MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 plasmid pSN254

Total Repeats: 3390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009140	GTC	2	6	25941	25946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047163
502	NC_009140	TCAAG	2	10	26120	26129	40 %	20 %	20 %	20 %	134047163
503	NC_009140	CTT	2	6	26210	26215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047163
504	NC_009140	TCT	3	9	26218	26226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047163
505	NC_009140	CGGT	2	8	26479	26486	0 %	25 %	50 %	25 %	134047163
506	NC_009140	CGA	2	6	26534	26539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047163
507	NC_009140	GTC	2	6	26736	26741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047163
508	NC_009140	CGA	2	6	26746	26751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009140	GCG	2	6	26774	26779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047131
510	NC_009140	GTTCA	2	10	26844	26853	20 %	40 %	20 %	20 %	134047131
511	NC_009140	TCGCCG	2	12	26854	26865	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	134047131
512	NC_009140	GC	3	6	26923	26928	0 %	0 %	50 %	50 %	134047131
513	NC_009140	GGA	2	6	26942	26947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047131
514	NC_009140	GCAG	2	8	27003	27010	25 %	0 %	50 %	25 %	134047131
515	NC_009140	CGG	2	6	27031	27036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047131
516	NC_009140	CTGG	2	8	27084	27091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_009140	GGCA	2	8	27106	27113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
518	NC_009140	TGTA	2	8	27155	27162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009140	GGC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009140	CGGGAT	2	12	27219	27230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
521	NC_009140	GAA	2	6	27363	27368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047112
522	NC_009140	GGCA	2	8	27396	27403	25 %	0 %	50 %	25 %	134047112
523	NC_009140	GTT	2	6	27450	27455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134047112
524	NC_009140	AGG	2	6	27483	27488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047112
525	NC_009140	CGA	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047112
526	NC_009140	GCC	2	6	27519	27524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047112
527	NC_009140	CCTG	2	8	27562	27569	0 %	25 %	25 %	50 %	134047112
528	NC_009140	ACA	2	6	27571	27576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047112
529	NC_009140	TTGC	2	8	27577	27584	0 %	50 %	25 %	25 %	134047112
530	NC_009140	AAGC	2	8	27610	27617	50 %	0 %	25 %	25 %	134047112
531	NC_009140	CCAT	2	8	27637	27644	25 %	25 %	0 %	50 %	134047112
532	NC_009140	GGC	2	6	27728	27733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047112
533	NC_009140	CGGC	2	8	27853	27860	0 %	0 %	50 %	50 %	134047112
534	NC_009140	ATG	2	6	27879	27884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047112
535	NC_009140	AAG	2	6	27885	27890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047112
536	NC_009140	GCG	2	6	27903	27908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047112
537	NC_009140	ACG	2	6	27909	27914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047112
538	NC_009140	AGCG	2	8	27941	27948	25 %	0 %	50 %	25 %	134047112
539	NC_009140	CGGC	2	8	27971	27978	0 %	0 %	50 %	50 %	134047112
540	NC_009140	GAA	2	6	28052	28057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047112
541	NC_009140	G	6	6	28066	28071	0 %	0 %	100 %	0 %	134047112
542	NC_009140	CCCGAA	2	12	28115	28126	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	134047112
543	NC_009140	CG	4	8	28152	28159	0 %	0 %	50 %	50 %	134047112
544	NC_009140	AAAGG	2	10	28255	28264	60 %	0 %	40 %	0 %	134047112
545	NC_009140	ATG	2	6	28275	28280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047112
546	NC_009140	CAG	2	6	28291	28296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047112
547	NC_009140	GCC	3	9	28324	28332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047112
548	NC_009140	GC	3	6	28348	28353	0 %	0 %	50 %	50 %	134047112
549	NC_009140	CAG	2	6	28397	28402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047112
550	NC_009140	CGT	2	6	28423	28428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047112
551	NC_009140	AGG	2	6	28449	28454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047112
552	NC_009140	GCA	2	6	28459	28464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047112
553	NC_009140	CG	3	6	28582	28587	0 %	0 %	50 %	50 %	134047112
554	NC_009140	TGG	2	6	28609	28614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134047112
555	NC_009140	GCC	2	6	28682	28687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047255
556	NC_009140	GAC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047255
557	NC_009140	CAG	2	6	28757	28762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047255
558	NC_009140	GCT	2	6	28798	28803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047255
559	NC_009140	CGA	3	9	28861	28869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047255
560	NC_009140	CAGG	2	8	28906	28913	25 %	0 %	50 %	25 %	134047255
561	NC_009140	GCT	2	6	28915	28920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047255
562	NC_009140	GC	4	8	28935	28942	0 %	0 %	50 %	50 %	134047255
563	NC_009140	GCTTC	2	10	28996	29005	0 %	40 %	20 %	40 %	134047255
564	NC_009140	TGA	2	6	29049	29054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047255
565	NC_009140	GAG	2	6	29087	29092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047255
566	NC_009140	GCG	2	6	29121	29126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047255
567	NC_009140	CGC	2	6	29151	29156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047255
568	NC_009140	CGA	2	6	29182	29187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047255
569	NC_009140	AGG	2	6	29249	29254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	134047255
570	NC_009140	CACT	2	8	29325	29332	25 %	25 %	0 %	50 %	134047104
571	NC_009140	CAG	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047104
572	NC_009140	ACA	2	6	29350	29355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047104
573	NC_009140	TCCCC	2	10	29356	29365	0 %	20 %	0 %	80 %	134047104
574	NC_009140	AGC	2	6	29390	29395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047104
575	NC_009140	TGCCC	2	10	29414	29423	0 %	20 %	20 %	60 %	134047104
576	NC_009140	CT	3	6	29454	29459	0 %	50 %	0 %	50 %	134047104
577	NC_009140	GGC	2	6	29460	29465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047104
578	NC_009140	CTG	2	6	29478	29483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047104
579	NC_009140	CG	3	6	29515	29520	0 %	0 %	50 %	50 %	134047104
580	NC_009140	GGC	2	6	29559	29564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047104
581	NC_009140	TGC	2	6	29708	29713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009140	CTC	2	6	29936	29941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047221
583	NC_009140	GA	3	6	30028	30033	50 %	0 %	50 %	0 %	134047221
584	NC_009140	GTC	2	6	30077	30082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047221
585	NC_009140	GGC	2	6	30110	30115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047221
586	NC_009140	CCAG	2	8	30157	30164	25 %	0 %	25 %	50 %	134047221
587	NC_009140	ATG	2	6	30180	30185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047221
588	NC_009140	ATG	2	6	30191	30196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047221
589	NC_009140	TCA	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
590	NC_009140	CGC	2	6	30257	30262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047221
591	NC_009140	ATC	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
592	NC_009140	GC	3	6	30302	30307	0 %	0 %	50 %	50 %	134047221
593	NC_009140	GA	3	6	30448	30453	50 %	0 %	50 %	0 %	134047221
594	NC_009140	CTCCC	2	10	30517	30526	0 %	20 %	0 %	80 %	134047221
595	NC_009140	TCA	2	6	30561	30566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134047221
596	NC_009140	TCT	2	6	30573	30578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134047221
597	NC_009140	GGC	2	6	30702	30707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047221
598	NC_009140	AAGGC	2	10	30749	30758	40 %	0 %	40 %	20 %	134047125
599	NC_009140	GC	3	6	30809	30814	0 %	0 %	50 %	50 %	134047125
600	NC_009140	CTG	2	6	30885	30890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047125
601	NC_009140	GCC	2	6	30897	30902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047125
602	NC_009140	CCA	2	6	30942	30947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047125
603	NC_009140	AAC	2	6	30979	30984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134047125
604	NC_009140	GCG	2	6	31053	31058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047125
605	NC_009140	AAG	2	6	31079	31084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134047125
606	NC_009140	TGC	2	6	31196	31201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134047125
607	NC_009140	CAGA	2	8	31236	31243	50 %	0 %	25 %	25 %	134047125
608	NC_009140	GCC	2	6	31247	31252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047125
609	NC_009140	TCC	2	6	31298	31303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134047125
610	NC_009140	TGA	2	6	31311	31316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047125
611	NC_009140	CGG	2	6	31385	31390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047125
612	NC_009140	CAC	2	6	31425	31430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047125
613	NC_009140	A	8	8	31495	31502	100 %	0 %	0 %	0 %	134047125
614	NC_009140	TGA	2	6	31539	31544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009140	TTTC	2	8	31596	31603	0 %	75 %	0 %	25 %	134047177
616	NC_009140	GCC	2	6	31607	31612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047177
617	NC_009140	GT	3	6	31648	31653	0 %	50 %	50 %	0 %	134047177
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619	NC_009140	GC	4	8	31740	31747	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
620	NC_009140	ACAG	2	8	31766	31773	50 %	0 %	25 %	25 %	134047177
621	NC_009140	AGC	2	6	31843	31848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047177
622	NC_009140	A	6	6	31855	31860	100 %	0 %	0 %	0 %	134047177
623	NC_009140	GC	3	6	31924	31929	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
624	NC_009140	CGC	2	6	31939	31944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134047177
625	NC_009140	ATG	2	6	31955	31960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134047177
626	NC_009140	CTGC	2	8	31986	31993	0 %	25 %	25 %	50 %	134047177
627	NC_009140	ACG	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134047177
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629	NC_009140	CAC	2	6	32097	32102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134047177
630	NC_009140	CGAG	2	8	32142	32149	25 %	0 %	50 %	25 %	134047177
631	NC_009140	CG	3	6	32195	32200	0 %	0 %	50 %	50 %	134047177
632	NC_009140	GCG	2	6	32225	32230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	134047177
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888	NC_009140	TAA	2	6	45574	45579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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