MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008750	GC	3	6	195386	195391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_008750	GTA	2	6	195450	195455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_008750	GCG	2	6	195516	195521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596999
3504	NC_008750	TCG	2	6	195562	195567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596999
3505	NC_008750	AAG	2	6	195606	195611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596999
3506	NC_008750	GAA	2	6	195631	195636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596999
3507	NC_008750	GGT	2	6	195655	195660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596999
3508	NC_008750	CGT	2	6	195683	195688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596999
3509	NC_008750	AAC	3	9	195737	195745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596999
3510	NC_008750	CGT	2	6	195871	195876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597000
3511	NC_008750	TCCT	2	8	195938	195945	0 %	50 %	0 %	50 %	120597000
3512	NC_008750	A	6	6	195982	195987	100 %	0 %	0 %	0 %	120597000
3513	NC_008750	TTG	2	6	196028	196033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597000
3514	NC_008750	AGAA	2	8	196034	196041	75 %	0 %	25 %	0 %	120597000
3515	NC_008750	A	6	6	196126	196131	100 %	0 %	0 %	0 %	120597000
3516	NC_008750	TTC	2	6	196138	196143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597000
3517	NC_008750	TGT	2	6	196215	196220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597001
3518	NC_008750	A	6	6	196321	196326	100 %	0 %	0 %	0 %	120597001
3519	NC_008750	GCGT	2	8	196574	196581	0 %	25 %	50 %	25 %	120597001
3520	NC_008750	TGA	2	6	196668	196673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597001
3521	NC_008750	TAT	2	6	196819	196824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597002
3522	NC_008750	CTT	2	6	196836	196841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597002
3523	NC_008750	TGA	2	6	196843	196848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597002
3524	NC_008750	GTG	2	6	197001	197006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597002
3525	NC_008750	GCT	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597003
3526	NC_008750	AGA	2	6	197185	197190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597003
3527	NC_008750	AAGCC	2	10	197223	197232	40 %	0 %	20 %	40 %	120597003
3528	NC_008750	GTC	2	6	197298	197303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597003
3529	NC_008750	TGA	2	6	197391	197396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597003
3530	NC_008750	GCC	2	6	197405	197410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120597003
3531	NC_008750	CAA	2	6	197576	197581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597004
3532	NC_008750	TGT	2	6	197591	197596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3533	NC_008750	TTC	2	6	197620	197625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597004
3534	NC_008750	GTT	2	6	197637	197642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3535	NC_008750	TAC	2	6	197663	197668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597004
3536	NC_008750	ACA	2	6	197683	197688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597004
3537	NC_008750	GTT	2	6	197691	197696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597004
3538	NC_008750	AGTT	2	8	197728	197735	25 %	50 %	25 %	0 %	120597004
3539	NC_008750	TCG	2	6	197758	197763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3540	NC_008750	TC	3	6	197791	197796	0 %	50 %	0 %	50 %	120597004
3541	NC_008750	GCT	2	6	197898	197903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3542	NC_008750	CCA	2	6	197922	197927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120597004
3543	NC_008750	GAC	2	6	197958	197963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597004
3544	NC_008750	GAA	2	6	197964	197969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597004
3545	NC_008750	AAG	3	9	197988	197996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597004
3546	NC_008750	AAG	2	6	198055	198060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597005
3547	NC_008750	GGT	2	6	198144	198149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597005
3548	NC_008750	GCT	2	6	198154	198159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3549	NC_008750	TTG	2	6	198236	198241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597005
3550	NC_008750	GC	3	6	198246	198251	0 %	0 %	50 %	50 %	120597005
3551	NC_008750	GCT	2	6	198316	198321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3552	NC_008750	TGC	2	6	198330	198335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597005
3553	NC_008750	ATTG	2	8	198417	198424	25 %	50 %	25 %	0 %	120597006
3554	NC_008750	AGT	2	6	198444	198449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597006
3555	NC_008750	AGT	2	6	198486	198491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597006
3556	NC_008750	GGCTAT	2	12	198514	198525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120597006
3557	NC_008750	GC	3	6	198532	198537	0 %	0 %	50 %	50 %	120597006
3558	NC_008750	CAG	2	6	198545	198550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3559	NC_008750	CGT	2	6	198577	198582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3560	NC_008750	GTC	2	6	198635	198640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597006
3561	NC_008750	TAT	2	6	198687	198692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597006
3562	NC_008750	CTA	2	6	198764	198769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597006
3563	NC_008750	CG	3	6	198787	198792	0 %	0 %	50 %	50 %	120597006
3564	NC_008750	AGA	2	6	198999	199004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597007
3565	NC_008750	CAA	2	6	199029	199034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597007
3566	NC_008750	CTA	2	6	199038	199043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597007
3567	NC_008750	GGA	2	6	199056	199061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120597007
3568	NC_008750	TGG	2	6	199194	199199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597008
3569	NC_008750	GGT	2	6	199222	199227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597008
3570	NC_008750	TCGCG	2	10	199270	199279	0 %	20 %	40 %	40 %	120597008
3571	NC_008750	TTA	2	6	199367	199372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597008
3572	NC_008750	GCA	2	6	199465	199470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597008
3573	NC_008750	GCT	2	6	199477	199482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597008
3574	NC_008750	AAT	2	6	199499	199504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597008
3575	NC_008750	CCT	2	6	199573	199578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120597009
3576	NC_008750	GTG	2	6	199713	199718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597009
3577	NC_008750	TAT	2	6	199750	199755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3578	NC_008750	A	6	6	199823	199828	100 %	0 %	0 %	0 %	120597009
3579	NC_008750	GTCG	2	8	199900	199907	0 %	25 %	50 %	25 %	120597009
3580	NC_008750	TTG	2	6	199974	199979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3581	NC_008750	TTG	2	6	200085	200090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3582	NC_008750	TTG	3	9	200159	200167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
3583	NC_008750	CGT	2	6	200225	200230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597009
3584	NC_008750	GTT	2	6	200234	200239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597009
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3586	NC_008750	C	6	6	200326	200331	0 %	0 %	0 %	100 %	120597009
3587	NC_008750	CAT	2	6	200347	200352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
3588	NC_008750	ATT	2	6	200455	200460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3589	NC_008750	GCA	3	9	200465	200473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120597009
3590	NC_008750	ATT	2	6	200474	200479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120597009
3591	NC_008750	TTC	2	6	200480	200485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597009
3592	NC_008750	TCT	2	6	200490	200495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597009
3593	NC_008750	GAA	2	6	200539	200544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597009
3594	NC_008750	GTG	2	6	200547	200552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597009
3595	NC_008750	ACT	2	6	200716	200721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
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3597	NC_008750	TCA	2	6	200779	200784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120597009
3598	NC_008750	TGA	2	6	200796	200801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597009
3599	NC_008750	TGA	2	6	200866	200871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_008750	GAA	2	6	200893	200898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597010
3601	NC_008750	TAA	2	6	200984	200989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120597010
3602	NC_008750	CATTG	2	10	201150	201159	20 %	40 %	20 %	20 %	120597011
3603	NC_008750	GAA	2	6	201274	201279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120597011
3604	NC_008750	TAG	2	6	201293	201298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120597011
3605	NC_008750	CGT	2	6	201310	201315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597011
3606	NC_008750	GTT	2	6	201353	201358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120597011
3607	NC_008750	TCG	2	6	201375	201380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597011
3608	NC_008750	GCCT	2	8	201383	201390	0 %	25 %	25 %	50 %	120597011
3609	NC_008750	CGTA	2	8	201510	201517	25 %	25 %	25 %	25 %	120597012
3610	NC_008750	ATGGC	2	10	201530	201539	20 %	20 %	40 %	20 %	120597012
3611	NC_008750	CTT	2	6	201551	201556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120597012
3612	NC_008750	CAA	2	6	201558	201563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120597012
3613	NC_008750	GGT	2	6	201619	201624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120597012
3614	NC_008750	TGC	2	6	201660	201665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3615	NC_008750	GCT	2	6	201673	201678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3616	NC_008750	TGC	3	9	201690	201698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3617	NC_008750	A	6	6	201714	201719	100 %	0 %	0 %	0 %	120597012
3618	NC_008750	GTCCAG	2	12	201740	201751	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3619	NC_008750	GTC	2	6	201839	201844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3620	NC_008750	CGT	2	6	201856	201861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120597012
3621	NC_008750	TTG	2	6	201884	201889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_008750	CAAGCT	2	12	201920	201931	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	120597013
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