MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 4723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009332	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	139472889
3	NC_009332	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	139472889
4	NC_009332	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
5	NC_009332	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
6	NC_009332	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009332	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
8	NC_009332	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
9	NC_009332	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
10	NC_009332	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	139472890
11	NC_009332	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
12	NC_009332	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009332	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009332	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	139472892
15	NC_009332	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	139472892
16	NC_009332	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	139472892
17	NC_009332	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	139472893
18	NC_009332	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
19	NC_009332	ACGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	139472894
20	NC_009332	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	139472894
21	NC_009332	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	139472894
22	NC_009332	TGAT	2	8	7419	7426	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
23	NC_009332	ACCA	2	8	7576	7583	50 %	0 %	0 %	50 %	139472894
24	NC_009332	AAAG	2	8	7708	7715	75 %	0 %	25 %	0 %	139472894
25	NC_009332	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
26	NC_009332	TCGG	2	8	8144	8151	0 %	25 %	50 %	25 %	139472894
27	NC_009332	AGCA	2	8	8192	8199	50 %	0 %	25 %	25 %	139472894
28	NC_009332	AATC	2	8	8236	8243	50 %	25 %	0 %	25 %	139472894
29	NC_009332	TCAA	2	8	8326	8333	50 %	25 %	0 %	25 %	139472894
30	NC_009332	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009332	AAAT	2	8	9027	9034	75 %	25 %	0 %	0 %	139472895
32	NC_009332	AAGA	2	8	9173	9180	75 %	0 %	25 %	0 %	139472896
33	NC_009332	GGAT	2	8	9236	9243	25 %	25 %	50 %	0 %	139472896
34	NC_009332	TATT	2	8	9264	9271	25 %	75 %	0 %	0 %	139472896
35	NC_009332	TCAA	2	8	9759	9766	50 %	25 %	0 %	25 %	139472898
36	NC_009332	CAAA	2	8	10123	10130	75 %	0 %	0 %	25 %	139472898
37	NC_009332	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	139472898
38	NC_009332	AAAT	2	8	10860	10867	75 %	25 %	0 %	0 %	139472898
39	NC_009332	CAAA	2	8	11093	11100	75 %	0 %	0 %	25 %	139472899
40	NC_009332	TTCA	2	8	11529	11536	25 %	50 %	0 %	25 %	139472899
41	NC_009332	AGTT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	25 %	0 %	139472899
42	NC_009332	TTTA	2	8	11948	11955	25 %	75 %	0 %	0 %	139472899
43	NC_009332	TTTA	2	8	12035	12042	25 %	75 %	0 %	0 %	139472899
44	NC_009332	GAAG	2	8	12481	12488	50 %	0 %	50 %	0 %	139472900
45	NC_009332	TGTT	2	8	12639	12646	0 %	75 %	25 %	0 %	139472900
46	NC_009332	ATTA	2	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	139472901
47	NC_009332	GAAA	2	8	13104	13111	75 %	0 %	25 %	0 %	139472901
48	NC_009332	TCAA	2	8	13302	13309	50 %	25 %	0 %	25 %	139472901
49	NC_009332	GTTC	2	8	13576	13583	0 %	50 %	25 %	25 %	139472901
50	NC_009332	ATGG	2	8	13723	13730	25 %	25 %	50 %	0 %	139472901
51	NC_009332	GTTG	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	139472901
52	NC_009332	AAAG	2	8	14070	14077	75 %	0 %	25 %	0 %	139472901
53	NC_009332	TGAT	2	8	14498	14505	25 %	50 %	25 %	0 %	139472901
54	NC_009332	ATTG	2	8	14583	14590	25 %	50 %	25 %	0 %	139472901
55	NC_009332	ACTA	2	8	15028	15035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009332	TTTA	2	8	15645	15652	25 %	75 %	0 %	0 %	139472902
57	NC_009332	GTAT	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	139472902
58	NC_009332	ATAA	2	8	16463	16470	75 %	25 %	0 %	0 %	139472902
59	NC_009332	TACT	2	8	16546	16553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009332	AAAT	2	8	16990	16997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009332	ACCT	2	8	17164	17171	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009332	GTGA	2	8	17445	17452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009332	TAAC	2	8	17528	17535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009332	AGCG	2	8	17616	17623	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009332	TGGT	2	8	18281	18288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009332	AGCC	2	8	18498	18505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009332	AGCG	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009332	GTAA	2	8	19094	19101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009332	ACTA	2	8	19136	19143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009332	GAAG	2	8	19176	19183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009332	GCGA	2	8	19250	19257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009332	ATTC	2	8	20116	20123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009332	CTAA	2	8	20472	20479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009332	TAGG	2	8	21127	21134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009332	TTGG	2	8	21310	21317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009332	AATC	2	8	21319	21326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009332	AAAT	2	8	22991	22998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009332	ACCT	2	8	23165	23172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009332	GTGA	2	8	23446	23453	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009332	TAAC	2	8	23529	23536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009332	AGCG	2	8	23617	23624	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009332	TGGT	2	8	24282	24289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009332	AGCC	2	8	24499	24506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009332	AGCG	2	8	24845	24852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009332	GTAA	2	8	25095	25102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009332	ACTA	2	8	25137	25144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009332	GAAG	2	8	25177	25184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009332	GCGA	2	8	25251	25258	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009332	ATTC	2	8	26117	26124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009332	CTAA	2	8	26473	26480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009332	TAGG	2	8	27128	27135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009332	TTGG	2	8	27311	27318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009332	AATC	2	8	27320	27327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009332	GCGT	2	8	29167	29174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009332	GTTA	2	8	29851	29858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009332	ATTC	2	8	30650	30657	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009332	AAGT	2	8	31116	31123	50 %	25 %	25 %	0 %	139472903
98	NC_009332	AAGC	2	8	31424	31431	50 %	0 %	25 %	25 %	139472903
99	NC_009332	TGGT	2	8	32095	32102	0 %	50 %	50 %	0 %	139472903
100	NC_009332	ATTT	2	8	32122	32129	25 %	75 %	0 %	0 %	139472903
101	NC_009332	TTGA	2	8	33056	33063	25 %	50 %	25 %	0 %	139472904
102	NC_009332	TGAT	2	8	33069	33076	25 %	50 %	25 %	0 %	139472904
103	NC_009332	TTCT	2	8	33159	33166	0 %	75 %	0 %	25 %	139472904
104	NC_009332	ATTA	2	8	33424	33431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009332	CATT	2	8	34253	34260	25 %	50 %	0 %	25 %	139472905
106	NC_009332	GTTT	2	8	34721	34728	0 %	75 %	25 %	0 %	139472906
107	NC_009332	TAAT	2	8	35144	35151	50 %	50 %	0 %	0 %	139472906
108	NC_009332	GTAC	2	8	35329	35336	25 %	25 %	25 %	25 %	139472906
109	NC_009332	AACA	2	8	35478	35485	75 %	0 %	0 %	25 %	139472907
110	NC_009332	TTAG	2	8	35638	35645	25 %	50 %	25 %	0 %	139472907
111	NC_009332	AGAA	2	8	35770	35777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009332	TTAT	2	8	35805	35812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009332	GGTT	2	8	36279	36286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009332	TTGA	2	8	36306	36313	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009332	GGAA	2	8	36506	36513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009332	AATC	2	8	37231	37238	50 %	25 %	0 %	25 %	139472908
117	NC_009332	TACT	2	8	37277	37284	25 %	50 %	0 %	25 %	139472908
118	NC_009332	CTTG	2	8	37955	37962	0 %	50 %	25 %	25 %	139472908
119	NC_009332	GCAC	2	8	38499	38506	25 %	0 %	25 %	50 %	139472908
120	NC_009332	CCAA	2	8	39955	39962	50 %	0 %	0 %	50 %	139472908
121	NC_009332	TTGG	2	8	40010	40017	0 %	50 %	50 %	0 %	139472908
122	NC_009332	ACTT	2	8	40658	40665	25 %	50 %	0 %	25 %	139472909
123	NC_009332	AATC	2	8	40778	40785	50 %	25 %	0 %	25 %	139472909
124	NC_009332	TGAT	2	8	41643	41650	25 %	50 %	25 %	0 %	139472909
125	NC_009332	AATT	2	8	41793	41800	50 %	50 %	0 %	0 %	139472909
126	NC_009332	TTGA	2	8	41876	41883	25 %	50 %	25 %	0 %	139472909
127	NC_009332	TGCT	2	8	42273	42280	0 %	50 %	25 %	25 %	139472910
128	NC_009332	TAGT	2	8	43114	43121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009332	AGTT	2	8	43317	43324	25 %	50 %	25 %	0 %	139472911
130	NC_009332	CCTG	2	8	43563	43570	0 %	25 %	25 %	50 %	139472911
131	NC_009332	AAAG	2	8	43868	43875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009332	TCCA	2	8	44186	44193	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009332	GCTA	2	8	45003	45010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009332	CCAA	2	8	45177	45184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009332	AACC	2	8	45297	45304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009332	AAAC	2	8	45483	45490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009332	ATTA	2	8	46719	46726	50 %	50 %	0 %	0 %	139472912
138	NC_009332	TAAT	2	8	46899	46906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009332	AGAA	2	8	48294	48301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009332	CAAT	2	8	50145	50152	50 %	25 %	0 %	25 %	139472916
141	NC_009332	ATTA	2	8	50536	50543	50 %	50 %	0 %	0 %	139472916
142	NC_009332	AAGC	2	8	50556	50563	50 %	0 %	25 %	25 %	139472916
143	NC_009332	AGCA	2	8	50811	50818	50 %	0 %	25 %	25 %	139472916
144	NC_009332	ATAA	2	8	50885	50892	75 %	25 %	0 %	0 %	139472916
145	NC_009332	CAAA	2	8	50920	50927	75 %	0 %	0 %	25 %	139472916
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147	NC_009332	AAAT	2	8	51557	51564	75 %	25 %	0 %	0 %	139472917
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