MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 98HAH33

Total Repeats: 42515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009443	GACA	2	8	244120	244127	50 %	0 %	25 %	25 %	146320098
5002	NC_009443	GAA	2	6	244193	244198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320098
5003	NC_009443	TA	3	6	244212	244217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_009443	A	6	6	244219	244224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_009443	ACC	2	6	244332	244337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320099
5006	NC_009443	AG	3	6	244378	244383	50 %	0 %	50 %	0 %	146320099
5007	NC_009443	CAG	2	6	244424	244429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320099
5008	NC_009443	GATA	2	8	244447	244454	50 %	25 %	25 %	0 %	146320099
5009	NC_009443	TCCAT	2	10	244618	244627	20 %	40 %	0 %	40 %	146320099
5010	NC_009443	GTT	2	6	244674	244679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320099
5011	NC_009443	GAG	3	9	244739	244747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320099
5012	NC_009443	TCAA	2	8	244935	244942	50 %	25 %	0 %	25 %	146320099
5013	NC_009443	GAA	2	6	244961	244966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320099
5014	NC_009443	CAT	2	6	244991	244996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320099
5015	NC_009443	AT	3	6	245028	245033	50 %	50 %	0 %	0 %	146320099
5016	NC_009443	TTC	2	6	245034	245039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320099
5017	NC_009443	ACG	2	6	245064	245069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320099
5018	NC_009443	CTTGG	2	10	245070	245079	0 %	40 %	40 %	20 %	146320099
5019	NC_009443	AGC	2	6	245088	245093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320099
5020	NC_009443	A	6	6	245322	245327	100 %	0 %	0 %	0 %	146320100
5021	NC_009443	AAG	2	6	245332	245337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320100
5022	NC_009443	TGA	2	6	245434	245439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320100
5023	NC_009443	AG	3	6	245513	245518	50 %	0 %	50 %	0 %	146320100
5024	NC_009443	TCT	2	6	245587	245592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320100
5025	NC_009443	TAG	2	6	245619	245624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320100
5026	NC_009443	GAT	2	6	245634	245639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320100
5027	NC_009443	AT	3	6	245638	245643	50 %	50 %	0 %	0 %	146320100
5028	NC_009443	GTA	2	6	245644	245649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320100
5029	NC_009443	GAA	2	6	245688	245693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320100
5030	NC_009443	AG	3	6	245711	245716	50 %	0 %	50 %	0 %	146320100
5031	NC_009443	AGAA	2	8	245755	245762	75 %	0 %	25 %	0 %	146320100
5032	NC_009443	TCA	2	6	245783	245788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320100
5033	NC_009443	CTC	2	6	245830	245835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146320100
5034	NC_009443	AAT	2	6	245895	245900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320101
5035	NC_009443	ATC	2	6	245971	245976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320101
5036	NC_009443	GAGAA	2	10	246035	246044	60 %	0 %	40 %	0 %	146320101
5037	NC_009443	CTT	2	6	246100	246105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320101
5038	NC_009443	GGT	2	6	246178	246183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320101
5039	NC_009443	TGGT	2	8	246252	246259	0 %	50 %	50 %	0 %	146320101
5040	NC_009443	A	7	7	246266	246272	100 %	0 %	0 %	0 %	146320101
5041	NC_009443	TGG	2	6	246284	246289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320101
5042	NC_009443	ATA	2	6	246356	246361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320101
5043	NC_009443	TCAA	2	8	246380	246387	50 %	25 %	0 %	25 %	146320101
5044	NC_009443	CAT	2	6	246423	246428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320101
5045	NC_009443	TCCAA	2	10	246471	246480	40 %	20 %	0 %	40 %	146320101
5046	NC_009443	TGG	3	9	246606	246614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320101
5047	NC_009443	GAT	2	6	246646	246651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320101
5048	NC_009443	TTTTCC	2	12	246652	246663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320101
5049	NC_009443	CAG	2	6	246687	246692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320101
5050	NC_009443	ATCAT	2	10	246794	246803	40 %	40 %	0 %	20 %	146320101
5051	NC_009443	TTA	2	6	246897	246902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320102
5052	NC_009443	AT	3	6	246914	246919	50 %	50 %	0 %	0 %	146320102
5053	NC_009443	GAG	2	6	246921	246926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320102
5054	NC_009443	GAA	2	6	246967	246972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320102
5055	NC_009443	TGC	2	6	246990	246995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320102
5056	NC_009443	CAA	2	6	247056	247061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320102
5057	NC_009443	ATG	2	6	247170	247175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320102
5058	NC_009443	CAT	2	6	247188	247193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320102
5059	NC_009443	CAG	2	6	247299	247304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320102
5060	NC_009443	GT	3	6	247315	247320	0 %	50 %	50 %	0 %	146320102
5061	NC_009443	TGT	3	9	247318	247326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320102
5062	NC_009443	CAGG	2	8	247351	247358	25 %	0 %	50 %	25 %	146320102
5063	NC_009443	GTTC	2	8	247388	247395	0 %	50 %	25 %	25 %	146320102
5064	NC_009443	TTC	2	6	247461	247466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_009443	A	6	6	247569	247574	100 %	0 %	0 %	0 %	146320103
5066	NC_009443	TCAA	2	8	247693	247700	50 %	25 %	0 %	25 %	146320103
5067	NC_009443	TGA	2	6	247742	247747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320103
5068	NC_009443	TGG	2	6	247750	247755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320103
5069	NC_009443	AG	3	6	247766	247771	50 %	0 %	50 %	0 %	146320103
5070	NC_009443	GAA	2	6	247824	247829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320103
5071	NC_009443	ACT	2	6	247834	247839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320103
5072	NC_009443	TCA	2	6	247846	247851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320103
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5074	NC_009443	TTG	2	6	247948	247953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320103
5075	NC_009443	GA	3	6	248048	248053	50 %	0 %	50 %	0 %	146320103
5076	NC_009443	GGC	2	6	248075	248080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146320103
5077	NC_009443	GACT	2	8	248149	248156	25 %	25 %	25 %	25 %	146320103
5078	NC_009443	TCA	2	6	248350	248355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320103
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5080	NC_009443	CAAT	2	8	248414	248421	50 %	25 %	0 %	25 %	146320103
5081	NC_009443	GCAG	2	8	248423	248430	25 %	0 %	50 %	25 %	146320103
5082	NC_009443	AAC	2	6	248437	248442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320103
5083	NC_009443	CTG	2	6	248464	248469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320103
5084	NC_009443	ATCA	2	8	248526	248533	50 %	25 %	0 %	25 %	146320103
5085	NC_009443	GGA	2	6	248559	248564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146320103
5086	NC_009443	ACTCT	2	10	248578	248587	20 %	40 %	0 %	40 %	146320103
5087	NC_009443	TTG	2	6	248628	248633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320103
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5089	NC_009443	CAGC	2	8	248656	248663	25 %	0 %	25 %	50 %	146320103
5090	NC_009443	TTGG	2	8	248724	248731	0 %	50 %	50 %	0 %	146320103
5091	NC_009443	TGGCA	2	10	248834	248843	20 %	20 %	40 %	20 %	146320103
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5100	NC_009443	GTG	2	6	249271	249276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320103
5101	NC_009443	CTCAG	2	10	249339	249348	20 %	20 %	20 %	40 %	146320103
5102	NC_009443	CAA	2	6	249354	249359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320103
5103	NC_009443	GTC	2	6	249366	249371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320103
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5106	NC_009443	AGC	2	6	249611	249616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320103
5107	NC_009443	TTC	2	6	249634	249639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320103
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5109	NC_009443	TGG	2	6	249730	249735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320103
5110	NC_009443	TAC	2	6	249781	249786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320103
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5112	NC_009443	TAG	2	6	249914	249919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320103
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5114	NC_009443	TCT	2	6	249943	249948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320103
5115	NC_009443	TAG	2	6	249949	249954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320103
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5117	NC_009443	ATTG	2	8	250069	250076	25 %	50 %	25 %	0 %	146320104
5118	NC_009443	TGG	2	6	250083	250088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320104
5119	NC_009443	TAGGGT	2	12	250126	250137	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	146320104
5120	NC_009443	TAAG	2	8	250219	250226	50 %	25 %	25 %	0 %	146320104
5121	NC_009443	TC	3	6	250242	250247	0 %	50 %	0 %	50 %	146320104
5122	NC_009443	TAG	2	6	250268	250273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146320104
5123	NC_009443	CTA	2	6	250287	250292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146320104
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5163	NC_009443	TA	3	6	252252	252257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5167	NC_009443	AGT	2	6	252390	252395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_009443	TTC	2	6	255003	255008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320110
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5235	NC_009443	TTTTTC	2	12	255398	255409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5236	NC_009443	TA	3	6	255423	255428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_009443	TCTGC	2	10	255435	255444	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5241	NC_009443	AGTTG	2	10	255778	255787	20 %	40 %	40 %	0 %	146320111
5242	NC_009443	TTG	2	6	255863	255868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320111
5243	NC_009443	TTGA	2	8	255938	255945	25 %	50 %	25 %	0 %	146320111
5244	NC_009443	TAT	2	6	256007	256012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320111
5245	NC_009443	TCGG	2	8	256031	256038	0 %	25 %	50 %	25 %	146320111
5246	NC_009443	GTT	2	6	256058	256063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146320111
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5249	NC_009443	TTC	2	6	256088	256093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320111
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5349	NC_009443	CAAA	2	8	260544	260551	75 %	0 %	0 %	25 %	146320115
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5362	NC_009443	A	7	7	261215	261221	100 %	0 %	0 %	0 %	146320115
5363	NC_009443	TAA	2	6	261225	261230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320115
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5366	NC_009443	GGAA	2	8	261299	261306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_009443	GAA	2	6	261432	261437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320116
5368	NC_009443	CTG	3	9	261479	261487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146320116
5369	NC_009443	AAT	2	6	261523	261528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146320116
5370	NC_009443	TAT	2	6	261540	261545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146320116
5371	NC_009443	AACCAA	2	12	261644	261655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146320116
5372	NC_009443	CTGC	2	8	261673	261680	0 %	25 %	25 %	50 %	146320116
5373	NC_009443	CCA	2	6	261703	261708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320116
5374	NC_009443	ACC	2	6	261831	261836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320116
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5377	NC_009443	ACC	2	6	262131	262136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146320116
5378	NC_009443	AGC	2	6	262175	262180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320116
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5386	NC_009443	ATCT	2	8	262878	262885	25 %	50 %	0 %	25 %	146320117
5387	NC_009443	ATTT	2	8	262955	262962	25 %	75 %	0 %	0 %	146320117
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5389	NC_009443	TGT	2	6	263042	263047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5390	NC_009443	T	6	6	263097	263102	0 %	100 %	0 %	0 %	146320118
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5402	NC_009443	TCC	2	6	263405	263410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5404	NC_009443	GTAAA	2	10	263497	263506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5406	NC_009443	T	6	6	263530	263535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_009443	A	6	6	266414	266419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_009443	AAATA	2	10	266438	266447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5474	NC_009443	A	6	6	266447	266452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5475	NC_009443	TAG	2	6	266453	266458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5490	NC_009443	ATTG	2	8	266918	266925	25 %	50 %	25 %	0 %	146320122
5491	NC_009443	TCT	2	6	266979	266984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146320122
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5496	NC_009443	TGG	2	6	267125	267130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146320122
5497	NC_009443	GTGC	2	8	267141	267148	0 %	25 %	50 %	25 %	146320122
5498	NC_009443	GCA	2	6	267234	267239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146320122
5499	NC_009443	AAG	2	6	267313	267318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146320122
5500	NC_009443	ACTT	2	8	267357	267364	25 %	50 %	0 %	25 %	146320122

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