MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 10156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009092	ATGG	2	8	207	214	25 %	25 %	50 %	0 %	127510936
2	NC_009092	ATCA	2	8	285	292	50 %	25 %	0 %	25 %	127510936
3	NC_009092	CAAG	2	8	421	428	50 %	0 %	25 %	25 %	127510936
4	NC_009092	TAAC	2	8	1336	1343	50 %	25 %	0 %	25 %	127510936
5	NC_009092	AAGT	2	8	1617	1624	50 %	25 %	25 %	0 %	127510937
6	NC_009092	TCAC	2	8	1627	1634	25 %	25 %	0 %	50 %	127510937
7	NC_009092	GCCG	2	8	1843	1850	0 %	0 %	50 %	50 %	127510937
8	NC_009092	GACG	2	8	4005	4012	25 %	0 %	50 %	25 %	127510939
9	NC_009092	AAGG	2	8	4680	4687	50 %	0 %	50 %	0 %	127510939
10	NC_009092	ATCC	2	8	5481	5488	25 %	25 %	0 %	50 %	127510939
11	NC_009092	AGTT	2	8	6863	6870	25 %	50 %	25 %	0 %	127510940
12	NC_009092	CGAG	2	8	6910	6917	25 %	0 %	50 %	25 %	127510940
13	NC_009092	GCAG	2	8	7137	7144	25 %	0 %	50 %	25 %	127510941
14	NC_009092	CCTC	2	8	7751	7758	0 %	25 %	0 %	75 %	127510941
15	NC_009092	CCAT	2	8	7800	7807	25 %	25 %	0 %	50 %	127510941
16	NC_009092	CTGC	2	8	8669	8676	0 %	25 %	25 %	50 %	127510942
17	NC_009092	GCCA	2	8	8832	8839	25 %	0 %	25 %	50 %	127510943
18	NC_009092	CTGC	2	8	8891	8898	0 %	25 %	25 %	50 %	127510943
19	NC_009092	GATA	2	8	9357	9364	50 %	25 %	25 %	0 %	127510943
20	NC_009092	GCCT	2	8	10416	10423	0 %	25 %	25 %	50 %	127510944
21	NC_009092	CGGA	2	8	11097	11104	25 %	0 %	50 %	25 %	127510944
22	NC_009092	TTGG	2	8	11311	11318	0 %	50 %	50 %	0 %	127510944
23	NC_009092	AGGC	2	8	11759	11766	25 %	0 %	50 %	25 %	127510945
24	NC_009092	GGTA	2	8	13113	13120	25 %	25 %	50 %	0 %	127510946
25	NC_009092	CTAA	2	8	13166	13173	50 %	25 %	0 %	25 %	127510946
26	NC_009092	TCTG	2	8	13213	13220	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
27	NC_009092	GTCT	2	8	13412	13419	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
28	NC_009092	TCAC	2	8	13657	13664	25 %	25 %	0 %	50 %	127510947
29	NC_009092	CTGT	2	8	13687	13694	0 %	50 %	25 %	25 %	127510947
30	NC_009092	CATC	2	8	15397	15404	25 %	25 %	0 %	50 %	127510948
31	NC_009092	TTGC	2	8	15590	15597	0 %	50 %	25 %	25 %	127510948
32	NC_009092	TGCT	2	8	15627	15634	0 %	50 %	25 %	25 %	127510948
33	NC_009092	GATA	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	127510948
34	NC_009092	ATCT	2	8	17114	17121	25 %	50 %	0 %	25 %	127510948
35	NC_009092	TTGG	2	8	17284	17291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009092	CTGG	2	8	18229	18236	0 %	25 %	50 %	25 %	127510950
37	NC_009092	TACT	2	8	19719	19726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009092	TTCC	2	8	21025	21032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009092	CGGC	2	8	21233	21240	0 %	0 %	50 %	50 %	127510954
40	NC_009092	GTAG	2	8	21569	21576	25 %	25 %	50 %	0 %	127510954
41	NC_009092	ATTG	2	8	21888	21895	25 %	50 %	25 %	0 %	127510954
42	NC_009092	GCTT	2	8	22012	22019	0 %	50 %	25 %	25 %	127510954
43	NC_009092	CGCC	2	8	22061	22068	0 %	0 %	25 %	75 %	127510954
44	NC_009092	TGAT	2	8	22153	22160	25 %	50 %	25 %	0 %	127510954
45	NC_009092	CTTG	2	8	22185	22192	0 %	50 %	25 %	25 %	127510954
46	NC_009092	GTCT	2	8	22338	22345	0 %	50 %	25 %	25 %	127510954
47	NC_009092	CCAG	2	8	22925	22932	25 %	0 %	25 %	50 %	127510954
48	NC_009092	TTGC	2	8	23189	23196	0 %	50 %	25 %	25 %	127510954
49	NC_009092	CCAC	2	8	23218	23225	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009092	ATTC	2	8	23591	23598	25 %	50 %	0 %	25 %	127510955
51	NC_009092	GCGA	2	8	24062	24069	25 %	0 %	50 %	25 %	127510955
52	NC_009092	TCCT	2	8	24212	24219	0 %	50 %	0 %	50 %	127510955
53	NC_009092	TATC	2	8	26159	26166	25 %	50 %	0 %	25 %	127510957
54	NC_009092	AGCG	2	8	27572	27579	25 %	0 %	50 %	25 %	127510958
55	NC_009092	GTTC	2	8	27652	27659	0 %	50 %	25 %	25 %	127510959
56	NC_009092	ATTA	2	8	27932	27939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009092	CAGC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009092	CTTG	2	8	28769	28776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009092	GTTT	2	8	28848	28855	0 %	75 %	25 %	0 %	127510961
60	NC_009092	AAGA	2	8	29342	29349	75 %	0 %	25 %	0 %	127510961
61	NC_009092	CCTG	2	8	29356	29363	0 %	25 %	25 %	50 %	127510961
62	NC_009092	CGCC	2	8	30421	30428	0 %	0 %	25 %	75 %	127510963
63	NC_009092	ATCT	2	8	30584	30591	25 %	50 %	0 %	25 %	127510963
64	NC_009092	CTGT	2	8	30611	30618	0 %	50 %	25 %	25 %	127510963
65	NC_009092	TTAT	2	8	31109	31116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009092	GCTC	2	8	31598	31605	0 %	25 %	25 %	50 %	127510964
67	NC_009092	GGCA	2	8	31852	31859	25 %	0 %	50 %	25 %	127510964
68	NC_009092	ATGG	2	8	31971	31978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009092	TGGA	2	8	32313	32320	25 %	25 %	50 %	0 %	127510965
70	NC_009092	GCCA	2	8	32339	32346	25 %	0 %	25 %	50 %	127510965
71	NC_009092	CCAT	2	8	32653	32660	25 %	25 %	0 %	50 %	127510965
72	NC_009092	GTTA	2	8	33282	33289	25 %	50 %	25 %	0 %	127510966
73	NC_009092	ATGT	2	8	34117	34124	25 %	50 %	25 %	0 %	127510966
74	NC_009092	GATC	2	8	34272	34279	25 %	25 %	25 %	25 %	127510966
75	NC_009092	ATCG	2	8	34441	34448	25 %	25 %	25 %	25 %	127510967
76	NC_009092	ATCG	2	8	35430	35437	25 %	25 %	25 %	25 %	127510967
77	NC_009092	GGTT	2	8	35962	35969	0 %	50 %	50 %	0 %	127510967
78	NC_009092	GTCG	2	8	36357	36364	0 %	25 %	50 %	25 %	127510967
79	NC_009092	CTGC	2	8	36883	36890	0 %	25 %	25 %	50 %	127510967
80	NC_009092	GCCT	2	8	37178	37185	0 %	25 %	25 %	50 %	127510967
81	NC_009092	TTAT	2	8	37748	37755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009092	CTGG	2	8	38049	38056	0 %	25 %	50 %	25 %	127510968
83	NC_009092	CAGC	2	8	40112	40119	25 %	0 %	25 %	50 %	127510969
84	NC_009092	AAGG	2	8	40695	40702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009092	GGCG	2	8	41238	41245	0 %	0 %	75 %	25 %	127510970
86	NC_009092	GCCA	2	8	42495	42502	25 %	0 %	25 %	50 %	127510972
87	NC_009092	GCTC	2	8	42622	42629	0 %	25 %	25 %	50 %	127510972
88	NC_009092	CGCC	2	8	43319	43326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_009092	GTAA	2	8	43348	43355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009092	GCTA	2	8	43733	43740	25 %	25 %	25 %	25 %	127510973
91	NC_009092	TGAT	2	8	44167	44174	25 %	50 %	25 %	0 %	127510974
92	NC_009092	TGGT	2	8	45045	45052	0 %	50 %	50 %	0 %	127510974
93	NC_009092	GCCC	2	8	45422	45429	0 %	0 %	25 %	75 %	127510974
94	NC_009092	TGCG	2	8	45788	45795	0 %	25 %	50 %	25 %	127510974
95	NC_009092	GTCT	2	8	46522	46529	0 %	50 %	25 %	25 %	127510975
96	NC_009092	GCCG	2	8	46827	46834	0 %	0 %	50 %	50 %	127510975
97	NC_009092	AAAC	2	8	47043	47050	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009092	GCCA	2	8	47584	47591	25 %	0 %	25 %	50 %	127510976
99	NC_009092	CAGA	2	8	47632	47639	50 %	0 %	25 %	25 %	127510976
100	NC_009092	ATAG	2	8	47788	47795	50 %	25 %	25 %	0 %	127510976
101	NC_009092	GATC	2	8	48219	48226	25 %	25 %	25 %	25 %	127510976
102	NC_009092	AGAT	2	8	48365	48372	50 %	25 %	25 %	0 %	127510976
103	NC_009092	TGAG	2	8	48857	48864	25 %	25 %	50 %	0 %	127510976
104	NC_009092	CTGC	2	8	49830	49837	0 %	25 %	25 %	50 %	127510976
105	NC_009092	GAGC	2	8	50436	50443	25 %	0 %	50 %	25 %	127510976
106	NC_009092	GTAG	2	8	51205	51212	25 %	25 %	50 %	0 %	127510977
107	NC_009092	TCTA	2	8	51349	51356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009092	ATCA	2	8	51529	51536	50 %	25 %	0 %	25 %	127510978
109	NC_009092	AAAC	2	8	51554	51561	75 %	0 %	0 %	25 %	127510978
110	NC_009092	TATT	2	8	51581	51588	25 %	75 %	0 %	0 %	127510978
111	NC_009092	TGGT	2	8	52812	52819	0 %	50 %	50 %	0 %	127510979
112	NC_009092	TATC	2	8	53645	53652	25 %	50 %	0 %	25 %	127510979
113	NC_009092	GGCA	2	8	53831	53838	25 %	0 %	50 %	25 %	127510979
114	NC_009092	TTGT	2	8	54009	54016	0 %	75 %	25 %	0 %	127510979
115	NC_009092	AACG	2	8	54036	54043	50 %	0 %	25 %	25 %	127510979
116	NC_009092	AGCC	2	8	54293	54300	25 %	0 %	25 %	50 %	127510979
117	NC_009092	GCCC	2	8	54672	54679	0 %	0 %	25 %	75 %	127510979
118	NC_009092	GATG	2	8	56357	56364	25 %	25 %	50 %	0 %	127510981
119	NC_009092	GCCA	2	8	56691	56698	25 %	0 %	25 %	50 %	127510981
120	NC_009092	GCCT	2	8	57148	57155	0 %	25 %	25 %	50 %	127510981
121	NC_009092	TACT	2	8	58200	58207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009092	CTCG	2	8	58284	58291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009092	TTGT	2	8	59170	59177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009092	CTAT	2	8	59740	59747	25 %	50 %	0 %	25 %	127510984
125	NC_009092	CGTG	2	8	60492	60499	0 %	25 %	50 %	25 %	127510984
126	NC_009092	CGAT	2	8	60572	60579	25 %	25 %	25 %	25 %	127510984
127	NC_009092	GGTG	2	8	60594	60601	0 %	25 %	75 %	0 %	127510984
128	NC_009092	TATC	2	8	61309	61316	25 %	50 %	0 %	25 %	127510985
129	NC_009092	GATG	2	8	61336	61343	25 %	25 %	50 %	0 %	127510985
130	NC_009092	AGGC	2	8	62242	62249	25 %	0 %	50 %	25 %	127510986
131	NC_009092	GCTG	2	8	62513	62520	0 %	25 %	50 %	25 %	127510986
132	NC_009092	CTGT	2	8	63067	63074	0 %	50 %	25 %	25 %	127510986
133	NC_009092	CGCT	2	8	64047	64054	0 %	25 %	25 %	50 %	127510987
134	NC_009092	ATGC	2	8	64487	64494	25 %	25 %	25 %	25 %	127510987
135	NC_009092	CCAT	2	8	65177	65184	25 %	25 %	0 %	50 %	127510988
136	NC_009092	TAGA	2	8	65425	65432	50 %	25 %	25 %	0 %	127510988
137	NC_009092	ATGT	2	8	65885	65892	25 %	50 %	25 %	0 %	127510989
138	NC_009092	GCAT	2	8	67104	67111	25 %	25 %	25 %	25 %	127510991
139	NC_009092	GACA	2	8	67167	67174	50 %	0 %	25 %	25 %	127510991
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