MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 6172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	146319849
2	NC_009442	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	146319849
3	NC_009442	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	146319849
4	NC_009442	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	146319849
5	NC_009442	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	146319849
6	NC_009442	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	146317664
7	NC_009442	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	146317664
8	NC_009442	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	146317664
9	NC_009442	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	146317664
10	NC_009442	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	146317664
11	NC_009442	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	146317665
12	NC_009442	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	146317665
13	NC_009442	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	146317665
14	NC_009442	AATG	2	8	4189	4196	50 %	25 %	25 %	0 %	146317667
15	NC_009442	AAAT	2	8	4660	4667	75 %	25 %	0 %	0 %	146317668
16	NC_009442	CTTG	2	8	5248	5255	0 %	50 %	25 %	25 %	146317668
17	NC_009442	TTGG	2	8	5627	5634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009442	GATT	2	8	5680	5687	25 %	50 %	25 %	0 %	146317669
19	NC_009442	ATGA	2	8	5871	5878	50 %	25 %	25 %	0 %	146317669
20	NC_009442	ATCA	2	8	6278	6285	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
21	NC_009442	AATC	2	8	6302	6309	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
22	NC_009442	GTTT	2	8	6508	6515	0 %	75 %	25 %	0 %	146317670
23	NC_009442	TCAA	2	8	6535	6542	50 %	25 %	0 %	25 %	146317670
24	NC_009442	CTTA	2	8	7008	7015	25 %	50 %	0 %	25 %	146317670
25	NC_009442	GATG	2	8	7591	7598	25 %	25 %	50 %	0 %	146317670
26	NC_009442	GCAA	2	8	8223	8230	50 %	0 %	25 %	25 %	146317670
27	NC_009442	TCAG	2	8	9163	9170	25 %	25 %	25 %	25 %	146317670
28	NC_009442	ATTG	2	8	9400	9407	25 %	50 %	25 %	0 %	146317670
29	NC_009442	CTTG	2	8	9442	9449	0 %	50 %	25 %	25 %	146317670
30	NC_009442	AAGG	2	8	9721	9728	50 %	0 %	50 %	0 %	146317670
31	NC_009442	GAAG	2	8	9842	9849	50 %	0 %	50 %	0 %	146317671
32	NC_009442	TCTT	2	8	10172	10179	0 %	75 %	0 %	25 %	146317672
33	NC_009442	TGCC	2	8	10187	10194	0 %	25 %	25 %	50 %	146317672
34	NC_009442	CTAT	2	8	10651	10658	25 %	50 %	0 %	25 %	146317674
35	NC_009442	AGTG	2	8	11514	11521	25 %	25 %	50 %	0 %	146317674
36	NC_009442	AGAT	2	8	11822	11829	50 %	25 %	25 %	0 %	146317675
37	NC_009442	GAAG	2	8	12137	12144	50 %	0 %	50 %	0 %	146317675
38	NC_009442	GATT	2	8	12205	12212	25 %	50 %	25 %	0 %	146317675
39	NC_009442	GGCG	2	8	12216	12223	0 %	0 %	75 %	25 %	146317675
40	NC_009442	AGGC	2	8	12867	12874	25 %	0 %	50 %	25 %	146317675
41	NC_009442	TAAA	2	8	12901	12908	75 %	25 %	0 %	0 %	146317675
42	NC_009442	CTTG	2	8	14364	14371	0 %	50 %	25 %	25 %	146317677
43	NC_009442	TGTT	2	8	14438	14445	0 %	75 %	25 %	0 %	146317677
44	NC_009442	GTTC	2	8	14464	14471	0 %	50 %	25 %	25 %	146317677
45	NC_009442	GTCG	2	8	14533	14540	0 %	25 %	50 %	25 %	146317677
46	NC_009442	CAAC	2	8	14592	14599	50 %	0 %	0 %	50 %	146317677
47	NC_009442	ATGG	2	8	14611	14618	25 %	25 %	50 %	0 %	146317677
48	NC_009442	CAAC	2	8	14654	14661	50 %	0 %	0 %	50 %	146317677
49	NC_009442	TTGG	2	8	14719	14726	0 %	50 %	50 %	0 %	146317677
50	NC_009442	AAGA	2	8	14959	14966	75 %	0 %	25 %	0 %	146317677
51	NC_009442	ACAA	2	8	15342	15349	75 %	0 %	0 %	25 %	146317677
52	NC_009442	TTAT	2	8	15777	15784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009442	ATTA	2	8	16360	16367	50 %	50 %	0 %	0 %	146317678
54	NC_009442	AAAT	2	8	16631	16638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009442	GTGA	2	8	17380	17387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009442	AGCG	2	8	17551	17558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009442	AGCC	2	8	18433	18440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009442	GTAA	2	8	19012	19019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009442	TCAC	2	8	19069	19076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009442	GCGA	2	8	19168	19175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009442	ATTC	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009442	CTAA	2	8	20389	20396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009442	TAGG	2	8	21045	21052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009442	AATC	2	8	22192	22199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009442	GCGT	2	8	23103	23110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009442	TTTG	2	8	23632	23639	0 %	75 %	25 %	0 %	146317679
67	NC_009442	CAAA	2	8	24389	24396	75 %	0 %	0 %	25 %	146317679
68	NC_009442	GGTC	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009442	AACA	2	8	24896	24903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009442	TCTA	2	8	25040	25047	25 %	50 %	0 %	25 %	146317680
71	NC_009442	ATCA	2	8	25379	25386	50 %	25 %	0 %	25 %	146317680
72	NC_009442	TTTG	2	8	26291	26298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009442	ATTG	2	8	26803	26810	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
74	NC_009442	TTGA	2	8	27014	27021	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
75	NC_009442	TGAT	2	8	27027	27034	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
76	NC_009442	TTTG	2	8	27292	27299	0 %	75 %	25 %	0 %	146317681
77	NC_009442	ATTT	2	8	27354	27361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009442	TGCC	2	8	27764	27771	0 %	25 %	25 %	50 %	146317682
79	NC_009442	GCGG	2	8	28281	28288	0 %	0 %	75 %	25 %	146317682
80	NC_009442	GAAA	2	8	28436	28443	75 %	0 %	25 %	0 %	146317682
81	NC_009442	TGGG	2	8	29375	29382	0 %	25 %	75 %	0 %	146317684
82	NC_009442	TCAA	2	8	29414	29421	50 %	25 %	0 %	25 %	146317684
83	NC_009442	CGTG	2	8	29841	29848	0 %	25 %	50 %	25 %	146317684
84	NC_009442	TCAA	2	8	30094	30101	50 %	25 %	0 %	25 %	146317684
85	NC_009442	AACC	2	8	30143	30150	50 %	0 %	0 %	50 %	146317684
86	NC_009442	CTTG	2	8	30201	30208	0 %	50 %	25 %	25 %	146317684
87	NC_009442	AATT	2	8	30384	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	146317685
88	NC_009442	TTTA	2	8	30566	30573	25 %	75 %	0 %	0 %	146317685
89	NC_009442	AAGA	2	8	30827	30834	75 %	0 %	25 %	0 %	146317686
90	NC_009442	TGAA	2	8	30894	30901	50 %	25 %	25 %	0 %	146317686
91	NC_009442	TTCA	2	8	32021	32028	25 %	50 %	0 %	25 %	146317687
92	NC_009442	TACT	2	8	32086	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	146317687
93	NC_009442	GTCC	2	8	33095	33102	0 %	25 %	25 %	50 %	146317687
94	NC_009442	TTCC	2	8	33232	33239	0 %	50 %	0 %	50 %	146317687
95	NC_009442	GCAG	2	8	33682	33689	25 %	0 %	50 %	25 %	146317687
96	NC_009442	TACC	2	8	33899	33906	25 %	25 %	0 %	50 %	146317687
97	NC_009442	CCAA	2	8	34764	34771	50 %	0 %	0 %	50 %	146317687
98	NC_009442	GACG	2	8	34891	34898	25 %	0 %	50 %	25 %	146317687
99	NC_009442	AAGA	2	8	35102	35109	75 %	0 %	25 %	0 %	146317687
100	NC_009442	AAAT	2	8	35150	35157	75 %	25 %	0 %	0 %	146317687
101	NC_009442	TGGT	2	8	36023	36030	0 %	50 %	50 %	0 %	146317688
102	NC_009442	CAAC	2	8	36136	36143	50 %	0 %	0 %	50 %	146317688
103	NC_009442	ACCT	2	8	36433	36440	25 %	25 %	0 %	50 %	146317688
104	NC_009442	AGCC	2	8	37008	37015	25 %	0 %	25 %	50 %	146317689
105	NC_009442	GATT	2	8	37071	37078	25 %	50 %	25 %	0 %	146317689
106	NC_009442	CTGG	2	8	37130	37137	0 %	25 %	50 %	25 %	146317689
107	NC_009442	GGCT	2	8	38136	38143	0 %	25 %	50 %	25 %	146317691
108	NC_009442	GTCC	2	8	38628	38635	0 %	25 %	25 %	50 %	146317692
109	NC_009442	CAAG	2	8	38821	38828	50 %	0 %	25 %	25 %	146317692
110	NC_009442	GCAG	2	8	39094	39101	25 %	0 %	50 %	25 %	146317692
111	NC_009442	AACC	2	8	39556	39563	50 %	0 %	0 %	50 %	146317692
112	NC_009442	CGTC	2	8	39570	39577	0 %	25 %	25 %	50 %	146317692
113	NC_009442	CAAA	2	8	40242	40249	75 %	0 %	0 %	25 %	146317693
114	NC_009442	GACC	2	8	40746	40753	25 %	0 %	25 %	50 %	146317693
115	NC_009442	AAAG	2	8	41308	41315	75 %	0 %	25 %	0 %	146317694
116	NC_009442	GCGG	2	8	41402	41409	0 %	0 %	75 %	25 %	146317694
117	NC_009442	TGCC	2	8	42331	42338	0 %	25 %	25 %	50 %	146317695
118	NC_009442	TGAA	2	8	42457	42464	50 %	25 %	25 %	0 %	146317695
119	NC_009442	ATAC	2	8	43221	43228	50 %	25 %	0 %	25 %	146317696
120	NC_009442	AAAG	2	8	43240	43247	75 %	0 %	25 %	0 %	146317696
121	NC_009442	TGAC	2	8	43546	43553	25 %	25 %	25 %	25 %	146317696
122	NC_009442	AATA	2	8	43615	43622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009442	TAAA	2	8	43648	43655	75 %	25 %	0 %	0 %	146317697
124	NC_009442	TTAT	2	8	44338	44345	25 %	75 %	0 %	0 %	146317698
125	NC_009442	GAAG	2	8	44594	44601	50 %	0 %	50 %	0 %	146317698
126	NC_009442	GAAG	2	8	44762	44769	50 %	0 %	50 %	0 %	146317698
127	NC_009442	TTGG	2	8	44937	44944	0 %	50 %	50 %	0 %	146317699
128	NC_009442	CGAC	2	8	45152	45159	25 %	0 %	25 %	50 %	146317699
129	NC_009442	TTGA	2	8	45952	45959	25 %	50 %	25 %	0 %	146317699
130	NC_009442	TCAG	2	8	46079	46086	25 %	25 %	25 %	25 %	146317699
131	NC_009442	AATA	2	8	46215	46222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009442	CTCC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_009442	TTCG	2	8	46342	46349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009442	AAGC	2	8	46464	46471	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009442	AAAC	2	8	46666	46673	75 %	0 %	0 %	25 %	146317700
136	NC_009442	ATCA	2	8	46736	46743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009442	CTAT	2	8	47539	47546	25 %	50 %	0 %	25 %	146317701
138	NC_009442	TCAA	2	8	47560	47567	50 %	25 %	0 %	25 %	146317701
139	NC_009442	GCTT	2	8	47874	47881	0 %	50 %	25 %	25 %	146317703
140	NC_009442	CCTA	2	8	47960	47967	25 %	25 %	0 %	50 %	146317703
141	NC_009442	GCTA	2	8	48228	48235	25 %	25 %	25 %	25 %	146317703
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143	NC_009442	ATCA	2	8	48862	48869	50 %	25 %	0 %	25 %	146317705
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