MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_008750	TAA	2	6	53867	53872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596875
1003	NC_008750	TTG	2	6	53882	53887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596875
1004	NC_008750	AAAT	2	8	53914	53921	75 %	25 %	0 %	0 %	120596875
1005	NC_008750	G	6	6	53984	53989	0 %	0 %	100 %	0 %	120596875
1006	NC_008750	TGA	2	6	54060	54065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596875
1007	NC_008750	CTG	2	6	54115	54120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008750	TTA	2	6	54127	54132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008750	GT	3	6	54186	54191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008750	A	6	6	54200	54205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008750	GGC	2	6	54206	54211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008750	GCC	2	6	54221	54226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_008750	CGGT	2	8	54292	54299	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_008750	CTT	2	6	54303	54308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008750	T	8	8	54307	54314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008750	AGC	2	6	54424	54429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_008750	TCA	2	6	54431	54436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008750	CCAT	2	8	54452	54459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_008750	CCAG	2	8	54494	54501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_008750	TTA	3	9	54674	54682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008750	AGT	2	6	54686	54691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008750	ATTAT	2	10	54696	54705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008750	ATTT	2	8	54773	54780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008750	A	7	7	54888	54894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008750	GATA	2	8	54941	54948	50 %	25 %	25 %	0 %	120596876
1026	NC_008750	CAT	2	6	55000	55005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596876
1027	NC_008750	ATT	2	6	55018	55023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596876
1028	NC_008750	CATGC	2	10	55133	55142	20 %	20 %	20 %	40 %	120596876
1029	NC_008750	ACC	2	6	55291	55296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596876
1030	NC_008750	ACC	2	6	55324	55329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596876
1031	NC_008750	TGCGC	2	10	55334	55343	0 %	20 %	40 %	40 %	120596876
1032	NC_008750	CCATG	2	10	55428	55437	20 %	20 %	20 %	40 %	120596876
1033	NC_008750	GGC	2	6	55510	55515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596876
1034	NC_008750	ACA	2	6	55520	55525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596876
1035	NC_008750	ATT	2	6	55574	55579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008750	TTC	2	6	55674	55679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008750	ATTA	2	8	55680	55687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_008750	GCA	2	6	55697	55702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008750	GGAC	2	8	55916	55923	25 %	0 %	50 %	25 %	120596877
1040	NC_008750	TGG	2	6	55965	55970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596877
1041	NC_008750	GCA	2	6	56023	56028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596877
1042	NC_008750	GTG	2	6	56075	56080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596877
1043	NC_008750	GAT	2	6	56122	56127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596877
1044	NC_008750	TGAA	2	8	56214	56221	50 %	25 %	25 %	0 %	120596877
1045	NC_008750	AATG	2	8	56318	56325	50 %	25 %	25 %	0 %	120596877
1046	NC_008750	CTAA	2	8	56373	56380	50 %	25 %	0 %	25 %	120596877
1047	NC_008750	TTA	2	6	56386	56391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008750	CTT	2	6	56438	56443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008750	TCT	2	6	56448	56453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_008750	A	7	7	56488	56494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008750	ATA	2	6	56522	56527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008750	CAA	2	6	56555	56560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008750	TTA	2	6	56629	56634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008750	TGA	2	6	56656	56661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008750	T	6	6	56663	56668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_008750	A	6	6	56669	56674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_008750	A	8	8	56680	56687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_008750	TCA	2	6	56726	56731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008750	AAT	2	6	56792	56797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008750	T	6	6	56826	56831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_008750	A	6	6	56833	56838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_008750	TG	3	6	56870	56875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008750	A	6	6	56876	56881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_008750	AATG	2	8	56934	56941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_008750	CA	3	6	57038	57043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_008750	CTTA	2	8	57046	57053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_008750	TGA	2	6	57059	57064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008750	AAG	2	6	57089	57094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_008750	TGCTAT	2	12	57106	57117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_008750	T	6	6	57162	57167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008750	TTTG	2	8	57284	57291	0 %	75 %	25 %	0 %	120596878
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1077	NC_008750	GCATT	2	10	57479	57488	20 %	40 %	20 %	20 %	120596878
1078	NC_008750	CGA	2	6	57517	57522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596878
1079	NC_008750	CTG	2	6	57551	57556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596878
1080	NC_008750	GC	3	6	57562	57567	0 %	0 %	50 %	50 %	120596878
1081	NC_008750	TTC	2	6	57570	57575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596878
1082	NC_008750	AAGT	2	8	57607	57614	50 %	25 %	25 %	0 %	120596878
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1084	NC_008750	GCG	2	6	57714	57719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596878
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1088	NC_008750	CTT	2	6	57926	57931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596878
1089	NC_008750	TGG	2	6	58000	58005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596878
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1091	NC_008750	CTT	2	6	58145	58150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596878
1092	NC_008750	GC	3	6	58163	58168	0 %	0 %	50 %	50 %	120596878
1093	NC_008750	T	7	7	58178	58184	0 %	100 %	0 %	0 %	120596878
1094	NC_008750	A	6	6	58209	58214	100 %	0 %	0 %	0 %	120596878
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1098	NC_008750	TCC	2	6	58480	58485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596878
1099	NC_008750	GCA	2	6	58486	58491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596878
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1101	NC_008750	GTT	2	6	58532	58537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596878
1102	NC_008750	ATCC	2	8	58601	58608	25 %	25 %	0 %	50 %	120596878
1103	NC_008750	T	6	6	58734	58739	0 %	100 %	0 %	0 %	120596878
1104	NC_008750	GTC	2	6	58746	58751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596878
1105	NC_008750	GC	3	6	58805	58810	0 %	0 %	50 %	50 %	120596878
1106	NC_008750	ATG	2	6	58931	58936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596878
1107	NC_008750	TCA	2	6	58960	58965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596878
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1109	NC_008750	GCC	2	6	59260	59265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596878
1110	NC_008750	GCG	2	6	59311	59316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596878
1111	NC_008750	T	6	6	59363	59368	0 %	100 %	0 %	0 %	120596878
1112	NC_008750	AAT	2	6	59430	59435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596878
1113	NC_008750	TGC	2	6	59460	59465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596878
1114	NC_008750	ATG	2	6	59482	59487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596878
1115	NC_008750	TCA	2	6	59521	59526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596878
1116	NC_008750	GCTT	2	8	59583	59590	0 %	50 %	25 %	25 %	120596878
1117	NC_008750	CAT	2	6	59612	59617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596878
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1119	NC_008750	ATC	2	6	59700	59705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596878
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1121	NC_008750	TAC	2	6	59832	59837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596878
1122	NC_008750	GAG	2	6	59882	59887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120596878
1123	NC_008750	ATA	2	6	59892	59897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596878
1124	NC_008750	AAG	2	6	59912	59917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596878
1125	NC_008750	ATCC	2	8	59918	59925	25 %	25 %	0 %	50 %	120596878
1126	NC_008750	AAT	2	6	60082	60087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008750	GTT	3	9	60121	60129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008750	T	6	6	60128	60133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008750	T	6	6	60197	60202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008750	CGA	2	6	60258	60263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1132	NC_008750	A	7	7	60350	60356	100 %	0 %	0 %	0 %	120596879
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