MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella loihica PV-4 chromosome

Total Repeats: 93132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009092	TGG	2	6	221351	221356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511141
4502	NC_009092	GCG	2	6	221398	221403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511141
4503	NC_009092	TGA	2	6	221504	221509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511141
4504	NC_009092	CTT	2	6	221561	221566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511141
4505	NC_009092	TCG	2	6	221647	221652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511141
4506	NC_009092	CTT	2	6	221708	221713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511141
4507	NC_009092	GCC	2	6	221772	221777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511141
4508	NC_009092	ACC	2	6	221803	221808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511141
4509	NC_009092	GCG	2	6	221813	221818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511141
4510	NC_009092	TCG	2	6	221863	221868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511141
4511	NC_009092	CT	3	6	221905	221910	0 %	50 %	0 %	50 %	127511141
4512	NC_009092	TTG	2	6	222046	222051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511141
4513	NC_009092	GTT	2	6	222060	222065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511141
4514	NC_009092	GCC	2	6	222189	222194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511141
4515	NC_009092	GTT	2	6	222285	222290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511141
4516	NC_009092	GCCT	2	8	222309	222316	0 %	25 %	25 %	50 %	127511141
4517	NC_009092	TTG	2	6	222358	222363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511141
4518	NC_009092	TGA	2	6	222365	222370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511141
4519	NC_009092	GC	3	6	222375	222380	0 %	0 %	50 %	50 %	127511141
4520	NC_009092	TGA	2	6	222428	222433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511141
4521	NC_009092	CGG	3	9	222464	222472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511141
4522	NC_009092	TG	3	6	222508	222513	0 %	50 %	50 %	0 %	127511141
4523	NC_009092	CGC	2	6	222572	222577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511141
4524	NC_009092	GTG	2	6	222658	222663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511141
4525	NC_009092	CCG	2	6	222676	222681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511141
4526	NC_009092	CGA	2	6	222865	222870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511141
4527	NC_009092	GGC	2	6	222903	222908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511141
4528	NC_009092	CTC	2	6	222960	222965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	127511141
4529	NC_009092	TAG	2	6	222979	222984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511141
4530	NC_009092	GCG	2	6	222991	222996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511141
4531	NC_009092	TCTT	2	8	223057	223064	0 %	75 %	0 %	25 %	127511141
4532	NC_009092	TCT	2	6	223124	223129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511141
4533	NC_009092	CT	3	6	223128	223133	0 %	50 %	0 %	50 %	127511141
4534	NC_009092	GAA	2	6	223140	223145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511141
4535	NC_009092	CTG	2	6	223158	223163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511141
4536	NC_009092	CTT	2	6	223188	223193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511141
4537	NC_009092	ATG	2	6	223225	223230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511141
4538	NC_009092	GAA	2	6	223257	223262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511141
4539	NC_009092	TCT	2	6	223270	223275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511141
4540	NC_009092	ATTA	2	8	223290	223297	50 %	50 %	0 %	0 %	127511141
4541	NC_009092	TTG	2	6	223299	223304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511141
4542	NC_009092	AATT	2	8	223356	223363	50 %	50 %	0 %	0 %	127511141
4543	NC_009092	GCA	2	6	223459	223464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511141
4544	NC_009092	GGCTA	2	10	223485	223494	20 %	20 %	40 %	20 %	127511141
4545	NC_009092	TA	3	6	223564	223569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_009092	AGC	2	6	223575	223580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_009092	A	7	7	223606	223612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_009092	CTAAT	2	10	223672	223681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_009092	CTG	2	6	223792	223797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511142
4550	NC_009092	CTG	2	6	223805	223810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511142
4551	NC_009092	A	6	6	223849	223854	100 %	0 %	0 %	0 %	127511142
4552	NC_009092	GCG	2	6	223948	223953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511142
4553	NC_009092	TGA	2	6	223976	223981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511142
4554	NC_009092	AGATCG	2	12	224033	224044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	127511142
4555	NC_009092	TC	3	6	224068	224073	0 %	50 %	0 %	50 %	127511142
4556	NC_009092	TGC	2	6	224138	224143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511142
4557	NC_009092	TGAT	2	8	224216	224223	25 %	50 %	25 %	0 %	127511142
4558	NC_009092	CGC	2	6	224262	224267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511142
4559	NC_009092	GGT	2	6	224295	224300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511142
4560	NC_009092	TGG	2	6	224306	224311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511142
4561	NC_009092	ACC	2	6	224329	224334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511142
4562	NC_009092	GTG	2	6	224341	224346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511142
4563	NC_009092	TGG	2	6	224385	224390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511142
4564	NC_009092	CTATC	2	10	224408	224417	20 %	40 %	0 %	40 %	127511142
4565	NC_009092	ACA	2	6	224523	224528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511142
4566	NC_009092	TG	3	6	224594	224599	0 %	50 %	50 %	0 %	127511142
4567	NC_009092	CAT	2	6	224661	224666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511142
4568	NC_009092	TTGC	2	8	224685	224692	0 %	50 %	25 %	25 %	127511142
4569	NC_009092	TAA	2	6	224733	224738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511142
4570	NC_009092	GAG	2	6	224766	224771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511142
4571	NC_009092	GAA	2	6	224811	224816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511143
4572	NC_009092	AAAAAC	2	12	224824	224835	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	127511143
4573	NC_009092	GCT	2	6	224856	224861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511143
4574	NC_009092	TTTA	2	8	224887	224894	25 %	75 %	0 %	0 %	127511143
4575	NC_009092	ATG	2	6	224913	224918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511143
4576	NC_009092	GAG	2	6	224922	224927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511143
4577	NC_009092	AG	3	6	224929	224934	50 %	0 %	50 %	0 %	127511143
4578	NC_009092	AAGA	2	8	225012	225019	75 %	0 %	25 %	0 %	127511143
4579	NC_009092	CGT	2	6	225027	225032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511143
4580	NC_009092	ACCC	2	8	225071	225078	25 %	0 %	0 %	75 %	127511143
4581	NC_009092	CCG	2	6	225108	225113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511143
4582	NC_009092	AT	3	6	225117	225122	50 %	50 %	0 %	0 %	127511143
4583	NC_009092	AAG	2	6	225138	225143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511143
4584	NC_009092	AAC	3	9	225180	225188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511143
4585	NC_009092	ATG	2	6	225198	225203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511143
4586	NC_009092	ATG	2	6	225265	225270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511143
4587	NC_009092	GAA	2	6	225315	225320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511143
4588	NC_009092	GAGC	2	8	225349	225356	25 %	0 %	50 %	25 %	127511143
4589	NC_009092	GGT	2	6	225430	225435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511144
4590	NC_009092	CAT	2	6	225454	225459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511144
4591	NC_009092	TCG	2	6	225465	225470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511144
4592	NC_009092	GAT	2	6	225545	225550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511144
4593	NC_009092	GCT	2	6	225631	225636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511144
4594	NC_009092	GCCTG	2	10	225664	225673	0 %	20 %	40 %	40 %	127511144
4595	NC_009092	CGA	2	6	225676	225681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511144
4596	NC_009092	AAG	2	6	225735	225740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511144
4597	NC_009092	GTGGC	2	10	225822	225831	0 %	20 %	60 %	20 %	127511144
4598	NC_009092	GCG	2	6	225959	225964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511144
4599	NC_009092	GAA	2	6	225973	225978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511144
4600	NC_009092	GAA	2	6	225981	225986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511144
4601	NC_009092	GAC	2	6	226059	226064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511145
4602	NC_009092	CG	4	8	226083	226090	0 %	0 %	50 %	50 %	127511145
4603	NC_009092	C	6	6	226093	226098	0 %	0 %	0 %	100 %	127511145
4604	NC_009092	GA	3	6	226173	226178	50 %	0 %	50 %	0 %	127511145
4605	NC_009092	GGT	2	6	226191	226196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511145
4606	NC_009092	CGC	2	6	226234	226239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511145
4607	NC_009092	ATG	2	6	226331	226336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511145
4608	NC_009092	AATT	2	8	226427	226434	50 %	50 %	0 %	0 %	127511145
4609	NC_009092	ACTG	2	8	226479	226486	25 %	25 %	25 %	25 %	127511145
4610	NC_009092	AAT	2	6	226513	226518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511146
4611	NC_009092	TCT	2	6	226523	226528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511146
4612	NC_009092	A	6	6	226549	226554	100 %	0 %	0 %	0 %	127511146
4613	NC_009092	TGGCT	2	10	226579	226588	0 %	40 %	40 %	20 %	127511146
4614	NC_009092	TTA	2	6	226589	226594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	127511146
4615	NC_009092	TTC	2	6	226612	226617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511146
4616	NC_009092	TGAT	2	8	226632	226639	25 %	50 %	25 %	0 %	127511146
4617	NC_009092	ATC	2	6	226662	226667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511146
4618	NC_009092	GAG	2	6	226691	226696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511146
4619	NC_009092	ATC	2	6	226742	226747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511146
4620	NC_009092	CGA	2	6	226756	226761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511146
4621	NC_009092	CAA	2	6	226798	226803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511146
4622	NC_009092	TGG	2	6	226857	226862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511146
4623	NC_009092	CAAGG	2	10	226886	226895	40 %	0 %	40 %	20 %	127511146
4624	NC_009092	CGC	2	6	226954	226959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511146
4625	NC_009092	TGG	3	9	227011	227019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511146
4626	NC_009092	GTT	2	6	227023	227028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511146
4627	NC_009092	TAA	2	6	227038	227043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	127511146
4628	NC_009092	GGTG	2	8	227071	227078	0 %	25 %	75 %	0 %	127511146
4629	NC_009092	ACA	2	6	227100	227105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511146
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4631	NC_009092	GC	3	6	227198	227203	0 %	0 %	50 %	50 %	127511146
4632	NC_009092	TGG	2	6	227208	227213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511146
4633	NC_009092	TGC	2	6	227290	227295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511146
4634	NC_009092	GTC	2	6	227297	227302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511146
4635	NC_009092	GAAGA	2	10	227306	227315	60 %	0 %	40 %	0 %	127511146
4636	NC_009092	GTAC	2	8	227360	227367	25 %	25 %	25 %	25 %	127511146
4637	NC_009092	TGC	2	6	227370	227375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511146
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4645	NC_009092	TGG	2	6	227784	227789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511146
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4649	NC_009092	ATC	2	6	228104	228109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511146
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4652	NC_009092	AAG	2	6	228218	228223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511146
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4654	NC_009092	GGT	2	6	228407	228412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511146
4655	NC_009092	CAA	2	6	228422	228427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511146
4656	NC_009092	CGAC	2	8	228498	228505	25 %	0 %	25 %	50 %	127511146
4657	NC_009092	ATC	2	6	228548	228553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511146
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4659	NC_009092	G	6	6	228663	228668	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4660	NC_009092	T	6	6	228733	228738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4661	NC_009092	TAG	2	6	228809	228814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511147
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4672	NC_009092	A	7	7	229417	229423	100 %	0 %	0 %	0 %	127511148
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4688	NC_009092	TTGT	2	8	230177	230184	0 %	75 %	25 %	0 %	127511148
4689	NC_009092	TCA	2	6	230255	230260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511148
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4693	NC_009092	CCAG	2	8	230436	230443	25 %	0 %	25 %	50 %	127511149
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4702	NC_009092	GAT	2	6	230735	230740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511149
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4714	NC_009092	AGC	2	6	231456	231461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511149
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4726	NC_009092	AG	3	6	232009	232014	50 %	0 %	50 %	0 %	127511150
4727	NC_009092	CTT	2	6	232016	232021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	127511150
4728	NC_009092	CGG	2	6	232031	232036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511150
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4730	NC_009092	TGT	2	6	232150	232155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511150
4731	NC_009092	ATCA	2	8	232161	232168	50 %	25 %	0 %	25 %	127511150
4732	NC_009092	AT	3	6	232214	232219	50 %	50 %	0 %	0 %	127511150
4733	NC_009092	AAG	2	6	232261	232266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511150
4734	NC_009092	AAG	2	6	232413	232418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511150
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4736	NC_009092	CTG	2	6	232620	232625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511150
4737	NC_009092	AAG	2	6	232776	232781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511150
4738	NC_009092	CTGT	2	8	233032	233039	0 %	50 %	25 %	25 %	127511151
4739	NC_009092	GGC	2	6	233051	233056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511151
4740	NC_009092	AAGA	2	8	233066	233073	75 %	0 %	25 %	0 %	127511151
4741	NC_009092	GCA	2	6	233077	233082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511151
4742	NC_009092	AG	3	6	233083	233088	50 %	0 %	50 %	0 %	127511151
4743	NC_009092	TGG	2	6	233109	233114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511152
4744	NC_009092	TGA	2	6	233141	233146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511152
4745	NC_009092	AGC	2	6	233153	233158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511152
4746	NC_009092	CTGC	2	8	233232	233239	0 %	25 %	25 %	50 %	127511152
4747	NC_009092	GAG	2	6	233276	233281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511152
4748	NC_009092	CAA	2	6	233364	233369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	127511152
4749	NC_009092	GCG	2	6	233372	233377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511152
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4751	NC_009092	GCC	2	6	233527	233532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4752	NC_009092	AGGCT	2	10	233588	233597	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4753	NC_009092	TATCT	2	10	233674	233683	20 %	60 %	0 %	20 %	127511153
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4799	NC_009092	T	6	6	236057	236062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4800	NC_009092	AGG	2	6	236078	236083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4824	NC_009092	TGA	2	6	237073	237078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4846	NC_009092	TGGC	2	8	237827	237834	0 %	25 %	50 %	25 %	127511157
4847	NC_009092	CGA	2	6	237842	237847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511157
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4853	NC_009092	TGC	2	6	238190	238195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511158
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4855	NC_009092	AGG	2	6	238205	238210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	127511158
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4857	NC_009092	GCA	2	6	238289	238294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511158
4858	NC_009092	TTGGT	2	10	238354	238363	0 %	60 %	40 %	0 %	127511158
4859	NC_009092	GCC	2	6	238381	238386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511158
4860	NC_009092	GTC	2	6	238419	238424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511158
4861	NC_009092	CAT	2	6	238458	238463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511158
4862	NC_009092	CCCA	2	8	238467	238474	25 %	0 %	0 %	75 %	127511158
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4864	NC_009092	CG	3	6	238632	238637	0 %	0 %	50 %	50 %	127511159
4865	NC_009092	CGT	2	6	238666	238671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511159
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4984	NC_009092	ATG	2	6	244578	244583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	127511164
4985	NC_009092	GTC	2	6	244595	244600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511164
4986	NC_009092	GCCA	2	8	244615	244622	25 %	0 %	25 %	50 %	127511164
4987	NC_009092	ATC	2	6	244703	244708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	127511164
4988	NC_009092	TGG	2	6	244774	244779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	127511164
4989	NC_009092	TGT	2	6	244792	244797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511164
4990	NC_009092	CCAG	2	8	244831	244838	25 %	0 %	25 %	50 %	127511164
4991	NC_009092	CGG	2	6	244879	244884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	127511164
4992	NC_009092	GTAC	2	8	244905	244912	25 %	25 %	25 %	25 %	127511164
4993	NC_009092	CAG	2	6	244922	244927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511164
4994	NC_009092	CGC	3	9	244963	244971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	127511164
4995	NC_009092	AGC	2	6	244995	245000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	127511164
4996	NC_009092	CCA	2	6	245020	245025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	127511164
4997	NC_009092	TCGCCT	2	12	245034	245045	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	127511164
4998	NC_009092	TTG	2	6	245184	245189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	127511164
4999	NC_009092	AAG	2	6	245244	245249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	127511164
5000	NC_009092	TCG	2	6	245265	245270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	127511164

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