MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 6958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009092	GA	3	6	263	268	50 %	0 %	50 %	0 %	127510936
3	NC_009092	GC	3	6	1099	1104	0 %	0 %	50 %	50 %	127510936
4	NC_009092	GA	3	6	1574	1579	50 %	0 %	50 %	0 %	127510937
5	NC_009092	CT	3	6	2068	2073	0 %	50 %	0 %	50 %	127510937
6	NC_009092	TC	3	6	2326	2331	0 %	50 %	0 %	50 %	127510937
7	NC_009092	AC	3	6	3418	3423	50 %	0 %	0 %	50 %	127510938
8	NC_009092	GA	3	6	3772	3777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009092	CT	3	6	5169	5174	0 %	50 %	0 %	50 %	127510939
10	NC_009092	GC	3	6	5515	5520	0 %	0 %	50 %	50 %	127510939
11	NC_009092	GC	3	6	7251	7256	0 %	0 %	50 %	50 %	127510941
12	NC_009092	GC	3	6	8196	8201	0 %	0 %	50 %	50 %	127510942
13	NC_009092	GT	3	6	8933	8938	0 %	50 %	50 %	0 %	127510943
14	NC_009092	AG	3	6	9064	9069	50 %	0 %	50 %	0 %	127510943
15	NC_009092	TC	3	6	9195	9200	0 %	50 %	0 %	50 %	127510943
16	NC_009092	AG	3	6	9304	9309	50 %	0 %	50 %	0 %	127510943
17	NC_009092	GC	3	6	9341	9346	0 %	0 %	50 %	50 %	127510943
18	NC_009092	TC	3	6	9398	9403	0 %	50 %	0 %	50 %	127510943
19	NC_009092	CT	3	6	9751	9756	0 %	50 %	0 %	50 %	127510944
20	NC_009092	AC	3	6	9818	9823	50 %	0 %	0 %	50 %	127510944
21	NC_009092	CG	3	6	10128	10133	0 %	0 %	50 %	50 %	127510944
22	NC_009092	GC	3	6	10323	10328	0 %	0 %	50 %	50 %	127510944
23	NC_009092	AG	3	6	10398	10403	50 %	0 %	50 %	0 %	127510944
24	NC_009092	AG	3	6	10816	10821	50 %	0 %	50 %	0 %	127510944
25	NC_009092	GC	3	6	11025	11030	0 %	0 %	50 %	50 %	127510944
26	NC_009092	TG	3	6	11088	11093	0 %	50 %	50 %	0 %	127510944
27	NC_009092	TA	3	6	12644	12649	50 %	50 %	0 %	0 %	127510946
28	NC_009092	TC	3	6	14769	14774	0 %	50 %	0 %	50 %	127510948
29	NC_009092	GC	3	6	15474	15479	0 %	0 %	50 %	50 %	127510948
30	NC_009092	GA	3	6	15604	15609	50 %	0 %	50 %	0 %	127510948
31	NC_009092	CT	3	6	15771	15776	0 %	50 %	0 %	50 %	127510948
32	NC_009092	AG	3	6	17310	17315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009092	AT	3	6	17456	17461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009092	TC	3	6	18318	18323	0 %	50 %	0 %	50 %	127510950
35	NC_009092	AG	3	6	18570	18575	50 %	0 %	50 %	0 %	127510951
36	NC_009092	TC	3	6	19031	19036	0 %	50 %	0 %	50 %	127510952
37	NC_009092	CA	3	6	20061	20066	50 %	0 %	0 %	50 %	127510953
38	NC_009092	CA	3	6	20844	20849	50 %	0 %	0 %	50 %	127510953
39	NC_009092	AG	3	6	20925	20930	50 %	0 %	50 %	0 %	127510953
40	NC_009092	GC	3	6	20938	20943	0 %	0 %	50 %	50 %	127510953
41	NC_009092	AC	3	6	21176	21181	50 %	0 %	0 %	50 %	127510954
42	NC_009092	GC	3	6	22390	22395	0 %	0 %	50 %	50 %	127510954
43	NC_009092	TC	3	6	23087	23092	0 %	50 %	0 %	50 %	127510954
44	NC_009092	AG	3	6	23567	23572	50 %	0 %	50 %	0 %	127510955
45	NC_009092	AC	3	6	24386	24391	50 %	0 %	0 %	50 %	127510955
46	NC_009092	GT	3	6	24942	24947	0 %	50 %	50 %	0 %	127510956
47	NC_009092	GC	3	6	25176	25181	0 %	0 %	50 %	50 %	127510956
48	NC_009092	GT	4	8	26319	26326	0 %	50 %	50 %	0 %	127510957
49	NC_009092	GA	3	6	26411	26416	50 %	0 %	50 %	0 %	127510957
50	NC_009092	GT	3	6	27664	27669	0 %	50 %	50 %	0 %	127510959
51	NC_009092	GC	3	6	27714	27719	0 %	0 %	50 %	50 %	127510959
52	NC_009092	CT	3	6	27918	27923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009092	CT	3	6	28154	28159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009092	CT	3	6	28516	28521	0 %	50 %	0 %	50 %	127510960
55	NC_009092	CT	3	6	28723	28728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009092	AG	3	6	29704	29709	50 %	0 %	50 %	0 %	127510962
57	NC_009092	GC	3	6	30472	30477	0 %	0 %	50 %	50 %	127510963
58	NC_009092	GA	3	6	30633	30638	50 %	0 %	50 %	0 %	127510963
59	NC_009092	TC	3	6	30685	30690	0 %	50 %	0 %	50 %	127510963
60	NC_009092	AT	3	6	31100	31105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009092	GC	3	6	31274	31279	0 %	0 %	50 %	50 %	127510964
62	NC_009092	AT	3	6	31563	31568	50 %	50 %	0 %	0 %	127510964
63	NC_009092	CT	3	6	31871	31876	0 %	50 %	0 %	50 %	127510964
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69	NC_009092	GC	3	6	36030	36035	0 %	0 %	50 %	50 %	127510967
70	NC_009092	AG	3	6	36174	36179	50 %	0 %	50 %	0 %	127510967
71	NC_009092	TC	3	6	37020	37025	0 %	50 %	0 %	50 %	127510967
72	NC_009092	GC	3	6	37968	37973	0 %	0 %	50 %	50 %	127510968
73	NC_009092	AT	3	6	39444	39449	50 %	50 %	0 %	0 %	127510968
74	NC_009092	GA	3	6	39630	39635	50 %	0 %	50 %	0 %	127510968
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82	NC_009092	AG	3	6	43063	43068	50 %	0 %	50 %	0 %	127510972
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89	NC_009092	TC	3	6	49748	49753	0 %	50 %	0 %	50 %	127510976
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102	NC_009092	GA	3	6	59391	59396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009092	CT	3	6	59975	59980	0 %	50 %	0 %	50 %	127510984
104	NC_009092	TG	3	6	60929	60934	0 %	50 %	50 %	0 %	127510984
105	NC_009092	GA	3	6	61446	61451	50 %	0 %	50 %	0 %	127510985
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107	NC_009092	TG	3	6	63755	63760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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111	NC_009092	CT	3	6	68274	68279	0 %	50 %	0 %	50 %	127510991
112	NC_009092	TC	3	6	68392	68397	0 %	50 %	0 %	50 %	127510991
113	NC_009092	TG	3	6	68399	68404	0 %	50 %	50 %	0 %	127510991
114	NC_009092	TG	3	6	68474	68479	0 %	50 %	50 %	0 %	127510991
115	NC_009092	TG	3	6	68490	68495	0 %	50 %	50 %	0 %	127510991
116	NC_009092	TG	3	6	69178	69183	0 %	50 %	50 %	0 %	127510992
117	NC_009092	GT	3	6	69865	69870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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124	NC_009092	TC	3	6	75879	75884	0 %	50 %	0 %	50 %	127510998
125	NC_009092	AC	3	6	77436	77441	50 %	0 %	0 %	50 %	127510998
126	NC_009092	GC	3	6	78284	78289	0 %	0 %	50 %	50 %	127510999
127	NC_009092	TG	3	6	78434	78439	0 %	50 %	50 %	0 %	127510999
128	NC_009092	TG	3	6	78446	78451	0 %	50 %	50 %	0 %	127510999
129	NC_009092	AG	3	6	79753	79758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_009092	TA	3	6	80356	80361	50 %	50 %	0 %	0 %	127511002
132	NC_009092	GA	5	10	80967	80976	50 %	0 %	50 %	0 %	127511003
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134	NC_009092	GA	3	6	81699	81704	50 %	0 %	50 %	0 %	127511003
135	NC_009092	CG	3	6	82724	82729	0 %	0 %	50 %	50 %	127511004
136	NC_009092	GT	3	6	83325	83330	0 %	50 %	50 %	0 %	127511004
137	NC_009092	TG	3	6	84814	84819	0 %	50 %	50 %	0 %	127511005
138	NC_009092	TA	3	6	86709	86714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009092	GC	4	8	87089	87096	0 %	0 %	50 %	50 %	127511008
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144	NC_009092	GT	3	6	91754	91759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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