MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 56450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008750	TGA	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008750	CAA	2	6	168	173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596834
3	NC_008750	GAC	2	6	181	186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596834
4	NC_008750	CAG	2	6	207	212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596834
5	NC_008750	GTC	2	6	388	393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596834
6	NC_008750	TCG	2	6	553	558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596834
7	NC_008750	TGG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
8	NC_008750	ATT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596834
9	NC_008750	TGG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
10	NC_008750	TTG	2	6	672	677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596834
11	NC_008750	ATC	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
12	NC_008750	AAT	2	6	705	710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596834
13	NC_008750	AAT	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596834
14	NC_008750	GAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
15	NC_008750	TAC	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
16	NC_008750	AAG	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
17	NC_008750	TTC	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
18	NC_008750	ACC	2	6	913	918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596834
19	NC_008750	ATT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596834
20	NC_008750	CTT	2	6	1097	1102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
21	NC_008750	TAC	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596834
22	NC_008750	TGT	2	6	1312	1317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596834
23	NC_008750	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596834
24	NC_008750	CAC	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596834
25	NC_008750	AGA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596834
26	NC_008750	TCT	2	6	1527	1532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596834
27	NC_008750	TTG	2	6	1713	1718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596835
28	NC_008750	GAA	2	6	1745	1750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
29	NC_008750	ACA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596835
30	NC_008750	AAG	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
31	NC_008750	ATA	2	6	1836	1841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596835
32	NC_008750	TGC	2	6	1848	1853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596835
33	NC_008750	AGA	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
34	NC_008750	TTA	2	6	2011	2016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596835
35	NC_008750	GTG	2	6	2391	2396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596835
36	NC_008750	GAA	2	6	2453	2458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
37	NC_008750	ATC	2	6	2468	2473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596835
38	NC_008750	GAT	2	6	2555	2560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596835
39	NC_008750	GAA	2	6	2615	2620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596835
40	NC_008750	CGC	2	6	2705	2710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008750	TAT	2	6	2804	2809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008750	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596836
43	NC_008750	TCG	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596836
44	NC_008750	ACT	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596836
45	NC_008750	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596836
46	NC_008750	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596836
47	NC_008750	GAT	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596836
48	NC_008750	CTG	2	6	3853	3858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596836
49	NC_008750	ATA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596837
50	NC_008750	TTC	2	6	3972	3977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
51	NC_008750	CGA	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
52	NC_008750	CAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596837
53	NC_008750	AGT	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
54	NC_008750	GAT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
55	NC_008750	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
56	NC_008750	GCA	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
57	NC_008750	TTA	2	6	4232	4237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596837
58	NC_008750	CGG	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
59	NC_008750	GAT	2	6	4267	4272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
60	NC_008750	TGG	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
61	NC_008750	TCG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
62	NC_008750	TCG	2	6	4625	4630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
63	NC_008750	ATT	2	6	4631	4636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596837
64	NC_008750	TAA	2	6	4644	4649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596837
65	NC_008750	GAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
66	NC_008750	CAA	2	6	4764	4769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596837
67	NC_008750	TGG	2	6	4785	4790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
68	NC_008750	CAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596837
69	NC_008750	GAT	2	6	4891	4896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
70	NC_008750	CCG	2	6	5048	5053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596837
71	NC_008750	GCG	2	6	5104	5109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
72	NC_008750	CGT	2	6	5131	5136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
73	NC_008750	GGT	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
74	NC_008750	CTG	2	6	5234	5239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596837
75	NC_008750	TGT	2	6	5336	5341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
76	NC_008750	AAG	2	6	5348	5353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
77	NC_008750	CGA	2	6	5394	5399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
78	NC_008750	CAT	4	12	5430	5441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596837
79	NC_008750	CTT	3	9	5490	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
80	NC_008750	GCC	2	6	5547	5552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596837
81	NC_008750	TTG	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
82	NC_008750	AGC	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596837
83	NC_008750	TGA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
84	NC_008750	TGG	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
85	NC_008750	TTC	2	6	5995	6000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596837
86	NC_008750	GCG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
87	NC_008750	GAA	2	6	6058	6063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
88	NC_008750	GGC	2	6	6064	6069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596837
89	NC_008750	GTG	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596837
90	NC_008750	AAG	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596837
91	NC_008750	TGA	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596837
92	NC_008750	GTT	2	6	6279	6284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596837
93	NC_008750	TGT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008750	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008750	AGC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008750	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008750	GTT	2	6	6462	6467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008750	TAA	2	6	6588	6593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596838
99	NC_008750	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596838
100	NC_008750	CAG	2	6	6694	6699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596838
101	NC_008750	GTT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596838
102	NC_008750	ATG	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596838
103	NC_008750	CAA	2	6	6795	6800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596838
104	NC_008750	TGA	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596838
105	NC_008750	ACA	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596838
106	NC_008750	CAC	2	6	7089	7094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596838
107	NC_008750	CGT	2	6	7138	7143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
108	NC_008750	CTC	2	6	7276	7281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596838
109	NC_008750	GAC	2	6	7344	7349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596838
110	NC_008750	TGC	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
111	NC_008750	TGC	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
112	NC_008750	GCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596838
113	NC_008750	GCT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596838
114	NC_008750	ATT	2	6	7704	7709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596839
115	NC_008750	ATT	2	6	7753	7758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596839
116	NC_008750	CAA	2	6	7759	7764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596839
117	NC_008750	TCA	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596839
118	NC_008750	GAA	2	6	7819	7824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596839
119	NC_008750	TTG	2	6	7867	7872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596839
120	NC_008750	TAG	2	6	7974	7979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596839
121	NC_008750	GCT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596839
122	NC_008750	CAG	2	6	8100	8105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596839
123	NC_008750	TCG	2	6	8207	8212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596839
124	NC_008750	ATA	2	6	8303	8308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596839
125	NC_008750	GCA	2	6	8310	8315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596839
126	NC_008750	GGC	2	6	8323	8328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596839
127	NC_008750	TCA	2	6	8580	8585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596839
128	NC_008750	GGC	2	6	8656	8661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596839
129	NC_008750	GCT	2	6	8703	8708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596839
130	NC_008750	TCA	2	6	8897	8902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596839
131	NC_008750	TTC	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596839
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154	NC_008750	TGA	2	6	10837	10842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596841
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255	NC_008750	CAG	2	6	19319	19324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_008750	CAT	2	6	19332	19337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_008750	ACA	2	6	19380	19385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008750	ATT	2	6	19562	19567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_008750	ATG	2	6	19578	19583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_008750	AGC	2	6	19608	19613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_008750	TGT	2	6	19658	19663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008750	ATA	2	6	19702	19707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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