MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 80963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008700	AAG	2	6	239012	239017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773347
4502	NC_008700	TGA	2	6	239039	239044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773347
4503	NC_008700	GT	3	6	239114	239119	0 %	50 %	50 %	0 %	119773347
4504	NC_008700	ACTC	2	8	239143	239150	25 %	25 %	0 %	50 %	119773347
4505	NC_008700	CG	3	6	239172	239177	0 %	0 %	50 %	50 %	119773347
4506	NC_008700	TAT	2	6	239178	239183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773347
4507	NC_008700	CTGG	2	8	239199	239206	0 %	25 %	50 %	25 %	119773347
4508	NC_008700	CGT	3	9	239251	239259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4509	NC_008700	CTGC	2	8	239263	239270	0 %	25 %	25 %	50 %	119773347
4510	NC_008700	TCT	2	6	239321	239326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773347
4511	NC_008700	AAGA	2	8	239350	239357	75 %	0 %	25 %	0 %	119773347
4512	NC_008700	CT	3	6	239358	239363	0 %	50 %	0 %	50 %	119773347
4513	NC_008700	TGA	2	6	239366	239371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773347
4514	NC_008700	GCT	2	6	239373	239378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4515	NC_008700	CGT	2	6	239455	239460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4516	NC_008700	A	6	6	239489	239494	100 %	0 %	0 %	0 %	119773347
4517	NC_008700	GCC	2	6	239545	239550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773347
4518	NC_008700	CAA	2	6	239595	239600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773347
4519	NC_008700	CCA	3	9	239720	239728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773347
4520	NC_008700	ATG	2	6	239761	239766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773347
4521	NC_008700	CCA	2	6	239779	239784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773347
4522	NC_008700	TGC	2	6	239793	239798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4523	NC_008700	TTC	2	6	239821	239826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773347
4524	NC_008700	CGT	2	6	239875	239880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4525	NC_008700	ACG	2	6	239921	239926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4526	NC_008700	TGA	2	6	239939	239944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773347
4527	NC_008700	AGA	2	6	239945	239950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773347
4528	NC_008700	GTAACG	2	12	239963	239974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119773347
4529	NC_008700	CGT	2	6	240007	240012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4530	NC_008700	GC	3	6	240072	240077	0 %	0 %	50 %	50 %	119773347
4531	NC_008700	GTCT	2	8	240089	240096	0 %	50 %	25 %	25 %	119773347
4532	NC_008700	TCA	2	6	240131	240136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773347
4533	NC_008700	GCG	2	6	240154	240159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773347
4534	NC_008700	TTC	2	6	240169	240174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773347
4535	NC_008700	TTC	2	6	240177	240182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773347
4536	NC_008700	AAC	2	6	240208	240213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773347
4537	NC_008700	GC	3	6	240279	240284	0 %	0 %	50 %	50 %	119773347
4538	NC_008700	GTC	2	6	240323	240328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4539	NC_008700	CGA	2	6	240456	240461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4540	NC_008700	GAA	2	6	240484	240489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773347
4541	NC_008700	GTC	2	6	240563	240568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4542	NC_008700	GC	3	6	240591	240596	0 %	0 %	50 %	50 %	119773347
4543	NC_008700	ATC	2	6	240634	240639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773347
4544	NC_008700	GCA	2	6	240646	240651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4545	NC_008700	ACG	3	9	240674	240682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4546	NC_008700	GGTA	2	8	240753	240760	25 %	25 %	50 %	0 %	119773347
4547	NC_008700	GTT	2	6	240799	240804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773347
4548	NC_008700	TGAA	2	8	240863	240870	50 %	25 %	25 %	0 %	119773347
4549	NC_008700	GAC	2	6	241129	241134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
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4551	NC_008700	CATTCA	2	12	241146	241157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773347
4552	NC_008700	CGA	2	6	241251	241256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4553	NC_008700	GGC	2	6	241291	241296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773347
4554	NC_008700	TGGT	2	8	241304	241311	0 %	50 %	50 %	0 %	119773347
4555	NC_008700	CTG	2	6	241357	241362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4556	NC_008700	CT	3	6	241404	241409	0 %	50 %	0 %	50 %	119773347
4557	NC_008700	ATCGAA	2	12	241492	241503	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	119773347
4558	NC_008700	CTG	2	6	241588	241593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4559	NC_008700	GGT	2	6	241600	241605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773347
4560	NC_008700	CTG	2	6	241645	241650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4561	NC_008700	AAG	2	6	241735	241740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773347
4562	NC_008700	GTC	2	6	241859	241864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4563	NC_008700	ACG	2	6	241916	241921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4564	NC_008700	AGC	2	6	242057	242062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4565	NC_008700	CAG	2	6	242119	242124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4566	NC_008700	CGA	2	6	242148	242153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4567	NC_008700	AAAGAG	2	12	242224	242235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773347
4568	NC_008700	TACATG	2	12	242338	242349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	119773347
4569	NC_008700	ACC	2	6	242360	242365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773347
4570	NC_008700	CGA	2	6	242370	242375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4571	NC_008700	CAG	2	6	242419	242424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4572	NC_008700	CGG	2	6	242430	242435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773347
4573	NC_008700	TGG	2	6	242448	242453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773347
4574	NC_008700	TGC	2	6	242499	242504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4575	NC_008700	ACC	2	6	242588	242593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773347
4576	NC_008700	CTG	2	6	242629	242634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773347
4577	NC_008700	GA	3	6	242759	242764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_008700	TTA	2	6	242777	242782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773348
4579	NC_008700	CAG	2	6	242795	242800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4580	NC_008700	ACCTG	2	10	242845	242854	20 %	20 %	20 %	40 %	119773348
4581	NC_008700	TG	3	6	242979	242984	0 %	50 %	50 %	0 %	119773348
4582	NC_008700	GCG	2	6	243030	243035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773348
4583	NC_008700	GAA	2	6	243251	243256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4584	NC_008700	GAA	2	6	243275	243280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4585	NC_008700	TGA	2	6	243286	243291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4586	NC_008700	CTG	2	6	243329	243334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4587	NC_008700	GAAA	2	8	243352	243359	75 %	0 %	25 %	0 %	119773348
4588	NC_008700	GAT	2	6	243475	243480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4589	NC_008700	CGG	2	6	243535	243540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773348
4590	NC_008700	CGC	2	6	243575	243580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773348
4591	NC_008700	TCA	2	6	243582	243587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4592	NC_008700	AAC	2	6	243593	243598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773348
4593	NC_008700	CTG	2	6	243611	243616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4594	NC_008700	GCT	2	6	243623	243628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4595	NC_008700	ATC	2	6	243635	243640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4596	NC_008700	TGC	2	6	243660	243665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
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4598	NC_008700	CGT	2	6	243698	243703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4599	NC_008700	CAA	2	6	243724	243729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773348
4600	NC_008700	CTG	2	6	243791	243796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4601	NC_008700	ACT	2	6	243810	243815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4602	NC_008700	TTA	2	6	243828	243833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119773348
4603	NC_008700	TGGCC	2	10	243931	243940	0 %	20 %	40 %	40 %	119773348
4604	NC_008700	ACC	2	6	243941	243946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773348
4605	NC_008700	GCC	2	6	243953	243958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773348
4606	NC_008700	AAG	2	6	243959	243964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4607	NC_008700	GT	3	6	244124	244129	0 %	50 %	50 %	0 %	119773348
4608	NC_008700	TGA	2	6	244215	244220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773348
4609	NC_008700	CAA	2	6	244228	244233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119773348
4610	NC_008700	GCCA	2	8	244243	244250	25 %	0 %	25 %	50 %	119773348
4611	NC_008700	ATC	2	6	244262	244267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4612	NC_008700	TAC	2	6	244298	244303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4613	NC_008700	GCTGAA	2	12	244358	244369	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119773348
4614	NC_008700	TGC	2	6	244387	244392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4615	NC_008700	CAT	2	6	244432	244437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773348
4616	NC_008700	AGC	2	6	244461	244466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4617	NC_008700	GTCT	2	8	244524	244531	0 %	50 %	25 %	25 %	119773348
4618	NC_008700	AAG	2	6	244559	244564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773348
4619	NC_008700	GCT	2	6	244576	244581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773348
4620	NC_008700	CCA	2	6	244662	244667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119773348
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4623	NC_008700	GCCGAA	2	12	244736	244747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119773348
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4732	NC_008700	TCA	2	6	250732	250737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773352
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4741	NC_008700	GCT	2	6	251135	251140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4742	NC_008700	CTG	2	6	251175	251180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773352
4743	NC_008700	TGA	2	6	251195	251200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773352
4744	NC_008700	CA	3	6	251245	251250	50 %	0 %	0 %	50 %	119773352
4745	NC_008700	AGA	2	6	251285	251290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119773352
4746	NC_008700	GGT	2	6	251292	251297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119773352
4747	NC_008700	TTC	2	6	251310	251315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773352
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4749	NC_008700	GTT	2	6	251421	251426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773352
4750	NC_008700	GGC	2	6	251481	251486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119773352
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4752	NC_008700	GAA	2	6	251542	251547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4753	NC_008700	T	6	6	251566	251571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_008700	TTACG	2	10	251649	251658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4755	NC_008700	CGA	2	6	251671	251676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4756	NC_008700	CCTG	2	8	251696	251703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4757	NC_008700	TAA	2	6	251715	251720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_008700	ACT	2	6	251775	251780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4761	NC_008700	ATC	2	6	251932	251937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773353
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4764	NC_008700	TAA	2	6	252062	252067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119773353
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4769	NC_008700	GCCG	2	8	252457	252464	0 %	0 %	50 %	50 %	119773354
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4772	NC_008700	GTA	2	6	252769	252774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773354
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4851	NC_008700	GC	3	6	256921	256926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4852	NC_008700	GTTA	2	8	256955	256962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4859	NC_008700	TTC	2	6	257263	257268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119773364
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4862	NC_008700	CGT	2	6	257405	257410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773365
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4982	NC_008700	TCG	2	6	263615	263620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773378
4983	NC_008700	ACT	2	6	263653	263658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119773378
4984	NC_008700	GTT	2	6	263817	263822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119773378
4985	NC_008700	TTCA	2	8	263831	263838	25 %	50 %	0 %	25 %	119773378
4986	NC_008700	ATG	2	6	263851	263856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119773378
4987	NC_008700	CGC	2	6	263954	263959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119773378
4988	NC_008700	TCG	2	6	264031	264036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773378
4989	NC_008700	TAAG	2	8	264047	264054	50 %	25 %	25 %	0 %	119773378
4990	NC_008700	AACA	2	8	264058	264065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4991	NC_008700	AG	3	6	264066	264071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_008700	GTC	2	6	264221	264226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119773379
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