MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_009092	CGCGGG	2	12	98007	98018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511019
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2124	NC_009092	CTG	2	6	103636	103641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511023
2125	NC_009092	GGC	2	6	103651	103656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511023
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2244	NC_009092	GCA	2	6	109774	109779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511032
2245	NC_009092	CTG	2	6	109919	109924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511032
2246	NC_009092	TGG	2	6	109944	109949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511032
2247	NC_009092	GAT	2	6	110045	110050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511032
2248	NC_009092	CAA	2	6	110101	110106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511032
2249	NC_009092	CGA	2	6	110248	110253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511033
2250	NC_009092	CTG	3	9	110396	110404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511033
2251	NC_009092	CGAG	2	8	110415	110422	25 %	0 %	50 %	25 %	127511033
2252	NC_009092	GCG	2	6	110423	110428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511033
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2254	NC_009092	GCA	2	6	110547	110552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511033
2255	NC_009092	GCT	2	6	110560	110565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511033
2256	NC_009092	GCA	2	6	110568	110573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511033
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2258	NC_009092	AC	3	6	110660	110665	50 %	0 %	0 %	50 %	127511033
2259	NC_009092	TGG	2	6	110722	110727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511033
2260	NC_009092	ATGCCT	2	12	110754	110765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	127511033
2261	NC_009092	GGCAGG	2	12	110778	110789	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	127511033
2262	NC_009092	ATC	2	6	110799	110804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511033
2263	NC_009092	A	6	6	110845	110850	100 %	0 %	0 %	0 %	127511033
2264	NC_009092	TTAA	2	8	110907	110914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2265	NC_009092	CTG	2	6	110945	110950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511034
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2269	NC_009092	CAT	2	6	111025	111030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511034
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2271	NC_009092	CTG	2	6	111059	111064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511034
2272	NC_009092	GTG	2	6	111077	111082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511034
2273	NC_009092	T	7	7	111204	111210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_009092	ATGA	2	8	111302	111309	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2275	NC_009092	GA	3	6	111312	111317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2276	NC_009092	GGC	2	6	111349	111354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511035
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2281	NC_009092	ACC	2	6	111632	111637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511035
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2283	NC_009092	GGC	2	6	111721	111726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511035
2284	NC_009092	GCG	2	6	111796	111801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2286	NC_009092	AGAA	2	8	111829	111836	75 %	0 %	25 %	0 %	127511036
2287	NC_009092	ATCA	2	8	111841	111848	50 %	25 %	0 %	25 %	127511036
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2292	NC_009092	ATTT	2	8	111996	112003	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2293	NC_009092	GGC	2	6	112115	112120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2294	NC_009092	CCCA	2	8	112128	112135	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2295	NC_009092	TAA	2	6	112171	112176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2296	NC_009092	ATA	2	6	112291	112296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511037
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2298	NC_009092	CTG	2	6	112320	112325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511037
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2323	NC_009092	TGA	2	6	113272	113277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511037
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2354	NC_009092	CACC	2	8	114456	114463	25 %	0 %	0 %	75 %	127511039
2355	NC_009092	GCGA	2	8	114602	114609	25 %	0 %	50 %	25 %	127511039
2356	NC_009092	GGC	2	6	114643	114648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511039
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2362	NC_009092	CGT	2	6	114936	114941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2365	NC_009092	TGAT	2	8	115007	115014	25 %	50 %	25 %	0 %	127511039
2366	NC_009092	GTC	2	6	115030	115035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2367	NC_009092	AGA	2	6	115080	115085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511039
2368	NC_009092	GC	3	6	115146	115151	0 %	0 %	50 %	50 %	127511039
2369	NC_009092	GGTG	2	8	115181	115188	0 %	25 %	75 %	0 %	127511039
2370	NC_009092	TGCCAG	2	12	115237	115248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2371	NC_009092	AGG	2	6	115269	115274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511039
2372	NC_009092	GTT	2	6	115285	115290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511039
2373	NC_009092	GCA	2	6	115308	115313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2374	NC_009092	CTG	3	9	115330	115338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
2375	NC_009092	GTA	2	6	115411	115416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511039
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2380	NC_009092	TCTG	2	8	115722	115729	0 %	50 %	25 %	25 %	127511039
2381	NC_009092	TCACCT	2	12	115752	115763	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	127511039
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2383	NC_009092	TCG	2	6	115928	115933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2387	NC_009092	GGC	2	6	116038	116043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511039
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2391	NC_009092	GCT	2	6	116215	116220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511039
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2394	NC_009092	TAT	2	6	116338	116343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_009092	TA	3	6	116346	116351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_009092	TGA	2	6	116460	116465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_009092	TAT	2	6	116475	116480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2398	NC_009092	CCG	2	6	116665	116670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511040
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2400	NC_009092	CCATG	2	10	116715	116724	20 %	20 %	20 %	40 %	127511040
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2409	NC_009092	TGA	2	6	117115	117120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2410	NC_009092	AGGCTG	2	12	117197	117208	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	127511041
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2473	NC_009092	TGAC	2	8	120271	120278	25 %	25 %	25 %	25 %	127511043
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2475	NC_009092	GAC	2	6	120432	120437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511043
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2481	NC_009092	GCG	2	6	120728	120733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511044
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2487	NC_009092	CATG	2	8	120924	120931	25 %	25 %	25 %	25 %	127511044
2488	NC_009092	TAG	2	6	120943	120948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511044
2489	NC_009092	GCT	2	6	120954	120959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2490	NC_009092	TGAG	2	8	120978	120985	25 %	25 %	50 %	0 %	127511044
2491	NC_009092	CAG	2	6	121036	121041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511044
2492	NC_009092	CCT	2	6	121065	121070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511044
2493	NC_009092	GGCG	2	8	121147	121154	0 %	0 %	75 %	25 %	127511044
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2497	NC_009092	TGA	2	6	121335	121340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511044
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2500	NC_009092	GTT	2	6	121393	121398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511044

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