MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 39160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009033	AT	3	6	40300	40305	50 %	50 %	0 %	0 %	126464958
1002	NC_009033	ATAA	2	8	40373	40380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_009033	TCT	2	6	40398	40403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464959
1004	NC_009033	T	6	6	40403	40408	0 %	100 %	0 %	0 %	126464959
1005	NC_009033	ACA	2	6	40456	40461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464959
1006	NC_009033	TAAAG	2	10	40511	40520	60 %	20 %	20 %	0 %	126464959
1007	NC_009033	GATT	2	8	40710	40717	25 %	50 %	25 %	0 %	126464959
1008	NC_009033	TACA	2	8	40768	40775	50 %	25 %	0 %	25 %	126464960
1009	NC_009033	TTA	2	6	40851	40856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464960
1010	NC_009033	CCAG	2	8	40931	40938	25 %	0 %	25 %	50 %	126464960
1011	NC_009033	AT	3	6	40975	40980	50 %	50 %	0 %	0 %	126464960
1012	NC_009033	AT	3	6	40984	40989	50 %	50 %	0 %	0 %	126464960
1013	NC_009033	TAA	2	6	41169	41174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464961
1014	NC_009033	TA	3	6	41187	41192	50 %	50 %	0 %	0 %	126464961
1015	NC_009033	CTT	2	6	41232	41237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464961
1016	NC_009033	CTA	2	6	41328	41333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464961
1017	NC_009033	CTT	2	6	41340	41345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464961
1018	NC_009033	AT	3	6	41366	41371	50 %	50 %	0 %	0 %	126464961
1019	NC_009033	AT	3	6	41378	41383	50 %	50 %	0 %	0 %	126464961
1020	NC_009033	TCT	2	6	41388	41393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464961
1021	NC_009033	CT	4	8	41397	41404	0 %	50 %	0 %	50 %	126464961
1022	NC_009033	TCA	2	6	41414	41419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464961
1023	NC_009033	CAA	2	6	41517	41522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464961
1024	NC_009033	CAT	2	6	41571	41576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464961
1025	NC_009033	TATT	2	8	41639	41646	25 %	75 %	0 %	0 %	126464961
1026	NC_009033	CTT	2	6	41682	41687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464961
1027	NC_009033	CTC	2	6	41757	41762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464961
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1029	NC_009033	CATC	2	8	41897	41904	25 %	25 %	0 %	50 %	126464961
1030	NC_009033	TCC	2	6	41986	41991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464961
1031	NC_009033	GCT	2	6	42002	42007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126464961
1032	NC_009033	TTC	2	6	42019	42024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464961
1033	NC_009033	ATT	2	6	42061	42066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464961
1034	NC_009033	T	6	6	42084	42089	0 %	100 %	0 %	0 %	126464961
1035	NC_009033	CATT	2	8	42150	42157	25 %	50 %	0 %	25 %	126464961
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1037	NC_009033	TCC	2	6	42308	42313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464961
1038	NC_009033	ATT	2	6	42323	42328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464961
1039	NC_009033	CAA	2	6	42408	42413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464961
1040	NC_009033	GCA	2	6	42431	42436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464961
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1042	NC_009033	GAG	2	6	42542	42547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009033	TCA	2	6	42552	42557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_009033	AT	3	6	42558	42563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009033	AT	4	8	42579	42586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009033	GAG	2	6	42599	42604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_009033	A	6	6	42660	42665	100 %	0 %	0 %	0 %	126464962
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1050	NC_009033	ATGG	2	8	42786	42793	25 %	25 %	50 %	0 %	126464962
1051	NC_009033	GAT	2	6	42815	42820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464962
1052	NC_009033	GAG	2	6	42959	42964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126464962
1053	NC_009033	A	6	6	42995	43000	100 %	0 %	0 %	0 %	126464962
1054	NC_009033	A	7	7	43011	43017	100 %	0 %	0 %	0 %	126464962
1055	NC_009033	GA	3	6	43050	43055	50 %	0 %	50 %	0 %	126464962
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1061	NC_009033	ATA	2	6	43388	43393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464962
1062	NC_009033	TTG	2	6	43488	43493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126464962
1063	NC_009033	GA	3	6	43578	43583	50 %	0 %	50 %	0 %	126464962
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1068	NC_009033	A	6	6	43728	43733	100 %	0 %	0 %	0 %	126464962
1069	NC_009033	ATTAT	2	10	43835	43844	40 %	60 %	0 %	0 %	126464962
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1071	NC_009033	ATT	2	6	43869	43874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464962
1072	NC_009033	TTTA	2	8	43876	43883	25 %	75 %	0 %	0 %	126464962
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1084	NC_009033	TA	3	6	44103	44108	50 %	50 %	0 %	0 %	126464963
1085	NC_009033	TTGT	2	8	44113	44120	0 %	75 %	25 %	0 %	126464963
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1089	NC_009033	GTA	2	6	44288	44293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126464963
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1096	NC_009033	ATT	2	6	44716	44721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464963
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1098	NC_009033	ATC	2	6	44782	44787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464964
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1100	NC_009033	TCC	2	6	44824	44829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464964
1101	NC_009033	TAT	2	6	44853	44858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464964
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1106	NC_009033	ATTT	2	8	44971	44978	25 %	75 %	0 %	0 %	126464964
1107	NC_009033	AAT	2	6	45011	45016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126464964
1108	NC_009033	CAT	2	6	45021	45026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464964
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1111	NC_009033	CTC	2	6	45117	45122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464964
1112	NC_009033	AAC	2	6	45124	45129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464964
1113	NC_009033	TCT	2	6	45134	45139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126464964
1114	NC_009033	ACA	2	6	45170	45175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464964
1115	NC_009033	ATT	2	6	45185	45190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464964
1116	NC_009033	ACTC	2	8	45231	45238	25 %	25 %	0 %	50 %	126464964
1117	NC_009033	TTA	2	6	45269	45274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126464964
1118	NC_009033	CT	3	6	45289	45294	0 %	50 %	0 %	50 %	126464964
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1121	NC_009033	CTC	2	6	45363	45368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126464964
1122	NC_009033	TC	3	6	45382	45387	0 %	50 %	0 %	50 %	126464964
1123	NC_009033	AAC	2	6	45391	45396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126464964
1124	NC_009033	AGC	2	6	45427	45432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126464964
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1126	NC_009033	TAC	2	6	45463	45468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126464964
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