MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 80963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008700	TGG	2	6	160287	160292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_008700	AAT	2	6	160383	160388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_008700	CAA	2	6	160493	160498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773283
3004	NC_008700	GCTG	2	8	160500	160507	0 %	25 %	50 %	25 %	119773283
3005	NC_008700	CCA	2	6	160508	160513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773283
3006	NC_008700	GCC	2	6	160612	160617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773283
3007	NC_008700	GAA	2	6	160642	160647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773283
3008	NC_008700	GCC	2	6	160661	160666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773283
3009	NC_008700	TGT	2	6	160745	160750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773283
3010	NC_008700	ATT	2	6	160835	160840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773283
3011	NC_008700	AGC	2	6	160874	160879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773283
3012	NC_008700	GAA	3	9	160882	160890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773283
3013	NC_008700	TGGT	2	8	160925	160932	0 %	50 %	50 %	0 %	119773283
3014	NC_008700	CAT	2	6	161001	161006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773283
3015	NC_008700	TGC	2	6	161026	161031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008700	TTA	2	6	161064	161069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773284
3017	NC_008700	ATCC	2	8	161087	161094	25 %	25 %	0 %	50 %	119773284
3018	NC_008700	GGCT	2	8	161095	161102	0 %	25 %	50 %	25 %	119773284
3019	NC_008700	TGG	2	6	161107	161112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773284
3020	NC_008700	GCA	2	6	161126	161131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3021	NC_008700	ACTG	2	8	161177	161184	25 %	25 %	25 %	25 %	119773284
3022	NC_008700	GATTC	2	10	161218	161227	20 %	40 %	20 %	20 %	119773284
3023	NC_008700	CCA	2	6	161234	161239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773284
3024	NC_008700	GC	3	6	161275	161280	0 %	0 %	50 %	50 %	119773284
3025	NC_008700	T	6	6	161358	161363	0 %	100 %	0 %	0 %	119773284
3026	NC_008700	AGAT	2	8	161404	161411	50 %	25 %	25 %	0 %	119773284
3027	NC_008700	TGA	2	6	161455	161460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773284
3028	NC_008700	TGT	2	6	161462	161467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773284
3029	NC_008700	CAAAC	2	10	161607	161616	60 %	0 %	0 %	40 %	119773284
3030	NC_008700	GCA	2	6	161756	161761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3031	NC_008700	AGTGA	2	10	161770	161779	40 %	20 %	40 %	0 %	119773284
3032	NC_008700	CGC	2	6	161783	161788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773284
3033	NC_008700	CCA	2	6	161798	161803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773284
3034	NC_008700	TCG	2	6	161827	161832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3035	NC_008700	GCA	2	6	162074	162079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3037	NC_008700	AT	3	6	162253	162258	50 %	50 %	0 %	0 %	119773284
3038	NC_008700	CAG	2	6	162345	162350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3039	NC_008700	TTGC	2	8	162414	162421	0 %	50 %	25 %	25 %	119773284
3040	NC_008700	GGC	2	6	162422	162427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773284
3041	NC_008700	TCA	3	9	162469	162477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773284
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3043	NC_008700	TGC	2	6	162560	162565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3044	NC_008700	CGT	2	6	162584	162589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3052	NC_008700	T	6	6	162884	162889	0 %	100 %	0 %	0 %	119773284
3053	NC_008700	CAG	2	6	162948	162953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3054	NC_008700	AG	3	6	162957	162962	50 %	0 %	50 %	0 %	119773284
3055	NC_008700	GCT	2	6	163051	163056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3056	NC_008700	GC	3	6	163062	163067	0 %	0 %	50 %	50 %	119773284
3057	NC_008700	GCA	2	6	163076	163081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3058	NC_008700	CGTT	2	8	163090	163097	0 %	50 %	25 %	25 %	119773284
3059	NC_008700	CCA	2	6	163107	163112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773284
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3061	NC_008700	CGG	2	6	163220	163225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773284
3062	NC_008700	GCA	2	6	163265	163270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3064	NC_008700	TCG	2	6	163285	163290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3065	NC_008700	GCT	2	6	163301	163306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3069	NC_008700	TTC	2	6	163572	163577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773284
3070	NC_008700	CAG	2	6	163671	163676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3072	NC_008700	CAT	2	6	163763	163768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773284
3073	NC_008700	TGC	2	6	163777	163782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3074	NC_008700	TGAT	2	8	163786	163793	25 %	50 %	25 %	0 %	119773284
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3080	NC_008700	TGC	2	6	164014	164019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
3081	NC_008700	TGG	2	6	164042	164047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773284
3082	NC_008700	TGC	2	6	164086	164091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773284
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3084	NC_008700	ATG	2	6	164188	164193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773284
3085	NC_008700	TCTG	2	8	164243	164250	0 %	50 %	25 %	25 %	119773284
3086	NC_008700	A	6	6	164420	164425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_008700	TG	3	6	164427	164432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_008700	TTAT	2	8	164452	164459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_008700	CAAAA	2	10	164527	164536	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3093	NC_008700	GCACA	2	10	164738	164747	40 %	0 %	20 %	40 %	119773285
3094	NC_008700	TGG	2	6	164905	164910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773285
3095	NC_008700	TGT	2	6	164992	164997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773285
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3100	NC_008700	GCCGC	2	10	165179	165188	0 %	0 %	40 %	60 %	119773285
3101	NC_008700	CAG	2	6	165239	165244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773285
3102	NC_008700	ATA	2	6	165270	165275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773285
3103	NC_008700	GTC	2	6	165374	165379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008700	CAG	2	6	165383	165388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_008700	TCA	2	6	165420	165425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_008700	TC	3	6	165444	165449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_008700	ACA	2	6	165496	165501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_008700	CTG	2	6	165541	165546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_008700	CCG	2	6	165611	165616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_008700	CGGG	2	8	165668	165675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_008700	CCTTG	2	10	165715	165724	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3112	NC_008700	TAA	2	6	165779	165784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_008700	TGG	2	6	165816	165821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_008700	GCG	2	6	165896	165901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773286
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3117	NC_008700	GAC	2	6	166118	166123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773286
3118	NC_008700	TGGCA	2	10	166142	166151	20 %	20 %	40 %	20 %	119773286
3119	NC_008700	CCG	2	6	166162	166167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773286
3120	NC_008700	CAT	2	6	166192	166197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773286
3121	NC_008700	CG	3	6	166198	166203	0 %	0 %	50 %	50 %	119773286
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3123	NC_008700	TGC	2	6	166255	166260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773286
3124	NC_008700	CTG	2	6	166334	166339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773286
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3241	NC_008700	CAG	2	6	172032	172037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773291
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3246	NC_008700	ACA	2	6	172228	172233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773291
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3248	NC_008700	C	6	6	172354	172359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3249	NC_008700	GCAG	2	8	172500	172507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3250	NC_008700	AGC	2	6	172561	172566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3262	NC_008700	CTG	2	6	173656	173661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3263	NC_008700	AAT	2	6	173713	173718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_008700	AACT	2	8	173742	173749	50 %	25 %	0 %	25 %	119773293
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3319	NC_008700	TGG	2	6	177093	177098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773293
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3344	NC_008700	GAA	2	6	178547	178552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773293
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3346	NC_008700	GTG	2	6	178572	178577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773293
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3350	NC_008700	GTA	2	6	178720	178725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_008700	ACA	2	6	178936	178941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773294
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3353	NC_008700	TGC	2	6	179122	179127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773294
3354	NC_008700	GCC	2	6	179138	179143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773294
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3487	NC_008700	GCG	2	6	186557	186562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773299
3488	NC_008700	TCA	2	6	186596	186601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773299
3489	NC_008700	CAG	2	6	186606	186611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773299
3490	NC_008700	ATGG	2	8	186692	186699	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_008700	GTC	2	6	186703	186708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3492	NC_008700	GTTT	2	8	186790	186797	0 %	75 %	25 %	0 %	119773300
3493	NC_008700	GCG	2	6	186831	186836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773300
3494	NC_008700	CCG	2	6	186917	186922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773300
3495	NC_008700	CGG	2	6	186946	186951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773300
3496	NC_008700	GCT	2	6	186972	186977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3497	NC_008700	GAG	2	6	187026	187031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119773300
3498	NC_008700	GCC	2	6	187061	187066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773300
3499	NC_008700	CTG	2	6	187083	187088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300
3500	NC_008700	GTC	2	6	187145	187150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773300

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