75 %	0 %	0 %	25 %	146320123
5555	NC_009443	ACA	2	6	270458	270463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320123
5556	NC_009443	CTT	2	6	270477	270482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_009443	ACC	2	6	270523	270528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320124
5558	NC_009443	GTCC	2	8	270530	270537	0 %	25 %	25 %	50 %	146320124
5559	NC_009443	TCT	2	6	270553	270558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320124
5560	NC_009443	AGCTG	2	10	270609	270618	20 %	20 %	40 %	20 %	146320124
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5562	NC_009443	GAA	3	9	270706	270714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320124
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5564	NC_009443	CGT	2	6	271008	271013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320124
5565	NC_009443	ATTT	2	8	271068	271075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_009443	GTTT	2	8	271101	271108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_009443	TTAAA	2	10	271121	271130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_009443	TA	3	6	271160	271165	50 %	50 %	0 %	0 %	146320125
5569	NC_009443	GAT	2	6	271187	271192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320125
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5571	NC_009443	A	6	6	271227	271232	100 %	0 %	0 %	0 %	146320125
5572	NC_009443	ATT	2	6	271326	271331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320125
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5577	NC_009443	CGG	3	9	271558	271566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320126
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5579	NC_009443	CTA	2	6	271619	271624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320126
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5583	NC_009443	TGA	3	9	272122	272130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320126
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5589	NC_009443	TCTA	2	8	272487	272494	25 %	50 %	0 %	25 %	146320126
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5592	NC_009443	TGA	2	6	272612	272617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320126
5593	NC_009443	CAG	2	6	272646	272651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320126
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5595	NC_009443	TCA	3	9	272782	272790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320126
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5597	NC_009443	GGAG	2	8	272846	272853	25 %	0 %	75 %	0 %	146320126
5598	NC_009443	CAA	2	6	272916	272921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320126
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5602	NC_009443	TTTGC	2	10	273032	273041	0 %	60 %	20 %	20 %	146320127
5603	NC_009443	GGT	2	6	273054	273059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320127
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5605	NC_009443	GGC	2	6	273225	273230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320127
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5612	NC_009443	GA	3	6	273658	273663	50 %	0 %	50 %	0 %	146320127
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5747	NC_009443	GTC	2	6	280178	280183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320133
5748	NC_009443	CA	3	6	280235	280240	50 %	0 %	0 %	50 %	146320133
5749	NC_009443	TGG	2	6	280293	280298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320133
5750	NC_009443	ATGC	2	8	280370	280377	25 %	25 %	25 %	25 %	146320133
5751	NC_009443	AAC	2	6	280378	280383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320133
5752	NC_009443	CT	3	6	280385	280390	0 %	50 %	0 %	50 %	146320133
5753	NC_009443	GATG	2	8	280534	280541	25 %	25 %	50 %	0 %	146320133
5754	NC_009443	TAG	2	6	280545	280550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320133
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5756	NC_009443	ATC	2	6	280583	280588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320133
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5762	NC_009443	TTGA	2	8	280899	280906	25 %	50 %	25 %	0 %	146320134
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5779	NC_009443	TCA	2	6	281957	281962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320135
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5793	NC_009443	CAA	2	6	282890	282895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5834	NC_009443	TTGA	2	8	285249	285256	25 %	50 %	25 %	0 %	146320137
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5860	NC_009443	TA	3	6	286539	286544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5861	NC_009443	AGA	2	6	286580	286585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5863	NC_009443	AGA	2	6	286678	286683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5864	NC_009443	GAT	2	6	286783	286788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5869	NC_009443	GA	3	6	286961	286966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5994	NC_009443	CTC	2	6	292913	292918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5995	NC_009443	GCCTA	2	10	292949	292958	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5998	NC_009443	TAA	2	6	293062	293067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_009443	GAAAG	2	10	293134	293143	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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