MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009332	CTG	3	9	186666	186674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4002	NC_009332	A	6	6	186675	186680	100 %	0 %	0 %	0 %	139473048
4003	NC_009332	ATCGGT	2	12	186710	186721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	139473048
4004	NC_009332	AGC	2	6	186742	186747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4005	NC_009332	GATT	2	8	186748	186755	25 %	50 %	25 %	0 %	139473048
4006	NC_009332	T	6	6	186754	186759	0 %	100 %	0 %	0 %	139473048
4007	NC_009332	ATC	2	6	186762	186767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473048
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4009	NC_009332	AAG	3	9	186978	186986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
4010	NC_009332	AAC	2	6	187052	187057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473048
4011	NC_009332	TGG	2	6	187087	187092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473048
4012	NC_009332	CTG	2	6	187110	187115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4013	NC_009332	TTG	2	6	187121	187126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473048
4014	NC_009332	TGC	2	6	187132	187137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4015	NC_009332	TGC	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
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4017	NC_009332	GCT	2	6	187235	187240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4018	NC_009332	TGG	2	6	187322	187327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473048
4019	NC_009332	TCAC	2	8	187405	187412	25 %	25 %	0 %	50 %	139473048
4020	NC_009332	AAG	2	6	187428	187433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
4021	NC_009332	AGA	2	6	187507	187512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473048
4022	NC_009332	CTT	2	6	187583	187588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
4023	NC_009332	CA	3	6	187592	187597	50 %	0 %	0 %	50 %	139473048
4024	NC_009332	GGC	2	6	187601	187606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473048
4025	NC_009332	CTT	2	6	187669	187674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
4026	NC_009332	CTT	2	6	187766	187771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473048
4027	NC_009332	CAG	2	6	187797	187802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473048
4028	NC_009332	CTT	2	6	187843	187848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_009332	GGC	2	6	187894	187899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_009332	CAT	2	6	187905	187910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_009332	ATA	2	6	187939	187944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009332	TAT	2	6	187976	187981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009332	A	6	6	188005	188010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_009332	GAA	2	6	188013	188018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_009332	CAGTTC	2	12	188049	188060	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_009332	AG	3	6	188090	188095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_009332	AGG	2	6	188151	188156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_009332	A	6	6	188164	188169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009332	AAG	2	6	188172	188177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
4040	NC_009332	TTC	2	6	188191	188196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473049
4041	NC_009332	GCT	2	6	188256	188261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473049
4042	NC_009332	CAAACT	2	12	188275	188286	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	139473049
4043	NC_009332	AAAC	2	8	188287	188294	75 %	0 %	0 %	25 %	139473049
4044	NC_009332	CTGG	2	8	188344	188351	0 %	25 %	50 %	25 %	139473049
4045	NC_009332	AGATA	2	10	188395	188404	60 %	20 %	20 %	0 %	139473049
4046	NC_009332	AAG	2	6	188430	188435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
4047	NC_009332	TGA	2	6	188448	188453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
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4049	NC_009332	TAG	3	9	188635	188643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
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4052	NC_009332	A	6	6	188720	188725	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
4053	NC_009332	TGA	2	6	188846	188851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473049
4054	NC_009332	AAG	2	6	188870	188875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
4055	NC_009332	TAAA	2	8	188890	188897	75 %	25 %	0 %	0 %	139473049
4056	NC_009332	ATC	2	6	188917	188922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473049
4057	NC_009332	TCAACA	2	12	189063	189074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	139473049
4058	NC_009332	A	6	6	189082	189087	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
4059	NC_009332	AAG	2	6	189089	189094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473049
4060	NC_009332	TCTA	2	8	189097	189104	25 %	50 %	0 %	25 %	139473049
4061	NC_009332	T	7	7	189125	189131	0 %	100 %	0 %	0 %	139473049
4062	NC_009332	ATATA	2	10	189184	189193	60 %	40 %	0 %	0 %	139473049
4063	NC_009332	AAT	2	6	189291	189296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
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4066	NC_009332	A	7	7	189441	189447	100 %	0 %	0 %	0 %	139473049
4067	NC_009332	AATA	2	8	189477	189484	75 %	25 %	0 %	0 %	139473049
4068	NC_009332	TAA	2	6	189492	189497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
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4072	NC_009332	AAT	2	6	189646	189651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
4073	NC_009332	ATA	2	6	189664	189669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473049
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4075	NC_009332	TTAAA	2	10	189695	189704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_009332	TA	3	6	189716	189721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_009332	ATC	2	6	189787	189792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4079	NC_009332	TCA	2	6	189808	189813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_009332	GATT	2	8	189817	189824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009332	GA	3	6	189849	189854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009332	AC	3	6	189862	189867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4083	NC_009332	TTTAAA	2	12	189897	189908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_009332	AGGG	2	8	189945	189952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4086	NC_009332	T	6	6	190117	190122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_009332	GA	3	6	190123	190128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_009332	ATG	2	6	190183	190188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_009332	A	6	6	190189	190194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_009332	TTA	2	6	190267	190272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473051
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4093	NC_009332	AGG	2	6	190350	190355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_009332	TTA	2	6	190375	190380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473052
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4103	NC_009332	TGA	2	6	190850	190855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473052
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4105	NC_009332	TAT	2	6	190998	191003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473052
4106	NC_009332	TGGT	2	8	191006	191013	0 %	50 %	50 %	0 %	139473052
4107	NC_009332	GT	3	6	191012	191017	0 %	50 %	50 %	0 %	139473052
4108	NC_009332	AGTG	2	8	191043	191050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009332	TAG	2	6	191077	191082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_009332	AGG	2	6	191112	191117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_009332	CCT	2	6	191125	191130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_009332	GTTTT	2	10	191141	191150	0 %	80 %	20 %	0 %	139473053
4113	NC_009332	GAT	2	6	191172	191177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473053
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4115	NC_009332	CAT	2	6	191261	191266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
4116	NC_009332	TCAG	2	8	191329	191336	25 %	25 %	25 %	25 %	139473053
4117	NC_009332	AAT	2	6	191412	191417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473053
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4120	NC_009332	GCA	2	6	191563	191568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473053
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4122	NC_009332	ATC	2	6	191640	191645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473053
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4124	NC_009332	CAA	2	6	191675	191680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473053
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4246	NC_009332	TAA	2	6	197394	197399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_009332	CAAG	2	8	197400	197407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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