MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_009092	GTGAG	2	10	269887	269896	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009092	ATT	2	6	269905	269910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_009092	TTA	2	6	269916	269921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_009092	GTAG	2	8	269922	269929	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_009092	TAG	2	6	269931	269936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_009092	TTAT	2	8	269957	269964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_009092	GAT	2	6	270049	270054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_009092	CAGTTT	2	12	270103	270114	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5510	NC_009092	AAT	2	6	270137	270142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009092	AGG	2	6	270150	270155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009092	GAA	2	6	270215	270220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511185
5513	NC_009092	ATAG	2	8	270290	270297	50 %	25 %	25 %	0 %	127511185
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5517	NC_009092	AGT	2	6	270476	270481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511185
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5519	NC_009092	ACTC	2	8	270593	270600	25 %	25 %	0 %	50 %	127511185
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5523	NC_009092	CAT	2	6	270813	270818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5525	NC_009092	AGTTCT	2	12	270905	270916	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	127511186
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5535	NC_009092	AGGATC	2	12	271250	271261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	127511186
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5539	NC_009092	CAT	2	6	271331	271336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511186
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5544	NC_009092	AATC	2	8	271663	271670	50 %	25 %	0 %	25 %	127511186
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5546	NC_009092	AACA	2	8	271727	271734	75 %	0 %	0 %	25 %	127511186
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5557	NC_009092	GTT	3	9	272253	272261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511187
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5745	NC_009092	GGCA	2	8	281979	281986	25 %	0 %	50 %	25 %	127511196
5746	NC_009092	GCGA	2	8	281987	281994	25 %	0 %	50 %	25 %	127511196
5747	NC_009092	CGG	2	6	282018	282023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511196
5748	NC_009092	CTG	2	6	282031	282036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511196
5749	NC_009092	GAT	2	6	282121	282126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511196
5750	NC_009092	GTGA	2	8	282187	282194	25 %	25 %	50 %	0 %	127511196
5751	NC_009092	TGC	2	6	282242	282247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511196
5752	NC_009092	AGG	2	6	282263	282268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511196
5753	NC_009092	GCT	2	6	282321	282326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511196
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5758	NC_009092	CG	3	6	282435	282440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5759	NC_009092	A	7	7	282448	282454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5760	NC_009092	GCT	2	6	282661	282666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511197
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5769	NC_009092	GC	3	6	283137	283142	0 %	0 %	50 %	50 %	127511198
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5796	NC_009092	A	7	7	284780	284786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5803	NC_009092	CCTCT	2	10	285141	285150	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5804	NC_009092	TCG	2	6	285168	285173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511201
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5811	NC_009092	TCG	2	6	285484	285489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5822	NC_009092	GGCGC	2	10	285871	285880	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5823	NC_009092	AT	3	6	285899	285904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5844	NC_009092	ACAG	2	8	286898	286905	50 %	0 %	25 %	25 %	127511204
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5863	NC_009092	TG	3	6	287598	287603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5864	NC_009092	ATGG	2	8	287677	287684	25 %	25 %	50 %	0 %	127511205
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5992	NC_009092	GCA	2	6	294906	294911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511211
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5999	NC_009092	GAA	2	6	295592	295597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_009092	GGT	2	6	295667	295672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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