MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 1164

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009033	TAGAA	2	10	2217	2226	60 %	20 %	20 %	0 %	126464917
2	NC_009033	TCTAT	2	10	5470	5479	20 %	60 %	0 %	20 %	126464921
3	NC_009033	AGTTT	2	10	6274	6283	20 %	60 %	20 %	0 %	126464921
4	NC_009033	CCATA	2	10	11638	11647	40 %	20 %	0 %	40 %	126464927
5	NC_009033	ATTGT	2	10	17192	17201	20 %	60 %	20 %	0 %	126464929
6	NC_009033	AGTAT	2	10	22208	22217	40 %	40 %	20 %	0 %	126464937
7	NC_009033	ATGTA	2	10	23469	23478	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
8	NC_009033	GATTA	2	10	23726	23735	40 %	40 %	20 %	0 %	126464939
9	NC_009033	TCAAT	2	10	24004	24013	40 %	40 %	0 %	20 %	126464940
10	NC_009033	ATGAA	2	10	24924	24933	60 %	20 %	20 %	0 %	126464940
11	NC_009033	AAAGA	2	10	25477	25486	80 %	0 %	20 %	0 %	126464941
12	NC_009033	ATGGA	2	10	25728	25737	40 %	20 %	40 %	0 %	126464942
13	NC_009033	AGTAT	2	10	25947	25956	40 %	40 %	20 %	0 %	126464942
14	NC_009033	ATAGA	2	10	26628	26637	60 %	20 %	20 %	0 %	126464942
15	NC_009033	ATCCT	2	10	27473	27482	20 %	40 %	0 %	40 %	126464943
16	NC_009033	ATTAT	2	10	28063	28072	40 %	60 %	0 %	0 %	126464943
17	NC_009033	GATAC	2	10	28384	28393	40 %	20 %	20 %	20 %	126464944
18	NC_009033	ATCAT	2	10	28903	28912	40 %	40 %	0 %	20 %	126464944
19	NC_009033	GATCT	2	10	31378	31387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009033	TACCA	2	10	31577	31586	40 %	20 %	0 %	40 %	126464949
21	NC_009033	TAATA	2	10	31701	31710	60 %	40 %	0 %	0 %	126464949
22	NC_009033	ATGAG	2	10	32173	32182	40 %	20 %	40 %	0 %	126464950
23	NC_009033	TACTA	2	10	33945	33954	40 %	40 %	0 %	20 %	126464952
24	NC_009033	TAGAT	2	10	34202	34211	40 %	40 %	20 %	0 %	126464952
25	NC_009033	TATTT	2	10	36551	36560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009033	GATCA	2	10	37513	37522	40 %	20 %	20 %	20 %	126464956
27	NC_009033	AATTA	2	10	38662	38671	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009033	GAATA	2	10	38892	38901	60 %	20 %	20 %	0 %	126464957
29	NC_009033	GCTAG	2	10	39035	39044	20 %	20 %	40 %	20 %	126464957
30	NC_009033	TATAT	2	10	39562	39571	40 %	60 %	0 %	0 %	126464957
31	NC_009033	TAAAG	2	10	40511	40520	60 %	20 %	20 %	0 %	126464959
32	NC_009033	ATTAT	2	10	43835	43844	40 %	60 %	0 %	0 %	126464962
33	NC_009033	AAGAG	2	10	46297	46306	60 %	0 %	40 %	0 %	126464966
34	NC_009033	AATTT	2	10	47186	47195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009033	TTTAT	2	10	47828	47837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009033	ATTTG	2	10	50604	50613	20 %	60 %	20 %	0 %	126464968
37	NC_009033	TCCAT	2	10	50816	50825	20 %	40 %	0 %	40 %	126464969
38	NC_009033	AGCTA	2	10	55606	55615	40 %	20 %	20 %	20 %	126464973
39	NC_009033	TGTAG	2	10	56741	56750	20 %	40 %	40 %	0 %	126464975
40	NC_009033	ATATA	2	10	57120	57129	60 %	40 %	0 %	0 %	126464976
41	NC_009033	GCCTT	2	10	58372	58381	0 %	40 %	20 %	40 %	126464977
42	NC_009033	TGTAT	2	10	58917	58926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009033	ATAGA	2	10	61052	61061	60 %	20 %	20 %	0 %	126464978
44	NC_009033	ATTAT	2	10	61745	61754	40 %	60 %	0 %	0 %	126464978
45	NC_009033	AAGGA	2	10	61788	61797	60 %	0 %	40 %	0 %	126464978
46	NC_009033	AAATT	2	10	61826	61835	60 %	40 %	0 %	0 %	126464978
47	NC_009033	TCTAT	2	10	64445	64454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009033	TTTTA	2	10	64634	64643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009033	TTGGG	2	10	66776	66785	0 %	40 %	60 %	0 %	126464985
50	NC_009033	AAGGT	2	10	67437	67446	40 %	20 %	40 %	0 %	126464986
51	NC_009033	AGAAT	2	10	71834	71843	60 %	20 %	20 %	0 %	126464989
52	NC_009033	TTAGC	2	10	73616	73625	20 %	40 %	20 %	20 %	126464989
53	NC_009033	CTTTT	2	10	74074	74083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009033	ATCTT	2	10	75070	75079	20 %	60 %	0 %	20 %	126464991
55	NC_009033	TTATT	2	10	75442	75451	20 %	80 %	0 %	0 %	126464991
56	NC_009033	CTATA	2	10	80210	80219	40 %	40 %	0 %	20 %	126464996
57	NC_009033	CTTCT	2	10	82315	82324	0 %	60 %	0 %	40 %	126464997
58	NC_009033	CTATT	2	10	83197	83206	20 %	60 %	0 %	20 %	126464997
59	NC_009033	AAATA	2	10	86989	86998	80 %	20 %	0 %	0 %	126465002
60	NC_009033	GGATT	2	10	87270	87279	20 %	40 %	40 %	0 %	126465002
61	NC_009033	GTTGT	2	10	88067	88076	0 %	60 %	40 %	0 %	126465003
62	NC_009033	GCTTC	2	10	89318	89327	0 %	40 %	20 %	40 %	126465004
63	NC_009033	GGATG	2	10	91284	91293	20 %	20 %	60 %	0 %	126465006
64	NC_009033	TTGGG	2	10	92505	92514	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009033	TTCTT	2	10	95040	95049	0 %	80 %	0 %	20 %	126465008
66	NC_009033	ATTAT	2	10	95952	95961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009033	TGAAT	2	10	97140	97149	40 %	40 %	20 %	0 %	126465009
68	NC_009033	AGCAT	2	10	100700	100709	40 %	20 %	20 %	20 %	126465012
69	NC_009033	ATTGT	2	10	101259	101268	20 %	60 %	20 %	0 %	126465013
70	NC_009033	TATCA	2	10	102483	102492	40 %	40 %	0 %	20 %	126465014
71	NC_009033	TTTTC	2	10	103047	103056	0 %	80 %	0 %	20 %	126465015
72	NC_009033	TAGTT	2	10	103507	103516	20 %	60 %	20 %	0 %	126465016
73	NC_009033	TATAT	2	10	105259	105268	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009033	ATTCT	2	10	106246	106255	20 %	60 %	0 %	20 %	126465019
75	NC_009033	GAGAA	2	10	114823	114832	60 %	0 %	40 %	0 %	126465026
76	NC_009033	ATTAT	2	10	115538	115547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009033	ATCAA	2	10	115587	115596	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009033	GATTT	2	10	116627	116636	20 %	60 %	20 %	0 %	126465027
79	NC_009033	TGCTT	2	10	116997	117006	0 %	60 %	20 %	20 %	126465028
80	NC_009033	AAACT	2	10	117433	117442	60 %	20 %	0 %	20 %	126465028
81	NC_009033	GATAG	2	10	117561	117570	40 %	20 %	40 %	0 %	126465028
82	NC_009033	TAGTG	2	10	117625	117634	20 %	40 %	40 %	0 %	126465028
83	NC_009033	TAGGC	2	10	118773	118782	20 %	20 %	40 %	20 %	126465029
84	NC_009033	TACCC	2	10	119239	119248	20 %	20 %	0 %	60 %	126465030
85	NC_009033	CTATA	2	10	120746	120755	40 %	40 %	0 %	20 %	126465030
86	NC_009033	GGGAG	2	10	122932	122941	20 %	0 %	80 %	0 %	126465032
87	NC_009033	AGATA	2	10	124574	124583	60 %	20 %	20 %	0 %	126465033
88	NC_009033	AAGAT	2	10	128106	128115	60 %	20 %	20 %	0 %	126465038
89	NC_009033	TACAT	2	10	129075	129084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009033	AATTT	2	10	130644	130653	40 %	60 %	0 %	0 %	126465041
91	NC_009033	TGGAA	2	10	131988	131997	40 %	20 %	40 %	0 %	126465042
92	NC_009033	AAGAG	2	10	132740	132749	60 %	0 %	40 %	0 %	126465043
93	NC_009033	TGGCT	2	10	136234	136243	0 %	40 %	40 %	20 %	126465045
94	NC_009033	GAAGA	2	10	137293	137302	60 %	0 %	40 %	0 %	126465046
95	NC_009033	TTCTC	2	10	137901	137910	0 %	60 %	0 %	40 %	126465047
96	NC_009033	AACTA	2	10	138072	138081	60 %	20 %	0 %	20 %	126465047
97	NC_009033	GTTAT	2	10	138164	138173	20 %	60 %	20 %	0 %	126465047
98	NC_009033	AAAAT	2	10	138401	138410	80 %	20 %	0 %	0 %	126465047
99	NC_009033	CTTGG	2	10	140936	140945	0 %	40 %	40 %	20 %	126465050
100	NC_009033	AAGAG	2	10	143893	143902	60 %	0 %	40 %	0 %	126465052
101	NC_009033	TTTCT	2	10	146763	146772	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009033	CTTAG	2	10	150599	150608	20 %	40 %	20 %	20 %	126465056
103	NC_009033	CATAA	2	10	151428	151437	60 %	20 %	0 %	20 %	126465056
104	NC_009033	TGTAT	2	10	151749	151758	20 %	60 %	20 %	0 %	126465057
105	NC_009033	CATTG	2	10	153072	153081	20 %	40 %	20 %	20 %	126465057
106	NC_009033	TCTAT	2	10	153495	153504	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009033	AAGGC	2	10	154213	154222	40 %	0 %	40 %	20 %	126465059
108	NC_009033	AAATA	3	15	154775	154789	80 %	20 %	0 %	0 %	126465059
109	NC_009033	ACAGG	2	10	158052	158061	40 %	0 %	40 %	20 %	126465062
110	NC_009033	ATGTT	2	10	160024	160033	20 %	60 %	20 %	0 %	126465063
111	NC_009033	ATCAT	2	10	163421	163430	40 %	40 %	0 %	20 %	126465065
112	NC_009033	AGATA	2	10	163537	163546	60 %	20 %	20 %	0 %	126465065
113	NC_009033	GATAG	2	10	166064	166073	40 %	20 %	40 %	0 %	126465066
114	NC_009033	TGGGA	2	10	166194	166203	20 %	20 %	60 %	0 %	126465066
115	NC_009033	ATGGT	2	10	166792	166801	20 %	40 %	40 %	0 %	126465067
116	NC_009033	GAATA	2	10	167086	167095	60 %	20 %	20 %	0 %	126465067
117	NC_009033	ATTAT	2	10	168905	168914	40 %	60 %	0 %	0 %	126465069
118	NC_009033	ATTGC	2	10	170092	170101	20 %	40 %	20 %	20 %	126465071
119	NC_009033	GAATG	2	10	172249	172258	40 %	20 %	40 %	0 %	126465074
120	NC_009033	AAATG	3	15	172315	172329	60 %	20 %	20 %	0 %	126465074
121	NC_009033	GTTAT	2	10	175458	175467	20 %	60 %	20 %	0 %	126465078
122	NC_009033	ATTAT	2	10	176082	176091	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009033	ACTAT	2	10	176337	176346	40 %	40 %	0 %	20 %	126465079
124	NC_009033	AAATG	2	10	178742	178751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009033	GAAAA	2	10	179513	179522	80 %	0 %	20 %	0 %	126465083
126	NC_009033	GATAC	2	10	179607	179616	40 %	20 %	20 %	20 %	126465083
127	NC_009033	CTATA	2	10	180428	180437	40 %	40 %	0 %	20 %	126465083
128	NC_009033	AGTGA	2	10	182647	182656	40 %	20 %	40 %	0 %	126465085
129	NC_009033	GAGAA	2	10	183427	183436	60 %	0 %	40 %	0 %	126465086
130	NC_009033	TTCTC	2	10	184270	184279	0 %	60 %	0 %	40 %	126465087
131	NC_009033	ATATT	2	10	184809	184818	40 %	60 %	0 %	0 %	126465088
132	NC_009033	TTCTA	2	10	184961	184970	20 %	60 %	0 %	20 %	126465088
133	NC_009033	ATAGT	2	10	189140	189149	40 %	40 %	20 %	0 %	126465091
134	NC_009033	GAATT	2	10	189252	189261	40 %	40 %	20 %	0 %	126465091
135	NC_009033	AGGGA	2	10	190066	190075	40 %	0 %	60 %	0 %	126465091
136	NC_009033	GTATT	2	10	190907	190916	20 %	60 %	20 %	0 %	126465091
137	NC_009033	CCATT	2	10	193492	193501	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_009033	TTATA	2	10	196384	196393	40 %	60 %	0 %	0 %	126465097
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140	NC_009033	TCCTA	2	10	198721	198730	20 %	40 %	0 %	40 %	126465099
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154	NC_009033	CTATT	2	10	221934	221943	20 %	60 %	0 %	20 %	126465121
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254	NC_009033	CTATA	2	10	360673	360682	40 %	40 %	0 %	20 %	126465252
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264	NC_009033	ACAAT	2	10	377612	377621	60 %	20 %	0 %	20 %	126465266
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266	NC_009033	ATAAG	2	10	379237	379246	60 %	20 %	20 %	0 %	126465268
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