MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis 05ZYH33 chromosome

Total Repeats: 42566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009442	AGA	2	6	23854	23859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317679
502	NC_009442	AAC	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317679
503	NC_009442	GTG	2	6	23991	23996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317679
504	NC_009442	TGG	2	6	24025	24030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317679
505	NC_009442	CGG	2	6	24066	24071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317679
506	NC_009442	ATG	2	6	24165	24170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317679
507	NC_009442	TGA	2	6	24211	24216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317679
508	NC_009442	TGT	2	6	24235	24240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317679
509	NC_009442	CAAA	2	8	24389	24396	75 %	0 %	0 %	25 %	146317679
510	NC_009442	TTTAT	2	10	24441	24450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009442	GGTC	2	8	24487	24494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_009442	ATT	2	6	24497	24502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_009442	T	6	6	24538	24543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_009442	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_009442	CTA	2	6	24637	24642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_009442	TCT	2	6	24676	24681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009442	TAG	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009442	TTA	2	6	24751	24756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009442	TAA	2	6	24815	24820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009442	ATT	2	6	24872	24877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009442	AACA	2	8	24896	24903	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_009442	TAA	2	6	24917	24922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009442	T	7	7	24944	24950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009442	GA	3	6	24959	24964	50 %	0 %	50 %	0 %	146317680
525	NC_009442	GAG	2	6	24978	24983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317680
526	NC_009442	GAA	2	6	24998	25003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317680
527	NC_009442	A	7	7	25002	25008	100 %	0 %	0 %	0 %	146317680
528	NC_009442	TCTA	2	8	25040	25047	25 %	50 %	0 %	25 %	146317680
529	NC_009442	ATG	2	6	25078	25083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317680
530	NC_009442	CAA	2	6	25099	25104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
531	NC_009442	A	6	6	25103	25108	100 %	0 %	0 %	0 %	146317680
532	NC_009442	CAA	2	6	25134	25139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
533	NC_009442	CAA	3	9	25149	25157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
534	NC_009442	AGA	2	6	25214	25219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317680
535	NC_009442	GGC	2	6	25253	25258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317680
536	NC_009442	ATCA	2	8	25379	25386	50 %	25 %	0 %	25 %	146317680
537	NC_009442	AATGC	2	10	25407	25416	40 %	20 %	20 %	20 %	146317680
538	NC_009442	ATT	2	6	25422	25427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317680
539	NC_009442	TAA	2	6	25433	25438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317680
540	NC_009442	AAC	2	6	25450	25455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
541	NC_009442	TTG	2	6	25477	25482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317680
542	NC_009442	ACT	2	6	25512	25517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317680
543	NC_009442	GCT	2	6	25587	25592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317680
544	NC_009442	CTG	2	6	25621	25626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317680
545	NC_009442	TTG	2	6	25644	25649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317680
546	NC_009442	AGA	2	6	25667	25672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317680
547	NC_009442	AGC	2	6	25673	25678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317680
548	NC_009442	CAA	2	6	25737	25742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
549	NC_009442	TAG	2	6	25777	25782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317680
550	NC_009442	CAT	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317680
551	NC_009442	GCA	2	6	25893	25898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317680
552	NC_009442	AAT	2	6	25899	25904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317680
553	NC_009442	GGT	2	6	26079	26084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317680
554	NC_009442	TAT	2	6	26085	26090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317680
555	NC_009442	GTT	2	6	26103	26108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317680
556	NC_009442	CAA	2	6	26125	26130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317680
557	NC_009442	GTT	2	6	26139	26144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317680
558	NC_009442	GTC	2	6	26161	26166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317680
559	NC_009442	GTG	2	6	26185	26190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317680
560	NC_009442	CTA	2	6	26203	26208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317680
561	NC_009442	TAC	2	6	26229	26234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317680
562	NC_009442	TTTG	2	8	26291	26298	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009442	TA	3	6	26319	26324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009442	AT	3	6	26337	26342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009442	AGG	2	6	26343	26348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009442	TTC	2	6	26520	26525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317681
567	NC_009442	CTG	2	6	26598	26603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317681
568	NC_009442	GTA	2	6	26615	26620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317681
569	NC_009442	TTA	2	6	26626	26631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317681
570	NC_009442	TGG	2	6	26688	26693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317681
571	NC_009442	TTG	2	6	26726	26731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317681
572	NC_009442	TGC	2	6	26746	26751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317681
573	NC_009442	TTC	2	6	26765	26770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317681
574	NC_009442	ATTG	2	8	26803	26810	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
575	NC_009442	ATT	2	6	26814	26819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317681
576	NC_009442	CGT	2	6	26825	26830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146317681
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578	NC_009442	TGG	2	6	26872	26877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317681
579	NC_009442	TAT	2	6	26926	26931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317681
580	NC_009442	TGA	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317681
581	NC_009442	ATT	2	6	26981	26986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317681
582	NC_009442	TTGA	2	8	27014	27021	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
583	NC_009442	TGAT	2	8	27027	27034	25 %	50 %	25 %	0 %	146317681
584	NC_009442	GTT	2	6	27170	27175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146317681
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587	NC_009442	ATT	2	6	27257	27262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317681
588	NC_009442	TTTG	2	8	27292	27299	0 %	75 %	25 %	0 %	146317681
589	NC_009442	CTT	2	6	27342	27347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009442	T	6	6	27346	27351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009442	ATTT	2	8	27354	27361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009442	TAT	2	6	27370	27375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009442	TAA	2	6	27426	27431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146317682
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597	NC_009442	TTA	2	6	27588	27593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146317682
598	NC_009442	CT	3	6	27688	27693	0 %	50 %	0 %	50 %	146317682
599	NC_009442	TTC	2	6	27758	27763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317682
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601	NC_009442	TGG	2	6	27806	27811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146317682
602	NC_009442	ACG	2	6	27835	27840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317682
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604	NC_009442	CAT	2	6	28167	28172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317682
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606	NC_009442	CAT	2	6	28311	28316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146317682
607	NC_009442	CTT	2	6	28416	28421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317682
608	NC_009442	GAAA	2	8	28436	28443	75 %	0 %	25 %	0 %	146317682
609	NC_009442	GCA	2	6	28510	28515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317682
610	NC_009442	GGA	2	6	28521	28526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146317682
611	NC_009442	AGA	2	6	28563	28568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146317682
612	NC_009442	TA	3	6	28602	28607	50 %	50 %	0 %	0 %	146317683
613	NC_009442	ATG	3	9	28755	28763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317683
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616	NC_009442	CT	3	6	28899	28904	0 %	50 %	0 %	50 %	146317683
617	NC_009442	T	6	6	28909	28914	0 %	100 %	0 %	0 %	146317683
618	NC_009442	CAA	2	6	29102	29107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146317683
619	NC_009442	TGA	2	6	29176	29181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317683
620	NC_009442	T	6	6	29228	29233	0 %	100 %	0 %	0 %	146317683
621	NC_009442	GAT	2	6	29291	29296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317683
622	NC_009442	TCT	2	6	29300	29305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146317683
623	NC_009442	TGGG	2	8	29375	29382	0 %	25 %	75 %	0 %	146317684
624	NC_009442	TCAA	2	8	29414	29421	50 %	25 %	0 %	25 %	146317684
625	NC_009442	TGA	2	6	29463	29468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317684
626	NC_009442	ACG	2	6	29521	29526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146317684
627	NC_009442	GAT	2	6	29542	29547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146317684
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630	NC_009442	GGC	2	6	29664	29669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146317684
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