MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella sp. ANA-3 chromosome 1

Total Repeats: 61079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008577	GAG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008577	ATT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918460
3	NC_008577	CAC	2	6	111	116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918460
4	NC_008577	TTG	2	6	132	137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
5	NC_008577	TCA	2	6	145	150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918460
6	NC_008577	AGT	2	6	154	159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918460
7	NC_008577	AGC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918460
8	NC_008577	TTG	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
9	NC_008577	CAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918460
10	NC_008577	GTT	2	6	587	592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918460
11	NC_008577	AAC	2	6	662	667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008577	TAT	2	6	700	705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008577	TAA	2	6	792	797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
14	NC_008577	CAG	2	6	819	824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
15	NC_008577	GCT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
16	NC_008577	TTG	2	6	985	990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918461
17	NC_008577	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
18	NC_008577	GAC	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
19	NC_008577	GCA	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
20	NC_008577	ACG	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
21	NC_008577	CAT	2	6	1286	1291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
22	NC_008577	CCA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
23	NC_008577	GCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918461
24	NC_008577	TCA	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
25	NC_008577	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
26	NC_008577	CTT	2	6	1529	1534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
27	NC_008577	GAA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117918461
28	NC_008577	AAT	2	6	1625	1630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
29	NC_008577	TGG	2	6	1724	1729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
30	NC_008577	TGA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918461
31	NC_008577	AAT	2	6	1902	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
32	NC_008577	CAA	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918461
33	NC_008577	GTG	2	6	2057	2062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
34	NC_008577	TGG	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918461
35	NC_008577	ACC	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
36	NC_008577	ATC	2	6	2286	2291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918461
37	NC_008577	TTG	2	6	2298	2303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918461
38	NC_008577	TCT	2	6	2345	2350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918461
39	NC_008577	CTG	2	6	2393	2398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
40	NC_008577	CCG	2	6	2509	2514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918461
41	NC_008577	AAT	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918461
42	NC_008577	TGC	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918461
43	NC_008577	ACC	3	9	2622	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918461
44	NC_008577	ACA	2	6	2632	2637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918461
45	NC_008577	TCT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008577	ATA	2	6	3009	3014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008577	AGT	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008577	GGT	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008577	TCT	2	6	3150	3155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918462
50	NC_008577	TGT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918462
51	NC_008577	AGC	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918462
52	NC_008577	TTA	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918462
53	NC_008577	CGA	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918462
54	NC_008577	GAT	2	6	3392	3397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918462
55	NC_008577	CTG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918462
56	NC_008577	GTG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918462
57	NC_008577	ACT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918463
58	NC_008577	TAT	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918463
59	NC_008577	TGA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
60	NC_008577	GGT	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918463
61	NC_008577	ACA	2	6	3978	3983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918463
62	NC_008577	TTC	2	6	4114	4119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
63	NC_008577	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
64	NC_008577	GCC	2	6	4339	4344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918463
65	NC_008577	TGG	2	6	4444	4449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918463
66	NC_008577	TGC	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918463
67	NC_008577	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918463
68	NC_008577	GTT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918463
69	NC_008577	GAT	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
70	NC_008577	TGA	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918463
71	NC_008577	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
72	NC_008577	TAT	2	6	5047	5052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117918463
73	NC_008577	TTC	2	6	5180	5185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918463
74	NC_008577	GGC	2	6	5206	5211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918463
75	NC_008577	TTC	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
76	NC_008577	GGC	2	6	5567	5572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918464
77	NC_008577	TTC	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
78	NC_008577	GTG	3	9	5818	5826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
79	NC_008577	GTG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
80	NC_008577	ATA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117918464
81	NC_008577	GTG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
82	NC_008577	GAT	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918464
83	NC_008577	CTT	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918464
84	NC_008577	CCA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918464
85	NC_008577	GGC	2	6	6318	6323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918464
86	NC_008577	TGG	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918464
87	NC_008577	ACC	2	6	6483	6488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918464
88	NC_008577	CGC	2	6	6686	6691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918464
89	NC_008577	ATC	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008577	GGC	2	6	6778	6783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008577	GCC	2	6	6791	6796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008577	TCT	2	6	6879	6884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918465
93	NC_008577	GAT	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918465
94	NC_008577	CAA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918465
95	NC_008577	GAA	2	6	6949	6954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117918465
96	NC_008577	CAT	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
97	NC_008577	GTA	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918465
98	NC_008577	CTT	2	6	7228	7233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117918465
99	NC_008577	CAT	2	6	7243	7248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
100	NC_008577	ACC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918465
101	NC_008577	CAA	2	6	7485	7490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918465
102	NC_008577	TGG	2	6	7669	7674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117918465
103	NC_008577	CGC	2	6	7708	7713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918465
104	NC_008577	ACC	2	6	7717	7722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918465
105	NC_008577	CAT	3	9	7822	7830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117918465
106	NC_008577	GCT	2	6	7831	7836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918465
107	NC_008577	AGC	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918465
108	NC_008577	GTT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918465
109	NC_008577	GCA	2	6	8051	8056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918465
110	NC_008577	GCG	2	6	8060	8065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918465
111	NC_008577	CAC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117918465
112	NC_008577	GCT	2	6	8288	8293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117918465
113	NC_008577	AGT	2	6	8429	8434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918465
114	NC_008577	CCG	2	6	8513	8518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117918466
115	NC_008577	CAA	2	6	8561	8566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918466
116	NC_008577	TGA	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117918466
117	NC_008577	GCG	2	6	8703	8708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117918466
118	NC_008577	TTG	2	6	8740	8745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918467
119	NC_008577	CAA	2	6	8789	8794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117918467
120	NC_008577	TGT	2	6	8917	8922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117918467
121	NC_008577	CAG	2	6	8954	8959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117918467
122	NC_008577	AAG	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117918467
123	NC_008577	ACG	3	9	9098	9106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008577	GCC	2	6	9122	9127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008577	ATG	2	6	9204	9209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008577	CAA	2	6	9308	9313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008577	AGA	2	6	9376	9381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008577	GTA	2	6	9412	9417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008577	TAA	2	6	9476	9481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008577	TTG	2	6	9499	9504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008577	TGA	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008577	TTG	2	6	9560	9565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008577	ATT	2	6	9572	9577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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