MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 chromosome

Total Repeats: 61564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009052	GAT	2	6	18	23	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009052	CAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172258
3	NC_009052	CAG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172258
4	NC_009052	GTC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172258
5	NC_009052	ACG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172258
6	NC_009052	GCG	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172258
7	NC_009052	GGT	2	6	509	514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172258
8	NC_009052	ATT	2	6	526	531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172258
9	NC_009052	TTG	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172258
10	NC_009052	AAT	2	6	599	604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172258
11	NC_009052	GAA	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
12	NC_009052	TAC	2	6	698	703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172258
13	NC_009052	GAT	2	6	728	733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172258
14	NC_009052	AAG	2	6	765	770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
15	NC_009052	ATT	2	6	815	820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172258
16	NC_009052	CCA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172258
17	NC_009052	CTT	2	6	991	996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172258
18	NC_009052	GCC	2	6	1077	1082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172258
19	NC_009052	TAC	2	6	1181	1186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172258
20	NC_009052	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172258
21	NC_009052	TGG	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172258
22	NC_009052	CAC	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172258
23	NC_009052	AGA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172258
24	NC_009052	TCT	2	6	1421	1426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172258
25	NC_009052	CCT	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126172259
26	NC_009052	GAA	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
27	NC_009052	TAC	2	6	1649	1654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
28	NC_009052	GCT	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172259
29	NC_009052	AAC	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172259
30	NC_009052	ATA	2	6	1729	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172259
31	NC_009052	TGC	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172259
32	NC_009052	AGA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
33	NC_009052	TTA	2	6	1904	1909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172259
34	NC_009052	CTA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
35	NC_009052	GTG	2	6	2284	2289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172259
36	NC_009052	GAA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
37	NC_009052	ATC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172259
38	NC_009052	CAA	2	6	2432	2437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172259
39	NC_009052	GAT	2	6	2448	2453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172259
40	NC_009052	GAA	2	6	2508	2513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172259
41	NC_009052	CGG	2	6	2610	2615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009052	GCA	2	6	2631	2636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009052	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172260
44	NC_009052	CGA	3	9	2939	2947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172260
45	NC_009052	GTG	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172260
46	NC_009052	TCG	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172260
47	NC_009052	ACT	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172260
48	NC_009052	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172260
49	NC_009052	ACA	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172260
50	NC_009052	GAT	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172260
51	NC_009052	CTG	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172260
52	NC_009052	ATA	2	6	3845	3850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172261
53	NC_009052	TTC	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
54	NC_009052	CGA	2	6	3942	3947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
55	NC_009052	CAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172261
56	NC_009052	AGT	2	6	3978	3983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172261
57	NC_009052	GAA	2	6	4105	4110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
58	NC_009052	GCA	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
59	NC_009052	CGG	2	6	4152	4157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
60	NC_009052	CGA	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
61	NC_009052	TCG	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
62	NC_009052	ACA	2	6	4478	4483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
63	NC_009052	ATT	2	6	4529	4534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172261
64	NC_009052	TAA	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172261
65	NC_009052	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
66	NC_009052	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172261
67	NC_009052	TGG	2	6	4683	4688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
68	NC_009052	CGA	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
69	NC_009052	CTG	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
70	NC_009052	GCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
71	NC_009052	CGT	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
72	NC_009052	GGT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
73	NC_009052	CTG	2	6	5132	5137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
74	NC_009052	TGT	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
75	NC_009052	AAG	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
76	NC_009052	CGA	2	6	5292	5297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
77	NC_009052	CAT	4	12	5328	5339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172261
78	NC_009052	CTT	3	9	5388	5396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
79	NC_009052	CCA	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172261
80	NC_009052	TTG	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
81	NC_009052	AGC	2	6	5645	5650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
82	NC_009052	ACC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172261
83	NC_009052	TGG	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172261
84	NC_009052	AGC	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172261
85	NC_009052	CTG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
86	NC_009052	CTT	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172261
87	NC_009052	GCG	2	6	5935	5940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
88	NC_009052	GAA	2	6	5956	5961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
89	NC_009052	GGC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172261
90	NC_009052	AAG	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172261
91	NC_009052	CGT	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
92	NC_009052	TGA	2	6	6153	6158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172261
93	NC_009052	GTT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172261
94	NC_009052	TCG	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172261
95	NC_009052	TCT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172262
96	NC_009052	CAA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172262
97	NC_009052	TGC	2	6	6447	6452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172262
98	NC_009052	ACA	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172262
99	NC_009052	CAT	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172262
100	NC_009052	GCA	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172262
101	NC_009052	AGT	2	6	6985	6990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172262
102	NC_009052	CTA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009052	TCG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009052	TGA	2	6	7241	7246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009052	TAA	2	6	7330	7335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172263
106	NC_009052	AGC	2	6	7434	7439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172263
107	NC_009052	TTG	2	6	7496	7501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172263
108	NC_009052	GCA	2	6	7516	7521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172263
109	NC_009052	TCG	2	6	7571	7576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
110	NC_009052	TTA	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172264
111	NC_009052	CTC	2	6	7666	7671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126172264
112	NC_009052	CTG	2	6	7780	7785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
113	NC_009052	CAG	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172264
114	NC_009052	TGG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172264
115	NC_009052	CTT	2	6	7988	7993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172264
116	NC_009052	AAT	2	6	8019	8024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172264
117	NC_009052	TCA	2	6	8114	8119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172264
118	NC_009052	GGC	2	6	8180	8185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172264
119	NC_009052	TGG	2	6	8270	8275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172264
120	NC_009052	GCG	2	6	8301	8306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172264
121	NC_009052	ATG	2	6	8335	8340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172264
122	NC_009052	GAA	2	6	8430	8435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172264
123	NC_009052	GCA	2	6	8621	8626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172264
124	NC_009052	AGT	2	6	8711	8716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172264
125	NC_009052	GTC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172264
126	NC_009052	GTG	2	6	8778	8783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172264
127	NC_009052	TTA	2	6	9064	9069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172265
128	NC_009052	GCC	2	6	9127	9132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172265
129	NC_009052	TCG	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172266
130	NC_009052	GAT	2	6	9575	9580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009052	AGT	2	6	9621	9626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172267
132	NC_009052	TCG	2	6	9662	9667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172267
133	NC_009052	AAT	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172267
134	NC_009052	CTG	2	6	9755	9760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172267
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141	NC_009052	ATC	2	6	10508	10513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172267
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143	NC_009052	ATG	2	6	10610	10615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009052	GCA	2	6	10671	10676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009052	ATG	2	6	10786	10791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009052	ATT	2	6	10818	10823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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246	NC_009052	TGA	2	6	19190	19195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NC_009052	CAT	2	6	19374	19379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172274
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249	NC_009052	ATC	2	6	19546	19551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172274
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255	NC_009052	CAT	2	6	19993	19998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172275
256	NC_009052	CGT	2	6	20058	20063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172275
257	NC_009052	ATG	2	6	20215	20220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009052	TTA	2	6	20251	20256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009052	TGC	2	6	20319	20324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_009052	TGC	2	6	20338	20343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009052	CTT	2	6	20405	20410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_009052	AAT	2	6	20433	20438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_009052	TGA	2	6	20495	20500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009052	TTC	2	6	20517	20522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_009052	ATG	2	6	20539	20544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009052	CCA	2	6	20557	20562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_009052	ATC	2	6	20673	20678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_009052	GGC	2	6	20721	20726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_009052	TTC	2	6	20802	20807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_009052	CTG	2	6	20811	20816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_009052	TCT	2	6	21153	21158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_009052	CAG	2	6	21200	21205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_009052	CGA	2	6	21247	21252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_009052	ATG	2	6	21273	21278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_009052	AAC	2	6	21419	21424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_009052	TGA	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_009052	TGT	2	6	21476	21481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_009052	CAG	2	6	21544	21549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_009052	ATT	2	6	21627	21632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_009052	CGT	2	6	21743	21748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172276
282	NC_009052	AAC	2	6	21766	21771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172276
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286	NC_009052	TTC	2	6	22049	22054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172276
287	NC_009052	AGA	2	6	22091	22096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172276
288	NC_009052	CAG	2	6	22102	22107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172276
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331	NC_009052	TGT	2	6	25391	25396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
332	NC_009052	ATT	2	6	25437	25442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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