MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 80963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008700	GCC	2	6	213441	213446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773327
4002	NC_008700	AAT	2	6	213465	213470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773327
4003	NC_008700	CTG	2	6	213633	213638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773327
4004	NC_008700	GGC	2	6	213719	213724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773327
4005	NC_008700	TGG	2	6	213736	213741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773327
4006	NC_008700	T	7	7	213763	213769	0 %	100 %	0 %	0 %	119773327
4007	NC_008700	CT	3	6	213779	213784	0 %	50 %	0 %	50 %	119773327
4008	NC_008700	GCACA	2	10	213843	213852	40 %	0 %	20 %	40 %	119773327
4009	NC_008700	CGC	2	6	213878	213883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773328
4010	NC_008700	T	6	6	213895	213900	0 %	100 %	0 %	0 %	119773328
4011	NC_008700	AT	3	6	213930	213935	50 %	50 %	0 %	0 %	119773328
4012	NC_008700	TGC	2	6	213951	213956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4013	NC_008700	TGG	2	6	213957	213962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4014	NC_008700	TTGT	2	8	214001	214008	0 %	75 %	25 %	0 %	119773328
4015	NC_008700	GCG	2	6	214016	214021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773328
4016	NC_008700	CGG	2	6	214063	214068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773328
4017	NC_008700	CTG	2	6	214115	214120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4018	NC_008700	CTG	3	9	214184	214192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4019	NC_008700	AGA	3	9	214261	214269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773328
4020	NC_008700	TGG	2	6	214320	214325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4021	NC_008700	CAG	2	6	214417	214422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4022	NC_008700	AAAGT	2	10	214463	214472	60 %	20 %	20 %	0 %	119773328
4023	NC_008700	ATGG	2	8	214531	214538	25 %	25 %	50 %	0 %	119773328
4024	NC_008700	TTGGTT	2	12	214555	214566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773328
4025	NC_008700	TGC	2	6	214644	214649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4026	NC_008700	TG	3	6	214689	214694	0 %	50 %	50 %	0 %	119773328
4027	NC_008700	TGC	2	6	214795	214800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4028	NC_008700	TGG	2	6	214875	214880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4029	NC_008700	GTG	2	6	214887	214892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4030	NC_008700	GCC	2	6	214934	214939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773328
4031	NC_008700	GTG	2	6	214941	214946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4032	NC_008700	ACA	2	6	214971	214976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773328
4033	NC_008700	CTT	2	6	214987	214992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773328
4034	NC_008700	TGG	2	6	214995	215000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4035	NC_008700	TGT	2	6	215010	215015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773328
4036	NC_008700	TGC	2	6	215022	215027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4037	NC_008700	CTG	2	6	215066	215071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4038	NC_008700	TGA	2	6	215076	215081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773328
4039	NC_008700	GTG	2	6	215087	215092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773328
4040	NC_008700	GGCA	2	8	215183	215190	25 %	0 %	50 %	25 %	119773328
4041	NC_008700	GGCGC	2	10	215207	215216	0 %	0 %	60 %	40 %	119773328
4042	NC_008700	TGC	2	6	215256	215261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4043	NC_008700	CCGG	2	8	215275	215282	0 %	0 %	50 %	50 %	119773328
4044	NC_008700	GCT	2	6	215320	215325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4045	NC_008700	CGA	2	6	215413	215418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4046	NC_008700	GATG	2	8	215425	215432	25 %	25 %	50 %	0 %	119773328
4047	NC_008700	GT	3	6	215441	215446	0 %	50 %	50 %	0 %	119773328
4048	NC_008700	AGA	2	6	215508	215513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773328
4049	NC_008700	TC	3	6	215515	215520	0 %	50 %	0 %	50 %	119773328
4050	NC_008700	CGG	2	6	215522	215527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773328
4051	NC_008700	TTC	2	6	215573	215578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773328
4052	NC_008700	GAC	2	6	215602	215607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773328
4053	NC_008700	GACA	2	8	215675	215682	50 %	0 %	25 %	25 %	119773328
4054	NC_008700	AATT	2	8	215706	215713	50 %	50 %	0 %	0 %	119773328
4055	NC_008700	CTG	2	6	215771	215776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_008700	GGC	2	6	215784	215789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_008700	TTG	2	6	215863	215868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773329
4058	NC_008700	GCG	2	6	215872	215877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773329
4059	NC_008700	AAT	2	6	215916	215921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773329
4060	NC_008700	TTGG	2	8	215928	215935	0 %	50 %	50 %	0 %	119773329
4061	NC_008700	TGC	2	6	215972	215977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4062	NC_008700	AC	3	6	216030	216035	50 %	0 %	0 %	50 %	119773329
4063	NC_008700	ATTG	2	8	216063	216070	25 %	50 %	25 %	0 %	119773329
4064	NC_008700	TGC	2	6	216080	216085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4065	NC_008700	CAC	2	6	216101	216106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773329
4066	NC_008700	GTA	2	6	216145	216150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773329
4067	NC_008700	ATG	2	6	216178	216183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773329
4068	NC_008700	CTG	2	6	216267	216272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4069	NC_008700	GC	3	6	216388	216393	0 %	0 %	50 %	50 %	119773329
4070	NC_008700	AAT	2	6	216411	216416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773329
4071	NC_008700	TGC	2	6	216452	216457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4072	NC_008700	ATG	2	6	216493	216498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773329
4073	NC_008700	CGT	2	6	216540	216545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4074	NC_008700	CAA	2	6	216596	216601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773329
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4076	NC_008700	CAG	2	6	216640	216645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773329
4077	NC_008700	GCTC	2	8	216649	216656	0 %	25 %	25 %	50 %	119773329
4078	NC_008700	TTA	2	6	216759	216764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773329
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4080	NC_008700	AAC	2	6	217012	217017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773329
4081	NC_008700	T	6	6	217059	217064	0 %	100 %	0 %	0 %	119773329
4082	NC_008700	CAT	2	6	217117	217122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008700	ACT	2	6	217167	217172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773330
4084	NC_008700	T	6	6	217224	217229	0 %	100 %	0 %	0 %	119773330
4085	NC_008700	TAA	2	6	217258	217263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773330
4086	NC_008700	CAG	3	9	217269	217277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773330
4087	NC_008700	TCCAG	2	10	217283	217292	20 %	20 %	20 %	40 %	119773330
4088	NC_008700	TCA	2	6	217340	217345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773330
4089	NC_008700	TTC	2	6	217512	217517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773330
4090	NC_008700	CTG	2	6	217548	217553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773330
4091	NC_008700	TGA	2	6	217642	217647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773330
4092	NC_008700	GCA	2	6	217649	217654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773330
4093	NC_008700	AATC	2	8	217679	217686	50 %	25 %	0 %	25 %	119773330
4094	NC_008700	CGAC	2	8	217754	217761	25 %	0 %	25 %	50 %	119773330
4095	NC_008700	TCAA	2	8	217855	217862	50 %	25 %	0 %	25 %	119773330
4096	NC_008700	GCC	2	6	217884	217889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773330
4097	NC_008700	TGG	2	6	218050	218055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773330
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4099	NC_008700	TCA	2	6	218126	218131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773330
4100	NC_008700	GC	3	6	218182	218187	0 %	0 %	50 %	50 %	119773330
4101	NC_008700	AAG	2	6	218212	218217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773330
4102	NC_008700	ACC	2	6	218264	218269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773331
4103	NC_008700	GCT	2	6	218336	218341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773331
4104	NC_008700	GAG	2	6	218342	218347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773331
4105	NC_008700	CCA	2	6	218383	218388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773331
4106	NC_008700	GCC	2	6	218393	218398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773331
4107	NC_008700	AGC	2	6	218418	218423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773331
4108	NC_008700	CGCT	2	8	218433	218440	0 %	25 %	25 %	50 %	119773331
4109	NC_008700	GCC	2	6	218486	218491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773331
4110	NC_008700	GC	3	6	218523	218528	0 %	0 %	50 %	50 %	119773331
4111	NC_008700	CAG	2	6	218531	218536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773331
4112	NC_008700	CAG	2	6	218591	218596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773331
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4114	NC_008700	TTGTT	2	10	218808	218817	0 %	80 %	20 %	0 %	119773331
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4118	NC_008700	CAT	2	6	219002	219007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773331
4119	NC_008700	GCC	2	6	219014	219019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773331
4120	NC_008700	TGG	2	6	219046	219051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773331
4121	NC_008700	GTC	2	6	219077	219082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773331
4122	NC_008700	GGT	2	6	219104	219109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773331
4123	NC_008700	TGA	2	6	219112	219117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773331
4124	NC_008700	GGT	2	6	219122	219127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773331
4125	NC_008700	CCAA	2	8	219171	219178	50 %	0 %	0 %	50 %	119773331
4126	NC_008700	CAA	2	6	219190	219195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773331
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4135	NC_008700	GTA	2	6	219540	219545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773332
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4248	NC_008700	TGC	2	6	225397	225402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4249	NC_008700	GTC	2	6	225409	225414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4374	NC_008700	A	6	6	233041	233046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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