MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella sp. ANA-3 plasmid 1

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008573	TG	3	6	1201	1206	0 %	50 %	50 %	0 %	117676081
2	NC_008573	CT	3	6	3162	3167	0 %	50 %	0 %	50 %	117676084
3	NC_008573	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	117676085
4	NC_008573	TC	3	6	3644	3649	0 %	50 %	0 %	50 %	117676085
5	NC_008573	GC	3	6	4944	4949	0 %	0 %	50 %	50 %	117676085
6	NC_008573	CA	3	6	5134	5139	50 %	0 %	0 %	50 %	117676085
7	NC_008573	TC	3	6	5142	5147	0 %	50 %	0 %	50 %	117676085
8	NC_008573	TG	3	6	5528	5533	0 %	50 %	50 %	0 %	117676085
9	NC_008573	AT	3	6	5724	5729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008573	TC	3	6	5849	5854	0 %	50 %	0 %	50 %	117676086
11	NC_008573	AT	3	6	6030	6035	50 %	50 %	0 %	0 %	117676086
12	NC_008573	TA	3	6	7516	7521	50 %	50 %	0 %	0 %	117676087
13	NC_008573	CT	3	6	9778	9783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008573	TG	3	6	10417	10422	0 %	50 %	50 %	0 %	117676089
15	NC_008573	GC	3	6	11368	11373	0 %	0 %	50 %	50 %	117676089
16	NC_008573	GA	3	6	13980	13985	50 %	0 %	50 %	0 %	117676094
17	NC_008573	CG	3	6	14077	14082	0 %	0 %	50 %	50 %	117676094
18	NC_008573	CG	4	8	14604	14611	0 %	0 %	50 %	50 %	117676094
19	NC_008573	AT	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	117676094
20	NC_008573	AC	3	6	16433	16438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008573	GC	4	8	16810	16817	0 %	0 %	50 %	50 %	117676095
22	NC_008573	CG	3	6	17592	17597	0 %	0 %	50 %	50 %	117676096
23	NC_008573	GT	3	6	17748	17753	0 %	50 %	50 %	0 %	117676096
24	NC_008573	CG	3	6	18419	18424	0 %	0 %	50 %	50 %	117676096
25	NC_008573	GC	3	6	18624	18629	0 %	0 %	50 %	50 %	117676096
26	NC_008573	CG	3	6	18819	18824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008573	GC	3	6	19440	19445	0 %	0 %	50 %	50 %	117676097
28	NC_008573	TC	3	6	26057	26062	0 %	50 %	0 %	50 %	117676103
29	NC_008573	TG	3	6	28205	28210	0 %	50 %	50 %	0 %	117676104
30	NC_008573	TC	3	6	29464	29469	0 %	50 %	0 %	50 %	117676104
31	NC_008573	AG	3	6	31356	31361	50 %	0 %	50 %	0 %	117676105
32	NC_008573	CA	3	6	31471	31476	50 %	0 %	0 %	50 %	117676106
33	NC_008573	AG	4	8	34908	34915	50 %	0 %	50 %	0 %	117676109
34	NC_008573	TC	4	8	35206	35213	0 %	50 %	0 %	50 %	117676109
35	NC_008573	GC	3	6	35619	35624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008573	CG	3	6	36397	36402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008573	AT	3	6	36854	36859	50 %	50 %	0 %	0 %	117676111
38	NC_008573	AG	3	6	37129	37134	50 %	0 %	50 %	0 %	117676111
39	NC_008573	CA	3	6	39062	39067	50 %	0 %	0 %	50 %	117676112
40	NC_008573	GT	3	6	39270	39275	0 %	50 %	50 %	0 %	117676112
41	NC_008573	CT	3	6	39334	39339	0 %	50 %	0 %	50 %	117676112
42	NC_008573	GA	3	6	44483	44488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008573	CT	3	6	45419	45424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008573	CT	3	6	45595	45600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008573	CT	3	6	46158	46163	0 %	50 %	0 %	50 %	117676119
46	NC_008573	CA	3	6	46663	46668	50 %	0 %	0 %	50 %	117676120
47	NC_008573	CA	3	6	47941	47946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008573	CT	3	6	48259	48264	0 %	50 %	0 %	50 %	117676122
49	NC_008573	CT	3	6	48445	48450	0 %	50 %	0 %	50 %	117676122
50	NC_008573	GC	3	6	49714	49719	0 %	0 %	50 %	50 %	117676124
51	NC_008573	AC	3	6	50519	50524	50 %	0 %	0 %	50 %	117676124
52	NC_008573	CA	3	6	50665	50670	50 %	0 %	0 %	50 %	117676124
53	NC_008573	AC	3	6	54648	54653	50 %	0 %	0 %	50 %	117676131
54	NC_008573	GA	3	6	55008	55013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008573	CA	3	6	57864	57869	50 %	0 %	0 %	50 %	117676134
56	NC_008573	TG	4	8	60993	61000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008573	TC	3	6	61348	61353	0 %	50 %	0 %	50 %	117676139
58	NC_008573	AC	3	6	62184	62189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008573	AG	4	8	62190	62197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008573	GT	3	6	62738	62743	0 %	50 %	50 %	0 %	117676140
61	NC_008573	AC	3	6	62785	62790	50 %	0 %	0 %	50 %	117676140
62	NC_008573	CT	3	6	64606	64611	0 %	50 %	0 %	50 %	117676141
63	NC_008573	TC	3	6	66566	66571	0 %	50 %	0 %	50 %	117676143
64	NC_008573	TC	3	6	67383	67388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008573	CA	3	6	67728	67733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008573	GT	3	6	68294	68299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008573	GA	3	6	71964	71969	50 %	0 %	50 %	0 %	117676146
68	NC_008573	CA	3	6	72578	72583	50 %	0 %	0 %	50 %	117676146
69	NC_008573	CA	4	8	72841	72848	50 %	0 %	0 %	50 %	117676146
70	NC_008573	AT	3	6	72976	72981	50 %	50 %	0 %	0 %	117676146
71	NC_008573	GT	3	6	74271	74276	0 %	50 %	50 %	0 %	117676146
72	NC_008573	CA	3	6	75592	75597	50 %	0 %	0 %	50 %	117676147
73	NC_008573	CT	3	6	77194	77199	0 %	50 %	0 %	50 %	117676148
74	NC_008573	GT	3	6	78345	78350	0 %	50 %	50 %	0 %	117676149
75	NC_008573	AC	3	6	78527	78532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008573	GT	3	6	81223	81228	0 %	50 %	50 %	0 %	117676153
77	NC_008573	AG	3	6	82131	82136	50 %	0 %	50 %	0 %	117676153
78	NC_008573	TG	3	6	82374	82379	0 %	50 %	50 %	0 %	117676153
79	NC_008573	AT	3	6	82899	82904	50 %	50 %	0 %	0 %	117676153
80	NC_008573	AG	3	6	83399	83404	50 %	0 %	50 %	0 %	117676153
81	NC_008573	TA	3	6	84486	84491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008573	CT	3	6	86570	86575	0 %	50 %	0 %	50 %	117676155
83	NC_008573	CA	3	6	86663	86668	50 %	0 %	0 %	50 %	117676155
84	NC_008573	CA	3	6	87156	87161	50 %	0 %	0 %	50 %	117676155
85	NC_008573	GA	3	6	88941	88946	50 %	0 %	50 %	0 %	117676157
86	NC_008573	AC	4	8	89439	89446	50 %	0 %	0 %	50 %	117676158
87	NC_008573	AC	3	6	89649	89654	50 %	0 %	0 %	50 %	117676158
88	NC_008573	GA	3	6	93025	93030	50 %	0 %	50 %	0 %	117676160
89	NC_008573	GT	3	6	93297	93302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008573	AT	3	6	95236	95241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008573	TA	3	6	95583	95588	50 %	50 %	0 %	0 %	117676163
92	NC_008573	GA	3	6	96181	96186	50 %	0 %	50 %	0 %	117676163
93	NC_008573	AC	3	6	96241	96246	50 %	0 %	0 %	50 %	117676163
94	NC_008573	AC	3	6	96742	96747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008573	CT	3	6	97803	97808	0 %	50 %	0 %	50 %	117676165
96	NC_008573	CT	3	6	98455	98460	0 %	50 %	0 %	50 %	117676166
97	NC_008573	CA	3	6	98796	98801	50 %	0 %	0 %	50 %	117676166
98	NC_008573	GA	3	6	101050	101055	50 %	0 %	50 %	0 %	117676167
99	NC_008573	TC	3	6	101584	101589	0 %	50 %	0 %	50 %	117676167
100	NC_008573	CA	3	6	102187	102192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008573	TC	3	6	103119	103124	0 %	50 %	0 %	50 %	117676168
102	NC_008573	TG	3	6	103236	103241	0 %	50 %	50 %	0 %	117676168
103	NC_008573	TG	3	6	103278	103283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008573	GA	3	6	103327	103332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008573	TA	3	6	104094	104099	50 %	50 %	0 %	0 %	117676170
106	NC_008573	TC	3	6	104145	104150	0 %	50 %	0 %	50 %	117676170
107	NC_008573	TC	3	6	104410	104415	0 %	50 %	0 %	50 %	117676170
108	NC_008573	TG	3	6	106261	106266	0 %	50 %	50 %	0 %	117676172
109	NC_008573	AG	3	6	107202	107207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008573	TC	3	6	107329	107334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008573	TC	3	6	107367	107372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008573	TG	3	6	107515	107520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008573	GA	3	6	108220	108225	50 %	0 %	50 %	0 %	117676174
114	NC_008573	TA	3	6	109003	109008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008573	AG	3	6	109181	109186	50 %	0 %	50 %	0 %	117676176
116	NC_008573	AG	3	6	109450	109455	50 %	0 %	50 %	0 %	117676176
117	NC_008573	CT	3	6	109736	109741	0 %	50 %	0 %	50 %	117676177
118	NC_008573	CT	3	6	109899	109904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008573	GA	3	6	110316	110321	50 %	0 %	50 %	0 %	117676178
120	NC_008573	AT	4	8	110356	110363	50 %	50 %	0 %	0 %	117676178
121	NC_008573	CT	3	6	111903	111908	0 %	50 %	0 %	50 %	117676178
122	NC_008573	CT	3	6	112507	112512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008573	TC	3	6	112900	112905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008573	GC	3	6	114602	114607	0 %	0 %	50 %	50 %	117676179
125	NC_008573	TG	3	6	115222	115227	0 %	50 %	50 %	0 %	117676180
126	NC_008573	TA	3	6	115354	115359	50 %	50 %	0 %	0 %	117676180
127	NC_008573	AC	3	6	115459	115464	50 %	0 %	0 %	50 %	117676180
128	NC_008573	CA	3	6	115841	115846	50 %	0 %	0 %	50 %	117676180
129	NC_008573	AT	3	6	115867	115872	50 %	50 %	0 %	0 %	117676180
130	NC_008573	GT	3	6	116390	116395	0 %	50 %	50 %	0 %	117676181
131	NC_008573	AG	3	6	117121	117126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008573	AG	3	6	117317	117322	50 %	0 %	50 %	0 %	117676183
133	NC_008573	CT	3	6	117746	117751	0 %	50 %	0 %	50 %	117676183
134	NC_008573	CT	3	6	118317	118322	0 %	50 %	0 %	50 %	117676183
135	NC_008573	CA	4	8	119536	119543	50 %	0 %	0 %	50 %	117676183
136	NC_008573	CT	3	6	120583	120588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008573	CA	3	6	121054	121059	50 %	0 %	0 %	50 %	117676184
138	NC_008573	GC	4	8	121449	121456	0 %	0 %	50 %	50 %	117676185
139	NC_008573	GA	4	8	121597	121604	50 %	0 %	50 %	0 %	117676185
140	NC_008573	GC	3	6	121624	121629	0 %	0 %	50 %	50 %	117676185
141	NC_008573	GA	3	6	122073	122078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008573	TC	3	6	122832	122837	0 %	50 %	0 %	50 %	117676186
143	NC_008573	GT	3	6	123828	123833	0 %	50 %	50 %	0 %	117676187
144	NC_008573	CT	3	6	124061	124066	0 %	50 %	0 %	50 %	117676187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.