MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009332	GAA	2	6	69757	69762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472934
1502	NC_009332	AAG	2	6	69902	69907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472935
1503	NC_009332	AAGA	2	8	69916	69923	75 %	0 %	25 %	0 %	139472935
1504	NC_009332	A	6	6	69934	69939	100 %	0 %	0 %	0 %	139472935
1505	NC_009332	GCA	2	6	69967	69972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472935
1506	NC_009332	GAAAT	2	10	70045	70054	60 %	20 %	20 %	0 %	139472935
1507	NC_009332	ACC	2	6	70173	70178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139472936
1508	NC_009332	A	6	6	70208	70213	100 %	0 %	0 %	0 %	139472936
1509	NC_009332	ATG	2	6	70224	70229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472936
1510	NC_009332	AAC	2	6	70232	70237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472936
1511	NC_009332	AAG	2	6	70245	70250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472936
1512	NC_009332	TCGT	2	8	70257	70264	0 %	50 %	25 %	25 %	139472936
1513	NC_009332	AGT	2	6	70315	70320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472936
1514	NC_009332	GAA	2	6	70322	70327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472936
1515	NC_009332	TTA	2	6	70332	70337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472936
1516	NC_009332	CAA	2	6	70373	70378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472937
1517	NC_009332	ATA	2	6	70401	70406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472937
1518	NC_009332	TGG	2	6	70441	70446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472937
1519	NC_009332	TGG	2	6	70510	70515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472937
1520	NC_009332	A	6	6	70523	70528	100 %	0 %	0 %	0 %	139472937
1521	NC_009332	TCGT	2	8	70551	70558	0 %	50 %	25 %	25 %	139472937
1522	NC_009332	GAC	2	6	70604	70609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472937
1523	NC_009332	TGC	2	6	70612	70617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472937
1524	NC_009332	ATC	2	6	70622	70627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472937
1525	NC_009332	TGA	2	6	70630	70635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472937
1526	NC_009332	CTC	2	6	70641	70646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139472937
1527	NC_009332	ATA	2	6	70796	70801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009332	A	7	7	70822	70828	100 %	0 %	0 %	0 %	139472938
1529	NC_009332	TTG	2	6	70914	70919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472938
1530	NC_009332	A	6	6	70937	70942	100 %	0 %	0 %	0 %	139472938
1531	NC_009332	TCG	2	6	70980	70985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472938
1532	NC_009332	AAG	2	6	70989	70994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472938
1533	NC_009332	GTT	2	6	71063	71068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472938
1534	NC_009332	A	6	6	71075	71080	100 %	0 %	0 %	0 %	139472938
1535	NC_009332	A	6	6	71093	71098	100 %	0 %	0 %	0 %	139472938
1536	NC_009332	AAGGA	2	10	71125	71134	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009332	A	6	6	71286	71291	100 %	0 %	0 %	0 %	139472939
1538	NC_009332	TTA	2	6	71342	71347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472939
1539	NC_009332	AATC	2	8	71360	71367	50 %	25 %	0 %	25 %	139472939
1540	NC_009332	CAA	2	6	71498	71503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472939
1541	NC_009332	AAC	2	6	71546	71551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472939
1542	NC_009332	TGA	2	6	71574	71579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472939
1543	NC_009332	ACT	2	6	71617	71622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472939
1544	NC_009332	GAA	2	6	71635	71640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472939
1545	NC_009332	ATA	2	6	71682	71687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472939
1546	NC_009332	TAAA	2	8	71693	71700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009332	A	6	6	71707	71712	100 %	0 %	0 %	0 %	139472940
1548	NC_009332	CTT	2	6	71876	71881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472940
1549	NC_009332	TTC	2	6	71911	71916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_009332	TTAA	2	8	71933	71940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009332	ACA	2	6	71980	71985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_009332	A	6	6	72032	72037	100 %	0 %	0 %	0 %	139472941
1553	NC_009332	TGAC	2	8	72044	72051	25 %	25 %	25 %	25 %	139472941
1554	NC_009332	A	6	6	72133	72138	100 %	0 %	0 %	0 %	139472941
1555	NC_009332	A	6	6	72174	72179	100 %	0 %	0 %	0 %	139472941
1556	NC_009332	GAT	2	6	72196	72201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472941
1557	NC_009332	CAT	2	6	72210	72215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472941
1558	NC_009332	GT	3	6	72218	72223	0 %	50 %	50 %	0 %	139472941
1559	NC_009332	A	6	6	72237	72242	100 %	0 %	0 %	0 %	139472941
1560	NC_009332	TGA	2	6	72309	72314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472941
1561	NC_009332	TGAC	2	8	72374	72381	25 %	25 %	25 %	25 %	139472941
1562	NC_009332	AAG	2	6	72383	72388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472941
1563	NC_009332	TGG	2	6	72405	72410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472941
1564	NC_009332	CGT	2	6	72452	72457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_009332	CA	3	6	72521	72526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1566	NC_009332	TAA	2	6	72652	72657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472942
1567	NC_009332	AAC	2	6	72695	72700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472942
1568	NC_009332	TTA	2	6	72705	72710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472942
1569	NC_009332	ACTC	2	8	72733	72740	25 %	25 %	0 %	50 %	139472942
1570	NC_009332	CAA	2	6	72748	72753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472942
1571	NC_009332	A	6	6	72887	72892	100 %	0 %	0 %	0 %	139472942
1572	NC_009332	CAA	2	6	73045	73050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472942
1573	NC_009332	GTT	2	6	73055	73060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472942
1574	NC_009332	GCT	2	6	73070	73075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472942
1575	NC_009332	CAAAGG	2	12	73108	73119	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	139472942
1576	NC_009332	TACG	2	8	73139	73146	25 %	25 %	25 %	25 %	139472942
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1579	NC_009332	CT	3	6	73342	73347	0 %	50 %	0 %	50 %	139472943
1580	NC_009332	CTG	2	6	73352	73357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472943
1581	NC_009332	TGA	2	6	73413	73418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472943
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1584	NC_009332	GGA	2	6	73639	73644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009332	AAT	2	6	73650	73655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472944
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1592	NC_009332	GCT	2	6	73846	73851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472944
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1595	NC_009332	TAT	2	6	73931	73936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472944
1596	NC_009332	TGC	2	6	73965	73970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472944
1597	NC_009332	TGG	2	6	73971	73976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472944
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1599	NC_009332	AGA	2	6	74100	74105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472944
1600	NC_009332	ATC	2	6	74157	74162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_009332	AAATTA	2	12	74170	74181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472945
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1603	NC_009332	TGT	2	6	74228	74233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472945
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1605	NC_009332	AGA	2	6	74273	74278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472945
1606	NC_009332	TGC	2	6	74282	74287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472945
1607	NC_009332	T	6	6	74412	74417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009332	CAA	2	6	74420	74425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009332	AGT	2	6	74428	74433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009332	A	7	7	74544	74550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009332	A	6	6	74555	74560	100 %	0 %	0 %	0 %	139472946
1612	NC_009332	GCT	2	6	74581	74586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472946
1613	NC_009332	CAT	2	6	74627	74632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472946
1614	NC_009332	GCGGTG	2	12	74684	74695	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	139472946
1615	NC_009332	CGT	2	6	74734	74739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472946
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1617	NC_009332	A	6	6	74914	74919	100 %	0 %	0 %	0 %	139472946
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1621	NC_009332	TAT	2	6	74964	74969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472946
1622	NC_009332	GGT	2	6	74977	74982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472946
1623	NC_009332	TAAAGA	2	12	75045	75056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	139472947
1624	NC_009332	TTAG	2	8	75191	75198	25 %	50 %	25 %	0 %	139472947
1625	NC_009332	AT	3	6	75247	75252	50 %	50 %	0 %	0 %	139472947
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