MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 101995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008554	GAA	2	6	147312	147317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747572
3002	NC_008554	CTG	2	6	147337	147342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747572
3003	NC_008554	TGG	2	6	147425	147430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747572
3004	NC_008554	TG	3	6	147456	147461	0 %	50 %	50 %	0 %	116747572
3005	NC_008554	CGC	2	6	147490	147495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747572
3006	NC_008554	CGA	2	6	147507	147512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747572
3007	NC_008554	CGG	2	6	147528	147533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747572
3008	NC_008554	ACA	2	6	147623	147628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747572
3009	NC_008554	CCA	2	6	147629	147634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747572
3010	NC_008554	TCG	2	6	147635	147640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747572
3011	NC_008554	CGA	2	6	147699	147704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747572
3012	NC_008554	ACC	2	6	147706	147711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747572
3013	NC_008554	CGG	2	6	147759	147764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747572
3014	NC_008554	TCA	2	6	147773	147778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747572
3015	NC_008554	ACCGAA	2	12	147793	147804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116747572
3016	NC_008554	AGA	2	6	147812	147817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747572
3017	NC_008554	GC	3	6	147820	147825	0 %	0 %	50 %	50 %	116747572
3018	NC_008554	GGA	2	6	147861	147866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747572
3019	NC_008554	CGG	3	9	147879	147887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747572
3020	NC_008554	CGA	2	6	147939	147944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747572
3021	NC_008554	GCCC	2	8	147984	147991	0 %	0 %	25 %	75 %	116747572
3022	NC_008554	CCAG	2	8	148082	148089	25 %	0 %	25 %	50 %	116747572
3023	NC_008554	ACC	2	6	148183	148188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747572
3024	NC_008554	C	6	6	148252	148257	0 %	0 %	0 %	100 %	116747572
3025	NC_008554	GCC	2	6	148284	148289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_008554	GCGCG	2	10	148304	148313	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3027	NC_008554	T	6	6	148360	148365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_008554	TTTTC	2	10	148367	148376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_008554	GCCGT	2	10	148432	148441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_008554	GTG	2	6	148462	148467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_008554	GCG	2	6	148500	148505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008554	CCGG	2	8	148590	148597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_008554	G	6	6	148628	148633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_008554	CCA	2	6	148637	148642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747573
3035	NC_008554	CAGA	2	8	148672	148679	50 %	0 %	25 %	25 %	116747573
3036	NC_008554	TGC	2	6	148757	148762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3037	NC_008554	CCG	2	6	148783	148788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747573
3038	NC_008554	TCC	2	6	148793	148798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747573
3039	NC_008554	CCT	2	6	148807	148812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747573
3040	NC_008554	CAA	2	6	148848	148853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747573
3041	NC_008554	GCA	2	6	148881	148886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3042	NC_008554	CGG	2	6	149062	149067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747573
3043	NC_008554	CGCT	2	8	149219	149226	0 %	25 %	25 %	50 %	116747573
3044	NC_008554	G	6	6	149293	149298	0 %	0 %	100 %	0 %	116747573
3045	NC_008554	ACC	2	6	149350	149355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747573
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3047	NC_008554	CTG	2	6	149458	149463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
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3049	NC_008554	CGA	2	6	149721	149726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3050	NC_008554	GTT	2	6	149733	149738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747573
3051	NC_008554	GAA	2	6	149904	149909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747573
3052	NC_008554	GGGAC	2	10	149967	149976	20 %	0 %	60 %	20 %	116747573
3053	NC_008554	A	6	6	150104	150109	100 %	0 %	0 %	0 %	116747573
3054	NC_008554	GAACG	2	10	150124	150133	40 %	0 %	40 %	20 %	116747573
3055	NC_008554	CTG	2	6	150141	150146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3056	NC_008554	GCT	2	6	150168	150173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3057	NC_008554	CCG	2	6	150175	150180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747573
3058	NC_008554	AGG	3	9	150221	150229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747573
3059	NC_008554	TCC	2	6	150355	150360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747573
3060	NC_008554	CTG	2	6	150361	150366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3061	NC_008554	GAG	2	6	150481	150486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747573
3062	NC_008554	ATC	2	6	150487	150492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747573
3063	NC_008554	CCG	2	6	150530	150535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747573
3064	NC_008554	GAC	2	6	150547	150552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3065	NC_008554	GGAT	2	8	150680	150687	25 %	25 %	50 %	0 %	116747573
3066	NC_008554	CCA	2	6	150708	150713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747573
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3069	NC_008554	CCCG	2	8	150868	150875	0 %	0 %	25 %	75 %	116747573
3070	NC_008554	TGG	2	6	150964	150969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747573
3071	NC_008554	GGA	2	6	151005	151010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747573
3072	NC_008554	AGGCCA	2	12	151118	151129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747573
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3074	NC_008554	GATTG	2	10	151174	151183	20 %	40 %	40 %	0 %	116747573
3075	NC_008554	AGG	2	6	151199	151204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747573
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3078	NC_008554	GCT	2	6	151340	151345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747573
3079	NC_008554	CGGT	2	8	151361	151368	0 %	25 %	50 %	25 %	116747573
3080	NC_008554	ATC	2	6	151379	151384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747573
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3082	NC_008554	CGGG	2	8	151521	151528	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3083	NC_008554	CGC	2	6	151535	151540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_008554	CGG	2	6	151554	151559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_008554	CACG	2	8	151580	151587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3089	NC_008554	CGT	2	6	151703	151708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747574
3090	NC_008554	T	6	6	151718	151723	0 %	100 %	0 %	0 %	116747574
3091	NC_008554	GGA	2	6	151749	151754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747574
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3093	NC_008554	TTC	2	6	151800	151805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747574
3094	NC_008554	TTG	2	6	151822	151827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747574
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3096	NC_008554	TC	3	6	151922	151927	0 %	50 %	0 %	50 %	116747574
3097	NC_008554	GTG	2	6	151950	151955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747574
3098	NC_008554	CCG	2	6	152023	152028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747574
3099	NC_008554	TCA	2	6	152041	152046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747574
3100	NC_008554	GCT	2	6	152051	152056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747574
3101	NC_008554	GCG	2	6	152091	152096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_008554	GGAA	2	8	152123	152130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_008554	GCG	2	6	152131	152136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_008554	TTC	2	6	152153	152158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747575
3105	NC_008554	CAC	2	6	152164	152169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116747575
3106	NC_008554	CTG	2	6	152215	152220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747575
3107	NC_008554	TCT	2	6	152391	152396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747575
3108	NC_008554	CGT	4	12	152433	152444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747575
3109	NC_008554	GA	3	6	152484	152489	50 %	0 %	50 %	0 %	116747575
3110	NC_008554	GCG	2	6	152552	152557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747575
3111	NC_008554	GGC	2	6	152594	152599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747575
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3113	NC_008554	TGCCGG	2	12	152683	152694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116747575
3114	NC_008554	CGG	2	6	152823	152828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747575
3115	NC_008554	ACG	2	6	152831	152836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747575
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3117	NC_008554	CAG	3	9	152864	152872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747575
3118	NC_008554	AAAC	2	8	152889	152896	75 %	0 %	0 %	25 %	116747575
3119	NC_008554	ACG	2	6	153061	153066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_008554	TGT	2	6	153096	153101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008554	CG	3	6	153118	153123	0 %	0 %	50 %	50 %	116747576
3122	NC_008554	CTGA	2	8	153130	153137	25 %	25 %	25 %	25 %	116747576
3123	NC_008554	TCC	2	6	153182	153187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747576
3124	NC_008554	ACA	2	6	153227	153232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747576
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3370	NC_008554	GTTCC	2	10	165789	165798	0 %	40 %	20 %	40 %	116747584
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3373	NC_008554	CCGG	2	8	165946	165953	0 %	0 %	50 %	50 %	116747584
3374	NC_008554	GCG	2	6	165977	165982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747584
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3377	NC_008554	GC	3	6	166265	166270	0 %	0 %	50 %	50 %	116747584
3378	NC_008554	GGC	2	6	166305	166310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747584
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3382	NC_008554	CAG	2	6	166411	166416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747584
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3393	NC_008554	CGAT	2	8	166838	166845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3394	NC_008554	GCA	3	9	166851	166859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3398	NC_008554	GTCAA	2	10	166994	167003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3402	NC_008554	ATT	2	6	167210	167215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116747585
3403	NC_008554	TGA	2	6	167217	167222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747585
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3471	NC_008554	CGC	3	9	170427	170435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3472	NC_008554	GCTCC	2	10	170476	170485	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3473	NC_008554	AGTC	2	8	170528	170535	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3474	NC_008554	G	8	8	170547	170554	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3475	NC_008554	AATTC	2	10	170559	170568	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3476	NC_008554	TCGA	2	8	170648	170655	25 %	25 %	25 %	25 %	116747589
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3482	NC_008554	TGA	2	6	170953	170958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747589
3483	NC_008554	A	7	7	170979	170985	100 %	0 %	0 %	0 %	116747589
3484	NC_008554	TCA	2	6	170986	170991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747589
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3486	NC_008554	TA	3	6	171030	171035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3487	NC_008554	TAA	2	6	171148	171153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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