MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal04

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009038	ACC	2	6	104	109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009038	AAT	2	6	118	123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009038	TCT	2	6	271	276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090339
4	NC_009038	TTC	2	6	310	315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090339
5	NC_009038	GCT	2	6	398	403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090339
6	NC_009038	TAT	2	6	819	824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009038	ATT	2	6	831	836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009038	TGT	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009038	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090340
10	NC_009038	TTC	2	6	1141	1146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090340
11	NC_009038	TCC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090340
12	NC_009038	ATT	2	6	1196	1201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090340
13	NC_009038	GAA	2	6	1532	1537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
14	NC_009038	ATC	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090341
15	NC_009038	CAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090341
16	NC_009038	GTG	2	6	2004	2009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090341
17	NC_009038	TGA	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090341
18	NC_009038	AAG	2	6	2105	2110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
19	NC_009038	TGT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090341
20	NC_009038	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090341
21	NC_009038	ATC	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090341
22	NC_009038	GGC	2	6	2572	2577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090341
23	NC_009038	AAG	2	6	2612	2617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090341
24	NC_009038	CCT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090341
25	NC_009038	CTG	2	6	2670	2675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090341
26	NC_009038	CTG	2	6	2745	2750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090341
27	NC_009038	CTT	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090341
28	NC_009038	GGA	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126090341
29	NC_009038	TGA	2	6	3089	3094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090341
30	NC_009038	ACA	2	6	3236	3241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090342
31	NC_009038	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090342
32	NC_009038	TAA	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090342
33	NC_009038	TCT	2	6	3343	3348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090342
34	NC_009038	ATT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090342
35	NC_009038	TGA	2	6	3372	3377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090342
36	NC_009038	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090342
37	NC_009038	AAT	2	6	3466	3471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009038	TGT	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009038	GTT	2	6	3562	3567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009038	GCT	2	6	3723	3728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
41	NC_009038	TGC	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
42	NC_009038	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090343
43	NC_009038	GCT	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090343
44	NC_009038	GTT	2	6	3902	3907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090343
45	NC_009038	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009038	TGG	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
47	NC_009038	TAC	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126090344
48	NC_009038	CTC	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
49	NC_009038	TGC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090344
50	NC_009038	TCC	2	6	4520	4525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
51	NC_009038	TGG	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
52	NC_009038	AAT	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090344
53	NC_009038	GTG	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126090344
54	NC_009038	CCT	2	6	5181	5186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126090344
55	NC_009038	ATG	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090344
56	NC_009038	CTG	3	9	5503	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126090344
57	NC_009038	AAG	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090344
58	NC_009038	TTC	2	6	5591	5596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090344
59	NC_009038	AGA	2	6	5669	5674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090344
60	NC_009038	CTT	2	6	5716	5721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090344
61	NC_009038	ATG	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090344
62	NC_009038	TAT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009038	TTA	2	6	6111	6116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009038	TGC	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009038	CTT	2	6	6341	6346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
66	NC_009038	CGG	2	6	6386	6391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126090345
67	NC_009038	GAA	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090345
68	NC_009038	TGA	2	6	6603	6608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
69	NC_009038	CAA	2	6	6736	6741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126090345
70	NC_009038	TGA	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
71	NC_009038	GAT	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
72	NC_009038	ATT	2	6	6874	6879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090345
73	NC_009038	AAT	2	6	7114	7119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126090345
74	NC_009038	ATT	2	6	7215	7220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126090345
75	NC_009038	TCT	2	6	7336	7341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
76	NC_009038	ATG	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126090345
77	NC_009038	TTG	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090345
78	NC_009038	TCT	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126090345
79	NC_009038	AAG	2	6	7579	7584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126090345
80	NC_009038	TGT	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126090345
81	NC_009038	ATT	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009038	GCA	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.