MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009442	CTC	2	6	194498	194503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317862
4002	NC_009442	ATC	2	6	194512	194517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317862
4003	NC_009442	CTT	2	6	194562	194567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317862
4004	NC_009442	AAAG	2	8	194583	194590	75 %	0 %	25 %	0 %	146317862
4005	NC_009442	GTCAAG	2	12	194651	194662	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146317862
4006	NC_009442	AAG	2	6	194681	194686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317862
4007	NC_009442	ATT	2	6	194717	194722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317862
4008	NC_009442	AGCAG	2	10	194736	194745	40 %	0 %	40 %	20 %	146317862
4009	NC_009442	GTA	2	6	194784	194789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317862
4010	NC_009442	TAG	2	6	194848	194853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317863
4011	NC_009442	ATG	2	6	194921	194926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317863
4012	NC_009442	AAC	2	6	194970	194975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317864
4013	NC_009442	ATTC	2	8	195025	195032	25 %	50 %	0 %	25 %	146317864
4014	NC_009442	GGA	2	6	195051	195056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317864
4015	NC_009442	CAG	2	6	195077	195082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317864
4016	NC_009442	TTC	2	6	195085	195090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317864
4017	NC_009442	CAG	2	6	195176	195181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317864
4018	NC_009442	GCT	2	6	195195	195200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317864
4019	NC_009442	GAA	2	6	195257	195262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317864
4020	NC_009442	ATT	2	6	195329	195334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317864
4021	NC_009442	TGAT	2	8	195407	195414	25 %	50 %	25 %	0 %	146317864
4022	NC_009442	TGA	2	6	195453	195458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317864
4023	NC_009442	TGA	2	6	195467	195472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317864
4024	NC_009442	AAAATC	2	12	195490	195501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	146317865
4025	NC_009442	GTT	2	6	195506	195511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317865
4026	NC_009442	TGA	2	6	195521	195526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317865
4027	NC_009442	TTGATT	2	12	195560	195571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146317865
4028	NC_009442	T	6	6	195595	195600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_009442	AAACG	2	10	195701	195710	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4030	NC_009442	GTTG	2	8	195739	195746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009442	T	7	7	195750	195756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009442	TGC	2	6	195808	195813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317866
4033	NC_009442	AT	3	6	195831	195836	50 %	50 %	0 %	0 %	146317866
4034	NC_009442	ATT	2	6	195862	195867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317866
4035	NC_009442	ATTG	2	8	195888	195895	25 %	50 %	25 %	0 %	146317866
4036	NC_009442	CAA	2	6	195897	195902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317866
4037	NC_009442	ATT	2	6	195904	195909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317866
4038	NC_009442	TAA	2	6	195937	195942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317866
4039	NC_009442	TAA	2	6	195951	195956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317866
4040	NC_009442	T	8	8	195960	195967	0 %	100 %	0 %	0 %	146317866
4041	NC_009442	A	6	6	196007	196012	100 %	0 %	0 %	0 %	146317866
4042	NC_009442	T	6	6	196029	196034	0 %	100 %	0 %	0 %	146317866
4043	NC_009442	AAT	2	6	196036	196041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317866
4044	NC_009442	ACA	2	6	196073	196078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317866
4045	NC_009442	TCT	2	6	196091	196096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317866
4046	NC_009442	ATT	2	6	196156	196161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317866
4047	NC_009442	AAG	2	6	196218	196223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317866
4048	NC_009442	ACT	2	6	196238	196243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317866
4049	NC_009442	TC	3	6	196254	196259	0 %	50 %	0 %	50 %	146317866
4050	NC_009442	TTTTG	2	10	196272	196281	0 %	80 %	20 %	0 %	146317866
4051	NC_009442	GAACA	2	10	196307	196316	60 %	0 %	20 %	20 %	146317866
4052	NC_009442	AATA	2	8	196333	196340	75 %	25 %	0 %	0 %	146317866
4053	NC_009442	AAAT	2	8	196457	196464	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_009442	ATT	2	6	196474	196479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_009442	ATA	2	6	196484	196489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_009442	AT	3	6	196590	196595	50 %	50 %	0 %	0 %	146317867
4057	NC_009442	CATT	2	8	196596	196603	25 %	50 %	0 %	25 %	146317867
4058	NC_009442	TAA	2	6	196737	196742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317867
4059	NC_009442	GTC	2	6	196743	196748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317867
4060	NC_009442	TAC	2	6	196749	196754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317867
4061	NC_009442	T	8	8	196801	196808	0 %	100 %	0 %	0 %	146317867
4062	NC_009442	T	6	6	196887	196892	0 %	100 %	0 %	0 %	146317867
4063	NC_009442	TAAA	2	8	196899	196906	75 %	25 %	0 %	0 %	146317867
4064	NC_009442	AT	3	6	196914	196919	50 %	50 %	0 %	0 %	146317867
4065	NC_009442	TCT	2	6	196943	196948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317867
4066	NC_009442	T	7	7	196948	196954	0 %	100 %	0 %	0 %	146317867
4067	NC_009442	T	6	6	197010	197015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_009442	A	6	6	197018	197023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_009442	AAAT	3	12	197043	197054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_009442	T	6	6	197059	197064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_009442	TAAA	2	8	197077	197084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_009442	AAAAT	2	10	197125	197134	80 %	20 %	0 %	0 %	146317868
4073	NC_009442	GGA	2	6	197139	197144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317868
4074	NC_009442	AATG	2	8	197151	197158	50 %	25 %	25 %	0 %	146317868
4075	NC_009442	ATG	2	6	197248	197253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317868
4076	NC_009442	TTC	2	6	197281	197286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317868
4077	NC_009442	AGT	2	6	197331	197336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317868
4078	NC_009442	TTG	2	6	197359	197364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317868
4079	NC_009442	ATCA	2	8	197384	197391	50 %	25 %	0 %	25 %	146317868
4080	NC_009442	TC	4	8	197405	197412	0 %	50 %	0 %	50 %	146317868
4081	NC_009442	ATC	2	6	197490	197495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317868
4082	NC_009442	TTTTA	2	10	197496	197505	20 %	80 %	0 %	0 %	146317868
4083	NC_009442	CAA	2	6	197522	197527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317868
4084	NC_009442	ATT	2	6	197607	197612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317868
4085	NC_009442	A	6	6	197691	197696	100 %	0 %	0 %	0 %	146317868
4086	NC_009442	AAC	2	6	197745	197750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317868
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4089	NC_009442	TGG	2	6	197925	197930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317868
4090	NC_009442	GCC	2	6	197995	198000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317868
4091	NC_009442	ATT	2	6	198022	198027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317868
4092	NC_009442	GGT	2	6	198064	198069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317868
4093	NC_009442	TC	3	6	198157	198162	0 %	50 %	0 %	50 %	146317868
4094	NC_009442	TTAATA	2	12	198164	198175	50 %	50 %	0 %	0 %	146317868
4095	NC_009442	TAT	2	6	198213	198218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317868
4096	NC_009442	GAT	2	6	198219	198224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317868
4097	NC_009442	AAT	2	6	198255	198260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317868
4098	NC_009442	ACT	2	6	198298	198303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317868
4099	NC_009442	GTT	2	6	198307	198312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317868
4100	NC_009442	G	6	6	198340	198345	0 %	0 %	100 %	0 %	146317868
4101	NC_009442	GGC	2	6	198358	198363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317868
4102	NC_009442	ATT	2	6	198388	198393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317868
4103	NC_009442	TCAT	2	8	198406	198413	25 %	50 %	0 %	25 %	146317868
4104	NC_009442	TATT	2	8	198414	198421	25 %	75 %	0 %	0 %	146317868
4105	NC_009442	ATA	2	6	198443	198448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317868
4106	NC_009442	GAA	2	6	198463	198468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317868
4107	NC_009442	TTTTGA	2	12	198568	198579	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	146317869
4108	NC_009442	AAT	2	6	198641	198646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317869
4109	NC_009442	TGAAA	2	10	198661	198670	60 %	20 %	20 %	0 %	146317869
4110	NC_009442	ACTG	2	8	198803	198810	25 %	25 %	25 %	25 %	146317869
4111	NC_009442	GAG	2	6	198858	198863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317869
4112	NC_009442	T	6	6	198941	198946	0 %	100 %	0 %	0 %	146317869
4113	NC_009442	AGA	2	6	199018	199023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317869
4114	NC_009442	CAA	2	6	199043	199048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317869
4115	NC_009442	GAA	2	6	199067	199072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317869
4116	NC_009442	CAT	2	6	199094	199099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317869
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4118	NC_009442	ACTA	2	8	199243	199250	50 %	25 %	0 %	25 %	146317869
4119	NC_009442	TG	3	6	199287	199292	0 %	50 %	50 %	0 %	146317869
4120	NC_009442	AAGGA	2	10	199313	199322	60 %	0 %	40 %	0 %	146317869
4121	NC_009442	TGTGAA	2	12	199373	199384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317869
4122	NC_009442	T	6	6	199480	199485	0 %	100 %	0 %	0 %	146317869
4123	NC_009442	ATG	2	6	199550	199555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317869
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4253	NC_009442	T	6	6	205176	205181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4328	NC_009442	GA	3	6	208771	208776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4360	NC_009442	AGCC	2	8	210516	210523	25 %	0 %	25 %	50 %	146317878
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4497	NC_009442	AGA	2	6	217933	217938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4498	NC_009442	AAC	2	6	217939	217944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_009442	C	6	6	217950	217955	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4500	NC_009442	AT	3	6	217990	217995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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