MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009442	CAA	2	6	47552	47557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317701
1002	NC_009442	TCAA	2	8	47560	47567	50 %	25 %	0 %	25 %	146317701
1003	NC_009442	T	6	6	47639	47644	0 %	100 %	0 %	0 %	146317701
1004	NC_009442	ACA	2	6	47656	47661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317701
1005	NC_009442	CAC	2	6	47666	47671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317701
1006	NC_009442	TGT	2	6	47691	47696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317701
1007	NC_009442	GTA	2	6	47752	47757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317701
1008	NC_009442	GCTT	2	8	47874	47881	0 %	50 %	25 %	25 %	146317703
1009	NC_009442	CCTA	2	8	47960	47967	25 %	25 %	0 %	50 %	146317703
1010	NC_009442	TAT	2	6	47973	47978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317703
1011	NC_009442	GAAGT	2	10	48055	48064	40 %	20 %	40 %	0 %	146317703
1012	NC_009442	TGA	2	6	48132	48137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317703
1013	NC_009442	TAT	2	6	48153	48158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317703
1014	NC_009442	GAA	2	6	48169	48174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317703
1015	NC_009442	TTATC	2	10	48186	48195	20 %	60 %	0 %	20 %	146317703
1016	NC_009442	GCTA	2	8	48228	48235	25 %	25 %	25 %	25 %	146317703
1017	NC_009442	TC	3	6	48247	48252	0 %	50 %	0 %	50 %	146317703
1018	NC_009442	TTG	2	6	48265	48270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317703
1019	NC_009442	ATT	2	6	48278	48283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317703
1020	NC_009442	TAATC	2	10	48294	48303	40 %	40 %	0 %	20 %	146317703
1021	NC_009442	GGA	2	6	48370	48375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317703
1022	NC_009442	ATG	2	6	48429	48434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317704
1023	NC_009442	TAT	2	6	48445	48450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317704
1024	NC_009442	TC	3	6	48503	48508	0 %	50 %	0 %	50 %	146317704
1025	NC_009442	TTG	3	9	48522	48530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317704
1026	NC_009442	TCAAT	2	10	48553	48562	40 %	40 %	0 %	20 %	146317704
1027	NC_009442	CAG	2	6	48604	48609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317704
1028	NC_009442	CAA	2	6	48619	48624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317704
1029	NC_009442	GAT	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317704
1030	NC_009442	TTG	2	6	48769	48774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317704
1031	NC_009442	TAT	2	6	48783	48788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317704
1032	NC_009442	TTATT	2	10	48806	48815	20 %	80 %	0 %	0 %	146317704
1033	NC_009442	CAG	2	6	48816	48821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317704
1034	NC_009442	AAGA	2	8	48831	48838	75 %	0 %	25 %	0 %	146317704
1035	NC_009442	ATCA	2	8	48862	48869	50 %	25 %	0 %	25 %	146317705
1036	NC_009442	TTG	2	6	48944	48949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317705
1037	NC_009442	A	6	6	48960	48965	100 %	0 %	0 %	0 %	146317705
1038	NC_009442	TGAT	2	8	49091	49098	25 %	50 %	25 %	0 %	146317705
1039	NC_009442	A	6	6	49162	49167	100 %	0 %	0 %	0 %	146317705
1040	NC_009442	AAC	2	6	49259	49264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317705
1041	NC_009442	ATTG	2	8	49356	49363	25 %	50 %	25 %	0 %	146317705
1042	NC_009442	GT	3	6	49646	49651	0 %	50 %	50 %	0 %	146317705
1043	NC_009442	ATTG	2	8	49665	49672	25 %	50 %	25 %	0 %	146317705
1044	NC_009442	GAAA	2	8	49701	49708	75 %	0 %	25 %	0 %	146317705
1045	NC_009442	TTTA	2	8	49815	49822	25 %	75 %	0 %	0 %	146317706
1046	NC_009442	TTG	2	6	49894	49899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317706
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1051	NC_009442	CAA	2	6	50071	50076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317706
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1053	NC_009442	AG	3	6	50183	50188	50 %	0 %	50 %	0 %	146317706
1054	NC_009442	TTTG	2	8	50260	50267	0 %	75 %	25 %	0 %	146317706
1055	NC_009442	GAT	3	9	50318	50326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317706
1056	NC_009442	TTG	2	6	50335	50340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317706
1057	NC_009442	GCGA	2	8	50385	50392	25 %	0 %	50 %	25 %	146317706
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1059	NC_009442	ATT	2	6	50436	50441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317706
1060	NC_009442	TGC	2	6	50465	50470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317706
1061	NC_009442	A	6	6	50472	50477	100 %	0 %	0 %	0 %	146317706
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1063	NC_009442	GTT	2	6	50524	50529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317707
1064	NC_009442	ATT	2	6	50727	50732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317707
1065	NC_009442	GTA	2	6	50748	50753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317707
1066	NC_009442	CAA	2	6	50771	50776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317707
1067	NC_009442	TTG	2	6	50792	50797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317707
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1069	NC_009442	TCA	2	6	50884	50889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317707
1070	NC_009442	TTC	2	6	50896	50901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317707
1071	NC_009442	TGA	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317707
1072	NC_009442	ATTT	2	8	50940	50947	25 %	75 %	0 %	0 %	146317707
1073	NC_009442	TCT	2	6	50986	50991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317708
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1077	NC_009442	TGA	2	6	51118	51123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1078	NC_009442	GA	3	6	51154	51159	50 %	0 %	50 %	0 %	146317708
1079	NC_009442	TAG	2	6	51236	51241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1080	NC_009442	TAT	2	6	51257	51262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317708
1081	NC_009442	TGA	2	6	51304	51309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1082	NC_009442	ATG	2	6	51342	51347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1083	NC_009442	TGAT	2	8	51352	51359	25 %	50 %	25 %	0 %	146317708
1084	NC_009442	TGC	2	6	51374	51379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317708
1085	NC_009442	GAA	2	6	51450	51455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317708
1086	NC_009442	GTTG	2	8	51470	51477	0 %	50 %	50 %	0 %	146317708
1087	NC_009442	CTA	2	6	51481	51486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317708
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1089	NC_009442	TGA	2	6	51625	51630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1090	NC_009442	CAA	2	6	51669	51674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317708
1091	NC_009442	GATT	2	8	51709	51716	25 %	50 %	25 %	0 %	146317708
1092	NC_009442	CT	3	6	51739	51744	0 %	50 %	0 %	50 %	146317708
1093	NC_009442	TAG	2	6	51844	51849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317708
1094	NC_009442	AAC	2	6	51916	51921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317708
1095	NC_009442	ATTT	2	8	51960	51967	25 %	75 %	0 %	0 %	146317708
1096	NC_009442	TCA	2	6	52142	52147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317708
1097	NC_009442	CAG	2	6	52149	52154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317708
1098	NC_009442	GA	3	6	52161	52166	50 %	0 %	50 %	0 %	146317708
1099	NC_009442	ATC	2	6	52168	52173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317708
1100	NC_009442	GACC	2	8	52231	52238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_009442	AGTCTA	2	12	52239	52250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1102	NC_009442	TAA	3	9	52259	52267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_009442	TGA	2	6	52278	52283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_009442	ATAG	2	8	52299	52306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_009442	GAGAA	2	10	52307	52316	60 %	0 %	40 %	0 %	146317709
1106	NC_009442	AAAC	2	8	52319	52326	75 %	0 %	0 %	25 %	146317709
1107	NC_009442	GGA	2	6	52346	52351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317709
1108	NC_009442	AG	3	6	52358	52363	50 %	0 %	50 %	0 %	146317709
1109	NC_009442	GAA	2	6	52385	52390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317709
1110	NC_009442	AT	3	6	52402	52407	50 %	50 %	0 %	0 %	146317709
1111	NC_009442	GAA	2	6	52441	52446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317709
1112	NC_009442	GAG	2	6	52481	52486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317709
1113	NC_009442	GAAT	2	8	52539	52546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009442	TA	3	6	52717	52722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_009442	TGA	2	6	52930	52935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317710
1116	NC_009442	ACC	2	6	52982	52987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146317710
1117	NC_009442	TGG	2	6	53067	53072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317710
1118	NC_009442	GAG	2	6	53144	53149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317710
1119	NC_009442	CAT	2	6	53185	53190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317710
1120	NC_009442	GCC	2	6	53233	53238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146317710
1121	NC_009442	CGG	2	6	53364	53369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317710
1122	NC_009442	GCT	2	6	53399	53404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317710
1123	NC_009442	TCG	2	6	53416	53421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317710
1124	NC_009442	AGA	2	6	53574	53579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317710
1125	NC_009442	GAG	2	6	53651	53656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317710
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