MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009092	CGG	2	6	26009	26014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
502	NC_009092	ATC	2	6	26022	26027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510957
503	NC_009092	G	6	6	26064	26069	0 %	0 %	100 %	0 %	127510957
504	NC_009092	CGC	2	6	26122	26127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510957
505	NC_009092	TATC	2	8	26159	26166	25 %	50 %	0 %	25 %	127510957
506	NC_009092	GGC	2	6	26259	26264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
507	NC_009092	GT	4	8	26319	26326	0 %	50 %	50 %	0 %	127510957
508	NC_009092	GCG	2	6	26343	26348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
509	NC_009092	CGC	2	6	26382	26387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510957
510	NC_009092	GA	3	6	26411	26416	50 %	0 %	50 %	0 %	127510957
511	NC_009092	GAG	2	6	26508	26513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127510957
512	NC_009092	CCA	2	6	26551	26556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510957
513	NC_009092	CGG	2	6	26557	26562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
514	NC_009092	TGC	2	6	26608	26613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510957
515	NC_009092	TCT	2	6	26617	26622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510957
516	NC_009092	GGC	2	6	26643	26648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
517	NC_009092	CGG	2	6	26657	26662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510957
518	NC_009092	GAT	2	6	26678	26683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510957
519	NC_009092	CTG	3	9	26688	26696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510957
520	NC_009092	CAT	2	6	26780	26785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510957
521	NC_009092	CTT	2	6	26801	26806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510957
522	NC_009092	ATA	2	6	26866	26871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127510957
523	NC_009092	AGGTG	2	10	26924	26933	20 %	20 %	60 %	0 %	127510957
524	NC_009092	TGGCGA	2	12	26954	26965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	127510957
525	NC_009092	TGG	3	9	26977	26985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510957
526	NC_009092	GTT	2	6	27026	27031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127510957
527	NC_009092	GAA	2	6	27047	27052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510957
528	NC_009092	TCA	2	6	27210	27215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510958
529	NC_009092	AAG	2	6	27296	27301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510958
530	NC_009092	CTT	2	6	27307	27312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510958
531	NC_009092	GTG	2	6	27323	27328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510958
532	NC_009092	GAA	2	6	27343	27348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510958
533	NC_009092	GAA	2	6	27373	27378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510958
534	NC_009092	CAG	2	6	27407	27412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510958
535	NC_009092	TTC	2	6	27455	27460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510958
536	NC_009092	AGCG	2	8	27572	27579	25 %	0 %	50 %	25 %	127510958
537	NC_009092	GTTC	2	8	27652	27659	0 %	50 %	25 %	25 %	127510959
538	NC_009092	GT	3	6	27664	27669	0 %	50 %	50 %	0 %	127510959
539	NC_009092	CCA	2	6	27700	27705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127510959
540	NC_009092	GC	3	6	27714	27719	0 %	0 %	50 %	50 %	127510959
541	NC_009092	ATC	2	6	27816	27821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127510959
542	NC_009092	CT	3	6	27918	27923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_009092	ATTA	2	8	27932	27939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009092	ATT	2	6	27941	27946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009092	CAGC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_009092	TGG	2	6	28074	28079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009092	TGC	2	6	28138	28143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009092	CT	3	6	28154	28159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009092	GCG	2	6	28249	28254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510960
550	NC_009092	GGC	2	6	28416	28421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510960
551	NC_009092	CTT	2	6	28434	28439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510960
552	NC_009092	GTG	2	6	28450	28455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510960
553	NC_009092	AAC	2	6	28486	28491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510960
554	NC_009092	CT	3	6	28516	28521	0 %	50 %	0 %	50 %	127510960
555	NC_009092	CCT	2	6	28571	28576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127510960
556	NC_009092	GAT	2	6	28596	28601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510960
557	NC_009092	CTG	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510960
558	NC_009092	CT	3	6	28723	28728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_009092	CTTG	2	8	28769	28776	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_009092	GTTT	2	8	28848	28855	0 %	75 %	25 %	0 %	127510961
561	NC_009092	GTC	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510961
562	NC_009092	GCT	2	6	29026	29031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510961
563	NC_009092	CTT	2	6	29038	29043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510961
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569	NC_009092	AAC	2	6	29231	29236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510961
570	NC_009092	AGG	2	6	29268	29273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127510961
571	NC_009092	CCG	2	6	29303	29308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127510961
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575	NC_009092	AGC	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510962
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579	NC_009092	AGT	2	6	29781	29786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510962
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582	NC_009092	AGA	2	6	30016	30021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510962
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584	NC_009092	CAG	2	6	30137	30142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510963
585	NC_009092	GAT	2	6	30217	30222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
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588	NC_009092	CGCC	2	8	30421	30428	0 %	0 %	25 %	75 %	127510963
589	NC_009092	ATG	3	9	30440	30448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
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594	NC_009092	CTGT	2	8	30611	30618	0 %	50 %	25 %	25 %	127510963
595	NC_009092	GA	3	6	30633	30638	50 %	0 %	50 %	0 %	127510963
596	NC_009092	TGA	2	6	30670	30675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127510963
597	NC_009092	TC	3	6	30685	30690	0 %	50 %	0 %	50 %	127510963
598	NC_009092	TGC	2	6	30724	30729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510963
599	NC_009092	CTG	2	6	30745	30750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510963
600	NC_009092	AGC	2	6	30786	30791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510963
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602	NC_009092	GGT	2	6	30845	30850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127510963
603	NC_009092	CGG	2	6	30934	30939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510963
604	NC_009092	ATC	2	6	31057	31062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_009092	TGT	2	6	31082	31087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009092	AT	3	6	31100	31105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009092	TTAT	2	8	31109	31116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009092	GTC	2	6	31152	31157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009092	TGG	2	6	31168	31173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009092	CAA	2	6	31210	31215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009092	GCT	2	6	31227	31232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009092	TAT	2	6	31235	31240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127510964
613	NC_009092	GC	3	6	31274	31279	0 %	0 %	50 %	50 %	127510964
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616	NC_009092	CTGAG	2	10	31378	31387	20 %	20 %	40 %	20 %	127510964
617	NC_009092	AAG	2	6	31389	31394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127510964
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619	NC_009092	ACA	2	6	31429	31434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127510964
620	NC_009092	GGC	2	6	31451	31456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127510964
621	NC_009092	CTT	2	6	31457	31462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127510964
622	NC_009092	CAG	2	6	31509	31514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127510964
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624	NC_009092	AT	3	6	31563	31568	50 %	50 %	0 %	0 %	127510964
625	NC_009092	GCTC	2	8	31598	31605	0 %	25 %	25 %	50 %	127510964
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627	NC_009092	CTG	2	6	31746	31751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127510964
628	NC_009092	GGCA	2	8	31852	31859	25 %	0 %	50 %	25 %	127510964
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630	NC_009092	ATGG	2	8	31971	31978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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