MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella baltica OS155 chromosome

Total Repeats: 90436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009052	AGA	2	6	194901	194906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172422
3502	NC_009052	TCA	2	6	195075	195080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172423
3503	NC_009052	CAT	2	6	195202	195207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172423
3504	NC_009052	AAT	2	6	195235	195240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172423
3505	NC_009052	CAT	2	6	195280	195285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172423
3506	NC_009052	TTGATA	2	12	195374	195385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	126172424
3507	NC_009052	TTCTT	2	10	195411	195420	0 %	80 %	0 %	20 %	126172424
3508	NC_009052	GC	3	6	195487	195492	0 %	0 %	50 %	50 %	126172424
3509	NC_009052	CAT	2	6	195493	195498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172424
3510	NC_009052	GCC	2	6	195761	195766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172424
3511	NC_009052	CTGT	2	8	195834	195841	0 %	50 %	25 %	25 %	126172424
3512	NC_009052	ACG	2	6	195878	195883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172424
3513	NC_009052	GAT	2	6	195902	195907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172424
3514	NC_009052	ATT	2	6	195959	195964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172424
3515	NC_009052	GAA	2	6	196010	196015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009052	TAA	2	6	196040	196045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_009052	TGAG	2	8	196090	196097	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009052	CA	3	6	196197	196202	50 %	0 %	0 %	50 %	126172425
3519	NC_009052	AAAG	2	8	196207	196214	75 %	0 %	25 %	0 %	126172425
3520	NC_009052	T	6	6	196216	196221	0 %	100 %	0 %	0 %	126172425
3521	NC_009052	GTC	2	6	196256	196261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3522	NC_009052	GTT	2	6	196274	196279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172425
3523	NC_009052	AGC	2	6	196300	196305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3524	NC_009052	GCA	2	6	196373	196378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3525	NC_009052	GCA	2	6	196385	196390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3526	NC_009052	CAA	2	6	196472	196477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3527	NC_009052	GCG	2	6	196484	196489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3528	NC_009052	GGC	2	6	196495	196500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3529	NC_009052	AAC	2	6	196518	196523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3530	NC_009052	AAC	2	6	196590	196595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3531	NC_009052	GGC	2	6	196615	196620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3532	NC_009052	AAC	2	6	196638	196643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3533	NC_009052	AGC	2	6	196672	196677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3534	NC_009052	CAA	2	6	196769	196774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3535	NC_009052	GGC	2	6	196792	196797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3536	NC_009052	TGC	2	6	196822	196827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3537	NC_009052	CAA	2	6	196916	196921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3538	NC_009052	GGC	2	6	196939	196944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3539	NC_009052	GCC	2	6	196976	196981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172425
3540	NC_009052	GCT	2	6	197018	197023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3541	NC_009052	CAG	2	6	197063	197068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3542	NC_009052	AAG	2	6	197136	197141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3543	NC_009052	GAT	3	9	197231	197239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172425
3544	NC_009052	GAA	2	6	197246	197251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3545	NC_009052	GAA	2	6	197255	197260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3546	NC_009052	AAC	2	6	197290	197295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172425
3547	NC_009052	GAA	2	6	197378	197383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3548	NC_009052	AGA	2	6	197388	197393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3549	NC_009052	ACC	2	6	197483	197488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172425
3550	NC_009052	AGC	2	6	197577	197582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3551	NC_009052	AC	3	6	197626	197631	50 %	0 %	0 %	50 %	126172425
3552	NC_009052	GCC	2	6	197672	197677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172425
3553	NC_009052	GTC	2	6	197718	197723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172425
3554	NC_009052	GAA	2	6	197747	197752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3555	NC_009052	GAA	2	6	197755	197760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3556	NC_009052	GTG	2	6	197762	197767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172425
3557	NC_009052	TGA	2	6	197772	197777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172425
3558	NC_009052	A	6	6	197777	197782	100 %	0 %	0 %	0 %	126172425
3559	NC_009052	CGC	2	6	197796	197801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172425
3560	NC_009052	ATT	2	6	197860	197865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172425
3561	NC_009052	AAG	2	6	197868	197873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172425
3562	NC_009052	GCG	2	6	197925	197930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172425
3563	NC_009052	TGA	2	6	197995	198000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172425
3564	NC_009052	TGAT	2	8	198072	198079	25 %	50 %	25 %	0 %	126172426
3565	NC_009052	CAG	2	6	198083	198088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172426
3566	NC_009052	GGC	2	6	198107	198112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172426
3567	NC_009052	ACA	2	6	198145	198150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172426
3568	NC_009052	CGA	2	6	198231	198236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172426
3569	NC_009052	TGG	2	6	198441	198446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172426
3570	NC_009052	TGT	2	6	198480	198485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172426
3571	NC_009052	CGG	2	6	198487	198492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172426
3572	NC_009052	GCC	2	6	198535	198540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172426
3573	NC_009052	CG	3	6	198670	198675	0 %	0 %	50 %	50 %	126172426
3574	NC_009052	CGA	2	6	198759	198764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172426
3575	NC_009052	TGA	2	6	198911	198916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172427
3576	NC_009052	CTG	2	6	199066	199071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172427
3577	NC_009052	AGA	2	6	199134	199139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172427
3578	NC_009052	TGA	2	6	199457	199462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172427
3579	NC_009052	GGC	2	6	199534	199539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172427
3580	NC_009052	TTGGC	2	10	199543	199552	0 %	40 %	40 %	20 %	126172427
3581	NC_009052	TTA	2	6	199564	199569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172427
3582	NC_009052	CTG	2	6	199654	199659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172427
3583	NC_009052	TTGG	2	8	199663	199670	0 %	50 %	50 %	0 %	126172427
3584	NC_009052	GGTT	2	8	199687	199694	0 %	50 %	50 %	0 %	126172427
3585	NC_009052	ATA	2	6	199743	199748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172427
3586	NC_009052	A	7	7	199765	199771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_009052	TGA	2	6	199773	199778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_009052	A	7	7	199778	199784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_009052	AGT	2	6	199944	199949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_009052	CAAT	2	8	199986	199993	50 %	25 %	0 %	25 %	126172428
3591	NC_009052	AGT	2	6	200019	200024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172428
3592	NC_009052	GCTGAG	2	12	200070	200081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126172428
3593	NC_009052	AAG	2	6	200218	200223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172428
3594	NC_009052	TGA	2	6	200236	200241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172428
3595	NC_009052	GCGT	2	8	200272	200279	0 %	25 %	50 %	25 %	126172428
3596	NC_009052	GTT	2	6	200381	200386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172428
3597	NC_009052	A	6	6	200406	200411	100 %	0 %	0 %	0 %	126172428
3598	NC_009052	GGTT	2	8	200418	200425	0 %	50 %	50 %	0 %	126172428
3599	NC_009052	TGG	2	6	200446	200451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172428
3600	NC_009052	GAG	2	6	200547	200552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126172428
3601	NC_009052	ATT	2	6	200572	200577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172428
3602	NC_009052	TCAT	2	8	200585	200592	25 %	50 %	0 %	25 %	126172428
3603	NC_009052	TAT	2	6	200650	200655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172428
3604	NC_009052	GC	3	6	200696	200701	0 %	0 %	50 %	50 %	126172428
3605	NC_009052	A	8	8	200865	200872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009052	T	7	7	200887	200893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_009052	TGA	2	6	200911	200916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_009052	TGA	2	6	200920	200925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_009052	CTGC	2	8	200980	200987	0 %	25 %	25 %	50 %	126172429
3610	NC_009052	CATA	2	8	201003	201010	50 %	25 %	0 %	25 %	126172429
3611	NC_009052	TG	3	6	201083	201088	0 %	50 %	50 %	0 %	126172429
3612	NC_009052	GCG	2	6	201114	201119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172429
3613	NC_009052	CAT	2	6	201163	201168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172429
3614	NC_009052	TCT	2	6	201204	201209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172429
3615	NC_009052	CGC	2	6	201223	201228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172429
3616	NC_009052	CTT	2	6	201316	201321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126172429
3617	NC_009052	CGC	2	6	201376	201381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172429
3618	NC_009052	CTG	2	6	201438	201443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172429
3619	NC_009052	CGC	3	9	201559	201567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172429
3620	NC_009052	TGC	2	6	201598	201603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172429
3621	NC_009052	TAA	2	6	201614	201619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172429
3622	NC_009052	AG	3	6	201644	201649	50 %	0 %	50 %	0 %	126172429
3623	NC_009052	AAC	2	6	201707	201712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126172429
3624	NC_009052	ACC	2	6	201752	201757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126172429
3625	NC_009052	AAT	2	6	201765	201770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172429
3626	NC_009052	AGC	2	6	201780	201785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172429
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3628	NC_009052	AGCT	2	8	201935	201942	25 %	25 %	25 %	25 %	126172429
3629	NC_009052	A	6	6	202082	202087	100 %	0 %	0 %	0 %	126172429
3630	NC_009052	ATC	2	6	202125	202130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172429
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3632	NC_009052	CTG	2	6	202180	202185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172429
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3635	NC_009052	TGC	2	6	202380	202385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172430
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3637	NC_009052	ACGC	2	8	202586	202593	25 %	0 %	25 %	50 %	126172430
3638	NC_009052	TAGC	2	8	202621	202628	25 %	25 %	25 %	25 %	126172430
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3641	NC_009052	AGC	2	6	202823	202828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172430
3642	NC_009052	CATG	2	8	202972	202979	25 %	25 %	25 %	25 %	126172430
3643	NC_009052	AAGG	2	8	203121	203128	50 %	0 %	50 %	0 %	126172430
3644	NC_009052	CAG	2	6	203153	203158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172430
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3647	NC_009052	AG	3	6	203273	203278	50 %	0 %	50 %	0 %	126172430
3648	NC_009052	TCA	2	6	203310	203315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172430
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3651	NC_009052	AT	3	6	203442	203447	50 %	50 %	0 %	0 %	126172430
3652	NC_009052	AGC	2	6	203478	203483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172431
3653	NC_009052	GCT	2	6	203514	203519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172431
3654	NC_009052	TGT	2	6	203527	203532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126172431
3655	NC_009052	GC	3	6	203678	203683	0 %	0 %	50 %	50 %	126172431
3656	NC_009052	AAGTG	2	10	203684	203693	40 %	20 %	40 %	0 %	126172431
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3661	NC_009052	CGCC	2	8	203982	203989	0 %	0 %	25 %	75 %	126172431
3662	NC_009052	GCG	2	6	204293	204298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172432
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3664	NC_009052	ATA	2	6	204469	204474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126172432
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3686	NC_009052	AGTTT	2	10	205838	205847	20 %	60 %	20 %	0 %	126172432
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3691	NC_009052	CTAAG	2	10	206096	206105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3692	NC_009052	GCT	2	6	206157	206162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3700	NC_009052	CT	3	6	206391	206396	0 %	50 %	0 %	50 %	126172433
3701	NC_009052	CAAA	2	8	206407	206414	75 %	0 %	0 %	25 %	126172433
3702	NC_009052	TGGTAA	2	12	206425	206436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172433
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3717	NC_009052	TAAA	2	8	207194	207201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3718	NC_009052	T	6	6	207274	207279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3719	NC_009052	GATAAA	2	12	207294	207305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3720	NC_009052	TTAAT	2	10	207328	207337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3721	NC_009052	TTG	2	6	207420	207425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3722	NC_009052	TAT	2	6	207428	207433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3723	NC_009052	A	8	8	207465	207472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3724	NC_009052	A	6	6	207518	207523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3725	NC_009052	T	6	6	207645	207650	0 %	100 %	0 %	0 %	126172434
3726	NC_009052	CAT	2	6	207675	207680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126172434
3727	NC_009052	T	6	6	207726	207731	0 %	100 %	0 %	0 %	126172434
3728	NC_009052	GACTA	2	10	207841	207850	40 %	20 %	20 %	20 %	126172434
3729	NC_009052	AAGC	2	8	208002	208009	50 %	0 %	25 %	25 %	126172434
3730	NC_009052	TCGGGT	2	12	208031	208042	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3731	NC_009052	CTC	2	6	208060	208065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3732	NC_009052	AAAT	2	8	208079	208086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3733	NC_009052	ATTGC	2	10	208142	208151	20 %	40 %	20 %	20 %	126172435
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3735	NC_009052	GTG	2	6	208334	208339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172435
3736	NC_009052	GCAC	2	8	208441	208448	25 %	0 %	25 %	50 %	126172435
3737	NC_009052	GCC	2	6	208463	208468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172435
3738	NC_009052	AGA	2	6	208586	208591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126172436
3739	NC_009052	GAT	2	6	208699	208704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172436
3740	NC_009052	ATG	2	6	208707	208712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126172436
3741	NC_009052	TAT	2	6	208835	208840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172436
3742	NC_009052	GTCA	2	8	208939	208946	25 %	25 %	25 %	25 %	126172436
3743	NC_009052	TTA	2	6	209007	209012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172436
3744	NC_009052	CGG	2	6	209028	209033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172436
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3746	NC_009052	TGC	2	6	209160	209165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172436
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3748	NC_009052	CG	3	6	209183	209188	0 %	0 %	50 %	50 %	126172436
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3874	NC_009052	GGTT	2	8	216259	216266	0 %	50 %	50 %	0 %	126172444
3875	NC_009052	GTG	2	6	216423	216428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126172444
3876	NC_009052	CTG	2	6	216435	216440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126172444
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3992	NC_009052	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172449
3993	NC_009052	TTAA	2	8	224150	224157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_009052	ATT	2	6	224197	224202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_009052	GCG	2	6	224206	224211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172450
3996	NC_009052	TTAC	2	8	224269	224276	25 %	50 %	0 %	25 %	126172450
3997	NC_009052	GGC	2	6	224293	224298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126172450
3998	NC_009052	TAT	2	6	224340	224345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126172450
3999	NC_009052	GCC	2	6	224403	224408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126172450
4000	NC_009052	AGC	2	6	224447	224452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126172450

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