MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 2444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	146319849
2	NC_009442	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	146319849
3	NC_009442	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	146317664
4	NC_009442	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	146317664
5	NC_009442	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009442	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
7	NC_009442	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
8	NC_009442	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
9	NC_009442	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	146317665
10	NC_009442	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
11	NC_009442	AG	3	6	4822	4827	50 %	0 %	50 %	0 %	146317668
12	NC_009442	TC	3	6	6906	6911	0 %	50 %	0 %	50 %	146317670
13	NC_009442	CA	3	6	7354	7359	50 %	0 %	0 %	50 %	146317670
14	NC_009442	AC	3	6	8069	8074	50 %	0 %	0 %	50 %	146317670
15	NC_009442	GC	3	6	8194	8199	0 %	0 %	50 %	50 %	146317670
16	NC_009442	GA	3	6	8688	8693	50 %	0 %	50 %	0 %	146317670
17	NC_009442	CT	3	6	8835	8840	0 %	50 %	0 %	50 %	146317670
18	NC_009442	TA	3	6	11150	11155	50 %	50 %	0 %	0 %	146317674
19	NC_009442	AT	3	6	11273	11278	50 %	50 %	0 %	0 %	146317674
20	NC_009442	TA	3	6	11578	11583	50 %	50 %	0 %	0 %	146317674
21	NC_009442	AG	3	6	11989	11994	50 %	0 %	50 %	0 %	146317675
22	NC_009442	CT	3	6	12591	12596	0 %	50 %	0 %	50 %	146317675
23	NC_009442	AT	3	6	12782	12787	50 %	50 %	0 %	0 %	146317675
24	NC_009442	TA	4	8	13063	13070	50 %	50 %	0 %	0 %	146317675
25	NC_009442	AT	3	6	13371	13376	50 %	50 %	0 %	0 %	146317676
26	NC_009442	TC	3	6	15523	15528	0 %	50 %	0 %	50 %	146317677
27	NC_009442	GA	3	6	16309	16314	50 %	0 %	50 %	0 %	146317678
28	NC_009442	AT	3	6	17680	17685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009442	CT	3	6	17711	17716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009442	AC	3	6	18201	18206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009442	AC	3	6	18370	18375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009442	AG	3	6	19275	19280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009442	CT	3	6	19389	19394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009442	TC	3	6	19767	19772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009442	TG	3	6	20158	20163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009442	GA	3	6	20309	20314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009442	GA	3	6	20604	20609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009442	CT	3	6	20720	20725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009442	GA	3	6	20927	20932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009442	GA	3	6	21742	21747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009442	TA	3	6	22946	22951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009442	AT	3	6	23037	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009442	AT	3	6	23563	23568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009442	GA	3	6	24959	24964	50 %	0 %	50 %	0 %	146317680
45	NC_009442	TA	3	6	26319	26324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009442	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009442	CT	3	6	27688	27693	0 %	50 %	0 %	50 %	146317682
48	NC_009442	TA	3	6	28602	28607	50 %	50 %	0 %	0 %	146317683
49	NC_009442	CT	3	6	28899	28904	0 %	50 %	0 %	50 %	146317683
50	NC_009442	AG	3	6	30356	30361	50 %	0 %	50 %	0 %	146317684
51	NC_009442	TG	3	6	30661	30666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009442	AG	3	6	34471	34476	50 %	0 %	50 %	0 %	146317687
53	NC_009442	CT	3	6	36536	36541	0 %	50 %	0 %	50 %	146317688
54	NC_009442	TG	3	6	36933	36938	0 %	50 %	50 %	0 %	146317689
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60	NC_009442	CT	3	6	44160	44165	0 %	50 %	0 %	50 %	146317698
61	NC_009442	AT	3	6	44394	44399	50 %	50 %	0 %	0 %	146317698
62	NC_009442	AT	3	6	44492	44497	50 %	50 %	0 %	0 %	146317698
63	NC_009442	TA	4	8	44602	44609	50 %	50 %	0 %	0 %	146317698
64	NC_009442	CT	3	6	45758	45763	0 %	50 %	0 %	50 %	146317699
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67	NC_009442	TC	3	6	48247	48252	0 %	50 %	0 %	50 %	146317703
68	NC_009442	TC	3	6	48503	48508	0 %	50 %	0 %	50 %	146317704
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70	NC_009442	AG	3	6	50183	50188	50 %	0 %	50 %	0 %	146317706
71	NC_009442	GA	3	6	51154	51159	50 %	0 %	50 %	0 %	146317708
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73	NC_009442	GA	3	6	52161	52166	50 %	0 %	50 %	0 %	146317708
74	NC_009442	AG	3	6	52358	52363	50 %	0 %	50 %	0 %	146317709
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77	NC_009442	TA	3	6	54229	54234	50 %	50 %	0 %	0 %	146317711
78	NC_009442	TC	3	6	55203	55208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009442	AT	3	6	55371	55376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009442	CT	3	6	55505	55510	0 %	50 %	0 %	50 %	146317713
81	NC_009442	AT	3	6	56058	56063	50 %	50 %	0 %	0 %	146317713
82	NC_009442	AG	3	6	56264	56269	50 %	0 %	50 %	0 %	146317713
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90	NC_009442	AG	3	6	63968	63973	50 %	0 %	50 %	0 %	146317719
91	NC_009442	CA	3	6	65419	65424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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104	NC_009442	AC	3	6	78815	78820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009442	CA	3	6	79138	79143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009442	CA	3	6	79220	79225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009442	CG	3	6	81008	81013	0 %	0 %	50 %	50 %	146317746
108	NC_009442	AC	3	6	81528	81533	50 %	0 %	0 %	50 %	146317747
109	NC_009442	TC	3	6	81797	81802	0 %	50 %	0 %	50 %	146317748
110	NC_009442	GA	3	6	84228	84233	50 %	0 %	50 %	0 %	146317751
111	NC_009442	AG	3	6	84569	84574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009442	CA	3	6	85692	85697	50 %	0 %	0 %	50 %	146317754
113	NC_009442	CT	3	6	85884	85889	0 %	50 %	0 %	50 %	146317755
114	NC_009442	TA	3	6	87405	87410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009442	AT	3	6	88469	88474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009442	CT	3	6	88500	88505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009442	AC	3	6	88990	88995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009442	AC	3	6	89159	89164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009442	AG	3	6	90064	90069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_009442	GA	3	6	91098	91103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009442	GA	3	6	91394	91399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009442	CT	3	6	91510	91515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009442	GA	3	6	91717	91722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_009442	GA	3	6	93446	93451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009442	CT	4	8	93515	93522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_009442	AT	3	6	94942	94947	50 %	50 %	0 %	0 %	146317758
132	NC_009442	AT	3	6	95387	95392	50 %	50 %	0 %	0 %	146317760
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134	NC_009442	TC	3	6	95895	95900	0 %	50 %	0 %	50 %	146317760
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136	NC_009442	AT	3	6	97944	97949	50 %	50 %	0 %	0 %	146317762
137	NC_009442	TA	3	6	98417	98422	50 %	50 %	0 %	0 %	146317763
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146	NC_009442	GT	3	6	110348	110353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009442	TA	3	6	110525	110530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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