MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2006	NC_009442	A	6	6	97145	97150	100 %	0 %	0 %	0 %	146317762
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2013	NC_009442	CCTG	2	8	97409	97416	0 %	25 %	25 %	50 %	146317762
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2015	NC_009442	TCA	2	6	97517	97522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317762
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2127	NC_009442	AAG	2	6	102565	102570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317768
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2129	NC_009442	TGA	2	6	102606	102611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317768
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2251	NC_009442	ATG	2	6	109322	109327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317778
2252	NC_009442	GAT	2	6	109384	109389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317778
2253	NC_009442	GTG	3	9	109476	109484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317778
2254	NC_009442	TGG	2	6	109534	109539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317778
2255	NC_009442	AACA	2	8	109547	109554	75 %	0 %	0 %	25 %	146317778
2256	NC_009442	TTG	2	6	109560	109565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317778
2257	NC_009442	AGT	2	6	109591	109596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317778
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2263	NC_009442	ATG	2	6	109839	109844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317778
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2276	NC_009442	GCA	2	6	110384	110389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2279	NC_009442	TCA	2	6	110511	110516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2280	NC_009442	TA	3	6	110525	110530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2281	NC_009442	TG	3	6	110551	110556	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2282	NC_009442	CGT	2	6	110598	110603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2284	NC_009442	TTA	2	6	110730	110735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2285	NC_009442	CGT	2	6	110790	110795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317779
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2353	NC_009442	CTG	2	6	114431	114436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2359	NC_009442	A	6	6	114585	114590	100 %	0 %	0 %	0 %	146317780
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2362	NC_009442	CA	3	6	114805	114810	50 %	0 %	0 %	50 %	146317780
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2364	NC_009442	ATGGTT	2	12	114985	114996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	146317780
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2367	NC_009442	GAT	2	6	115178	115183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317780
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2370	NC_009442	GAAC	2	8	115265	115272	50 %	0 %	25 %	25 %	146317780
2371	NC_009442	CCG	2	6	115277	115282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317780
2372	NC_009442	AAC	2	6	115296	115301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317780
2373	NC_009442	ATC	2	6	115338	115343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317780
2374	NC_009442	AAG	2	6	115369	115374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317780
2375	NC_009442	TTGA	2	8	115386	115393	25 %	50 %	25 %	0 %	146317780
2376	NC_009442	GTC	2	6	115408	115413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317780
2377	NC_009442	CTTG	2	8	115493	115500	0 %	50 %	25 %	25 %	146317780
2378	NC_009442	CCGTT	2	10	115523	115532	0 %	40 %	20 %	40 %	146317780
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2392	NC_009442	GAA	2	6	116520	116525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317780
2393	NC_009442	CGT	2	6	116562	116567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317780
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2400	NC_009442	GTG	2	6	117325	117330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317780
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2404	NC_009442	AGC	2	6	117569	117574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317780
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2406	NC_009442	GCTT	2	8	117604	117611	0 %	50 %	25 %	25 %	146317780
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2416	NC_009442	GAAA	2	8	118197	118204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2417	NC_009442	AT	4	8	118207	118214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2429	NC_009442	CCT	2	6	118970	118975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2431	NC_009442	GTCTG	2	10	118995	119004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2432	NC_009442	CAGT	2	8	119021	119028	25 %	25 %	25 %	25 %	146317783
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2447	NC_009442	T	6	6	119633	119638	0 %	100 %	0 %	0 %	146317783
2448	NC_009442	T	6	6	119656	119661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2449	NC_009442	ATT	2	6	119662	119667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2450	NC_009442	A	6	6	119673	119678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2451	NC_009442	GAG	2	6	119716	119721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2452	NC_009442	AAGA	2	8	119744	119751	75 %	0 %	25 %	0 %	146317784
2453	NC_009442	GTG	2	6	119803	119808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317784
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2459	NC_009442	ATGACA	2	12	120049	120060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	146317784
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2462	NC_009442	T	6	6	120130	120135	0 %	100 %	0 %	0 %	146317784
2463	NC_009442	AGG	2	6	120241	120246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317784
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2467	NC_009442	GAG	2	6	120477	120482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317784
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2475	NC_009442	GGT	2	6	120852	120857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317785
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2477	NC_009442	GCTTG	2	10	121011	121020	0 %	40 %	40 %	20 %	146317785
2478	NC_009442	TCT	2	6	121029	121034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317785
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2480	NC_009442	ATC	2	6	121076	121081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317785
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2482	NC_009442	TGGTT	2	10	121139	121148	0 %	60 %	40 %	0 %	146317785
2483	NC_009442	ACCT	2	8	121219	121226	25 %	25 %	0 %	50 %	146317785
2484	NC_009442	AGC	2	6	121307	121312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317785
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2486	NC_009442	GGTCA	2	10	121438	121447	20 %	20 %	40 %	20 %	146317785
2487	NC_009442	T	6	6	121500	121505	0 %	100 %	0 %	0 %	146317785
2488	NC_009442	TGC	2	6	121595	121600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317785
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2490	NC_009442	TGG	2	6	121668	121673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317786
2491	NC_009442	CTC	2	6	121712	121717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146317786
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2495	NC_009442	AGT	2	6	121783	121788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317786
2496	NC_009442	A	6	6	121901	121906	100 %	0 %	0 %	0 %	146317786
2497	NC_009442	CTG	2	6	121932	121937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317787
2498	NC_009442	TTG	2	6	121941	121946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317787
2499	NC_009442	T	6	6	121955	121960	0 %	100 %	0 %	0 %	146317787
2500	NC_009442	GAA	2	6	122010	122015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317787

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