MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	AG	3	6	332	337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009035	CG	3	6	730	735	0 %	0 %	50 %	50 %	126090119
3	NC_009035	TA	3	6	782	787	50 %	50 %	0 %	0 %	126090119
4	NC_009035	TG	3	6	1341	1346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009035	TG	3	6	1587	1592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009035	TG	3	6	1692	1697	0 %	50 %	50 %	0 %	126090120
7	NC_009035	TG	3	6	1794	1799	0 %	50 %	50 %	0 %	126090120
8	NC_009035	AT	3	6	2842	2847	50 %	50 %	0 %	0 %	126090120
9	NC_009035	CG	3	6	4754	4759	0 %	0 %	50 %	50 %	126090122
10	NC_009035	AC	3	6	5915	5920	50 %	0 %	0 %	50 %	126090124
11	NC_009035	CT	3	6	6308	6313	0 %	50 %	0 %	50 %	126090124
12	NC_009035	GC	3	6	6784	6789	0 %	0 %	50 %	50 %	126090124
13	NC_009035	GC	3	6	6968	6973	0 %	0 %	50 %	50 %	126090124
14	NC_009035	AT	3	6	7814	7819	50 %	50 %	0 %	0 %	126090126
15	NC_009035	GA	3	6	7981	7986	50 %	0 %	50 %	0 %	126090126
16	NC_009035	GT	4	8	8067	8074	0 %	50 %	50 %	0 %	126090127
17	NC_009035	CT	3	6	11126	11131	0 %	50 %	0 %	50 %	126090129
18	NC_009035	GT	3	6	12125	12130	0 %	50 %	50 %	0 %	126090130
19	NC_009035	TG	3	6	12307	12312	0 %	50 %	50 %	0 %	126090131
20	NC_009035	TA	3	6	12904	12909	50 %	50 %	0 %	0 %	126090131
21	NC_009035	AG	3	6	13798	13803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009035	CG	3	6	15232	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	126090134
23	NC_009035	TG	3	6	15674	15679	0 %	50 %	50 %	0 %	126090134
24	NC_009035	GC	3	6	15699	15704	0 %	0 %	50 %	50 %	126090134
25	NC_009035	CT	3	6	17919	17924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009035	CA	3	6	18564	18569	50 %	0 %	0 %	50 %	126090137
27	NC_009035	GC	3	6	19328	19333	0 %	0 %	50 %	50 %	126090138
28	NC_009035	GC	3	6	19534	19539	0 %	0 %	50 %	50 %	126090138
29	NC_009035	CA	3	6	19804	19809	50 %	0 %	0 %	50 %	126090138
30	NC_009035	GA	3	6	20398	20403	50 %	0 %	50 %	0 %	126090138
31	NC_009035	TA	3	6	20585	20590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009035	CG	3	6	20649	20654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009035	CA	3	6	24837	24842	50 %	0 %	0 %	50 %	126090141
34	NC_009035	GC	4	8	26031	26038	0 %	0 %	50 %	50 %	126090142
35	NC_009035	GC	3	6	26261	26266	0 %	0 %	50 %	50 %	126090142
36	NC_009035	GC	3	6	27042	27047	0 %	0 %	50 %	50 %	126090143
37	NC_009035	AC	3	6	27458	27463	50 %	0 %	0 %	50 %	126090143
38	NC_009035	GC	3	6	28589	28594	0 %	0 %	50 %	50 %	126090144
39	NC_009035	GC	3	6	29561	29566	0 %	0 %	50 %	50 %	126090145
40	NC_009035	TA	3	6	30554	30559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009035	GC	3	6	31114	31119	0 %	0 %	50 %	50 %	126090146
42	NC_009035	GC	3	6	31207	31212	0 %	0 %	50 %	50 %	126090146
43	NC_009035	GT	3	6	31626	31631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009035	GC	3	6	31896	31901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009035	CG	3	6	32661	32666	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
46	NC_009035	CT	3	6	33006	33011	0 %	50 %	0 %	50 %	126090148
47	NC_009035	GC	3	6	33121	33126	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
48	NC_009035	TG	3	6	33175	33180	0 %	50 %	50 %	0 %	126090148
49	NC_009035	CG	3	6	33435	33440	0 %	0 %	50 %	50 %	126090148
50	NC_009035	AT	3	6	34810	34815	50 %	50 %	0 %	0 %	126090149
51	NC_009035	AT	3	6	35945	35950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009035	AC	3	6	37176	37181	50 %	0 %	0 %	50 %	126090154
53	NC_009035	GC	3	6	39306	39311	0 %	0 %	50 %	50 %	126090156
54	NC_009035	AC	3	6	40131	40136	50 %	0 %	0 %	50 %	126090156
55	NC_009035	GC	3	6	40154	40159	0 %	0 %	50 %	50 %	126090156
56	NC_009035	CA	3	6	41650	41655	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
57	NC_009035	AC	3	6	41904	41909	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
58	NC_009035	AC	3	6	41954	41959	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
59	NC_009035	TA	3	6	43180	43185	50 %	50 %	0 %	0 %	126090158
60	NC_009035	CT	3	6	43696	43701	0 %	50 %	0 %	50 %	126090158
61	NC_009035	TG	3	6	43712	43717	0 %	50 %	50 %	0 %	126090158
62	NC_009035	TG	3	6	44722	44727	0 %	50 %	50 %	0 %	126090159
63	NC_009035	CG	3	6	44754	44759	0 %	0 %	50 %	50 %	126090159
64	NC_009035	TC	3	6	45330	45335	0 %	50 %	0 %	50 %	126090160
65	NC_009035	CG	3	6	47945	47950	0 %	0 %	50 %	50 %	126090162
66	NC_009035	AC	3	6	48153	48158	50 %	0 %	0 %	50 %	126090162
67	NC_009035	GC	3	6	48335	48340	0 %	0 %	50 %	50 %	126090162
68	NC_009035	CA	3	6	48614	48619	50 %	0 %	0 %	50 %	126090162
69	NC_009035	AG	3	6	49125	49130	50 %	0 %	50 %	0 %	126090163
70	NC_009035	TG	4	8	50199	50206	0 %	50 %	50 %	0 %	126090164
71	NC_009035	TA	3	6	50871	50876	50 %	50 %	0 %	0 %	126090164
72	NC_009035	CA	3	6	52002	52007	50 %	0 %	0 %	50 %	126090165
73	NC_009035	GA	3	6	52046	52051	50 %	0 %	50 %	0 %	126090165
74	NC_009035	GC	3	6	52644	52649	0 %	0 %	50 %	50 %	126090166
75	NC_009035	TC	3	6	54078	54083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009035	CA	3	6	55821	55826	50 %	0 %	0 %	50 %	126090167
77	NC_009035	TG	3	6	58970	58975	0 %	50 %	50 %	0 %	126090169
78	NC_009035	GA	3	6	59036	59041	50 %	0 %	50 %	0 %	126090169
79	NC_009035	CA	3	6	59479	59484	50 %	0 %	0 %	50 %	126090170
80	NC_009035	AC	3	6	59950	59955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009035	CG	3	6	60301	60306	0 %	0 %	50 %	50 %	126090171
82	NC_009035	GC	3	6	60838	60843	0 %	0 %	50 %	50 %	126090172
83	NC_009035	TC	3	6	61258	61263	0 %	50 %	0 %	50 %	126090172
84	NC_009035	GC	3	6	64105	64110	0 %	0 %	50 %	50 %	126090174
85	NC_009035	GC	3	6	64528	64533	0 %	0 %	50 %	50 %	126090175
86	NC_009035	CG	3	6	65650	65655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009035	CA	3	6	65797	65802	50 %	0 %	0 %	50 %	126090176
88	NC_009035	GC	3	6	66216	66221	0 %	0 %	50 %	50 %	126090176
89	NC_009035	GC	3	6	66272	66277	0 %	0 %	50 %	50 %	126090176
90	NC_009035	CA	4	8	66340	66347	50 %	0 %	0 %	50 %	126090176
91	NC_009035	AC	3	6	67061	67066	50 %	0 %	0 %	50 %	126090177
92	NC_009035	GC	3	6	67412	67417	0 %	0 %	50 %	50 %	126090177
93	NC_009035	GC	3	6	68816	68821	0 %	0 %	50 %	50 %	126090179
94	NC_009035	GC	4	8	69050	69057	0 %	0 %	50 %	50 %	126090179
95	NC_009035	GC	3	6	69310	69315	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
96	NC_009035	GC	4	8	69507	69514	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
97	NC_009035	CG	3	6	69608	69613	0 %	0 %	50 %	50 %	126090180
98	NC_009035	AC	3	6	69682	69687	50 %	0 %	0 %	50 %	126090180
99	NC_009035	GA	3	6	72492	72497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009035	CA	3	6	73297	73302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009035	AT	3	6	73591	73596	50 %	50 %	0 %	0 %	126090181
102	NC_009035	CA	4	8	73691	73698	50 %	0 %	0 %	50 %	126090181
103	NC_009035	GC	3	6	74651	74656	0 %	0 %	50 %	50 %	126090181
104	NC_009035	AT	3	6	74862	74867	50 %	50 %	0 %	0 %	126090181
105	NC_009035	GC	3	6	77946	77951	0 %	0 %	50 %	50 %	126090184
106	NC_009035	GC	4	8	78406	78413	0 %	0 %	50 %	50 %	126090184
107	NC_009035	GC	3	6	79756	79761	0 %	0 %	50 %	50 %	126090185
108	NC_009035	GT	3	6	80173	80178	0 %	50 %	50 %	0 %	126090185
109	NC_009035	TA	3	6	80606	80611	50 %	50 %	0 %	0 %	126090186
110	NC_009035	TC	3	6	80796	80801	0 %	50 %	0 %	50 %	126090186
111	NC_009035	CG	3	6	80901	80906	0 %	0 %	50 %	50 %	126090186
112	NC_009035	CG	4	8	81669	81676	0 %	0 %	50 %	50 %	126090187
113	NC_009035	TA	3	6	82160	82165	50 %	50 %	0 %	0 %	126090188
114	NC_009035	CG	3	6	82482	82487	0 %	0 %	50 %	50 %	126090188
115	NC_009035	CA	3	6	83230	83235	50 %	0 %	0 %	50 %	126090190
116	NC_009035	AG	3	6	84968	84973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009035	AC	3	6	84993	84998	50 %	0 %	0 %	50 %	126090192
118	NC_009035	GC	3	6	86545	86550	0 %	0 %	50 %	50 %	126090194
119	NC_009035	AC	3	6	89028	89033	50 %	0 %	0 %	50 %	126090195
120	NC_009035	CG	3	6	89067	89072	0 %	0 %	50 %	50 %	126090195
121	NC_009035	AT	3	6	94235	94240	50 %	50 %	0 %	0 %	126090199
122	NC_009035	AC	3	6	94898	94903	50 %	0 %	0 %	50 %	126090200
123	NC_009035	GC	4	8	95135	95142	0 %	0 %	50 %	50 %	126090200
124	NC_009035	CT	3	6	95592	95597	0 %	50 %	0 %	50 %	126090200
125	NC_009035	AC	3	6	95746	95751	50 %	0 %	0 %	50 %	126090200
126	NC_009035	TG	3	6	95817	95822	0 %	50 %	50 %	0 %	126090200
127	NC_009035	CG	3	6	95870	95875	0 %	0 %	50 %	50 %	126090200
128	NC_009035	AT	3	6	95939	95944	50 %	50 %	0 %	0 %	126090200
129	NC_009035	GC	3	6	97375	97380	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
130	NC_009035	CA	3	6	97842	97847	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
131	NC_009035	GT	3	6	98948	98953	0 %	50 %	50 %	0 %	126090201
132	NC_009035	GC	3	6	99095	99100	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
133	NC_009035	CA	3	6	99427	99432	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
134	NC_009035	GC	3	6	99450	99455	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
135	NC_009035	CA	4	8	100064	100071	50 %	0 %	0 %	50 %	126090201
136	NC_009035	GC	3	6	100129	100134	0 %	0 %	50 %	50 %	126090201
137	NC_009035	AG	3	6	100902	100907	50 %	0 %	50 %	0 %	126090202
138	NC_009035	GC	3	6	101678	101683	0 %	0 %	50 %	50 %	126090202
139	NC_009035	GT	3	6	102383	102388	0 %	50 %	50 %	0 %	126090202
140	NC_009035	GT	3	6	102910	102915	0 %	50 %	50 %	0 %	126090202
141	NC_009035	GC	3	6	103044	103049	0 %	0 %	50 %	50 %	126090202
142	NC_009035	AT	3	6	103482	103487	50 %	50 %	0 %	0 %	126090202
143	NC_009035	CT	3	6	103501	103506	0 %	50 %	0 %	50 %	126090202
144	NC_009035	GC	3	6	104099	104104	0 %	0 %	50 %	50 %	126090202
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146	NC_009035	CA	3	6	105020	105025	50 %	0 %	0 %	50 %	126090203
147	NC_009035	CG	3	6	105825	105830	0 %	0 %	50 %	50 %	126090203
148	NC_009035	CG	3	6	106847	106852	0 %	0 %	50 %	50 %	126090204
149	NC_009035	CT	3	6	107134	107139	0 %	50 %	0 %	50 %	126090204
150	NC_009035	CG	3	6	108313	108318	0 %	0 %	50 %	50 %	126090205
151	NC_009035	AT	3	6	108995	109000	50 %	50 %	0 %	0 %	126090206
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159	NC_009035	TA	3	6	114949	114954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009035	AC	3	6	116648	116653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.