MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS155 plasmid pSbal01

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009035	CATT	2	8	49	56	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009035	CAAG	2	8	640	647	50 %	0 %	25 %	25 %	126090119
3	NC_009035	AATC	2	8	1106	1113	50 %	25 %	0 %	25 %	126090119
4	NC_009035	GACA	2	8	1191	1198	50 %	0 %	25 %	25 %	126090119
5	NC_009035	CGTG	2	8	1781	1788	0 %	25 %	50 %	25 %	126090120
6	NC_009035	ACAA	2	8	1978	1985	75 %	0 %	0 %	25 %	126090120
7	NC_009035	CAGC	2	8	2267	2274	25 %	0 %	25 %	50 %	126090120
8	NC_009035	TTAT	2	8	2983	2990	25 %	75 %	0 %	0 %	126090121
9	NC_009035	TGAT	2	8	3385	3392	25 %	50 %	25 %	0 %	126090122
10	NC_009035	TCAA	2	8	3592	3599	50 %	25 %	0 %	25 %	126090122
11	NC_009035	AGCA	2	8	3868	3875	50 %	0 %	25 %	25 %	126090122
12	NC_009035	AATC	2	8	4235	4242	50 %	25 %	0 %	25 %	126090122
13	NC_009035	ATGG	2	8	4251	4258	25 %	25 %	50 %	0 %	126090122
14	NC_009035	CTTC	2	8	5203	5210	0 %	50 %	0 %	50 %	126090123
15	NC_009035	AATA	2	8	5443	5450	75 %	25 %	0 %	0 %	126090123
16	NC_009035	ACGA	2	8	6191	6198	50 %	0 %	25 %	25 %	126090124
17	NC_009035	CAGT	2	8	6286	6293	25 %	25 %	25 %	25 %	126090124
18	NC_009035	AAGC	2	8	6420	6427	50 %	0 %	25 %	25 %	126090124
19	NC_009035	TCTA	2	8	6452	6459	25 %	50 %	0 %	25 %	126090124
20	NC_009035	ATCT	2	8	8204	8211	25 %	50 %	0 %	25 %	126090127
21	NC_009035	GAAC	2	8	9075	9082	50 %	0 %	25 %	25 %	126090128
22	NC_009035	ACTG	2	8	9450	9457	25 %	25 %	25 %	25 %	126090128
23	NC_009035	TGTC	2	8	10320	10327	0 %	50 %	25 %	25 %	126090129
24	NC_009035	TCAG	2	8	10472	10479	25 %	25 %	25 %	25 %	126090129
25	NC_009035	TGGT	2	8	12271	12278	0 %	50 %	50 %	0 %	126090131
26	NC_009035	GGCT	2	8	12684	12691	0 %	25 %	50 %	25 %	126090131
27	NC_009035	GGTC	2	8	12724	12731	0 %	25 %	50 %	25 %	126090131
28	NC_009035	GCCA	2	8	12744	12751	25 %	0 %	25 %	50 %	126090131
29	NC_009035	AGTG	2	8	12937	12944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009035	TTGA	2	8	13654	13661	25 %	50 %	25 %	0 %	126090132
31	NC_009035	TTTC	2	8	14110	14117	0 %	75 %	0 %	25 %	126090133
32	NC_009035	GTCG	2	8	14806	14813	0 %	25 %	50 %	25 %	126090133
33	NC_009035	CTAA	2	8	15975	15982	50 %	25 %	0 %	25 %	126090134
34	NC_009035	TACA	2	8	16301	16308	50 %	25 %	0 %	25 %	126090135
35	NC_009035	AATA	2	8	16556	16563	75 %	25 %	0 %	0 %	126090135
36	NC_009035	ATTC	2	8	17153	17160	25 %	50 %	0 %	25 %	126090136
37	NC_009035	TCAG	2	8	17998	18005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009035	AGGA	2	8	18143	18150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009035	AACC	2	8	19072	19079	50 %	0 %	0 %	50 %	126090137
40	NC_009035	GCAC	2	8	19596	19603	25 %	0 %	25 %	50 %	126090138
41	NC_009035	CGTT	2	8	19647	19654	0 %	50 %	25 %	25 %	126090138
42	NC_009035	TTAT	2	8	20452	20459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009035	TTAT	2	8	20594	20601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009035	TCAA	2	8	21223	21230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009035	AATC	2	8	21654	21661	50 %	25 %	0 %	25 %	126090139
46	NC_009035	ATCA	2	8	21979	21986	50 %	25 %	0 %	25 %	126090139
47	NC_009035	GTTG	2	8	22081	22088	0 %	50 %	50 %	0 %	126090139
48	NC_009035	TTCA	2	8	22135	22142	25 %	50 %	0 %	25 %	126090139
49	NC_009035	TGAC	2	8	23629	23636	25 %	25 %	25 %	25 %	126090140
50	NC_009035	TCTT	2	8	23637	23644	0 %	75 %	0 %	25 %	126090140
51	NC_009035	TCAA	2	8	24381	24388	50 %	25 %	0 %	25 %	126090141
52	NC_009035	AACT	2	8	24722	24729	50 %	25 %	0 %	25 %	126090141
53	NC_009035	TCAA	2	8	25293	25300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009035	CTGG	2	8	25785	25792	0 %	25 %	50 %	25 %	126090142
55	NC_009035	CATC	2	8	26487	26494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009035	TAGC	2	8	27686	27693	25 %	25 %	25 %	25 %	126090143
57	NC_009035	TCAC	2	8	27811	27818	25 %	25 %	0 %	50 %	126090143
58	NC_009035	TGTC	2	8	28115	28122	0 %	50 %	25 %	25 %	126090143
59	NC_009035	ACCA	2	8	28171	28178	50 %	0 %	0 %	50 %	126090143
60	NC_009035	ATGA	2	8	28317	28324	50 %	25 %	25 %	0 %	126090144
61	NC_009035	CCGC	2	8	28849	28856	0 %	0 %	25 %	75 %	126090144
62	NC_009035	AACC	2	8	29449	29456	50 %	0 %	0 %	50 %	126090145
63	NC_009035	GATA	2	8	31085	31092	50 %	25 %	25 %	0 %	126090146
64	NC_009035	AATG	2	8	31139	31146	50 %	25 %	25 %	0 %	126090146
65	NC_009035	GGGC	2	8	31460	31467	0 %	0 %	75 %	25 %	126090146
66	NC_009035	GCTT	2	8	31886	31893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009035	ACTT	2	8	32152	32159	25 %	50 %	0 %	25 %	126090147
68	NC_009035	ACAA	2	8	32477	32484	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009035	GTTT	2	8	32507	32514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009035	ACCA	2	8	32671	32678	50 %	0 %	0 %	50 %	126090148
71	NC_009035	ATAA	2	8	33907	33914	75 %	25 %	0 %	0 %	126090148
72	NC_009035	TTGG	2	8	34667	34674	0 %	50 %	50 %	0 %	126090149
73	NC_009035	TATT	2	8	35716	35723	25 %	75 %	0 %	0 %	126090150
74	NC_009035	ACAA	2	8	35878	35885	75 %	0 %	0 %	25 %	126090150
75	NC_009035	GACA	2	8	36242	36249	50 %	0 %	25 %	25 %	126090152
76	NC_009035	AATT	2	8	36469	36476	50 %	50 %	0 %	0 %	126090152
77	NC_009035	GCCA	2	8	36997	37004	25 %	0 %	25 %	50 %	126090153
78	NC_009035	CAAA	2	8	37258	37265	75 %	0 %	0 %	25 %	126090154
79	NC_009035	TTTA	2	8	37485	37492	25 %	75 %	0 %	0 %	126090154
80	NC_009035	TTTG	2	8	37666	37673	0 %	75 %	25 %	0 %	126090154
81	NC_009035	AAAT	2	8	37926	37933	75 %	25 %	0 %	0 %	126090154
82	NC_009035	GAAT	2	8	39517	39524	50 %	25 %	25 %	0 %	126090156
83	NC_009035	TTTC	2	8	39741	39748	0 %	75 %	0 %	25 %	126090156
84	NC_009035	ATCG	2	8	39871	39878	25 %	25 %	25 %	25 %	126090156
85	NC_009035	TCAG	2	8	40010	40017	25 %	25 %	25 %	25 %	126090156
86	NC_009035	ATGG	2	8	40141	40148	25 %	25 %	50 %	0 %	126090156
87	NC_009035	ATCA	2	8	41166	41173	50 %	25 %	0 %	25 %	126090157
88	NC_009035	GGCA	2	8	41475	41482	25 %	0 %	50 %	25 %	126090157
89	NC_009035	CAAC	2	8	41916	41923	50 %	0 %	0 %	50 %	126090157
90	NC_009035	TAAA	2	8	42125	42132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009035	TTGC	2	8	42239	42246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009035	TTGA	2	8	42322	42329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009035	CAAA	2	8	42348	42355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009035	ACTC	2	8	42389	42396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009035	AATA	2	8	42439	42446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009035	ATCA	2	8	42514	42521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009035	ACAA	2	8	42568	42575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009035	TTTA	2	8	42666	42673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009035	ATGA	2	8	45079	45086	50 %	25 %	25 %	0 %	126090160
100	NC_009035	CACT	2	8	45109	45116	25 %	25 %	0 %	50 %	126090160
101	NC_009035	ACCA	2	8	45457	45464	50 %	0 %	0 %	50 %	126090160
102	NC_009035	GCAG	2	8	46204	46211	25 %	0 %	50 %	25 %	126090160
103	NC_009035	GTTT	2	8	47582	47589	0 %	75 %	25 %	0 %	126090162
104	NC_009035	CCGC	2	8	48631	48638	0 %	0 %	25 %	75 %	126090162
105	NC_009035	CGCC	2	8	50147	50154	0 %	0 %	25 %	75 %	126090164
106	NC_009035	ATAA	2	8	51413	51420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009035	TACT	2	8	51823	51830	25 %	50 %	0 %	25 %	126090165
108	NC_009035	ATTG	2	8	52022	52029	25 %	50 %	25 %	0 %	126090165
109	NC_009035	CATA	2	8	52392	52399	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009035	TGGC	2	8	52942	52949	0 %	25 %	50 %	25 %	126090166
111	NC_009035	CAAG	2	8	52976	52983	50 %	0 %	25 %	25 %	126090166
112	NC_009035	TATG	2	8	53594	53601	25 %	50 %	25 %	0 %	126090166
113	NC_009035	TGGC	2	8	54325	54332	0 %	25 %	50 %	25 %	126090167
114	NC_009035	TTCT	2	8	55928	55935	0 %	75 %	0 %	25 %	126090167
115	NC_009035	GGCT	2	8	56020	56027	0 %	25 %	50 %	25 %	126090167
116	NC_009035	AATT	2	8	57138	57145	50 %	50 %	0 %	0 %	126090168
117	NC_009035	AAGC	2	8	58705	58712	50 %	0 %	25 %	25 %	126090169
118	NC_009035	TAAG	2	8	59069	59076	50 %	25 %	25 %	0 %	126090169
119	NC_009035	TGGT	2	8	59202	59209	0 %	50 %	50 %	0 %	126090169
120	NC_009035	AGTA	2	8	59575	59582	50 %	25 %	25 %	0 %	126090170
121	NC_009035	GCGG	2	8	59983	59990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009035	GCTA	2	8	60211	60218	25 %	25 %	25 %	25 %	126090171
123	NC_009035	CTAT	2	8	61115	61122	25 %	50 %	0 %	25 %	126090172
124	NC_009035	TATC	2	8	61137	61144	25 %	50 %	0 %	25 %	126090172
125	NC_009035	CAAA	2	8	62405	62412	75 %	0 %	0 %	25 %	126090173
126	NC_009035	AGGC	2	8	62444	62451	25 %	0 %	50 %	25 %	126090173
127	NC_009035	TCAA	2	8	62641	62648	50 %	25 %	0 %	25 %	126090173
128	NC_009035	CGGT	2	8	62875	62882	0 %	25 %	50 %	25 %	126090173
129	NC_009035	CTAT	2	8	63814	63821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009035	ATTT	2	8	64299	64306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009035	AAGC	2	8	64459	64466	50 %	0 %	25 %	25 %	126090175
132	NC_009035	AAAG	2	8	65377	65384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009035	TTTC	2	8	65475	65482	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009035	ATCA	2	8	65637	65644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009035	ACCC	2	8	65946	65953	25 %	0 %	0 %	75 %	126090176
136	NC_009035	TACA	2	8	67377	67384	50 %	25 %	0 %	25 %	126090177
137	NC_009035	CCTG	2	8	68471	68478	0 %	25 %	25 %	50 %	126090178
138	NC_009035	GACA	2	8	69166	69173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009035	GAGC	2	8	69634	69641	25 %	0 %	50 %	25 %	126090180
140	NC_009035	CAAC	2	8	69735	69742	50 %	0 %	0 %	50 %	126090180
141	NC_009035	CGGT	2	8	70111	70118	0 %	25 %	50 %	25 %	126090180
142	NC_009035	TAAT	2	8	70230	70237	50 %	50 %	0 %	0 %	126090180
143	NC_009035	ATCA	2	8	70636	70643	50 %	25 %	0 %	25 %	126090180
144	NC_009035	TCCT	2	8	71306	71313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.