MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophobacter fumaroxidans MPOB chromosome

Total Repeats: 101995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008554	CCG	2	6	245339	245344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747659
5002	NC_008554	GAA	2	6	245364	245369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5003	NC_008554	GAA	2	6	245397	245402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5004	NC_008554	GAA	2	6	245419	245424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5005	NC_008554	GCC	2	6	245426	245431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747659
5006	NC_008554	CGG	3	9	245468	245476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5007	NC_008554	CGG	3	9	245501	245509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5008	NC_008554	CGG	2	6	245541	245546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5009	NC_008554	GGC	2	6	245553	245558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5010	NC_008554	CGG	2	6	245615	245620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5011	NC_008554	GAG	2	6	245644	245649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747659
5012	NC_008554	AGC	2	6	245691	245696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747659
5013	NC_008554	CCG	2	6	245708	245713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747659
5014	NC_008554	CGG	2	6	245714	245719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5015	NC_008554	CTC	2	6	245798	245803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747659
5016	NC_008554	CCG	2	6	245818	245823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747659
5017	NC_008554	GGA	2	6	245826	245831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747659
5018	NC_008554	GCG	2	6	245836	245841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747659
5019	NC_008554	A	6	6	245890	245895	100 %	0 %	0 %	0 %	116747659
5020	NC_008554	GAA	2	6	245898	245903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5021	NC_008554	GAA	2	6	245916	245921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5022	NC_008554	A	6	6	245920	245925	100 %	0 %	0 %	0 %	116747659
5023	NC_008554	CTT	2	6	245930	245935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747659
5024	NC_008554	AAG	3	9	245953	245961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747659
5025	NC_008554	GGC	2	6	245968	245973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_008554	CGGG	2	8	246197	246204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_008554	GCCC	2	8	246211	246218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5028	NC_008554	GCCC	3	12	246269	246280	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5029	NC_008554	GA	3	6	246380	246385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008554	TCCG	2	8	246594	246601	0 %	25 %	25 %	50 %	116747660
5031	NC_008554	GGCC	2	8	246725	246732	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
5032	NC_008554	GT	3	6	246734	246739	0 %	50 %	50 %	0 %	116747660
5033	NC_008554	CGG	2	6	246755	246760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747660
5034	NC_008554	GGTCCA	2	12	246836	246847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116747660
5035	NC_008554	GC	3	6	246916	246921	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
5036	NC_008554	TCG	2	6	247006	247011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747660
5037	NC_008554	GTC	2	6	247053	247058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747660
5038	NC_008554	ATGG	2	8	247062	247069	25 %	25 %	50 %	0 %	116747660
5039	NC_008554	CAG	2	6	247173	247178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747660
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5041	NC_008554	CCT	2	6	247296	247301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747660
5042	NC_008554	CG	3	6	247324	247329	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
5043	NC_008554	GGC	2	6	247468	247473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747660
5044	NC_008554	CG	4	8	247493	247500	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
5045	NC_008554	CTC	2	6	247566	247571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747660
5046	NC_008554	AATGC	2	10	247648	247657	40 %	20 %	20 %	20 %	116747660
5047	NC_008554	GCCG	2	8	247674	247681	0 %	0 %	50 %	50 %	116747660
5048	NC_008554	GAGC	2	8	247682	247689	25 %	0 %	50 %	25 %	116747660
5049	NC_008554	CG	3	6	247768	247773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_008554	ATT	2	6	247812	247817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008554	GAA	2	6	247874	247879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008554	AGC	2	6	247892	247897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_008554	CGC	2	6	247927	247932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747661
5054	NC_008554	AGGA	2	8	248121	248128	50 %	0 %	50 %	0 %	116747661
5055	NC_008554	TTC	2	6	248131	248136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747661
5056	NC_008554	GTT	2	6	248249	248254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747661
5057	NC_008554	G	6	6	248260	248265	0 %	0 %	100 %	0 %	116747661
5058	NC_008554	GGTTGC	2	12	248285	248296	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116747661
5059	NC_008554	GTG	2	6	248298	248303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747661
5060	NC_008554	GGC	2	6	248312	248317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
5061	NC_008554	GGC	2	6	248502	248507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
5062	NC_008554	GCG	2	6	248523	248528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
5063	NC_008554	CTC	2	6	248563	248568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116747661
5064	NC_008554	ATC	2	6	248601	248606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747661
5065	NC_008554	GTG	2	6	248625	248630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747661
5066	NC_008554	GTC	2	6	248631	248636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747661
5067	NC_008554	GCG	2	6	248640	248645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747661
5068	NC_008554	TCA	2	6	248662	248667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747661
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5070	NC_008554	CAT	2	6	248724	248729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747661
5071	NC_008554	GCT	2	6	248753	248758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747661
5072	NC_008554	AG	3	6	248760	248765	50 %	0 %	50 %	0 %	116747661
5073	NC_008554	TGG	2	6	248776	248781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747661
5074	NC_008554	GGA	2	6	248801	248806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747661
5075	NC_008554	CGA	2	6	248936	248941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747661
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5085	NC_008554	CGG	2	6	249725	249730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116747662
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5087	NC_008554	GAA	3	9	249853	249861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747662
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5092	NC_008554	CGC	2	6	250114	250119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747662
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5095	NC_008554	TCG	2	6	250344	250349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747662
5096	NC_008554	GCT	2	6	250420	250425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747662
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5098	NC_008554	CCG	2	6	250496	250501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747662
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5104	NC_008554	A	6	6	250716	250721	100 %	0 %	0 %	0 %	116747662
5105	NC_008554	GCA	2	6	250744	250749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747662
5106	NC_008554	CG	3	6	250807	250812	0 %	0 %	50 %	50 %	116747662
5107	NC_008554	TCG	2	6	250949	250954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747662
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5109	NC_008554	GAA	2	6	251047	251052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116747662
5110	NC_008554	CG	3	6	251136	251141	0 %	0 %	50 %	50 %	116747662
5111	NC_008554	TGG	2	6	251160	251165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747662
5112	NC_008554	CAG	2	6	251173	251178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747662
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5118	NC_008554	G	6	6	251293	251298	0 %	0 %	100 %	0 %	116747662
5119	NC_008554	AGGG	2	8	251301	251308	25 %	0 %	75 %	0 %	116747662
5120	NC_008554	CGC	2	6	251362	251367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116747662
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5122	NC_008554	CTT	2	6	251466	251471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747663
5123	NC_008554	GTG	2	6	251476	251481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747663
5124	NC_008554	CGGC	2	8	251495	251502	0 %	0 %	50 %	50 %	116747663
5125	NC_008554	ACA	2	6	251564	251569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116747663
5126	NC_008554	TGT	2	6	251588	251593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116747663
5127	NC_008554	TTC	3	9	251722	251730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747663
5128	NC_008554	TCA	2	6	251747	251752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747663
5129	NC_008554	GGA	2	6	251800	251805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747663
5130	NC_008554	GAG	2	6	251854	251859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747663
5131	NC_008554	TCG	2	6	251864	251869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747663
5132	NC_008554	CAT	2	6	251871	251876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747663
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5134	NC_008554	G	6	6	251884	251889	0 %	0 %	100 %	0 %	116747663
5135	NC_008554	TTCT	2	8	251893	251900	0 %	75 %	0 %	25 %	116747663
5136	NC_008554	ACG	2	6	251930	251935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747663
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5142	NC_008554	CTT	2	6	252219	252224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747664
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5147	NC_008554	CGGGAA	2	12	252374	252385	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116747664
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5149	NC_008554	AGGC	2	8	252493	252500	25 %	0 %	50 %	25 %	116747664
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5152	NC_008554	TC	3	6	252660	252665	0 %	50 %	0 %	50 %	116747664
5153	NC_008554	CTG	2	6	252718	252723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116747664
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5160	NC_008554	GCA	2	6	252998	253003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747665
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5175	NC_008554	CCA	2	6	253740	253745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5178	NC_008554	T	6	6	253865	253870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5180	NC_008554	AGG	2	6	254028	254033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5181	NC_008554	ACG	2	6	254035	254040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5183	NC_008554	CCA	2	6	254075	254080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5184	NC_008554	GAA	2	6	254089	254094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5185	NC_008554	CAG	2	6	254100	254105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5187	NC_008554	ATG	2	6	254187	254192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5189	NC_008554	TC	3	6	254230	254235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5190	NC_008554	ATT	2	6	254268	254273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5193	NC_008554	AATG	2	8	254335	254342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_008554	AGGTG	2	10	255973	255982	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5222	NC_008554	AGA	2	6	255999	256004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5223	NC_008554	AGGA	2	8	256053	256060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_008554	CGG	2	6	256179	256184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5230	NC_008554	CAAC	2	8	256255	256262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5231	NC_008554	GTT	2	6	256349	256354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_008554	CGC	2	6	256414	256419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5233	NC_008554	T	6	6	256426	256431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_008554	GAT	2	6	256561	256566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5243	NC_008554	CG	3	6	257088	257093	0 %	0 %	50 %	50 %	116747668
5244	NC_008554	ACTCC	2	10	257136	257145	20 %	20 %	0 %	60 %	116747668
5245	NC_008554	ATC	2	6	257224	257229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747668
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5249	NC_008554	C	6	6	257349	257354	0 %	0 %	0 %	100 %	116747668
5250	NC_008554	GC	3	6	257355	257360	0 %	0 %	50 %	50 %	116747668
5251	NC_008554	CGA	2	6	257370	257375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747668
5252	NC_008554	GTG	2	6	257401	257406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747668
5253	NC_008554	CAT	2	6	257430	257435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116747668
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5255	NC_008554	CTT	2	6	257479	257484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747668
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5258	NC_008554	GGGCG	2	10	257709	257718	0 %	0 %	80 %	20 %	116747668
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5260	NC_008554	GATC	2	8	257802	257809	25 %	25 %	25 %	25 %	116747668
5261	NC_008554	CGAG	2	8	257819	257826	25 %	0 %	50 %	25 %	116747668
5262	NC_008554	GAG	2	6	257881	257886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116747668
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5272	NC_008554	TCT	2	6	258266	258271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116747668
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5299	NC_008554	GAG	2	6	259511	259516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5355	NC_008554	CATCG	2	10	262810	262819	20 %	20 %	20 %	40 %	116747670
5356	NC_008554	GAACGG	2	12	262831	262842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116747670
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5358	NC_008554	GTG	3	9	262889	262897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747670
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5360	NC_008554	ACG	2	6	263042	263047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116747670
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5362	NC_008554	GC	3	6	263156	263161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5363	NC_008554	ACGGC	2	10	263209	263218	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5364	NC_008554	GATC	2	8	263244	263251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5365	NC_008554	CA	3	6	263285	263290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5366	NC_008554	CGC	2	6	263410	263415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5367	NC_008554	TGGC	2	8	263428	263435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5368	NC_008554	AAT	2	6	263444	263449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_008554	TAT	2	6	263519	263524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_008554	GGA	2	6	263531	263536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_008554	CGA	2	6	263677	263682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5373	NC_008554	AGC	2	6	263839	263844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5375	NC_008554	GTTT	2	8	263874	263881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_008554	GAT	2	6	270145	270150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116747678
5500	NC_008554	GGT	2	6	270187	270192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116747678

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