MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylothermus marinus F1 chromosome

Total Repeats: 39160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009033	CCAT	2	8	201693	201700	25 %	25 %	0 %	50 %	126465102
5002	NC_009033	GA	3	6	201716	201721	50 %	0 %	50 %	0 %	126465102
5003	NC_009033	ATC	2	6	201758	201763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009033	TTC	2	6	201790	201795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_009033	AATT	2	8	201829	201836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009033	ATT	2	6	201845	201850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_009033	ATA	2	6	201859	201864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_009033	ATTA	2	8	201902	201909	50 %	50 %	0 %	0 %	126465103
5009	NC_009033	ACT	2	6	201953	201958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465103
5010	NC_009033	GA	3	6	201965	201970	50 %	0 %	50 %	0 %	126465103
5011	NC_009033	TA	3	6	202002	202007	50 %	50 %	0 %	0 %	126465103
5012	NC_009033	ACT	2	6	202069	202074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465103
5013	NC_009033	TGG	3	9	202112	202120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126465103
5014	NC_009033	AAC	2	6	202163	202168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126465103
5015	NC_009033	ATAG	2	8	202173	202180	50 %	25 %	25 %	0 %	126465103
5016	NC_009033	TAG	2	6	202285	202290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465103
5017	NC_009033	TCG	2	6	202325	202330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126465103
5018	NC_009033	GCA	2	6	202346	202351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126465103
5019	NC_009033	TATG	2	8	202361	202368	25 %	50 %	25 %	0 %	126465103
5020	NC_009033	ACT	2	6	202458	202463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465103
5021	NC_009033	AGA	2	6	202496	202501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126465103
5022	NC_009033	ATT	2	6	202564	202569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465103
5023	NC_009033	AGG	2	6	202573	202578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126465103
5024	NC_009033	AGCTAG	2	12	202579	202590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126465103
5025	NC_009033	A	7	7	202662	202668	100 %	0 %	0 %	0 %	126465104
5026	NC_009033	GGA	2	6	202690	202695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126465104
5027	NC_009033	GAC	2	6	202726	202731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126465104
5028	NC_009033	GAA	2	6	202777	202782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126465104
5029	NC_009033	ATA	2	6	202889	202894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465104
5030	NC_009033	TTA	2	6	202903	202908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465104
5031	NC_009033	GTG	2	6	202922	202927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126465104
5032	NC_009033	ATCG	2	8	202983	202990	25 %	25 %	25 %	25 %	126465105
5033	NC_009033	AGG	2	6	203001	203006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126465105
5034	NC_009033	GAAA	2	8	203055	203062	75 %	0 %	25 %	0 %	126465105
5035	NC_009033	TAT	2	6	203096	203101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465105
5036	NC_009033	TA	3	6	203106	203111	50 %	50 %	0 %	0 %	126465105
5037	NC_009033	AAT	2	6	203136	203141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465105
5038	NC_009033	CA	3	6	203173	203178	50 %	0 %	0 %	50 %	126465105
5039	NC_009033	AT	3	6	203346	203351	50 %	50 %	0 %	0 %	126465105
5040	NC_009033	TAT	2	6	203358	203363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465105
5041	NC_009033	ATA	2	6	203440	203445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465105
5042	NC_009033	TA	3	6	203444	203449	50 %	50 %	0 %	0 %	126465105
5043	NC_009033	ATTA	2	8	203454	203461	50 %	50 %	0 %	0 %	126465105
5044	NC_009033	GGA	2	6	203464	203469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126465105
5045	NC_009033	GTAT	2	8	203490	203497	25 %	50 %	25 %	0 %	126465105
5046	NC_009033	AAT	2	6	203502	203507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465105
5047	NC_009033	TTA	2	6	203525	203530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465105
5048	NC_009033	CCAAC	2	10	203583	203592	40 %	0 %	0 %	60 %	126465105
5049	NC_009033	AAT	2	6	203622	203627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465105
5050	NC_009033	AT	3	6	203670	203675	50 %	50 %	0 %	0 %	126465105
5051	NC_009033	ATTGT	2	10	203681	203690	20 %	60 %	20 %	0 %	126465105
5052	NC_009033	GAT	2	6	203695	203700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126465105
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5054	NC_009033	GCAT	2	8	203830	203837	25 %	25 %	25 %	25 %	126465106
5055	NC_009033	CTA	2	6	203871	203876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465106
5056	NC_009033	AT	3	6	203892	203897	50 %	50 %	0 %	0 %	126465106
5057	NC_009033	TCT	2	6	203899	203904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126465106
5058	NC_009033	TTAAT	2	10	203940	203949	40 %	60 %	0 %	0 %	126465106
5059	NC_009033	TCC	2	6	203953	203958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126465106
5060	NC_009033	TA	3	6	203971	203976	50 %	50 %	0 %	0 %	126465106
5061	NC_009033	ACA	2	6	204008	204013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126465106
5062	NC_009033	TCT	2	6	204034	204039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126465106
5063	NC_009033	TTG	2	6	204070	204075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126465106
5064	NC_009033	AT	3	6	204085	204090	50 %	50 %	0 %	0 %	126465106
5065	NC_009033	GTTTT	2	10	204120	204129	0 %	80 %	20 %	0 %	126465106
5066	NC_009033	GAG	2	6	204146	204151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_009033	CCT	2	6	204155	204160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126465107
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5069	NC_009033	CTT	2	6	204218	204223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126465107
5070	NC_009033	TTA	3	9	204293	204301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465107
5071	NC_009033	ATTG	2	8	204398	204405	25 %	50 %	25 %	0 %	126465107
5072	NC_009033	ATT	2	6	204522	204527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465107
5073	NC_009033	AT	3	6	204546	204551	50 %	50 %	0 %	0 %	126465107
5074	NC_009033	ATA	2	6	204585	204590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465107
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5081	NC_009033	CAA	2	6	204875	204880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126465107
5082	NC_009033	TCA	2	6	204931	204936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126465107
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5088	NC_009033	T	6	6	205058	205063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_009033	CT	3	6	205067	205072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_009033	ATTT	2	8	205076	205083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_009033	T	6	6	205091	205096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_009033	AT	4	8	205129	205136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_009033	GAA	2	6	205144	205149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5100	NC_009033	AATAA	2	10	205532	205541	80 %	20 %	0 %	0 %	126465108
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5123	NC_009033	TAT	2	6	206316	206321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126465109
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5125	NC_009033	AAT	2	6	206377	206382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126465109
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