MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009332	CTT	2	6	138415	138420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473002
3002	NC_009332	TTCT	2	8	138466	138473	0 %	75 %	0 %	25 %	139473002
3003	NC_009332	ATT	2	6	138496	138501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473002
3004	NC_009332	GTT	2	6	138533	138538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473002
3005	NC_009332	CAA	2	6	138593	138598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473002
3006	NC_009332	TTTTA	2	10	138649	138658	20 %	80 %	0 %	0 %	139473002
3007	NC_009332	CTG	2	6	138665	138670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473002
3008	NC_009332	TTAT	2	8	138671	138678	25 %	75 %	0 %	0 %	139473002
3009	NC_009332	CTTA	2	8	138705	138712	25 %	50 %	0 %	25 %	139473002
3010	NC_009332	GTT	2	6	138761	138766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473002
3011	NC_009332	AAAAGC	2	12	138776	138787	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	139473002
3012	NC_009332	TA	3	6	138810	138815	50 %	50 %	0 %	0 %	139473002
3013	NC_009332	CTTA	2	8	138834	138841	25 %	50 %	0 %	25 %	139473002
3014	NC_009332	TTG	2	6	138918	138923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473002
3015	NC_009332	CCA	2	6	138932	138937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473002
3016	NC_009332	TTTATT	2	12	138962	138973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	139473002
3017	NC_009332	T	6	6	139049	139054	0 %	100 %	0 %	0 %	139473002
3018	NC_009332	GGA	2	6	139073	139078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473002
3019	NC_009332	ATGTCA	2	12	139113	139124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	139473002
3020	NC_009332	GAA	2	6	139127	139132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473002
3021	NC_009332	GGA	2	6	139141	139146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473002
3022	NC_009332	ATT	2	6	139171	139176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473003
3023	NC_009332	TGG	2	6	139187	139192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473003
3024	NC_009332	TTC	2	6	139197	139202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473003
3025	NC_009332	AGA	2	6	139298	139303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473003
3026	NC_009332	TTG	2	6	139462	139467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473003
3027	NC_009332	AGC	2	6	139562	139567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473003
3028	NC_009332	GTC	2	6	139599	139604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473003
3029	NC_009332	TAAA	2	8	139618	139625	75 %	25 %	0 %	0 %	139473003
3030	NC_009332	A	6	6	139658	139663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_009332	CAC	2	6	139670	139675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_009332	AAG	2	6	139751	139756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473004
3033	NC_009332	AAAGC	2	10	139837	139846	60 %	0 %	20 %	20 %	139473004
3034	NC_009332	GCA	3	9	139890	139898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473004
3035	NC_009332	AAGA	2	8	139910	139917	75 %	0 %	25 %	0 %	139473004
3036	NC_009332	CTA	2	6	139924	139929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473004
3037	NC_009332	CTT	2	6	139967	139972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139473004
3038	NC_009332	GAA	3	9	139999	140007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473004
3039	NC_009332	T	6	6	140013	140018	0 %	100 %	0 %	0 %	139473004
3040	NC_009332	A	6	6	140072	140077	100 %	0 %	0 %	0 %	139473004
3041	NC_009332	AGTTC	2	10	140087	140096	20 %	40 %	20 %	20 %	139473004
3042	NC_009332	GCTGA	2	10	140107	140116	20 %	20 %	40 %	20 %	139473004
3043	NC_009332	ATT	2	6	140204	140209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473004
3044	NC_009332	AGA	2	6	140241	140246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473004
3045	NC_009332	CAT	2	6	140256	140261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473004
3046	NC_009332	T	6	6	140270	140275	0 %	100 %	0 %	0 %	139473004
3047	NC_009332	AGG	2	6	140285	140290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473004
3048	NC_009332	ACT	2	6	140326	140331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473005
3049	NC_009332	ACA	2	6	140398	140403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473005
3050	NC_009332	CAGT	2	8	140425	140432	25 %	25 %	25 %	25 %	139473005
3051	NC_009332	ATCT	2	8	140478	140485	25 %	50 %	0 %	25 %	139473005
3052	NC_009332	ATT	2	6	140553	140558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473005
3053	NC_009332	GTT	2	6	140592	140597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473005
3054	NC_009332	AAAGCT	2	12	140599	140610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	139473005
3055	NC_009332	TTA	2	6	140632	140637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473005
3056	NC_009332	TGG	2	6	140660	140665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473005
3057	NC_009332	TGA	2	6	140697	140702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473005
3058	NC_009332	GGT	2	6	140715	140720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473005
3059	NC_009332	CAA	2	6	140851	140856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473005
3060	NC_009332	TGAT	2	8	140870	140877	25 %	50 %	25 %	0 %	139473005
3061	NC_009332	ATG	2	6	140935	140940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473005
3062	NC_009332	TTA	2	6	140944	140949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473005
3063	NC_009332	TGA	2	6	140952	140957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473005
3064	NC_009332	GAT	2	6	140995	141000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473005
3065	NC_009332	TGA	2	6	141008	141013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473005
3066	NC_009332	TTG	2	6	141116	141121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473005
3067	NC_009332	ATTT	2	8	141137	141144	25 %	75 %	0 %	0 %	139473005
3068	NC_009332	TGCT	2	8	141179	141186	0 %	50 %	25 %	25 %	139473005
3069	NC_009332	A	6	6	141216	141221	100 %	0 %	0 %	0 %	139473005
3070	NC_009332	GCT	2	6	141238	141243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473005
3071	NC_009332	GAT	2	6	141359	141364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473006
3072	NC_009332	TAA	2	6	141385	141390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473006
3073	NC_009332	TAT	2	6	141443	141448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473006
3074	NC_009332	AGA	2	6	141458	141463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473006
3075	NC_009332	TGC	2	6	141467	141472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473006
3076	NC_009332	CAG	2	6	141517	141522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473006
3077	NC_009332	TCA	2	6	141539	141544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473006
3078	NC_009332	TGA	2	6	141676	141681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_009332	TGA	2	6	141701	141706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_009332	AGC	2	6	141711	141716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_009332	TTAG	2	8	141779	141786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_009332	A	6	6	141797	141802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_009332	AGG	2	6	141806	141811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_009332	ATA	2	6	141833	141838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139473007
3085	NC_009332	TTG	2	6	141855	141860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473007
3086	NC_009332	AAG	2	6	141876	141881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473007
3087	NC_009332	ATT	2	6	141932	141937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473007
3088	NC_009332	AGT	2	6	142006	142011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473007
3089	NC_009332	ACT	2	6	142013	142018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473007
3090	NC_009332	GTCG	2	8	142030	142037	0 %	25 %	50 %	25 %	139473007
3091	NC_009332	GTG	2	6	142131	142136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473007
3092	NC_009332	AAG	2	6	142200	142205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473007
3093	NC_009332	TGG	2	6	142293	142298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473007
3094	NC_009332	GGT	2	6	142493	142498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473007
3095	NC_009332	GCT	2	6	142502	142507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473007
3096	NC_009332	GCA	2	6	142543	142548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473007
3097	NC_009332	TTAT	2	8	142581	142588	25 %	75 %	0 %	0 %	139473007
3098	NC_009332	AGC	2	6	142720	142725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473007
3099	NC_009332	TGA	2	6	142870	142875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473007
3100	NC_009332	CTTA	2	8	142887	142894	25 %	50 %	0 %	25 %	139473007
3101	NC_009332	TCC	2	6	142993	142998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139473007
3102	NC_009332	GAT	2	6	143135	143140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473007
3103	NC_009332	CAA	2	6	143182	143187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473007
3104	NC_009332	AGA	2	6	143230	143235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473007
3105	NC_009332	TGG	2	6	143247	143252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139473007
3106	NC_009332	GGA	2	6	143311	143316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473007
3107	NC_009332	CTTT	2	8	143426	143433	0 %	75 %	0 %	25 %	139473007
3108	NC_009332	ATCGC	2	10	143481	143490	20 %	20 %	20 %	40 %	139473007
3109	NC_009332	GCA	2	6	143493	143498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139473007
3110	NC_009332	AGA	2	6	143509	143514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473007
3111	NC_009332	CAC	2	6	143564	143569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139473007
3112	NC_009332	GGA	2	6	143582	143587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139473007
3113	NC_009332	TGGT	2	8	143631	143638	0 %	50 %	50 %	0 %	139473008
3114	NC_009332	TGA	2	6	143643	143648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473008
3115	NC_009332	TTG	2	6	143649	143654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473008
3116	NC_009332	AGA	2	6	143845	143850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473008
3117	NC_009332	CGG	2	6	143893	143898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139473008
3118	NC_009332	TCGT	2	8	144021	144028	0 %	50 %	25 %	25 %	139473008
3119	NC_009332	T	6	6	144045	144050	0 %	100 %	0 %	0 %	139473008
3120	NC_009332	TGA	2	6	144118	144123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473008
3121	NC_009332	ATGA	2	8	144182	144189	50 %	25 %	25 %	0 %	139473008
3122	NC_009332	GATC	2	8	144212	144219	25 %	25 %	25 %	25 %	139473008
3123	NC_009332	TATT	2	8	144225	144232	25 %	75 %	0 %	0 %	139473008
3124	NC_009332	ACA	2	6	144287	144292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139473008
3125	NC_009332	TCA	2	6	144333	144338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473008
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3127	NC_009332	TC	3	6	144439	144444	0 %	50 %	0 %	50 %	139473008
3128	NC_009332	GTC	2	6	144465	144470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139473008
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3132	NC_009332	ATT	2	6	144578	144583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139473008
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3151	NC_009332	CAT	2	6	145673	145678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139473009
3152	NC_009332	ATT	2	6	145708	145713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_009332	AGT	2	6	145719	145724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3155	NC_009332	GCTT	2	8	145763	145770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3156	NC_009332	GTT	2	6	145810	145815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139473010
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3220	NC_009332	TAA	2	6	148175	148180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_009332	A	6	6	148199	148204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_009332	T	6	6	148208	148213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_009332	TAA	2	6	148218	148223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_009332	AT	3	6	148232	148237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3225	NC_009332	CCTG	2	8	148254	148261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3226	NC_009332	CTT	2	6	148309	148314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3231	NC_009332	AAG	2	6	148532	148537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139473012
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3233	NC_009332	A	6	6	148578	148583	100 %	0 %	0 %	0 %	139473012
3234	NC_009332	ATG	2	6	148650	148655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139473012
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3500	NC_009332	TACC	2	8	160620	160627	25 %	25 %	0 %	50 %	139473022

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