MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 1619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	146319849
2	NC_009442	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	146319849
3	NC_009442	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	146317665
4	NC_009442	AAACA	2	10	5722	5731	80 %	0 %	0 %	20 %	146317669
5	NC_009442	TGTCT	2	10	6113	6122	0 %	60 %	20 %	20 %	146317669
6	NC_009442	GAGAT	2	10	6831	6840	40 %	20 %	40 %	0 %	146317670
7	NC_009442	TGAAA	2	10	9968	9977	60 %	20 %	20 %	0 %	146317671
8	NC_009442	CTATT	2	10	11205	11214	20 %	60 %	0 %	20 %	146317674
9	NC_009442	CTTTG	2	10	13434	13443	0 %	60 %	20 %	20 %	146317676
10	NC_009442	AACAG	2	10	13878	13887	60 %	0 %	20 %	20 %	146317677
11	NC_009442	CTTGT	2	10	15034	15043	0 %	60 %	20 %	20 %	146317677
12	NC_009442	CAAAC	2	10	16869	16878	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009442	ACAAA	2	10	16915	16924	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009442	TCGTG	2	10	18047	18056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009442	GTTAA	2	10	18926	18935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009442	ATTAT	2	10	22861	22870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009442	ATATT	2	10	23410	23419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009442	TTTAT	2	10	24441	24450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009442	AATGC	2	10	25407	25416	40 %	20 %	20 %	20 %	146317680
20	NC_009442	CTACG	2	10	30757	30766	20 %	20 %	20 %	40 %	146317686
21	NC_009442	GAACG	2	10	33043	33052	40 %	0 %	40 %	20 %	146317687
22	NC_009442	AAACC	2	10	33179	33188	60 %	0 %	0 %	40 %	146317687
23	NC_009442	ATTCT	2	10	34526	34535	20 %	60 %	0 %	20 %	146317687
24	NC_009442	GCCAT	2	10	35001	35010	20 %	20 %	20 %	40 %	146317687
25	NC_009442	AAATG	2	10	36087	36096	60 %	20 %	20 %	0 %	146317688
26	NC_009442	AGCAG	2	10	38719	38728	40 %	0 %	40 %	20 %	146317692
27	NC_009442	CTATT	2	10	38944	38953	20 %	60 %	0 %	20 %	146317692
28	NC_009442	CTATT	2	10	41506	41515	20 %	60 %	0 %	20 %	146317694
29	NC_009442	AGCGG	2	10	45792	45801	20 %	0 %	60 %	20 %	146317699
30	NC_009442	TTAGT	2	10	47408	47417	20 %	60 %	20 %	0 %	146317701
31	NC_009442	GAAGT	2	10	48055	48064	40 %	20 %	40 %	0 %	146317703
32	NC_009442	TTATC	2	10	48186	48195	20 %	60 %	0 %	20 %	146317703
33	NC_009442	TAATC	2	10	48294	48303	40 %	40 %	0 %	20 %	146317703
34	NC_009442	TCAAT	2	10	48553	48562	40 %	40 %	0 %	20 %	146317704
35	NC_009442	TTATT	2	10	48806	48815	20 %	80 %	0 %	0 %	146317704
36	NC_009442	GAGAA	2	10	52307	52316	60 %	0 %	40 %	0 %	146317709
37	NC_009442	GCAGA	2	10	53788	53797	40 %	0 %	40 %	20 %	146317711
38	NC_009442	GGGCT	2	10	54259	54268	0 %	20 %	60 %	20 %	146317711
39	NC_009442	TTTTG	2	10	55288	55297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009442	TGAAT	2	10	55882	55891	40 %	40 %	20 %	0 %	146317713
41	NC_009442	TTAAG	2	10	58297	58306	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009442	AGCAG	2	10	60022	60031	40 %	0 %	40 %	20 %	146317716
43	NC_009442	GCCCT	2	10	62844	62853	0 %	20 %	20 %	60 %	146317719
44	NC_009442	GTTTT	2	10	65347	65356	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009442	TTGCT	2	10	65943	65952	0 %	60 %	20 %	20 %	146317721
46	NC_009442	AGTCA	2	10	67829	67838	40 %	20 %	20 %	20 %	146317723
47	NC_009442	GTATC	2	10	69230	69239	20 %	40 %	20 %	20 %	146317725
48	NC_009442	TGGAT	2	10	71224	71233	20 %	40 %	40 %	0 %	146317729
49	NC_009442	TTATG	2	10	71434	71443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009442	AAATT	2	10	72326	72335	60 %	40 %	0 %	0 %	146317730
51	NC_009442	TGGCG	2	10	73333	73342	0 %	20 %	60 %	20 %	146317732
52	NC_009442	AAAAC	2	10	73893	73902	80 %	0 %	0 %	20 %	146317733
53	NC_009442	TACAC	2	10	74307	74316	40 %	20 %	0 %	40 %	146317734
54	NC_009442	GAAAA	2	10	75186	75195	80 %	0 %	20 %	0 %	162139882
55	NC_009442	GTCTT	2	10	75474	75483	0 %	60 %	20 %	20 %	146317736
56	NC_009442	TTTGG	2	10	75605	75614	0 %	60 %	40 %	0 %	146317736
57	NC_009442	AAGGA	2	10	78179	78188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009442	TAAGA	2	10	78937	78946	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009442	AGAAT	2	10	83725	83734	60 %	20 %	20 %	0 %	146317750
60	NC_009442	TAGTC	2	10	84510	84519	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009442	GAAAA	2	10	86050	86059	80 %	0 %	20 %	0 %	146317755
62	NC_009442	TGACT	2	10	86445	86454	20 %	40 %	20 %	20 %	146317755
63	NC_009442	TTTTA	2	10	87280	87289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009442	ACAAA	2	10	87704	87713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009442	TCGTG	2	10	88836	88845	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009442	GTTAA	2	10	89715	89724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009442	TTAAT	2	10	93425	93434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009442	TGTGA	2	10	94386	94395	20 %	40 %	40 %	0 %	146317758
69	NC_009442	CTTTC	2	10	95284	95293	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009442	TGCTT	2	10	95948	95957	0 %	60 %	20 %	20 %	146317760
71	NC_009442	CGCTC	2	10	97046	97055	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_009442	TTGTT	2	10	97153	97162	0 %	80 %	20 %	0 %	146317762
73	NC_009442	AATAT	2	10	98596	98605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009442	TTTCA	2	10	99412	99421	20 %	60 %	0 %	20 %	146317765
75	NC_009442	CTTCG	2	10	99655	99664	0 %	40 %	20 %	40 %	146317765
76	NC_009442	AAAAT	2	10	99789	99798	80 %	20 %	0 %	0 %	146317765
77	NC_009442	TTTTG	2	10	99968	99977	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	TTTTC	2	10	100576	100585	0 %	80 %	0 %	20 %	146317766
79	NC_009442	TTTGG	2	10	102872	102881	0 %	60 %	40 %	0 %	146317769
80	NC_009442	ATTGC	2	10	103337	103346	20 %	40 %	20 %	20 %	146317769
81	NC_009442	GCTTT	2	10	103568	103577	0 %	60 %	20 %	20 %	146317770
82	NC_009442	AGAAA	2	10	104026	104035	80 %	0 %	20 %	0 %	146317770
83	NC_009442	GACTT	2	10	105605	105614	20 %	40 %	20 %	20 %	146317771
84	NC_009442	CTGGG	2	10	109828	109837	0 %	20 %	60 %	20 %	146317778
85	NC_009442	AAGAA	2	10	114480	114489	80 %	0 %	20 %	0 %	146317780
86	NC_009442	CCGTT	2	10	115523	115532	0 %	40 %	20 %	40 %	146317780
87	NC_009442	GTCTG	2	10	118995	119004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009442	GGCCT	2	10	119063	119072	0 %	20 %	40 %	40 %	146317783
89	NC_009442	GTCAA	2	10	119160	119169	40 %	20 %	20 %	20 %	146317783
90	NC_009442	GCTTG	2	10	121011	121020	0 %	40 %	40 %	20 %	146317785
91	NC_009442	TGGTT	2	10	121139	121148	0 %	60 %	40 %	0 %	146317785
92	NC_009442	GGTCA	2	10	121438	121447	20 %	20 %	40 %	20 %	146317785
93	NC_009442	AAGGA	2	10	122528	122537	60 %	0 %	40 %	0 %	146317788
94	NC_009442	GGCAA	2	10	123087	123096	40 %	0 %	40 %	20 %	146317790
95	NC_009442	TTGGT	2	10	125477	125486	0 %	60 %	40 %	0 %	146317793
96	NC_009442	GAAAA	2	10	125939	125948	80 %	0 %	20 %	0 %	146317794
97	NC_009442	CCTTG	2	10	125992	126001	0 %	40 %	20 %	40 %	146317794
98	NC_009442	CTGGA	2	10	126880	126889	20 %	20 %	40 %	20 %	146317795
99	NC_009442	AGCAG	2	10	127236	127245	40 %	0 %	40 %	20 %	146317795
100	NC_009442	GCTCA	2	10	127344	127353	20 %	20 %	20 %	40 %	146317795
101	NC_009442	AATCA	2	10	127858	127867	60 %	20 %	0 %	20 %	146317796
102	NC_009442	AGGTG	2	10	128546	128555	20 %	20 %	60 %	0 %	146317796
103	NC_009442	CATGA	2	10	128919	128928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009442	GAAAG	2	10	130358	130367	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009442	ACTTT	2	10	132252	132261	20 %	60 %	0 %	20 %	146317802
106	NC_009442	CTATA	2	10	133276	133285	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009442	TAGCG	2	10	135350	135359	20 %	20 %	40 %	20 %	146317807
108	NC_009442	ATCAA	2	10	136511	136520	60 %	20 %	0 %	20 %	146317809
109	NC_009442	GAAGC	2	10	137000	137009	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009442	CGTAT	2	10	137783	137792	20 %	40 %	20 %	20 %	146317810
111	NC_009442	ATCCA	2	10	137874	137883	40 %	20 %	0 %	40 %	146317810
112	NC_009442	CAAGA	2	10	138650	138659	60 %	0 %	20 %	20 %	146317810
113	NC_009442	AAGCT	2	10	139080	139089	40 %	20 %	20 %	20 %	146317810
114	NC_009442	AAGAA	2	10	141340	141349	80 %	0 %	20 %	0 %	146317812
115	NC_009442	GCAGT	2	10	141630	141639	20 %	20 %	40 %	20 %	146317812
116	NC_009442	ATCCA	2	10	141741	141750	40 %	20 %	0 %	40 %	146317812
117	NC_009442	TACGA	2	10	142242	142251	40 %	20 %	20 %	20 %	146317812
118	NC_009442	TTAAG	2	10	142575	142584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009442	GTAAA	2	10	144055	144064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009442	GAAAA	2	10	146033	146042	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009442	CTATT	2	10	146059	146068	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009442	GTTTA	2	10	146238	146247	20 %	60 %	20 %	0 %	146317816
123	NC_009442	GCATG	2	10	147758	147767	20 %	20 %	40 %	20 %	146317818
124	NC_009442	AAAAT	2	10	148171	148180	80 %	20 %	0 %	0 %	146317818
125	NC_009442	ATAAA	2	10	148610	148619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009442	GGGTC	2	10	152795	152804	0 %	20 %	60 %	20 %	146317824
127	NC_009442	TTTCA	2	10	153765	153774	20 %	60 %	0 %	20 %	146317825
128	NC_009442	AAAAG	2	10	154358	154367	80 %	0 %	20 %	0 %	146317826
129	NC_009442	TGGTC	2	10	156953	156962	0 %	40 %	40 %	20 %	146317829
130	NC_009442	GTCTT	2	10	157908	157917	0 %	60 %	20 %	20 %	146317830
131	NC_009442	TTGGA	2	10	160424	160433	20 %	40 %	40 %	0 %	146317832
132	NC_009442	TCATC	2	10	161297	161306	20 %	40 %	0 %	40 %	146317834
133	NC_009442	CTTGG	2	10	161466	161475	0 %	40 %	40 %	20 %	146317834
134	NC_009442	AATTG	2	10	162126	162135	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009442	TTTTC	2	10	162485	162494	0 %	80 %	0 %	20 %	146317835
136	NC_009442	CACCT	2	10	163048	163057	20 %	20 %	0 %	60 %	146317835
137	NC_009442	AGACT	2	10	167834	167843	40 %	20 %	20 %	20 %	146317838
138	NC_009442	CATTG	2	10	171936	171945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_009442	ATACA	2	10	173002	173011	60 %	20 %	0 %	20 %	146317845
140	NC_009442	GGTTT	2	10	175160	175169	0 %	60 %	40 %	0 %	146317846
141	NC_009442	TTATC	2	10	176037	176046	20 %	60 %	0 %	20 %	146317847
142	NC_009442	CAAAT	2	10	178407	178416	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009442	TCTGG	2	10	179472	179481	0 %	40 %	40 %	20 %	146317849
144	NC_009442	TTCAA	2	10	180012	180021	40 %	40 %	0 %	20 %	146317849
145	NC_009442	TATAA	2	10	180857	180866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009442	TTGAT	2	10	183995	184004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009442	TGATT	2	10	184643	184652	20 %	60 %	20 %	0 %	146317853
148	NC_009442	GAAGC	2	10	186760	186769	40 %	0 %	40 %	20 %	146317854
149	NC_009442	TATTG	2	10	191256	191265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009442	GGAAA	2	10	192130	192139	60 %	0 %	40 %	0 %	146317857
151	NC_009442	CTGGT	2	10	192627	192636	0 %	40 %	40 %	20 %	146317858
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153	NC_009442	AGCAG	2	10	194736	194745	40 %	0 %	40 %	20 %	146317862
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155	NC_009442	TTTTG	2	10	196272	196281	0 %	80 %	20 %	0 %	146317866
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161	NC_009442	AGTAA	2	10	199784	199793	60 %	20 %	20 %	0 %	146317869
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164	NC_009442	AAGTT	2	10	205082	205091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009442	TTTGG	2	10	205329	205338	0 %	60 %	40 %	0 %	146317872
166	NC_009442	TCTAC	2	10	206109	206118	20 %	40 %	0 %	40 %	146317873
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168	NC_009442	ATTTT	2	10	207828	207837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009442	AGCAG	2	10	210396	210405	40 %	0 %	40 %	20 %	146317878
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172	NC_009442	CCATA	2	10	214437	214446	40 %	20 %	0 %	40 %	146317882
173	NC_009442	ATGAC	2	10	215825	215834	40 %	20 %	20 %	20 %	146317884
174	NC_009442	TTGAT	2	10	216440	216449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009442	ATTTA	2	10	216624	216633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_009442	AGCTC	2	10	217507	217516	20 %	20 %	20 %	40 %	146317885
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184	NC_009442	ATAAA	2	10	231209	231218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009442	TAATG	2	10	232398	232407	40 %	40 %	20 %	0 %	146317901
186	NC_009442	ATTTT	2	10	233660	233669	20 %	80 %	0 %	0 %	146317903
187	NC_009442	TAAAA	2	10	236094	236103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_009442	TCCAT	2	10	244771	244780	20 %	40 %	0 %	40 %	146317912
199	NC_009442	CTTGG	2	10	245223	245232	0 %	40 %	40 %	20 %	146317912
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202	NC_009442	ATCAT	2	10	246949	246958	40 %	40 %	0 %	20 %	146317915
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210	NC_009442	AGTTG	2	10	255929	255938	20 %	40 %	40 %	0 %	146317926
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214	NC_009442	TTTAG	2	10	260401	260410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
215	NC_009442	GTAAA	2	10	263643	263652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
216	NC_009442	TGACC	2	10	264651	264660	20 %	20 %	20 %	40 %	146317934
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219	NC_009442	AATTA	2	10	266585	266594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_009442	TAGAA	2	10	269689	269698	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_009442	AGCTG	2	10	270756	270765	20 %	20 %	40 %	20 %	229577509
223	NC_009442	TTAAA	2	10	271268	271277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
224	NC_009442	AGAAA	2	10	271367	271376	80 %	0 %	20 %	0 %	146317938
225	NC_009442	GGGCT	2	10	271614	271623	0 %	20 %	60 %	20 %	146317939
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242	NC_009442	TCTGT	2	10	288183	288192	0 %	60 %	20 %	20 %	146317952
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246	NC_009442	GAAAG	2	10	293280	293289	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
247	NC_009442	TGACA	2	10	297609	297618	40 %	20 %	20 %	20 %	146317961
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249	NC_009442	TGCCT	2	10	299125	299134	0 %	40 %	20 %	40 %	146317963
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255	NC_009442	CAAAT	2	10	305451	305460	60 %	20 %	0 %	20 %	146317972
256	NC_009442	CATTT	2	10	308350	308359	20 %	60 %	0 %	20 %	146317975
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259	NC_009442	AGAGC	2	10	309848	309857	40 %	0 %	40 %	20 %	146317977
260	NC_009442	GATTT	2	10	310177	310186	20 %	60 %	20 %	0 %	146317977
261	NC_009442	TTGGT	2	10	312114	312123	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_009442	TTCCT	2	10	312665	312674	0 %	60 %	0 %	40 %	146317980
263	NC_009442	CAATC	2	10	316617	316626	40 %	20 %	0 %	40 %	146317985
264	NC_009442	GTTTT	2	10	317438	317447	0 %	80 %	20 %	0 %	146317987
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266	NC_009442	ACAGA	2	10	318878	318887	60 %	0 %	20 %	20 %	146317988
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