MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 80963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008700	CAT	2	6	50680	50685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773189
1002	NC_008700	AAT	2	6	50695	50700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773189
1003	NC_008700	TAA	2	6	50708	50713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773189
1004	NC_008700	CTA	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_008700	AGAT	2	8	50827	50834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008700	CAG	2	6	50835	50840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008700	AGC	2	6	50869	50874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008700	CTG	2	6	50918	50923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008700	GT	3	6	50960	50965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008700	TGG	2	6	50975	50980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008700	GATAT	2	10	51060	51069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008700	AGAT	2	8	51297	51304	50 %	25 %	25 %	0 %	119773190
1013	NC_008700	TTG	2	6	51408	51413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773190
1014	NC_008700	CAA	2	6	51418	51423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773190
1015	NC_008700	CCGT	2	8	51445	51452	0 %	25 %	25 %	50 %	119773190
1016	NC_008700	CCGG	2	8	51534	51541	0 %	0 %	50 %	50 %	119773190
1017	NC_008700	TCA	2	6	51580	51585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773190
1018	NC_008700	GGC	2	6	51604	51609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773190
1019	NC_008700	GAA	2	6	51614	51619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773190
1020	NC_008700	TGCC	2	8	51625	51632	0 %	25 %	25 %	50 %	119773190
1021	NC_008700	CCG	2	6	51734	51739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773190
1022	NC_008700	TAA	2	6	51820	51825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773190
1023	NC_008700	CAT	2	6	51992	51997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773191
1024	NC_008700	GGC	2	6	52005	52010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773191
1025	NC_008700	AGC	2	6	52096	52101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773191
1026	NC_008700	CAG	2	6	52133	52138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773191
1027	NC_008700	GCT	2	6	52273	52278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773191
1028	NC_008700	ACGT	2	8	52315	52322	25 %	25 %	25 %	25 %	119773191
1029	NC_008700	TGCC	2	8	52334	52341	0 %	25 %	25 %	50 %	119773191
1030	NC_008700	CCA	2	6	52357	52362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773191
1031	NC_008700	CAGC	2	8	52383	52390	25 %	0 %	25 %	50 %	119773191
1032	NC_008700	GTG	2	6	52440	52445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773191
1033	NC_008700	CCA	2	6	52477	52482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773191
1034	NC_008700	AAG	2	6	52522	52527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773191
1035	NC_008700	GGC	2	6	52663	52668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773192
1036	NC_008700	GGT	2	6	52669	52674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773192
1037	NC_008700	CA	3	6	52769	52774	50 %	0 %	0 %	50 %	119773192
1038	NC_008700	ACC	2	6	52852	52857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773192
1039	NC_008700	CTT	2	6	52872	52877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773192
1040	NC_008700	AAG	2	6	52889	52894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773192
1041	NC_008700	TG	3	6	52905	52910	0 %	50 %	50 %	0 %	119773192
1042	NC_008700	CGG	2	6	52917	52922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773192
1043	NC_008700	CTT	2	6	53052	53057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773192
1044	NC_008700	GTGG	2	8	53086	53093	0 %	25 %	75 %	0 %	119773192
1045	NC_008700	TTC	2	6	53098	53103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773192
1046	NC_008700	GAT	2	6	53104	53109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773192
1047	NC_008700	CGT	2	6	53197	53202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773192
1048	NC_008700	GAGCGT	2	12	53221	53232	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119773192
1049	NC_008700	CGC	2	6	53248	53253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773192
1050	NC_008700	GGT	2	6	53314	53319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773192
1051	NC_008700	CTGG	2	8	53436	53443	0 %	25 %	50 %	25 %	119773192
1052	NC_008700	TAA	2	6	53467	53472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008700	TCA	2	6	53604	53609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773193
1054	NC_008700	CCG	2	6	53676	53681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773193
1055	NC_008700	AGCC	2	8	53682	53689	25 %	0 %	25 %	50 %	119773193
1056	NC_008700	CAG	2	6	53747	53752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773193
1057	NC_008700	TGC	2	6	53772	53777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773193
1058	NC_008700	GACT	2	8	53847	53854	25 %	25 %	25 %	25 %	119773193
1059	NC_008700	TCT	2	6	53890	53895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773193
1060	NC_008700	GCT	2	6	53969	53974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_008700	GAT	2	6	54059	54064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773194
1062	NC_008700	GACA	2	8	54077	54084	50 %	0 %	25 %	25 %	119773194
1063	NC_008700	GCA	2	6	54231	54236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773194
1064	NC_008700	TGA	2	6	54305	54310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773194
1065	NC_008700	ACA	2	6	54373	54378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773194
1066	NC_008700	TGG	2	6	54394	54399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773194
1067	NC_008700	ATA	2	6	54430	54435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773194
1068	NC_008700	TGG	2	6	54448	54453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773194
1069	NC_008700	GGT	2	6	54459	54464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773194
1070	NC_008700	TCGT	2	8	54490	54497	0 %	50 %	25 %	25 %	119773194
1071	NC_008700	GCA	2	6	54552	54557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773194
1072	NC_008700	ATT	2	6	54621	54626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773194
1073	NC_008700	GCT	2	6	54669	54674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773194
1074	NC_008700	ATG	2	6	54708	54713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773194
1075	NC_008700	GTTG	2	8	54791	54798	0 %	50 %	50 %	0 %	119773194
1076	NC_008700	TGC	2	6	54856	54861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773194
1077	NC_008700	AAG	2	6	54944	54949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773195
1078	NC_008700	CAG	2	6	54950	54955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773195
1079	NC_008700	TGG	2	6	54963	54968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773195
1080	NC_008700	CAG	2	6	54974	54979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773195
1081	NC_008700	CGC	2	6	55018	55023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773195
1082	NC_008700	GTGACC	2	12	55040	55051	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	119773195
1083	NC_008700	GCT	3	9	55055	55063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773195
1084	NC_008700	GAA	2	6	55115	55120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773195
1085	NC_008700	CTC	2	6	55180	55185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119773196
1086	NC_008700	CTGA	2	8	55209	55216	25 %	25 %	25 %	25 %	119773196
1087	NC_008700	GCA	2	6	55416	55421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773196
1088	NC_008700	CAT	2	6	55443	55448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773196
1089	NC_008700	AAT	2	6	55453	55458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773196
1090	NC_008700	TGC	2	6	55524	55529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773196
1091	NC_008700	GCA	2	6	55568	55573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773196
1092	NC_008700	CAT	2	6	55593	55598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773196
1093	NC_008700	ACCA	2	8	55615	55622	50 %	0 %	0 %	50 %	119773196
1094	NC_008700	TA	3	6	55639	55644	50 %	50 %	0 %	0 %	119773196
1095	NC_008700	T	6	6	55723	55728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008700	CAGGT	2	10	55753	55762	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1097	NC_008700	A	6	6	55785	55790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_008700	A	7	7	55792	55798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_008700	GCG	2	6	55874	55879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_008700	GGT	2	6	55889	55894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008700	TG	3	6	56047	56052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_008700	TGA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_008700	CAG	2	6	56122	56127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008700	GGC	2	6	56187	56192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_008700	GCG	2	6	56253	56258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008700	AGG	2	6	56348	56353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_008700	TAG	2	6	56400	56405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008700	CGA	2	6	56428	56433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008700	GCA	2	6	56502	56507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008700	GT	3	6	56555	56560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008700	GAA	2	6	56561	56566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008700	GGA	2	6	56597	56602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008700	AGA	2	6	56644	56649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008700	CAG	2	6	56670	56675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_008700	G	6	6	56817	56822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_008700	GGA	2	6	56861	56866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008700	GGC	2	6	56881	56886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008700	GAA	2	6	57124	57129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008700	TGC	2	6	57200	57205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008700	GTC	2	6	57212	57217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008700	CCTTAT	2	12	57264	57275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008700	GGA	2	6	57326	57331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008700	GAC	2	6	57339	57344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008700	TCA	2	6	57351	57356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_008700	AC	3	6	57377	57382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008700	TCG	2	6	57444	57449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_008700	AC	3	6	57546	57551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_008700	CCT	2	6	57687	57692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_008700	CTG	2	6	57713	57718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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