MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella sp. W3-18-1 chromosome

Total Repeats: 83796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008750	AGT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596854
502	NC_008750	CAC	2	6	26913	26918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596854
503	NC_008750	GTT	2	6	26940	26945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596854
504	NC_008750	GCTC	2	8	26960	26967	0 %	25 %	25 %	50 %	120596854
505	NC_008750	CTAATC	2	12	27018	27029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596854
506	NC_008750	CCG	2	6	27038	27043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596854
507	NC_008750	ATA	2	6	27053	27058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596854
508	NC_008750	GGTA	2	8	27063	27070	25 %	25 %	50 %	0 %	120596854
509	NC_008750	CGA	2	6	27123	27128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596854
510	NC_008750	TCA	2	6	27137	27142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596854
511	NC_008750	AAT	2	6	27151	27156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596854
512	NC_008750	CG	3	6	27165	27170	0 %	0 %	50 %	50 %	120596854
513	NC_008750	TGC	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596854
514	NC_008750	ACC	2	6	27268	27273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596854
515	NC_008750	GC	3	6	27281	27286	0 %	0 %	50 %	50 %	120596854
516	NC_008750	CAA	2	6	27348	27353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596854
517	NC_008750	CCA	2	6	27413	27418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596854
518	NC_008750	TTG	2	6	27510	27515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596854
519	NC_008750	GGC	2	6	27547	27552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596854
520	NC_008750	CTT	2	6	27612	27617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596854
521	NC_008750	ATT	2	6	27721	27726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596854
522	NC_008750	CACC	2	8	27729	27736	25 %	0 %	0 %	75 %	120596854
523	NC_008750	TAA	2	6	27839	27844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596855
524	NC_008750	TTGTC	2	10	27857	27866	0 %	60 %	20 %	20 %	120596855
525	NC_008750	TCTA	2	8	27940	27947	25 %	50 %	0 %	25 %	120596855
526	NC_008750	AAG	2	6	28003	28008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596855
527	NC_008750	CCT	2	6	28013	28018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596855
528	NC_008750	TTC	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596855
529	NC_008750	T	6	6	28088	28093	0 %	100 %	0 %	0 %	120596855
530	NC_008750	CGG	2	6	28118	28123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596855
531	NC_008750	CCA	2	6	28183	28188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596855
532	NC_008750	ACC	2	6	28339	28344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596855
533	NC_008750	CGC	2	6	28399	28404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120596855
534	NC_008750	TGCGC	2	10	28409	28418	0 %	20 %	40 %	40 %	120596855
535	NC_008750	ACT	2	6	28501	28506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596855
536	NC_008750	TCGC	2	8	28511	28518	0 %	25 %	25 %	50 %	120596855
537	NC_008750	ATG	2	6	28619	28624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596855
538	NC_008750	CTT	2	6	28647	28652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596855
539	NC_008750	GT	3	6	28677	28682	0 %	50 %	50 %	0 %	120596855
540	NC_008750	CGG	2	6	28797	28802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596855
541	NC_008750	TGG	2	6	28871	28876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596855
542	NC_008750	TTTG	2	8	28884	28891	0 %	75 %	25 %	0 %	120596855
543	NC_008750	TTG	2	6	29011	29016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596855
544	NC_008750	GC	4	8	29082	29089	0 %	0 %	50 %	50 %	120596855
545	NC_008750	ATT	2	6	29099	29104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596856
546	NC_008750	CGG	2	6	29225	29230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596856
547	NC_008750	ATA	2	6	29263	29268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596856
548	NC_008750	CTT	2	6	29378	29383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596856
549	NC_008750	CTT	3	9	29423	29431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596856
550	NC_008750	AGC	2	6	29602	29607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596856
551	NC_008750	CGCC	2	8	29666	29673	0 %	0 %	25 %	75 %	120596856
552	NC_008750	GCG	2	6	29750	29755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596856
553	NC_008750	ACC	3	9	29794	29802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596856
554	NC_008750	ATA	2	6	29803	29808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596856
555	NC_008750	TTG	2	6	29832	29837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596856
556	NC_008750	TTG	2	6	29881	29886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596856
557	NC_008750	T	6	6	29922	29927	0 %	100 %	0 %	0 %	120596856
558	NC_008750	TTGTG	2	10	29974	29983	0 %	60 %	40 %	0 %	120596856
559	NC_008750	AGC	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596856
560	NC_008750	ATG	2	6	30037	30042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596856
561	NC_008750	CAAATC	2	12	30054	30065	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	120596856
562	NC_008750	CTT	2	6	30071	30076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120596857
563	NC_008750	TTTG	2	8	30107	30114	0 %	75 %	25 %	0 %	120596857
564	NC_008750	GCG	2	6	30131	30136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120596857
565	NC_008750	ACAA	2	8	30148	30155	75 %	0 %	0 %	25 %	120596857
566	NC_008750	GGT	2	6	30167	30172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596857
567	NC_008750	CAA	2	6	30215	30220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596857
568	NC_008750	ACT	2	6	30333	30338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596857
569	NC_008750	GTT	2	6	30407	30412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596857
570	NC_008750	GCA	2	6	30433	30438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596857
571	NC_008750	TCA	2	6	30544	30549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596857
572	NC_008750	AGTT	2	8	30614	30621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_008750	CTAATG	2	12	30629	30640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
574	NC_008750	AAT	2	6	30668	30673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008750	ACA	2	6	30699	30704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596858
576	NC_008750	GTTT	2	8	30760	30767	0 %	75 %	25 %	0 %	120596858
577	NC_008750	A	6	6	30818	30823	100 %	0 %	0 %	0 %	120596858
578	NC_008750	TTAT	2	8	30921	30928	25 %	75 %	0 %	0 %	120596858
579	NC_008750	A	6	6	31012	31017	100 %	0 %	0 %	0 %	120596858
580	NC_008750	AGC	2	6	31131	31136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596858
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582	NC_008750	T	6	6	31253	31258	0 %	100 %	0 %	0 %	120596858
583	NC_008750	AGT	2	6	31355	31360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596858
584	NC_008750	GA	3	6	31365	31370	50 %	0 %	50 %	0 %	120596858
585	NC_008750	GGA	2	6	31399	31404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120596858
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588	NC_008750	CAT	2	6	31648	31653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596858
589	NC_008750	TGA	2	6	31780	31785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596858
590	NC_008750	ATT	2	6	31803	31808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596858
591	NC_008750	CAA	2	6	31895	31900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_008750	TTA	2	6	31901	31906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_008750	GAC	2	6	31922	31927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
594	NC_008750	GA	3	6	31949	31954	50 %	0 %	50 %	0 %	120596859
595	NC_008750	ATC	2	6	31974	31979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596859
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597	NC_008750	GCA	2	6	32032	32037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
598	NC_008750	CTC	2	6	32041	32046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596859
599	NC_008750	GTT	2	6	32089	32094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596859
600	NC_008750	CCT	2	6	32156	32161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120596859
601	NC_008750	TGC	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120596859
602	NC_008750	ATA	2	6	32313	32318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120596859
603	NC_008750	CAG	2	6	32396	32401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120596859
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606	NC_008750	TTA	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120596859
607	NC_008750	GAA	2	6	32708	32713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596859
608	NC_008750	CCA	2	6	32725	32730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120596859
609	NC_008750	AGA	2	6	32736	32741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596859
610	NC_008750	ACA	2	6	32798	32803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120596859
611	NC_008750	GGT	2	6	32900	32905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120596859
612	NC_008750	ACT	2	6	32985	32990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596860
613	NC_008750	TGA	2	6	32994	32999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120596860
614	NC_008750	ACTC	2	8	33018	33025	25 %	25 %	0 %	50 %	120596860
615	NC_008750	TCA	2	6	33036	33041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120596860
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617	NC_008750	TTCGT	2	10	33132	33141	0 %	60 %	20 %	20 %	120596860
618	NC_008750	TTG	2	6	33193	33198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120596860
619	NC_008750	TGAT	2	8	33245	33252	25 %	50 %	25 %	0 %	120596860
620	NC_008750	AACC	2	8	33272	33279	50 %	0 %	0 %	50 %	120596860
621	NC_008750	AGA	2	6	33288	33293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120596860
622	NC_008750	TTG	2	6	33406	33411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_008750	GA	3	6	33427	33432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008750	AGG	2	6	33434	33439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_008750	CCT	2	6	33446	33451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_008750	T	6	6	33451	33456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_008750	GGT	2	6	33511	33516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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