MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 27390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009442	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319849
2	NC_009442	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319849
3	NC_009442	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
4	NC_009442	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319849
5	NC_009442	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319849
6	NC_009442	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146319849
7	NC_009442	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146319849
8	NC_009442	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146319849
9	NC_009442	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319849
10	NC_009442	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146319849
11	NC_009442	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146319849
12	NC_009442	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
13	NC_009442	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146319849
14	NC_009442	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146319849
15	NC_009442	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146319849
16	NC_009442	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146319849
17	NC_009442	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009442	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009442	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009442	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
21	NC_009442	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317664
22	NC_009442	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317664
23	NC_009442	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317664
24	NC_009442	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317664
25	NC_009442	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317664
26	NC_009442	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317664
27	NC_009442	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
28	NC_009442	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
29	NC_009442	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317664
30	NC_009442	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317664
31	NC_009442	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
32	NC_009442	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
33	NC_009442	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317664
34	NC_009442	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317664
35	NC_009442	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317664
36	NC_009442	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009442	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317665
38	NC_009442	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317665
39	NC_009442	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
40	NC_009442	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
41	NC_009442	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317665
42	NC_009442	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317665
43	NC_009442	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
44	NC_009442	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317665
45	NC_009442	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317665
46	NC_009442	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317665
47	NC_009442	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317666
48	NC_009442	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317666
49	NC_009442	ATG	2	6	3790	3795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317666
50	NC_009442	ACT	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009442	GAG	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009442	TGG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317667
53	NC_009442	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317667
54	NC_009442	TGT	2	6	4246	4251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317667
55	NC_009442	ATT	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009442	ATT	2	6	4302	4307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009442	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009442	TCA	2	6	4569	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317668
59	NC_009442	CAA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317668
60	NC_009442	AGA	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
61	NC_009442	GAA	2	6	4970	4975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
62	NC_009442	TGA	2	6	5038	5043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317668
63	NC_009442	GCA	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
64	NC_009442	GTG	3	9	5120	5128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317668
65	NC_009442	GAA	3	9	5144	5152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
66	NC_009442	CGA	2	6	5164	5169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
67	NC_009442	CAG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317668
68	NC_009442	AGG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317668
69	NC_009442	CTC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317668
70	NC_009442	GAT	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317668
71	NC_009442	AAG	2	6	5433	5438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
72	NC_009442	GAA	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317668
73	NC_009442	CAT	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317668
74	NC_009442	TTC	2	6	5533	5538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009442	GTT	2	6	5539	5544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009442	GAT	2	6	5618	5623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009442	TGC	2	6	5746	5751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317669
78	NC_009442	TTA	2	6	5909	5914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317669
79	NC_009442	TAG	2	6	5938	5943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317669
80	NC_009442	GAC	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317669
81	NC_009442	TGG	2	6	6002	6007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317669
82	NC_009442	GAA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317669
83	NC_009442	GAT	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317669
84	NC_009442	TTA	3	9	6320	6328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317670
85	NC_009442	ATG	2	6	6417	6422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
86	NC_009442	ATT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317670
87	NC_009442	GAT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
88	NC_009442	AGA	2	6	6937	6942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317670
89	NC_009442	TAG	2	6	6946	6951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
90	NC_009442	TTG	2	6	7103	7108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
91	NC_009442	GAT	2	6	7142	7147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
92	NC_009442	TTG	2	6	7199	7204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
93	NC_009442	GAT	2	6	7208	7213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
94	NC_009442	CTT	2	6	7294	7299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317670
95	NC_009442	CCA	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317670
96	NC_009442	GTT	2	6	7439	7444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
97	NC_009442	GCA	2	6	7523	7528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317670
98	NC_009442	TAG	2	6	7536	7541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
99	NC_009442	TCA	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317670
100	NC_009442	TGT	2	6	7723	7728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
101	NC_009442	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317670
102	NC_009442	TCT	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317670
103	NC_009442	TAA	2	6	7903	7908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317670
104	NC_009442	GGA	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317670
105	NC_009442	GAT	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
106	NC_009442	TGA	3	9	8032	8040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
107	NC_009442	ACT	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317670
108	NC_009442	TGA	2	6	8104	8109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
109	NC_009442	TAG	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
110	NC_009442	ATG	2	6	8217	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
111	NC_009442	TGT	2	6	8428	8433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
112	NC_009442	CTA	2	6	8784	8789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317670
113	NC_009442	CAA	2	6	8880	8885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317670
114	NC_009442	GTG	2	6	9135	9140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317670
115	NC_009442	TGC	2	6	9157	9162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317670
116	NC_009442	AGA	2	6	9258	9263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317670
117	NC_009442	AAG	2	6	9393	9398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317670
118	NC_009442	GTA	2	6	9431	9436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317670
119	NC_009442	GAC	2	6	9504	9509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317670
120	NC_009442	TGT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317670
121	NC_009442	AAT	2	6	9765	9770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009442	TAA	2	6	9941	9946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317671
123	NC_009442	ACT	2	6	9947	9952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317671
124	NC_009442	GAA	2	6	10047	10052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317671
125	NC_009442	AAT	2	6	10072	10077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317672
126	NC_009442	CAA	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317672
127	NC_009442	TTG	2	6	10202	10207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317672
128	NC_009442	CAG	3	9	10225	10233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317672
129	NC_009442	GAA	2	6	10267	10272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317672
130	NC_009442	GCA	2	6	10333	10338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317672
131	NC_009442	AAG	2	6	10370	10375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317672
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388	NC_009442	CAT	2	6	28311	28316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317682
389	NC_009442	CTT	2	6	28416	28421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317682
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392	NC_009442	AGA	2	6	28563	28568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317682
393	NC_009442	ATG	3	9	28755	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317683
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395	NC_009442	CAA	2	6	29102	29107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317683
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400	NC_009442	ACG	2	6	29521	29526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317684
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420	NC_009442	GGA	2	6	30493	30498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317685
421	NC_009442	TGC	2	6	30523	30528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317685
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497	NC_009442	ATT	2	6	36412	36417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317688
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