MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 12646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008554	ACTC	2	8	1779	1786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008554	CGGA	2	8	1824	1831	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008554	CAAG	2	8	3281	3288	50 %	0 %	25 %	25 %	116747455
4	NC_008554	TTTG	2	8	3386	3393	0 %	75 %	25 %	0 %	116747455
5	NC_008554	GTGA	2	8	3484	3491	25 %	25 %	50 %	0 %	116747455
6	NC_008554	TGGC	2	8	3994	4001	0 %	25 %	50 %	25 %	116747456
7	NC_008554	GGGA	2	8	4673	4680	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008554	CCGC	2	8	4716	4723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008554	GAAC	2	8	5616	5623	50 %	0 %	25 %	25 %	116747457
10	NC_008554	GGGA	2	8	6031	6038	25 %	0 %	75 %	0 %	116747457
11	NC_008554	GCAC	2	8	6418	6425	25 %	0 %	25 %	50 %	116747457
12	NC_008554	CGCA	2	8	7377	7384	25 %	0 %	25 %	50 %	116747458
13	NC_008554	CATG	2	8	7400	7407	25 %	25 %	25 %	25 %	116747458
14	NC_008554	ATGA	2	8	7419	7426	50 %	25 %	25 %	0 %	116747458
15	NC_008554	GGGC	2	8	7430	7437	0 %	0 %	75 %	25 %	116747458
16	NC_008554	TGGC	2	8	7954	7961	0 %	25 %	50 %	25 %	116747459
17	NC_008554	CTGG	2	8	8196	8203	0 %	25 %	50 %	25 %	116747459
18	NC_008554	GCTC	2	8	9435	9442	0 %	25 %	25 %	50 %	116747460
19	NC_008554	TCGT	2	8	9507	9514	0 %	50 %	25 %	25 %	116747460
20	NC_008554	CGAT	2	8	10592	10599	25 %	25 %	25 %	25 %	116747460
21	NC_008554	GACG	2	8	11058	11065	25 %	0 %	50 %	25 %	116747460
22	NC_008554	CGAA	2	8	11565	11572	50 %	0 %	25 %	25 %	116747460
23	NC_008554	CGGT	2	8	11831	11838	0 %	25 %	50 %	25 %	116747460
24	NC_008554	TTCC	2	8	11962	11969	0 %	50 %	0 %	50 %	116747460
25	NC_008554	TGAA	2	8	12002	12009	50 %	25 %	25 %	0 %	116747460
26	NC_008554	GCCC	2	8	12330	12337	0 %	0 %	25 %	75 %	116747460
27	NC_008554	CGCC	2	8	12726	12733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_008554	TGCG	2	8	12756	12763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008554	ACGC	2	8	12957	12964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008554	CGTG	2	8	13259	13266	0 %	25 %	50 %	25 %	116747461
31	NC_008554	GTCC	2	8	13402	13409	0 %	25 %	25 %	50 %	116747461
32	NC_008554	CCGG	2	8	13676	13683	0 %	0 %	50 %	50 %	116747461
33	NC_008554	CCCA	2	8	13860	13867	25 %	0 %	0 %	75 %	116747461
34	NC_008554	CGGC	2	8	14660	14667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008554	CGGC	2	8	14699	14706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008554	GGCG	2	8	15320	15327	0 %	0 %	75 %	25 %	116747462
37	NC_008554	CTCC	2	8	15685	15692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_008554	GCCG	2	8	15693	15700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008554	CGGA	2	8	17278	17285	25 %	0 %	50 %	25 %	116747463
40	NC_008554	CGGC	2	8	17721	17728	0 %	0 %	50 %	50 %	116747463
41	NC_008554	GCGG	2	8	18187	18194	0 %	0 %	75 %	25 %	116747463
42	NC_008554	CGGT	2	8	18268	18275	0 %	25 %	50 %	25 %	116747463
43	NC_008554	CGGG	2	8	18644	18651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008554	CTTC	2	8	18941	18948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008554	CGGT	2	8	20031	20038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008554	CGTT	2	8	21175	21182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008554	CCCG	2	8	21295	21302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008554	GCCT	2	8	21619	21626	0 %	25 %	25 %	50 %	116747464
49	NC_008554	CAGG	2	8	22431	22438	25 %	0 %	50 %	25 %	116747464
50	NC_008554	CGGC	2	8	22457	22464	0 %	0 %	50 %	50 %	116747464
51	NC_008554	CTCC	2	8	22793	22800	0 %	25 %	0 %	75 %	116747464
52	NC_008554	ATCC	2	8	23602	23609	25 %	25 %	0 %	50 %	116747465
53	NC_008554	CGGG	3	12	23822	23833	0 %	0 %	75 %	25 %	116747465
54	NC_008554	TCCT	2	8	24660	24667	0 %	50 %	0 %	50 %	116747465
55	NC_008554	CCGG	2	8	24748	24755	0 %	0 %	50 %	50 %	116747465
56	NC_008554	CGGT	2	8	25410	25417	0 %	25 %	50 %	25 %	116747465
57	NC_008554	GTCC	2	8	25472	25479	0 %	25 %	25 %	50 %	116747465
58	NC_008554	CTGC	2	8	26021	26028	0 %	25 %	25 %	50 %	116747465
59	NC_008554	CGAT	2	8	26319	26326	25 %	25 %	25 %	25 %	116747465
60	NC_008554	CTTT	2	8	26445	26452	0 %	75 %	0 %	25 %	116747466
61	NC_008554	GCAC	2	8	26866	26873	25 %	0 %	25 %	50 %	116747466
62	NC_008554	GCCC	2	8	27690	27697	0 %	0 %	25 %	75 %	116747467
63	NC_008554	GTGG	2	8	27698	27705	0 %	25 %	75 %	0 %	116747467
64	NC_008554	CCCG	2	8	27739	27746	0 %	0 %	25 %	75 %	116747467
65	NC_008554	CAGG	2	8	27812	27819	25 %	0 %	50 %	25 %	116747467
66	NC_008554	CCCG	2	8	29097	29104	0 %	0 %	25 %	75 %	116747468
67	NC_008554	GATC	2	8	29783	29790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008554	CGGC	2	8	29818	29825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008554	AATC	2	8	30097	30104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008554	ATGC	2	8	30124	30131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008554	GGCG	2	8	30414	30421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008554	GCAC	2	8	30567	30574	25 %	0 %	25 %	50 %	116747470
73	NC_008554	GATG	2	8	30616	30623	25 %	25 %	50 %	0 %	116747470
74	NC_008554	ATCC	2	8	31001	31008	25 %	25 %	0 %	50 %	116747470
75	NC_008554	GACG	2	8	31759	31766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008554	CGGG	2	8	32013	32020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008554	CCCG	2	8	32173	32180	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008554	GAAC	2	8	32194	32201	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008554	TCCG	2	8	32428	32435	0 %	25 %	25 %	50 %	116747471
80	NC_008554	CCTT	2	8	32516	32523	0 %	50 %	0 %	50 %	116747471
81	NC_008554	CGAT	2	8	32918	32925	25 %	25 %	25 %	25 %	116747471
82	NC_008554	CCTT	2	8	34190	34197	0 %	50 %	0 %	50 %	116747471
83	NC_008554	TCAT	2	8	34391	34398	25 %	50 %	0 %	25 %	116747471
84	NC_008554	TCTT	2	8	34400	34407	0 %	75 %	0 %	25 %	116747471
85	NC_008554	CCGA	2	8	35037	35044	25 %	0 %	25 %	50 %	116747472
86	NC_008554	ATCG	2	8	35201	35208	25 %	25 %	25 %	25 %	116747473
87	NC_008554	CGTG	2	8	35441	35448	0 %	25 %	50 %	25 %	116747473
88	NC_008554	CCAG	2	8	36011	36018	25 %	0 %	25 %	50 %	116747474
89	NC_008554	CCTG	2	8	36356	36363	0 %	25 %	25 %	50 %	116747474
90	NC_008554	CCTT	2	8	36701	36708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008554	AGGG	2	8	36816	36823	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008554	TTCC	2	8	36877	36884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008554	CGGG	2	8	36936	36943	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008554	CGGG	2	8	36990	36997	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008554	GGAG	2	8	37073	37080	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008554	GAAG	2	8	37482	37489	50 %	0 %	50 %	0 %	116747475
97	NC_008554	TCCC	2	8	38379	38386	0 %	25 %	0 %	75 %	116747476
98	NC_008554	CGGG	2	8	38945	38952	0 %	0 %	75 %	25 %	116747477
99	NC_008554	GTTT	2	8	39152	39159	0 %	75 %	25 %	0 %	116747478
100	NC_008554	GAAG	2	8	39529	39536	50 %	0 %	50 %	0 %	116747478
101	NC_008554	GCAC	2	8	39567	39574	25 %	0 %	25 %	50 %	116747478
102	NC_008554	ACCT	2	8	39710	39717	25 %	25 %	0 %	50 %	116747478
103	NC_008554	CGGG	2	8	40725	40732	0 %	0 %	75 %	25 %	116747480
104	NC_008554	GAGG	2	8	41007	41014	25 %	0 %	75 %	0 %	116747480
105	NC_008554	GCTG	2	8	41033	41040	0 %	25 %	50 %	25 %	116747480
106	NC_008554	CCCG	2	8	41420	41427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_008554	CGGG	2	8	41468	41475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008554	AACC	2	8	41790	41797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008554	GCCA	2	8	41816	41823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008554	AATA	2	8	41869	41876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008554	GTGC	2	8	42683	42690	0 %	25 %	50 %	25 %	116747481
112	NC_008554	GCCT	2	8	42711	42718	0 %	25 %	25 %	50 %	116747481
113	NC_008554	GGTG	2	8	42848	42855	0 %	25 %	75 %	0 %	116747481
114	NC_008554	AAAG	2	8	43649	43656	75 %	0 %	25 %	0 %	116747482
115	NC_008554	GCGG	2	8	43676	43683	0 %	0 %	75 %	25 %	116747482
116	NC_008554	AGCG	2	8	44253	44260	25 %	0 %	50 %	25 %	116747482
117	NC_008554	CCGA	2	8	44472	44479	25 %	0 %	25 %	50 %	116747482
118	NC_008554	ACCG	2	8	44793	44800	25 %	0 %	25 %	50 %	116747482
119	NC_008554	CGCC	2	8	44978	44985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008554	GCGG	2	8	45224	45231	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008554	CCCG	2	8	45487	45494	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_008554	GGCG	2	8	46559	46566	0 %	0 %	75 %	25 %	116747483
123	NC_008554	AGGG	2	8	46593	46600	25 %	0 %	75 %	0 %	116747483
124	NC_008554	GTTC	2	8	47293	47300	0 %	50 %	25 %	25 %	116747483
125	NC_008554	GAGG	2	8	47366	47373	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008554	TGAA	2	8	47464	47471	50 %	25 %	25 %	0 %	116747484
127	NC_008554	TGCT	2	8	48429	48436	0 %	50 %	25 %	25 %	116747485
128	NC_008554	GTGC	2	8	50084	50091	0 %	25 %	50 %	25 %	116747487
129	NC_008554	CGAC	2	8	50371	50378	25 %	0 %	25 %	50 %	116747487
130	NC_008554	AGGC	2	8	50724	50731	25 %	0 %	50 %	25 %	116747487
131	NC_008554	AAGA	2	8	50997	51004	75 %	0 %	25 %	0 %	116747487
132	NC_008554	GTGG	2	8	51401	51408	0 %	25 %	75 %	0 %	116747487
133	NC_008554	TGGG	2	8	51417	51424	0 %	25 %	75 %	0 %	116747487
134	NC_008554	CCTC	2	8	51508	51515	0 %	25 %	0 %	75 %	116747487
135	NC_008554	CGGA	2	8	51532	51539	25 %	0 %	50 %	25 %	116747487
136	NC_008554	GGCT	2	8	51942	51949	0 %	25 %	50 %	25 %	116747487
137	NC_008554	GCGT	2	8	52533	52540	0 %	25 %	50 %	25 %	116747488
138	NC_008554	GACG	2	8	52781	52788	25 %	0 %	50 %	25 %	116747489
139	NC_008554	AAGG	2	8	53402	53409	50 %	0 %	50 %	0 %	116747489
140	NC_008554	GCTG	2	8	53415	53422	0 %	25 %	50 %	25 %	116747489
141	NC_008554	CGCT	2	8	54074	54081	0 %	25 %	25 %	50 %	116747490
142	NC_008554	GTGC	2	8	54184	54191	0 %	25 %	50 %	25 %	116747490
143	NC_008554	AGCG	2	8	54723	54730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008554	GCCG	2	8	54977	54984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_008554	CGGC	2	8	56192	56199	0 %	0 %	50 %	50 %	116747492
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261	NC_008554	CGAG	2	8	99498	99505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
262	NC_008554	CGGC	2	8	99882	99889	0 %	0 %	50 %	50 %	116747532
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281	NC_008554	CTTG	2	8	107630	107637	0 %	50 %	25 %	25 %	116747539
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