MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008750	TTG	2	6	168474	168479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596972
3002	NC_008750	AGA	2	6	168493	168498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596972
3003	NC_008750	TTGC	2	8	168511	168518	0 %	50 %	25 %	25 %	120596972
3004	NC_008750	GGC	2	6	168557	168562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596972
3005	NC_008750	GAT	2	6	168581	168586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596972
3006	NC_008750	TTGAGG	2	12	168657	168668	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	120596972
3007	NC_008750	GCA	2	6	168761	168766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596972
3008	NC_008750	ATCTTG	2	12	168828	168839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	120596972
3009	NC_008750	T	6	6	168850	168855	0 %	100 %	0 %	0 %	120596972
3010	NC_008750	TAA	2	6	169036	169041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596972
3011	NC_008750	T	7	7	169102	169108	0 %	100 %	0 %	0 %	120596972
3012	NC_008750	AGTG	2	8	169120	169127	25 %	25 %	50 %	0 %	120596972
3013	NC_008750	TGCT	2	8	169129	169136	0 %	50 %	25 %	25 %	120596972
3014	NC_008750	CGA	2	6	169161	169166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596972
3015	NC_008750	TTG	2	6	169167	169172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596972
3016	NC_008750	TGGT	2	8	169210	169217	0 %	50 %	50 %	0 %	120596972
3017	NC_008750	GCAG	2	8	169225	169232	25 %	0 %	50 %	25 %	120596972
3018	NC_008750	TTAGTT	2	12	169283	169294	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	120596972
3019	NC_008750	GTG	3	9	169299	169307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596972
3020	NC_008750	TAT	2	6	169468	169473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596973
3021	NC_008750	GCGA	2	8	169506	169513	25 %	0 %	50 %	25 %	120596973
3022	NC_008750	TGC	2	6	169529	169534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596973
3023	NC_008750	ATTG	2	8	169625	169632	25 %	50 %	25 %	0 %	120596973
3024	NC_008750	ATC	2	6	169660	169665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596973
3025	NC_008750	TGA	2	6	169679	169684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596973
3026	NC_008750	CAT	2	6	169812	169817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596973
3027	NC_008750	GTTG	2	8	169895	169902	0 %	50 %	50 %	0 %	120596973
3028	NC_008750	A	6	6	169971	169976	100 %	0 %	0 %	0 %	120596973
3029	NC_008750	CTGG	2	8	169977	169984	0 %	25 %	50 %	25 %	120596973
3030	NC_008750	TTA	2	6	170029	170034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596973
3031	NC_008750	AGAC	2	8	170131	170138	50 %	0 %	25 %	25 %	120596973
3032	NC_008750	AAC	2	6	170158	170163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596973
3033	NC_008750	ATTT	2	8	170233	170240	25 %	75 %	0 %	0 %	120596973
3034	NC_008750	CCG	2	6	170332	170337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596973
3035	NC_008750	CGG	2	6	170357	170362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596973
3036	NC_008750	TAC	2	6	170396	170401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596974
3037	NC_008750	AGC	2	6	170524	170529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596974
3038	NC_008750	TCA	3	9	170543	170551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596974
3039	NC_008750	ATG	2	6	170566	170571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596974
3040	NC_008750	TTC	2	6	170650	170655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596974
3041	NC_008750	ATAG	2	8	170665	170672	50 %	25 %	25 %	0 %	120596974
3042	NC_008750	CAA	2	6	170679	170684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596974
3043	NC_008750	AAAT	2	8	170868	170875	75 %	25 %	0 %	0 %	120596974
3044	NC_008750	CCA	2	6	170877	170882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596974
3045	NC_008750	CAA	2	6	170923	170928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596974
3046	NC_008750	AAAG	2	8	170958	170965	75 %	0 %	25 %	0 %	120596974
3047	NC_008750	TGT	2	6	171008	171013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596974
3048	NC_008750	TAA	2	6	171075	171080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596974
3049	NC_008750	TCA	2	6	171116	171121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596974
3050	NC_008750	TGC	2	6	171137	171142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596974
3051	NC_008750	TAAA	2	8	171181	171188	75 %	25 %	0 %	0 %	120596974
3052	NC_008750	ATC	2	6	171391	171396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_008750	A	6	6	171403	171408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_008750	TGGC	2	8	171474	171481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_008750	A	7	7	171486	171492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_008750	T	7	7	171507	171513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_008750	T	6	6	171527	171532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_008750	CCA	2	6	171744	171749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_008750	T	6	6	171750	171755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_008750	T	6	6	172008	172013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_008750	TCA	2	6	172028	172033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_008750	GCTAAA	2	12	172064	172075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	120596975
3063	NC_008750	TC	3	6	172155	172160	0 %	50 %	0 %	50 %	120596975
3064	NC_008750	TC	3	6	172200	172205	0 %	50 %	0 %	50 %	120596975
3065	NC_008750	AGA	2	6	172222	172227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596975
3066	NC_008750	TGC	2	6	172345	172350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596975
3067	NC_008750	TCA	2	6	172449	172454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596975
3068	NC_008750	TGA	2	6	172555	172560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596975
3069	NC_008750	AGC	2	6	172636	172641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596975
3070	NC_008750	AGT	2	6	172738	172743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596975
3071	NC_008750	CGA	2	6	172780	172785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596975
3072	NC_008750	TGA	2	6	172912	172917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596975
3073	NC_008750	TCAA	2	8	172952	172959	50 %	25 %	0 %	25 %	120596975
3074	NC_008750	CA	3	6	172962	172967	50 %	0 %	0 %	50 %	120596975
3075	NC_008750	AGA	2	6	173002	173007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596975
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3078	NC_008750	GTA	2	6	173222	173227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596975
3079	NC_008750	T	6	6	173286	173291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_008750	ATT	2	6	173302	173307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_008750	GTTTGC	2	12	173322	173333	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3082	NC_008750	A	6	6	173441	173446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008750	ATT	2	6	173476	173481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_008750	ACA	2	6	173524	173529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596976
3085	NC_008750	GCT	2	6	173596	173601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596976
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3087	NC_008750	ACAG	2	8	173694	173701	50 %	0 %	25 %	25 %	120596976
3088	NC_008750	A	6	6	173710	173715	100 %	0 %	0 %	0 %	120596976
3089	NC_008750	GCTTTT	2	12	173716	173727	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	120596976
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3091	NC_008750	TGC	2	6	173808	173813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596976
3092	NC_008750	GATG	2	8	173844	173851	25 %	25 %	50 %	0 %	120596976
3093	NC_008750	A	7	7	173923	173929	100 %	0 %	0 %	0 %	120596977
3094	NC_008750	GAA	2	6	174046	174051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596977
3095	NC_008750	CGT	2	6	174076	174081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596977
3096	NC_008750	AAG	2	6	174224	174229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596977
3097	NC_008750	GTG	2	6	174304	174309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596977
3098	NC_008750	GAA	2	6	174352	174357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596977
3099	NC_008750	TAAA	2	8	174455	174462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_008750	TA	3	6	174497	174502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_008750	GTT	2	6	174513	174518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_008750	AGA	2	6	174588	174593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596978
3103	NC_008750	CAC	2	6	174642	174647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596978
3104	NC_008750	CAT	2	6	174682	174687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596978
3105	NC_008750	A	6	6	174720	174725	100 %	0 %	0 %	0 %	120596978
3106	NC_008750	TTCA	2	8	174775	174782	25 %	50 %	0 %	25 %	120596978
3107	NC_008750	TCTT	2	8	174809	174816	0 %	75 %	0 %	25 %	120596978
3108	NC_008750	CTG	2	6	174825	174830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596978
3109	NC_008750	TCGC	2	8	174882	174889	0 %	25 %	25 %	50 %	120596978
3110	NC_008750	ACTA	2	8	175022	175029	50 %	25 %	0 %	25 %	120596979
3111	NC_008750	TTG	2	6	175126	175131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596979
3112	NC_008750	GTG	2	6	175192	175197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596979
3113	NC_008750	GCT	2	6	175278	175283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596979
3114	NC_008750	TTG	2	6	175294	175299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596979
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3116	NC_008750	GTT	2	6	175350	175355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596979
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3118	NC_008750	TAT	2	6	175520	175525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596979
3119	NC_008750	ACT	2	6	175530	175535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596979
3120	NC_008750	CAGTT	2	10	175558	175567	20 %	40 %	20 %	20 %	120596979
3121	NC_008750	GAAA	2	8	175568	175575	75 %	0 %	25 %	0 %	120596979
3122	NC_008750	GAA	2	6	175640	175645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596979
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3124	NC_008750	CTAA	2	8	175708	175715	50 %	25 %	0 %	25 %	120596979
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3242	NC_008750	CTGAT	2	10	181340	181349	20 %	40 %	20 %	20 %	120596983
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3244	NC_008750	TCTGT	2	10	181425	181434	0 %	60 %	20 %	20 %	120596983
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3246	NC_008750	CGT	2	6	181552	181557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
3247	NC_008750	TCG	2	6	181691	181696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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3250	NC_008750	TGA	2	6	181779	181784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596983
3251	NC_008750	CTG	2	6	181822	181827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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3253	NC_008750	GAA	2	6	181867	181872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596983
3254	NC_008750	TCAA	2	8	181879	181886	50 %	25 %	0 %	25 %	120596983
3255	NC_008750	TCG	2	6	181896	181901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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3270	NC_008750	GCT	2	6	182881	182886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596983
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3359	NC_008750	TGA	2	6	187555	187560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596986
3360	NC_008750	AAG	2	6	187569	187574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596986
3361	NC_008750	TGC	2	6	187606	187611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596986
3362	NC_008750	GT	3	6	187665	187670	0 %	50 %	50 %	0 %	120596986
3363	NC_008750	TCAGGC	2	12	187688	187699	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120596986
3364	NC_008750	ATGC	2	8	187751	187758	25 %	25 %	25 %	25 %	120596986
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3366	NC_008750	CAT	2	6	187983	187988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596986
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