MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 3390

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< Previous 1 2 3 456 7 Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009140	GCAA	2	8	104286	104293	50 %	0 %	25 %	25 %	134047202
2002	NC_009140	TTC	2	6	104306	104311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047202
2003	NC_009140	AGGT	2	8	104339	104346	25 %	25 %	50 %	0 %	134047202
2004	NC_009140	TCA	2	6	104408	104413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_009140	ACA	2	6	104414	104419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_009140	CAA	2	6	104456	104461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047179
2007	NC_009140	AAG	2	6	104596	104601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047179
2008	NC_009140	TGC	2	6	104616	104621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047179
2009	NC_009140	GGA	2	6	104665	104670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_009140	CTC	2	6	104690	104695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_009140	GAG	2	6	104706	104711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_009140	CAA	2	6	104791	104796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047237
2013	NC_009140	GT	3	6	104832	104837	0 %	50 %	50 %	0 %	134047237
2014	NC_009140	CAT	2	6	104982	104987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047237
2015	NC_009140	TCAG	2	8	104988	104995	25 %	25 %	25 %	25 %	134047237
2016	NC_009140	CT	3	6	105006	105011	0 %	50 %	0 %	50 %	134047237
2017	NC_009140	ACC	2	6	105174	105179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047128
2018	NC_009140	ATC	2	6	105242	105247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047128
2019	NC_009140	CTC	2	6	105249	105254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047128
2020	NC_009140	AG	3	6	105290	105295	50 %	0 %	50 %	0 %	134047128
2021	NC_009140	GGTT	2	8	105347	105354	0 %	50 %	50 %	0 %	134047128
2022	NC_009140	GTG	2	6	105404	105409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047128
2023	NC_009140	GGT	2	6	105459	105464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047128
2024	NC_009140	TGA	2	6	105529	105534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047128
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2027	NC_009140	TGA	2	6	105758	105763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047204
2028	NC_009140	GGA	2	6	105812	105817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047204
2029	NC_009140	TCC	2	6	105863	105868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2030	NC_009140	GGCT	2	8	106032	106039	0 %	25 %	50 %	25 %	134047126
2031	NC_009140	GAT	2	6	106162	106167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047102
2032	NC_009140	TTC	2	6	106199	106204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047102
2033	NC_009140	TGA	3	9	106264	106272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047102
2034	NC_009140	CTG	2	6	106408	106413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047102
2035	NC_009140	G	6	6	106492	106497	0 %	0 %	100 %	0 %	134047102
2036	NC_009140	CT	3	6	106571	106576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_009140	CAAA	2	8	106610	106617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2038	NC_009140	TGG	2	6	106660	106665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_009140	ACT	2	6	106696	106701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047207
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2041	NC_009140	GAAA	2	8	106917	106924	75 %	0 %	25 %	0 %	134047207
2042	NC_009140	TGC	2	6	106949	106954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047207
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2044	NC_009140	GTG	2	6	107083	107088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_009140	CAT	2	6	107111	107116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047149
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2047	NC_009140	ACGAA	2	10	107290	107299	60 %	0 %	20 %	20 %	134047149
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2049	NC_009140	TGGC	2	8	107368	107375	0 %	25 %	50 %	25 %	134047149
2050	NC_009140	GA	3	6	107485	107490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_009140	CTA	2	6	107499	107504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047248
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2063	NC_009140	CT	3	6	108299	108304	0 %	50 %	0 %	50 %	134047248
2064	NC_009140	TGT	2	6	108382	108387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047248
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2091	NC_009140	AAAC	2	8	110393	110400	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2092	NC_009140	CCT	2	6	110428	110433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2093	NC_009140	G	6	6	110438	110443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_009140	T	6	6	110495	110500	0 %	100 %	0 %	0 %	134047097
2095	NC_009140	CTT	2	6	110510	110515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047097
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2103	NC_009140	ACTG	2	8	111033	111040	25 %	25 %	25 %	25 %	134047259
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2107	NC_009140	TGGC	2	8	111301	111308	0 %	25 %	50 %	25 %	134047259
2108	NC_009140	GGC	2	6	111783	111788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047259
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2122	NC_009140	ATG	2	6	112717	112722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047259
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2125	NC_009140	TGG	2	6	112873	112878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047259
2126	NC_009140	CAC	2	6	112912	112917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047259
2127	NC_009140	GTT	2	6	112932	112937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047259
2128	NC_009140	GAA	2	6	112969	112974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047259
2129	NC_009140	TGAC	2	8	113009	113016	25 %	25 %	25 %	25 %	134047259
2130	NC_009140	TCG	2	6	113091	113096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047259
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2133	NC_009140	CTAT	2	8	113246	113253	25 %	50 %	0 %	25 %	134047259
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2138	NC_009140	TAACC	2	10	113540	113549	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2139	NC_009140	GGA	2	6	113555	113560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2140	NC_009140	CCT	2	6	113565	113570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2141	NC_009140	TC	3	6	113575	113580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2142	NC_009140	CAAA	2	8	113584	113591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2143	NC_009140	GA	3	6	113593	113598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2144	NC_009140	TGG	2	6	113627	113632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047135
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2150	NC_009140	TGT	2	6	113987	113992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047192
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2152	NC_009140	TGCT	2	8	114061	114068	0 %	50 %	25 %	25 %	134047192
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2163	NC_009140	TGG	2	6	114759	114764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047190
2164	NC_009140	ATC	2	6	114767	114772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047190
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2234	NC_009140	GAT	2	6	118842	118847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047267
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2236	NC_009140	CTG	2	6	119137	119142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047267
2237	NC_009140	TGA	2	6	119195	119200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047267
2238	NC_009140	ACG	2	6	119313	119318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047201
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2240	NC_009140	ATG	2	6	119420	119425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047201
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2242	NC_009140	AAG	2	6	119443	119448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047201
2243	NC_009140	TGA	2	6	119479	119484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047201
2244	NC_009140	CGA	2	6	119487	119492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047201
2245	NC_009140	CCT	2	6	119595	119600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2246	NC_009140	TC	3	6	119664	119669	0 %	50 %	0 %	50 %	134047251
2247	NC_009140	AAG	2	6	119675	119680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047251
2248	NC_009140	GTC	2	6	119750	119755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047251
2249	NC_009140	GAC	2	6	119804	119809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047251
2250	NC_009140	GCTT	2	8	119816	119823	0 %	50 %	25 %	25 %	134047251
2251	NC_009140	TGA	2	6	119881	119886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_009140	ATC	2	6	119961	119966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_009140	ATGA	2	8	119990	119997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_009140	GAC	2	6	120099	120104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047231
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2258	NC_009140	GTC	2	6	120250	120255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047231
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2274	NC_009140	GTT	2	6	120883	120888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047231
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2276	NC_009140	GAT	2	6	120959	120964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047231
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2278	NC_009140	AGG	2	6	121073	121078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2279	NC_009140	TAAA	2	8	121094	121101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2280	NC_009140	GCT	2	6	121161	121166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047160
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2284	NC_009140	GCCGT	2	10	121246	121255	0 %	20 %	40 %	40 %	134047160
2285	NC_009140	TGG	2	6	121271	121276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047160
2286	NC_009140	GCC	2	6	121312	121317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047160
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2327	NC_009140	CTG	3	9	123135	123143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047160
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2344	NC_009140	CTT	2	6	124363	124368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2348	NC_009140	CAG	2	6	124493	124498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2349	NC_009140	GCT	2	6	124601	124606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2350	NC_009140	TCAA	2	8	124696	124703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2351	NC_009140	AGA	2	6	124753	124758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2352	NC_009140	AGC	2	6	124794	124799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2353	NC_009140	ACG	2	6	124823	124828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2354	NC_009140	GCT	2	6	124830	124835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2355	NC_009140	GGA	2	6	124857	124862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2368	NC_009140	GCCA	2	8	125753	125760	25 %	0 %	25 %	50 %	134047152
2369	NC_009140	GCT	2	6	125782	125787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047152
2370	NC_009140	GTTCG	2	10	125856	125865	0 %	40 %	40 %	20 %	134047152
2371	NC_009140	GGT	2	6	125930	125935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047152
2372	NC_009140	T	7	7	125974	125980	0 %	100 %	0 %	0 %	134047161
2373	NC_009140	AGC	2	6	126006	126011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047161
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2375	NC_009140	GCA	2	6	126067	126072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047161
2376	NC_009140	CAT	2	6	126100	126105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047161
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2379	NC_009140	TGA	2	6	126277	126282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047161
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2383	NC_009140	TTG	2	6	126372	126377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047161
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2394	NC_009140	TAT	2	6	127008	127013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_009140	ATA	2	6	127026	127031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2419	NC_009140	CGC	2	6	128029	128034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2421	NC_009140	TTC	2	6	128059	128064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2436	NC_009140	CGC	2	6	128500	128505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2447	NC_009140	GAG	2	6	129075	129080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047129
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2460	NC_009140	CG	3	6	129498	129503	0 %	0 %	50 %	50 %	134047129
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2470	NC_009140	GC	3	6	129875	129880	0 %	0 %	50 %	50 %	134047129
2471	NC_009140	CGA	2	6	129920	129925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047129
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2479	NC_009140	GCG	2	6	130144	130149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047129
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2481	NC_009140	GGC	2	6	130164	130169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047129
2482	NC_009140	CAAG	2	8	130196	130203	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2483	NC_009140	CCCGC	2	10	130268	130277	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2484	NC_009140	AGC	2	6	130342	130347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2485	NC_009140	CGG	2	6	130391	130396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047141
2486	NC_009140	GC	3	6	130410	130415	0 %	0 %	50 %	50 %	134047141
2487	NC_009140	GCCG	2	8	130420	130427	0 %	0 %	50 %	50 %	134047141
2488	NC_009140	CGC	2	6	130432	130437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047141
2489	NC_009140	CG	3	6	130447	130452	0 %	0 %	50 %	50 %	134047141
2490	NC_009140	GCT	2	6	130471	130476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047141
2491	NC_009140	CG	3	6	130513	130518	0 %	0 %	50 %	50 %	134047141
2492	NC_009140	CCGC	2	8	130534	130541	0 %	0 %	25 %	75 %	134047141
2493	NC_009140	GAG	2	6	130559	130564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047141
2494	NC_009140	ACCT	2	8	130571	130578	25 %	25 %	0 %	50 %	134047141
2495	NC_009140	GCG	2	6	130584	130589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047141
2496	NC_009140	GTG	2	6	130613	130618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047141
2497	NC_009140	TGG	2	6	130644	130649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047141
2498	NC_009140	AAG	2	6	130661	130666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047141
2499	NC_009140	GCG	2	6	130693	130698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047141
2500	NC_009140	GC	3	6	130710	130715	0 %	0 %	50 %	50 %	134047141

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