MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 39256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009332	ATA	2	6	46937	46942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009332	TTG	3	9	46983	46991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472913
1003	NC_009332	GGT	2	6	46997	47002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472913
1004	NC_009332	AAG	2	6	47021	47026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472913
1005	NC_009332	ATG	2	6	47073	47078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472913
1006	NC_009332	TAG	2	6	47112	47117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472913
1007	NC_009332	TGA	2	6	47185	47190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472913
1008	NC_009332	AGC	2	6	47197	47202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472913
1009	NC_009332	TGA	2	6	47212	47217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472913
1010	NC_009332	CAA	2	6	47250	47255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472913
1011	NC_009332	GCA	2	6	47258	47263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472913
1012	NC_009332	CAG	2	6	47325	47330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472913
1013	NC_009332	AAAGCC	2	12	47357	47368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	139472913
1014	NC_009332	GGC	2	6	47467	47472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	139472913
1015	NC_009332	GAG	2	6	47546	47551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139472913
1016	NC_009332	CAT	2	6	47590	47595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472913
1017	NC_009332	TGG	2	6	47650	47655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472913
1018	NC_009332	ATG	2	6	47909	47914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472913
1019	NC_009332	ATC	2	6	48038	48043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472913
1020	NC_009332	CTA	2	6	48046	48051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472913
1021	NC_009332	TC	3	6	48088	48093	0 %	50 %	0 %	50 %	139472913
1022	NC_009332	GGA	2	6	48098	48103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	139472913
1023	NC_009332	CAC	2	6	48121	48126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139472913
1024	NC_009332	AGA	2	6	48127	48132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472913
1025	NC_009332	GCAGG	2	10	48143	48152	20 %	0 %	60 %	20 %	139472913
1026	NC_009332	CAA	2	6	48176	48181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472913
1027	NC_009332	ACA	2	6	48185	48190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472913
1028	NC_009332	TCT	2	6	48195	48200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472913
1029	NC_009332	AGAA	2	8	48294	48301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009332	A	6	6	48335	48340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009332	CGT	2	6	48382	48387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_009332	CTG	2	6	48394	48399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_009332	ATT	2	6	48528	48533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472914
1034	NC_009332	TAT	2	6	48536	48541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472914
1035	NC_009332	A	6	6	48574	48579	100 %	0 %	0 %	0 %	139472914
1036	NC_009332	GAA	2	6	48617	48622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472914
1037	NC_009332	GTC	2	6	48624	48629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472914
1038	NC_009332	ATC	3	9	48696	48704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472914
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1041	NC_009332	ATT	2	6	49018	49023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472915
1042	NC_009332	GGT	3	9	49024	49032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472915
1043	NC_009332	GAT	2	6	49044	49049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472915
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1045	NC_009332	CTA	2	6	49097	49102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472915
1046	NC_009332	CTGCC	2	10	49107	49116	0 %	20 %	20 %	60 %	139472915
1047	NC_009332	GAT	2	6	49150	49155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472915
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1050	NC_009332	CAG	2	6	49463	49468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472915
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1052	NC_009332	CTCAG	2	10	49500	49509	20 %	20 %	20 %	40 %	139472915
1053	NC_009332	CAA	2	6	49614	49619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472915
1054	NC_009332	CT	3	6	49724	49729	0 %	50 %	0 %	50 %	139472915
1055	NC_009332	GAT	2	6	49753	49758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472915
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1059	NC_009332	CAG	2	6	49930	49935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472915
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1062	NC_009332	TA	3	6	50081	50086	50 %	50 %	0 %	0 %	139472916
1063	NC_009332	CAAT	2	8	50145	50152	50 %	25 %	0 %	25 %	139472916
1064	NC_009332	TTA	2	6	50166	50171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472916
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1066	NC_009332	AT	3	6	50216	50221	50 %	50 %	0 %	0 %	139472916
1067	NC_009332	TA	3	6	50356	50361	50 %	50 %	0 %	0 %	139472916
1068	NC_009332	ATT	2	6	50379	50384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472916
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1071	NC_009332	TAG	2	6	50512	50517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472916
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1083	NC_009332	ATA	2	6	50828	50833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472916
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1093	NC_009332	TGA	2	6	51121	51126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472916
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1096	NC_009332	AG	3	6	51283	51288	50 %	0 %	50 %	0 %	139472916
1097	NC_009332	T	6	6	51480	51485	0 %	100 %	0 %	0 %	139472916
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1101	NC_009332	TTGG	2	8	51572	51579	0 %	50 %	50 %	0 %	139472917
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1106	NC_009332	CAAG	2	8	51824	51831	50 %	0 %	25 %	25 %	139472917
1107	NC_009332	CAT	2	6	51908	51913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472917
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1110	NC_009332	AAC	2	6	52246	52251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472917
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1112	NC_009332	GC	3	6	52347	52352	0 %	0 %	50 %	50 %	139472917
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1118	NC_009332	GAA	2	6	52611	52616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472917
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1125	NC_009332	CTT	2	6	52823	52828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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